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6 genomes BUD1464 9 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi
-

rrnAC0338

rrnAC2386

HVO_B0131

Hbo2358

Hmu0971

Hmu1512

Hut1544

Hut2963

-

NP1142A

-

Pairwise sequence scores
Consensus score1853 rrnAC2386 HVO_B0131 Hmu0971 Hut2963 Hbo2358 rrnAC0338 Hut1544 Hmu1512 NP1142A
722rrnAC2386 1855 402 558 589 483 469 443 423 501
838HVO_B0131 402 2211 545 552 576 620 616 588 602
962Hmu0971 558 545 1779 1214 618 609 589 540 577
998Hut2963 589 552 1214 1812 679 680 616 541 622
980Hbo2358 483 576 618 679 2120 827 687 653 693
1231rrnAC0338 469 620 609 680 827 1831 1258 973 991
1225Hut1544 443 616 589 616 687 1258 2063 955 980
1104Hmu1512 423 588 540 541 653 973 955 1938 1230
1176NP1142A 501 602 577 622 693 991 980 1230 1903

346 symbols
consensus       ----------------------------LRPIERVHIAPLGYERDRIVEPAREHRADRVY
#oth            11111111111111111111112334552565422132.212.41.1561264652.412
rrnAC2386       ::::::::::::::::::::::::::MT:QTPL::::::Q:::EE::YK::I:S:::V::
HVO_B0131       ::::::::::::::::::::::::::::MKRHL::::V::WR:H::::G:IEDD:P:K::
Hmu0971         ::::::::::::::::::::::::::::---------M:V:::N::::LS:QRFS::::V
Hut2963         ::::::::::::::::::::::::::::MDVP::::LM:V:::N:::AL::ERL:::::V
Hbo2358         ::::::::::::::::::::::::MDSG:PSGR:::::::::::::V:::V:TEV::V::
rrnAC0338       ::::::::::::::::::::::::::::MDQ:REI::::::H:::::A::IHQ:N::D::
Hut1544         VNELEVRREGSVSTTTETFLTIGVGICDMQ:::E::VV:::::H:::LS:I:::D:::::
Hmu1512         ::::::::::::::::::::::MHGSDS::SV:E:::::::::Y:::GD:VV:YGV:TLH
NP1142A         ::::::::::::::::::::::MRSETE:::VQE::V::V:::Y:::KR::L:YG::TL:

consensus       LL-------------------------ATDDEREHTSYQEAVVEELD----AAGIAVETR
#oth            ..1111111111111111111111113554455753513331252131111361454576
rrnAC2386       :::::::::::::::::::::::::::V:E:DEQSNQC::::EQN:A::::D:::ECKET
HVO_B0131       ::::::::::::::::::::::::::EHE:SAV:RPT:H::::DRIA:::DVV:SPPDVE
Hmu0971         ::::::::::::::::::::::::::::Y::QTP:P::S:T:R:R::::::G:::DH::I
Hut2963         :::::::::::::::::::::::::::QYT::TD:P::ADI:RDR:::::::T::TH::V
Hbo2358         ::VNDPNRTDDDHGDVDTDADWSSPDTENVSWSSS:A::L::R::::EFCD:R:VP:---
rrnAC0338       ::::::::::::::::::::::::::T::TELSRL:P::Q:L:K::::::::N:VS::LH
Hut1544         ::::::::::::::::::::::::::A:AHQD:HL:P::::L::::E:::::DSR::AF:
Hmu1512         :::::::::::::::::::::::::::-::S:L:T:G:H:RLER::T::::DH:V:LAYH
NP1142A         :::::::::::::::::::::::::::-RER::TEL::HDRL:T::T::::DR:MT:RS:

consensus       ECDLFDMYDVLGTVTTLAAEHADDIVRVNVSSGPKVAAVGAAIACMA--TDATPYYVRPE
#oth            6511314111224223235515225.3..2221313211.223...31112.32.3.431
rrnAC2386       V::I:::SESMQ:ISG:IQD:R::N:K::I:T:S:IT:::GTF:::M::YG::::::QA:
HVO_B0131       YL::::::E:M:A:::I:DW:P::F:::::TA:T:R:::::TM:::DEH:::E::V:D::
Hmu0971         D:NI::F::S:::IAE::TQF::HD:Y::LAT:S::T:I:GM::::::::G:::::::A:
Hut2963         A::I::L::SI:::AR::S:FEESD:Y::LA::S::T:I:GM::::::::G:::::::A:
Hbo2358         --:IHNV:::M:VT::I::A:D::Q:F::I:::TN:::::::::::T:::A:L::S:E::
rrnAC0338       RA::H:L::::AE::::T:D:PE:::::::::::::::I:S:::::::::A::A:::H::
Hut1544         :T::A:I::::AV:::V:::::E:V:::::::AG:L::I:S::::::::::::A:::HV:
Hmu1512         :T::D:V:::::RI:::ID::QG::::::::::::L:T::::L:::::::::SG:H::TA
NP1142A         :V::D:::::::E:::IVHG:DG::::::::::::LST::::L:::::::::SG:H:H::

consensus       EYAHELDADPVTEGVAEAEELPSYPIEAPSRDQVAVLDYLDEQDTDA-YTAKKRDLIEFA
#oth            52434235513241457354113.121423421.321332534432314433124.1422
rrnAC2386       D:GE:T----:SV::KDSF:::A::::P:EPEF:SI::F:E::RSEG:NKV:I:::NT:V
HVO_B0131       VRP:G:::-:::::F:Q:SL:TT:Q:DS::P::::A:AIIEAH:::::KH:::KT::TE:
Hmu0971         R::A:T:G:-:A::IR:VT:::T::MDH:DPQ::::MAH:---EAEG:-GVT::A::D:G
Hut2963         R::A:T:G:-:A::::KIA:::T::MDS:D:Q::::M:F:---:S:G:-P:A:::::A:G
Hbo2358         S:G:DVEDE:LSN:::SIDRV:D::::::T:E::HIMG::Y::TVENP::LN::S::QR:
rrnAC0338       :HVPSVA:E:L:R:MER::V::::::::I:::::::::::KRTN::T::::::S::::::
Hut1544         :HVPD:ESN:R:R:FE:::V::::::::V:Y:::::::::A:TN:::::::::S::::::
Hmu1512         :HL:PVAET:Q:GETIM::Q:::::L:T:TT:::RI:N:V::H::A::H:PN:SE::D::
NP1142A         TR::P::EQ:R:::MQF::Q:::::L:T:TE:::R::::I:RR:SET:::P::S::::::

consensus       EDEGLPFL--------TDADPANRKAKYALLNARILDPLEEDGYVAVEPVGRTKRVSLTE
#oth            33321413111111115453343433413312342431.546.12543531332324..1
rrnAC2386       MEKEFDAV::::::::QGVERKDNDNI:DIVQEEYRE::SKE:FIREQ:YAGS:YIT:::
HVO_B0131       ARY::E:MRGRVDGEAD:Y::VT--GD:NV:DN:VTAT::HQ:::T:TQR:TRRYLE:::
Hmu0971         :E::::::::::::::AEH:A::::SQ:R::DSHV:S::A:T:::TITER::S:::E::D
Hut2963         :A:::::V::::::::-EGGADS::GQ:RR:D:::::::GAR:::DS:QA:::T:::::D
Hbo2358         N:Y::::::::::::::NYSTES:QSE:RR:D:A:I:::V:K::LRL::A:KQ:N:A:::
rrnAC0338       ::A::S:I::::::::D::::::E:::F:::::N:V:::V::::IE:ND:::::Q:A:::
Hut1544         :AAE:S:M:::::::::E:::::D:::F:::::N:V::::S:::I:::A:::Q:QID:::
Hmu1512         :R:::A:I::::::::S:S::::D:::F::::N::VE::L::::::::S::::::I::::
NP1142A         :::Q:D:::::::::::RSE:::D:::F::::N:::E::SAN:::HI:::::::Q::::D

consensus       TGENTLRAFRHKLD--------------------------------
#oth            4.63213111123444222211111111111111111111111111
rrnAC2386       K::Q::DFS::LV:::::::::::::::::::::::::::::::::
HVO_B0131       E:RQ:::::::RAESVVSDLEARTDDPSESVDFALDNPVDALVENR
Hmu0971         A:H:::::::YL::DA::::::::::::::::::::::::::::::
Hut2963         R:SD::::::YLIE::::::::::::::::::::::::::::::::
Hbo2358         ::ISVY:::Q::V:LE::::::::::::::::::::::::::::::
rrnAC0338       ::::V:Q::::::-::::::::::::::::::::::::::::::::
Hut1544         ::W:V:H::::::QDDS:::::::::::::::::::::::::::::
Hmu1512         ::G:A::::::::PAESDGE::::::::::::::::::::::::::
NP1142A         ::::A::::::::-::::::::::::::::::::::::::::::::