|
Pairwise sequence scores | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 3901 | Hut0527 | NP5184A | NP4008A | rrnAC1425 | rrnAC1424 | Hmu1733 | Hbo0404 | HVO_1153 | Hut1415 |
1117 | Hut0527 | 5228 | 495 | 366 | 650 | 782 | 741 | 350 | 355 | 372 |
1410 | NP5184A | 495 | 4440 | 601 | 908 | 993 | 921 | 576 | 589 | 531 |
1278 | NP4008A | 366 | 601 | 3582 | 718 | 743 | 701 | 859 | 790 | 735 |
2073 | rrnAC1425 | 650 | 908 | 718 | 4392 | 1813 | 1771 | 854 | 837 | 811 |
2333 | rrnAC1424 | 782 | 993 | 743 | 1813 | 4260 | 2438 | 768 | 681 | 894 |
2265 | Hmu1733 | 741 | 921 | 701 | 1771 | 2438 | 4309 | 786 | 890 | 786 |
1549 | Hbo0404 | 350 | 576 | 859 | 854 | 768 | 786 | 3780 | 1292 | 1410 |
1687 | HVO_1153 | 355 | 589 | 790 | 837 | 681 | 890 | 1292 | 3651 | 1630 |
1679 | Hut1415 | 372 | 531 | 735 | 811 | 894 | 786 | 1410 | 1630 | 3892 |
767 symbols consensus -----------------------------------------------------MSRGRGD #oth 111111111111111111111111111111111111111111111111111123653545 Hut0527 MAAVKVETSPGKPSRLNYQQCIFVEIEFETATITEIYFLATIVIDIVSSKMGLS:D:S:E NP5184A :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::F::-- NP4008A :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::-----M: rrnAC1425 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::MGSAE::L:S rrnAC1424 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::NVP::Q Hmu1733 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::Y::L:R Hbo0404 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::RLSEP: HVO_1153 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::------- Hut1415 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::IFPGS: consensus -RAQSSPLGLVLLLGMTIAGSGAVVALGATALSDTQQQVDVERAENSMTQLDSRAALVAL #oth 51331434263.232322322422152.37214423564553322521332226222121 Hut0527 S:GL::VM:FA:VF::V::::MVI:SV::VS::ES:SV:SM:S:VTA:NDV:--:TISSI NP5184A ::::::VV:YA:IIAI:VTAVSVL:VA:GG::::L:GS:ADDN:::A:LE:N:E:S:::: NP4008A D::V:NTV:I::I::::::AVS:L:FV:GAV:E::RADTEQSQV:S::S:FS:K:S::G: rrnAC1425 ::G::A::::A:VFAVM:VSTT:::::::D:ITS::T:L::::T:K:L:E:N:KT::::: rrnAC1424 Q::::A::::L:V:SLV:V:::V::S::::::V::EAGL::S:::TG::::::Q:::::: Hmu1733 ::G::::IAVI::VS:VV:::L:::T:::QS::::RETM::::::KGL:::::NV:M::: Hbo0404 H::V::T:AV:::::::LL:T:II:GV:SS:::T:::S::A::::Q::::F:AVT:M:G: HVO_1153 :---------::::AI:V::TT::::::GP::DE:K:ASQLT:::H:::LF:::V:IS:: Hut1415 E:S::EV::T:::::LVV::V:ILGVV:T:::TG:::::G::::I::::LF:::::::G: consensus GQADAQQVSLGGTDDGTYRVDDDAGWMQITHTN--TSEGDTETLYNESLGAVAYE-NGDT #oth 154363433265334252345334134637462215555736534332214431313244 Hut0527 RGHSGS:A:IKLP:::E:VNS---::I::EI:D::S:GTVQNQTGKIT::KY::::RDGQ NP5184A :GSSHR::DF:T:::A:FETY:G:RI-------::VV:NG::::LE:TITTLE:R:R::: NP4008A :ES:::EFA::RIT::QVT:EP:E:HVLMYVED::-A:::RDDIGDV::::MV::::::: rrnAC1425 ::T:V:::::PASSSS:::I:E:::::NVSYQ::::TS:NRM:VF:::M:E:::HGSDE: rrnAC1424 :N::S:::::V:::KS:::I::T::R:TVNI::HSA:PST:T::MD:R::::V:::::NQ Hmu1733 :S:GG:EL::SR::GAA::LR::::R:TVAV::::::NDS:K:VM:AT::SI:::::DGR Hbo0404 ::T:RESLT:QSSS::G:T:SP:D::LR:K:W:::Y::EKD:VV::A:::S:T:R:TETS HVO_1153 :EGET:Y:D:S::GG:A:V::::S::LS:::K:H::DD::DQP:::::::S:E:R::::A Hut1415 :D::::A:DF-::GQ:S:E:QP:::RI::::Y:Y:SN::R::MI:::T:::LVFT:S:E: consensus EIAYQGGGVWRRDGDGGSVMVSPPEFHYRDA---TLTLPLVRVSGDG----SGDVRASVA #oth 521.1...1.33432232411...1.2.122111..12.234141461122233634424 Hut0527 :V:::::::::G::E-NF::::::D:E:AGGPNP::SF:ITSLE:VN::::ATGRSY:I: NP5184A H:::::::T::T:::-TTR::::::::::G:::::::M:::DLD:TV::::A:SATTIA: NP4008A ::::::::::E:T::-H:R::::::::::SE::::::F:ILN:::A:::SA:::::GAAT rrnAC1425 RL:::::::::AN:::T::::::::::::::::::::::::T:::S:::::AIRDG::IS rrnAC1424 KV::::::::::-S:S::::::::::Y:::::::::::::IT:R::R:::::LGS:::IS Hmu1733 SV::::::::KT::::::L::::::::::::::::::::::T::::E:::::L:G:IA:R Hbo0404 AVT:::::::Q:-S:::TS::::::::::::::::::::V:::RNTD::SA::R:::I:S HVO_1153 R:::E::::::T-Q:::TT::::::::::G:::::::::V:::::::::SS::::S:R:: Hut1415 ::::::::::::GAN:::LLL::::::::S:::::::::II:LANTAVDRAG:GP::V:E consensus ANR-ARQIYPNESANE--------------------YRNPLDNGT-VNVTVQSEYYRGWA #oth 54535455312645753122211111123311111636222551521411.3.32232.2 Hut0527 ::::SNN:SADTLPRG::::::::::::::::::::---:I:P:NE:QI::H:K:AD::: NP5184A Q:-:-----:DTTLQD::::::::::::::::::::-:RRVGETESIT:::E:R::ES:G NP4008A RGDDP::L:::V:K:::::::::::::::::::::DFD:::TD::::YIE:E:R:CE::E rrnAC1425 H:::T:SYF::STR:::::::::::::::::::::NFT:::E::K::::::::::::A:G rrnAC1424 KDG:TT:V::DQA:GN::::::::::::::::::::-I::::T:::::I::::::::S:G Hmu1733 PGGRST:HF::A::D::::::::::::::::::::QWV::::G:R::::::R:::::A:G Hbo0404 RRDEVARV::HPKEPGPGWKT::::YDDGVA::::T::::VR::S::::::H::F::::: HVO_1153 :TKR::S:::::T:AYN:::::::::::ETAG:::S:D::VS::::IV:::H:DH::::: Hut1415 PRER::K:F:::::TADGSSEVGAPYDPNSAGNELA:A:AIR::S::QI::::R::L::: consensus RYFEERTDG---DVTYDHDNDTVTLELTTPGGP--VTGAFAATSAGGQIELSGMAGDHAR #oth 41135.23.11133554543522433.4455324556332641654453544.5664546 Hut0527 ::LNK:A:::::::-TKTGSK::K:T::S:KT:SV:S:PISS:GSV:MDPE:::DYYDST NP5184A :F:AD:::::::T:S::::TES::::::NDPERPDIG:PVVS:T:SEEL::D:KFVVN:Y NP4008A SF:RD:SQ:GLDETCDEG:S::LVVD::AS---::FEP::G::VTAK:::ND:AEV:GST rrnAC1425 G:::::::::::::::HP:SNR:SII:KV:A::RK:QN:V::::DS:S:K:::---ND:F rrnAC1424 :::::::::::::AY:::E::S::TT:VV:T::RE::S:V:::::::::T:::SGT:P:: Hmu1733 :F::::::::::EA:L::A:E:A:VT:VV:A::QT::N:V:::::::E:V:A:-S::QT: Hbo0404 E::RT::T::::N::V:::AR:A::::A:V:--::MV:::ELPAKNEG::IR:::SG:PI HVO_1153 AF::S:SE::::T::V:DA:Q:ASV::E:L:--::LV:E:QMPNE:TSVDVR::::N:NV Hut1415 :::NQ::::::::IEIFKS:QS:R:::E:I::-::SI:D:DVPLD:NALPVQ:I:A::PL consensus TDSYNSLS-GDGGYAN-------------------------------------MAGSLGS #oth 443363352442656511111111111111111111111111111111111116744646 Hut0527 VGP:SASQ:::::LPTAIARGSFDPRADGSGDTFNSHVLTTGKVDITGSGDLTF::D:I: NP5184A DS:TGGP:ANP:QGEP::::::::::::::::::::::::::::::::::::::T:GQFV NP4008A REGIIAP:AS:RIEQR:::::::::::::::::::::::::::::::::::::------- rrnAC1425 ::::T:AD::::YD:S:::::::::::::::::::::::::::::::::::::E::DG:N rrnAC1424 ::::::SV:--:D:ST:::::::::::::::::::::::::::::::::::::SR::F:T Hmu1733 ::::::SK::T:L::D:::::::::::::::::::::::::::::::::::::TKTHN:: Hbo0404 REFEV::AKSN::NN:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::DF:FYT HVO_1153 SAFTLT:::N:QHLQ:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::EWGMYY Hut1415 ::FELT:A:P::H:G::::::::::::::::::::::::::::::::::::::LHW::YA consensus DTG-----AGDVEVNGNSQANGACKSGG-RVEVDGSGYYTNDDGY-H----W-N----PD #oth 663232225644534356565353542435434555643453647743233354563355 Hut0527 SSDDDSKMRAA:T:::DFSTE:SLELSSNKRK:FQGDF:VG:ESGDNLDIGPGTVGVQG: NP5184A A::DIDIADHRIDI::DLL:G::VSL:::-ADI::EIRCAAGNENC:ADGVET:TAVPSP NP4008A ---:::::ID:C:T::-------:RDDF:SSTLTHGT:::-----:-::::-:-::::T: rrnAC1425 L:T:::::::::I:T:SAEL::NIT:::::::FSSNSMTF:G:RV:-:::E:ADAF::D: rrnAC1424 I:T:::::::::Y:K:::EVD::VR::D:::::K:::VV:R:VE:S-::::-:-::::TT Hmu1733 IRT:::::::::T:K::::V::SLA::::K:T:K:::VV:R:A::TD::::-:-:::DIK Hbo0404 TK:SK::::YETV:HVPKGIGNY::N:K:EADMTMVV::R:GT:TQ::::V:A:DSI::A HVO_1153 :GD:::::QR:L:--LHV::DDK::G:SYDGTF:LTL::ATE::KY::::G:QATDLD:: Hut1415 :E::::::NEG:::HFH:SNP:K::::SFDG:LRL:V::F::T:SEYYHEE:R:ETID:N consensus KHGAGSIDCSTE--QIS-----GAIDGDVNRTYDDADSDNDNGGT--------------- #oth 755534233465235342443545643545553545545425373111123142232342 Hut0527 L:V::::TGQPSNLNVAGQVHV:GSS:SISKDSSSP::PL:P:IS:::::SIQHNANLIS NP5184A QPA:EVV:AD:LYQKVDSIGDGT:N:DVDAISGREL:I:DGDTV:::::::::::::::: NP4008A ADDIEN::ID:T::---:::::---::A:DIVV::S:GVDGT:SI::::::::::::::: rrnAC1425 ::::C:GS::D::::::SFGDTTN:NSH::TQV::LS:S::::::IADDGVIDGT:::EG rrnAC1424 ::IK:TVNGNVR:::::GVEGA:::::L:::RVAN:SDT::::A:::::GSISGNQLAAG Hmu1733 VT:S:GV:G:I::::L:GVDGI:P::AV:D:R:EN:TG:::::D:::::SAITGTTLSDG Hbo0404 GT:PV:::::::::T:A:::::VNYTS:MPL:::GTGTTDETAL:::::::::::::::: HVO_1153 TSD:V:::::ASNPEL::::::VDFTSSETM::G:IQ::KGF:NQ::::::::::::::: Hut1415 SNSDV::S:PSG::ELK:::::ADLL::ITM::::IEDMPGVS:S::::::::::::::: consensus ---L-AGKYHLDDLVLSGETLTLDTG-GGDVTL-V-DY---------------DIHVAG- #oth 332233353554554433445534333346544534333444443222211114344522 Hut0527 QKNNELSNPTN:NTAE::DISAIEN:GCSPCE:EAG::YVDEIDLTKNE::::K:ILDTS NP5184A ::::E::S:D::A:DIDEG::E:::S:S::IE:SAD:VDVSGDGNPGQGSADTS:T:::: NP4008A :::-:-------:I:DGDA:VS:YV:P::EFSMTGGSD:::::::::::::::EVN:G:E rrnAC1425 TTT:S::S::V:RID::SD-VEF::T:::N:IIG:EN:VSLNTRN::::::::::T:S:: rrnAC1424 DQT:D::T:Y:E::T:::::::IN::::D:::IA:R::VYIENNG::::::::R:K:N:: Hmu1733 DQT:S::E::::R:::D:::::::::T::TIS:A:R::VQLKNDG::::::::R:::V:: Hbo0404 :::-:-----W::P:D:SP-------:------:-:--:::::::::::::::SFNHS:E HVO_1153 :::-:-N:WQFAPEITD::AYD----:--S::F:-:--::::::::::::::::E:A:D: Hut1415 :::-:SN:WYFGSKIT-::SI:----::PTE:::-:--::::::::::::::::::SVD: consensus DGQVRLYVNGDTAASG--------SAVGHYFSIAAPEGDLDID-DGP-----------Q- #oth 425574336155566432211111655433345642454433415251222222232323 Hut0527 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:I::KDTLQARMEKKGSDKSRVT::IY:::G:KT:T:TFEIWK:E::::A:TSQ:ELEK: rrnAC1424 :M::RSDFDAF:EG:DTDTPQ:E::IY:::A::V:A:::SIKKAE::::L:A:S:TVDN: Hmu1733 :L::REDFQGR:DGTSSDTHL:E::VF:::G:TL:S::FT:EKGS::::V:T:S:TMDN: Hbo0404 -:--:::::::-:::::::::-:--::--:::N:::ARL:::E::----:-:-:-::::: HVO_1153 -:--:::::::-:::::::::-:--::--:::N:--Q:::ES::R----:-:-:-::::: Hut1415 -:--:::::::-:::::::::-:--::--:::::--:R::ESA::----:-:-:-::::: consensus -GGQ--LHYDRAL----------P--TSANRITYLHVSENRVEVDDE #oth 131511342.6324211143454454435452321121424133654 Hut0527 :DA:::F:F:N::RSGGGSGGSGSSGSG::E:D::R:TNPT:::QE: NP5184A D:::SHIS::E::ET:::QVVETLGGPDPIEVEHV:L:V::I:LV:: NP4008A :N:A::FTH:DDMS:::::::DIDVDID::TVK:::::::::TI:I- rrnAC1425 :::R::V:F::::K::::QERTI:KD::VVA:::::I:T:D:NITSN rrnAC1424 :::L::V::::::R::::NERAV:KN:NII:L::::::K::IN:TSG Hmu1733 ::::::V::::S:K::::RVNAV:PAENIV:L:::::::IEI:AR:- Hbo0404 :-:E:::R::TT-::::::::::-::::SQY::F:::T::N:T:ELS HVO_1153 :-:E:::D::Q:-::::::::::-::EGGQF::F:::T::E::::V: Hut1415 :-:T:::SF:S:-::::::::::-:::::EYL:F::IT::EIDIAL: