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6 genomes BUD1463 9 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi
-

rrnAC1424

rrnAC1425

HVO_1153

Hbo0404

Hmu1733

Hut0527

Hut1415

-

NP4008A

NP5184A

-

Pairwise sequence scores
Consensus score3901 Hut0527 NP5184A NP4008A rrnAC1425 rrnAC1424 Hmu1733 Hbo0404 HVO_1153 Hut1415
1117Hut0527 5228 495 366 650 782 741 350 355 372
1410NP5184A 495 4440 601 908 993 921 576 589 531
1278NP4008A 366 601 3582 718 743 701 859 790 735
2073rrnAC1425 650 908 718 4392 1813 1771 854 837 811
2333rrnAC1424 782 993 743 1813 4260 2438 768 681 894
2265Hmu1733 741 921 701 1771 2438 4309 786 890 786
1549Hbo0404 350 576 859 854 768 786 3780 1292 1410
1687HVO_1153 355 589 790 837 681 890 1292 3651 1630
1679Hut1415 372 531 735 811 894 786 1410 1630 3892

767 symbols
consensus       -----------------------------------------------------MSRGRGD
#oth            111111111111111111111111111111111111111111111111111123653545
Hut0527         MAAVKVETSPGKPSRLNYQQCIFVEIEFETATITEIYFLATIVIDIVSSKMGLS:D:S:E
NP5184A         :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::F::--
NP4008A         :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::-----M:
rrnAC1425       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::MGSAE::L:S
rrnAC1424       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::NVP::Q
Hmu1733         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::Y::L:R
Hbo0404         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::RLSEP:
HVO_1153        :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::-------
Hut1415         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::IFPGS:

consensus       -RAQSSPLGLVLLLGMTIAGSGAVVALGATALSDTQQQVDVERAENSMTQLDSRAALVAL
#oth            51331434263.232322322422152.37214423564553322521332226222121
Hut0527         S:GL::VM:FA:VF::V::::MVI:SV::VS::ES:SV:SM:S:VTA:NDV:--:TISSI
NP5184A         ::::::VV:YA:IIAI:VTAVSVL:VA:GG::::L:GS:ADDN:::A:LE:N:E:S::::
NP4008A         D::V:NTV:I::I::::::AVS:L:FV:GAV:E::RADTEQSQV:S::S:FS:K:S::G:
rrnAC1425       ::G::A::::A:VFAVM:VSTT:::::::D:ITS::T:L::::T:K:L:E:N:KT:::::
rrnAC1424       Q::::A::::L:V:SLV:V:::V::S::::::V::EAGL::S:::TG::::::Q::::::
Hmu1733         ::G::::IAVI::VS:VV:::L:::T:::QS::::RETM::::::KGL:::::NV:M:::
Hbo0404         H::V::T:AV:::::::LL:T:II:GV:SS:::T:::S::A::::Q::::F:AVT:M:G:
HVO_1153        :---------::::AI:V::TT::::::GP::DE:K:ASQLT:::H:::LF:::V:IS::
Hut1415         E:S::EV::T:::::LVV::V:ILGVV:T:::TG:::::G::::I::::LF:::::::G:

consensus       GQADAQQVSLGGTDDGTYRVDDDAGWMQITHTN--TSEGDTETLYNESLGAVAYE-NGDT
#oth            154363433265334252345334134637462215555736534332214431313244
Hut0527         RGHSGS:A:IKLP:::E:VNS---::I::EI:D::S:GTVQNQTGKIT::KY::::RDGQ
NP5184A         :GSSHR::DF:T:::A:FETY:G:RI-------::VV:NG::::LE:TITTLE:R:R:::
NP4008A         :ES:::EFA::RIT::QVT:EP:E:HVLMYVED::-A:::RDDIGDV::::MV:::::::
rrnAC1425       ::T:V:::::PASSSS:::I:E:::::NVSYQ::::TS:NRM:VF:::M:E:::HGSDE:
rrnAC1424       :N::S:::::V:::KS:::I::T::R:TVNI::HSA:PST:T::MD:R::::V:::::NQ
Hmu1733         :S:GG:EL::SR::GAA::LR::::R:TVAV::::::NDS:K:VM:AT::SI:::::DGR
Hbo0404         ::T:RESLT:QSSS::G:T:SP:D::LR:K:W:::Y::EKD:VV::A:::S:T:R:TETS
HVO_1153        :EGET:Y:D:S::GG:A:V::::S::LS:::K:H::DD::DQP:::::::S:E:R::::A
Hut1415         :D::::A:DF-::GQ:S:E:QP:::RI::::Y:Y:SN::R::MI:::T:::LVFT:S:E:

consensus       EIAYQGGGVWRRDGDGGSVMVSPPEFHYRDA---TLTLPLVRVSGDG----SGDVRASVA
#oth            521.1...1.33432232411...1.2.122111..12.234141461122233634424
Hut0527         :V:::::::::G::E-NF::::::D:E:AGGPNP::SF:ITSLE:VN::::ATGRSY:I:
NP5184A         H:::::::T::T:::-TTR::::::::::G:::::::M:::DLD:TV::::A:SATTIA:
NP4008A         ::::::::::E:T::-H:R::::::::::SE::::::F:ILN:::A:::SA:::::GAAT
rrnAC1425       RL:::::::::AN:::T::::::::::::::::::::::::T:::S:::::AIRDG::IS
rrnAC1424       KV::::::::::-S:S::::::::::Y:::::::::::::IT:R::R:::::LGS:::IS
Hmu1733         SV::::::::KT::::::L::::::::::::::::::::::T::::E:::::L:G:IA:R
Hbo0404         AVT:::::::Q:-S:::TS::::::::::::::::::::V:::RNTD::SA::R:::I:S
HVO_1153        R:::E::::::T-Q:::TT::::::::::G:::::::::V:::::::::SS::::S:R::
Hut1415         ::::::::::::GAN:::LLL::::::::S:::::::::II:LANTAVDRAG:GP::V:E

consensus       ANR-ARQIYPNESANE--------------------YRNPLDNGT-VNVTVQSEYYRGWA
#oth            54535455312645753122211111123311111636222551521411.3.32232.2
Hut0527         ::::SNN:SADTLPRG::::::::::::::::::::---:I:P:NE:QI::H:K:AD:::
NP5184A         Q:-:-----:DTTLQD::::::::::::::::::::-:RRVGETESIT:::E:R::ES:G
NP4008A         RGDDP::L:::V:K:::::::::::::::::::::DFD:::TD::::YIE:E:R:CE::E
rrnAC1425       H:::T:SYF::STR:::::::::::::::::::::NFT:::E::K::::::::::::A:G
rrnAC1424       KDG:TT:V::DQA:GN::::::::::::::::::::-I::::T:::::I::::::::S:G
Hmu1733         PGGRST:HF::A::D::::::::::::::::::::QWV::::G:R::::::R:::::A:G
Hbo0404         RRDEVARV::HPKEPGPGWKT::::YDDGVA::::T::::VR::S::::::H::F:::::
HVO_1153        :TKR::S:::::T:AYN:::::::::::ETAG:::S:D::VS::::IV:::H:DH:::::
Hut1415         PRER::K:F:::::TADGSSEVGAPYDPNSAGNELA:A:AIR::S::QI::::R::L:::

consensus       RYFEERTDG---DVTYDHDNDTVTLELTTPGGP--VTGAFAATSAGGQIELSGMAGDHAR
#oth            41135.23.11133554543522433.4455324556332641654453544.5664546
Hut0527         ::LNK:A:::::::-TKTGSK::K:T::S:KT:SV:S:PISS:GSV:MDPE:::DYYDST
NP5184A         :F:AD:::::::T:S::::TES::::::NDPERPDIG:PVVS:T:SEEL::D:KFVVN:Y
NP4008A         SF:RD:SQ:GLDETCDEG:S::LVVD::AS---::FEP::G::VTAK:::ND:AEV:GST
rrnAC1425       G:::::::::::::::HP:SNR:SII:KV:A::RK:QN:V::::DS:S:K:::---ND:F
rrnAC1424       :::::::::::::AY:::E::S::TT:VV:T::RE::S:V:::::::::T:::SGT:P::
Hmu1733         :F::::::::::EA:L::A:E:A:VT:VV:A::QT::N:V:::::::E:V:A:-S::QT:
Hbo0404         E::RT::T::::N::V:::AR:A::::A:V:--::MV:::ELPAKNEG::IR:::SG:PI
HVO_1153        AF::S:SE::::T::V:DA:Q:ASV::E:L:--::LV:E:QMPNE:TSVDVR::::N:NV
Hut1415         :::NQ::::::::IEIFKS:QS:R:::E:I::-::SI:D:DVPLD:NALPVQ:I:A::PL

consensus       TDSYNSLS-GDGGYAN-------------------------------------MAGSLGS
#oth            443363352442656511111111111111111111111111111111111116744646
Hut0527         VGP:SASQ:::::LPTAIARGSFDPRADGSGDTFNSHVLTTGKVDITGSGDLTF::D:I:
NP5184A         DS:TGGP:ANP:QGEP::::::::::::::::::::::::::::::::::::::T:GQFV
NP4008A         REGIIAP:AS:RIEQR:::::::::::::::::::::::::::::::::::::-------
rrnAC1425       ::::T:AD::::YD:S:::::::::::::::::::::::::::::::::::::E::DG:N
rrnAC1424       ::::::SV:--:D:ST:::::::::::::::::::::::::::::::::::::SR::F:T
Hmu1733         ::::::SK::T:L::D:::::::::::::::::::::::::::::::::::::TKTHN::
Hbo0404         REFEV::AKSN::NN:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::DF:FYT
HVO_1153        SAFTLT:::N:QHLQ:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::EWGMYY
Hut1415         ::FELT:A:P::H:G::::::::::::::::::::::::::::::::::::::LHW::YA

consensus       DTG-----AGDVEVNGNSQANGACKSGG-RVEVDGSGYYTNDDGY-H----W-N----PD
#oth            663232225644534356565353542435434555643453647743233354563355
Hut0527         SSDDDSKMRAA:T:::DFSTE:SLELSSNKRK:FQGDF:VG:ESGDNLDIGPGTVGVQG:
NP5184A         A::DIDIADHRIDI::DLL:G::VSL:::-ADI::EIRCAAGNENC:ADGVET:TAVPSP
NP4008A         ---:::::ID:C:T::-------:RDDF:SSTLTHGT:::-----:-::::-:-::::T:
rrnAC1425       L:T:::::::::I:T:SAEL::NIT:::::::FSSNSMTF:G:RV:-:::E:ADAF::D:
rrnAC1424       I:T:::::::::Y:K:::EVD::VR::D:::::K:::VV:R:VE:S-::::-:-::::TT
Hmu1733         IRT:::::::::T:K::::V::SLA::::K:T:K:::VV:R:A::TD::::-:-:::DIK
Hbo0404         TK:SK::::YETV:HVPKGIGNY::N:K:EADMTMVV::R:GT:TQ::::V:A:DSI::A
HVO_1153        :GD:::::QR:L:--LHV::DDK::G:SYDGTF:LTL::ATE::KY::::G:QATDLD::
Hut1415         :E::::::NEG:::HFH:SNP:K::::SFDG:LRL:V::F::T:SEYYHEE:R:ETID:N

consensus       KHGAGSIDCSTE--QIS-----GAIDGDVNRTYDDADSDNDNGGT---------------
#oth            755534233465235342443545643545553545545425373111123142232342
Hut0527         L:V::::TGQPSNLNVAGQVHV:GSS:SISKDSSSP::PL:P:IS:::::SIQHNANLIS
NP5184A         QPA:EVV:AD:LYQKVDSIGDGT:N:DVDAISGREL:I:DGDTV::::::::::::::::
NP4008A         ADDIEN::ID:T::---:::::---::A:DIVV::S:GVDGT:SI:::::::::::::::
rrnAC1425       ::::C:GS::D::::::SFGDTTN:NSH::TQV::LS:S::::::IADDGVIDGT:::EG
rrnAC1424       ::IK:TVNGNVR:::::GVEGA:::::L:::RVAN:SDT::::A:::::GSISGNQLAAG
Hmu1733         VT:S:GV:G:I::::L:GVDGI:P::AV:D:R:EN:TG:::::D:::::SAITGTTLSDG
Hbo0404         GT:PV:::::::::T:A:::::VNYTS:MPL:::GTGTTDETAL::::::::::::::::
HVO_1153        TSD:V:::::ASNPEL::::::VDFTSSETM::G:IQ::KGF:NQ:::::::::::::::
Hut1415         SNSDV::S:PSG::ELK:::::ADLL::ITM::::IEDMPGVS:S:::::::::::::::

consensus       ---L-AGKYHLDDLVLSGETLTLDTG-GGDVTL-V-DY---------------DIHVAG-
#oth            332233353554554433445534333346544534333444443222211114344522
Hut0527         QKNNELSNPTN:NTAE::DISAIEN:GCSPCE:EAG::YVDEIDLTKNE::::K:ILDTS
NP5184A         ::::E::S:D::A:DIDEG::E:::S:S::IE:SAD:VDVSGDGNPGQGSADTS:T::::
NP4008A         :::-:-------:I:DGDA:VS:YV:P::EFSMTGGSD:::::::::::::::EVN:G:E
rrnAC1425       TTT:S::S::V:RID::SD-VEF::T:::N:IIG:EN:VSLNTRN::::::::::T:S::
rrnAC1424       DQT:D::T:Y:E::T:::::::IN::::D:::IA:R::VYIENNG::::::::R:K:N::
Hmu1733         DQT:S::E::::R:::D:::::::::T::TIS:A:R::VQLKNDG::::::::R:::V::
Hbo0404         :::-:-----W::P:D:SP-------:------:-:--:::::::::::::::SFNHS:E
HVO_1153        :::-:-N:WQFAPEITD::AYD----:--S::F:-:--::::::::::::::::E:A:D:
Hut1415         :::-:SN:WYFGSKIT-::SI:----::PTE:::-:--::::::::::::::::::SVD:

consensus       DGQVRLYVNGDTAASG--------SAVGHYFSIAAPEGDLDID-DGP-----------Q-
#oth            425574336155566432211111655433345642454433415251222222232323
Hut0527         ::PIQ:F:::P:DVKEANL:::::TIN:SNGAEIYSN:EV::HK:SEVVTRNPRQSASSL
NP5184A         ::S:E:G:A:EFELD:ADVDIEDDAV:RM:V:D:DR:A:I:::::SSVNYDTNEANST:L
NP4008A         PS:FIT:IHS:VP:VRM:::::::NSATYVGG:Y::NTVMEG::Q:G:::::::::::-:
rrnAC1425       PN::KI:I::TSP:::G:::::::::D:YH:FTR:S:IRTTGA:VSE::::::::RST:V
rrnAC1424       G:K:::::K:EAM---:::::::::PS::H:H:Y-RT::V::::NAN::::::::NSK:F
Hmu1733         N:T:::::D:QAT---::::::::T:SN:H:::EGSG:QI::::E:Q::::::::NAS:F
Hbo0404         ::ENTTF:P:GQTT:R::::::::HLTR::L:FF:::F::NAW:H:::::::::::::-:
HVO_1153        S::TFSKAD::::PMA::::::::FV:N::::L:::QFE:TVT:::::::::::::::-:
Hut1415         P::---KSV:G::DL:::::::::LL:D::LGLMG:QY::TVT:::::::::::::::-:

consensus       W-YG-------I---------F-GV--AP--GGSGKSSVDVDGSTLYGG-V-G-V-----
#oth            241234343332442321235231233111314536444446444423253544235431
Hut0527         TW:LPPSETFR:KA:::::ST:T:LVD::::NADL:MKSGSADPVI:::MIGNFDSITK:
NP5184A         :L::PPDTDAD:QD:::::SV:S::LY::TD:TTDDADIEL::D:SVA:AIV:A:EGVDL
NP4008A         -:--:::::::-:::::::::-:--::--:G::C:GG::::T::VVVENFCFQ:-:::::
rrnAC1425       :I::KDTLQARMEKKGSDKSRVT::IY:::G:KT:T:TFEIWK:E::::A:TSQ:ELEK:
rrnAC1424       :M::RSDFDAF:EG:DTDTPQ:E::IY:::A::V:A:::SIKKAE::::L:A:S:TVDN:
Hmu1733         :L::REDFQGR:DGTSSDTHL:E::VF:::G:TL:S::FT:EKGS::::V:T:S:TMDN:
Hbo0404         -:--:::::::-:::::::::-:--::--:::N:::ARL:::E::----:-:-:-:::::
HVO_1153        -:--:::::::-:::::::::-:--::--:::N:--Q:::ES::R----:-:-:-:::::
Hut1415         -:--:::::::-:::::::::-:--::--:::::--:R::ESA::----:-:-:-:::::

consensus       -GGQ--LHYDRAL----------P--TSANRITYLHVSENRVEVDDE
#oth            131511342.6324211143454454435452321121424133654
Hut0527         :DA:::F:F:N::RSGGGSGGSGSSGSG::E:D::R:TNPT:::QE:
NP5184A         D:::SHIS::E::ET:::QVVETLGGPDPIEVEHV:L:V::I:LV::
NP4008A         :N:A::FTH:DDMS:::::::DIDVDID::TVK:::::::::TI:I-
rrnAC1425       :::R::V:F::::K::::QERTI:KD::VVA:::::I:T:D:NITSN
rrnAC1424       :::L::V::::::R::::NERAV:KN:NII:L::::::K::IN:TSG
Hmu1733         ::::::V::::S:K::::RVNAV:PAENIV:L:::::::IEI:AR:-
Hbo0404         :-:E:::R::TT-::::::::::-::::SQY::F:::T::N:T:ELS
HVO_1153        :-:E:::D::Q:-::::::::::-::EGGQF::F:::T::E::::V:
Hut1415         :-:T:::SF:S:-::::::::::-:::::EYL:F::IT::EIDIAL: