6 genomes BUD1466 6 proteins a Hsa Halobacterium sp. NRC-1 b Hma Haloarcula marismortui f Hvo Haloferax volcanii g Hbo Halogeometricum borinquense h Hmu Halomicrobium mukohataei i Hut Halorhabdus utahensis j Hla Halorubrum lacusprofundi q Nph Natronomonas pharaonis x Hwa Haloquadratum walsbyi - rrnAC2435 HVO_1935 Hbo1804 Hmu0310 Hut2097 - NP1052A -

Pairwise sequence scores
Consensus score	1193	HVO_1935	NP1052A	Hbo1804	rrnAC2435	Hut2097	Hmu0310
781	HVO_1935	1226	581	660	576	628	637
801	NP1052A	581	1232	680	544	655	610
880	Hbo1804	660	680	1260	665	703	678
845	rrnAC2435	576	544	665	1220	735	772
915	Hut2097	628	655	703	735	1238	779
889	Hmu0310	637	610	678	772	779	1202

171 symbols
consensus       --MEVAIISDTHVPSRAAAIPDWVRERIRAADHVIHAGDFDSRAALADVRDLA---ARLT
#oth            11122.221.1.111.153..222421123..1.2......1541222224211113411
HVO_1935        :::RL::L::::::G::DG::S::EATV:E::L:::::::::P:T:DRL:::S:::::FV
NP1052A         :::::::LA::::M::::::::::T:TVQS:::::::::::::P:YEELDS::::::S::
Hbo1804         MPA:L:VV::::I::::ER:::::A:::::::::V:::::::LD:YDR:VE::GGA:N::
rrnAC2435       :::D::L:::S:I:::EHE::PSF::::EV::::::::::::KG::::I:HM::::TE::
Hut2097         :::D::::::S:::::EP:::::ALD:::::::::::::::AS:::::::GA::::S:::
Hmu0310         ::::I::V:::::::::RR:::PF::::::::::L::::::AESTV::::::::::DT::

consensus       AVAGNIDP-AIDLPEVATVELGGVRFVVTHGTGPRAGYEDRVAAIVREAA-DGDAVGVAG
#oth            1.2..3.12331..22221213113......2.2351133.1.4313231132311112.
HVO_1935        G:S::V::PG::::F:EI::VD:LT::::::::T:T:::S:::KT::D:::GT:::::::
NP1052A         :::::M:H:GL:::T::::D:A:::::::::D::DE::KE:L:::TDTH::A:TT:::G:
Hbo1804         ::::::::RSF:::::T:FDVEA::::::::S::::::R:::::T:H:V:::S::ISIS:
rrnAC2435       ::S::::::Q:G:::R::::::::T:::::::::HQ:WA::::IA:::::::SN:I::::
Hut2097         :::::M::R:LG:::IER:T::::E::::::::S:HD::Q:::S::A:EGSE:PT:::::
Hmu0310         ::R::T::::VG::::::::::::S::::::::SKR:::::::RL:::HG:GT::::IS:

consensus       HTHEVLDTVVDGVRLLNPGSATAASPADEATMLTATVADGDLSVALHRE--
#oth            .1.123.3222.1.11...11.1.3.1333..212.131121213321321
HVO_1935        :I:::V:E::::::V::::T::::N:G:D:::MVG::T::SV::EVV:DD:
NP1052A         :::R::::E:::Y::C::::::::W::Q:E:::V::::G::VEL::R:GD:
Hbo1804         :::::M:D::::::::::::::G:A::::T::Y:I::EGS:V::T::::::
rrnAC2435       ::::QT:I:YE:::::::::V:G:::::RP:::::::E::T::::Q:EL::
Hut2097         ::::C:::T:::::::::::V:G::::S:::::::::N::::::TV:::SE
Hmu0310         ::::::::TRG::::::::::::::::TS:::::::A:::::T:RR:EL::