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6 genomes BUD1472 6 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi
-

rrnAC2721

HVO_0244

Hbo1253

Hmu3037

Hut0401

-

NP0120A

-

Pairwise sequence scores
Consensus score2353 NP0120A rrnAC2721 Hmu3037 Hut0401 HVO_0244 Hbo1253
989NP0120A 2223 847 865 952 824 853
1852rrnAC2721 847 2424 1861 1495 1471 1406
1829Hmu3037 865 1861 2410 1448 1417 1474
1726Hut0401 952 1495 1448 2390 1415 1498
1765HVO_0244 824 1471 1417 1415 2314 1586
1735Hbo1253 853 1406 1474 1498 1586 2315

330 symbols
consensus       MAGSRSVVIAALIANGAIAILKFIGFLLTGSAAMLSETYHSISDTGNQVFLLIGIRFSDR
#oth            112122..211.2.111..11..312.2.1111...11.1.1..1...111.2.1.3132
NP0120A         :VST:L::VVS:V:SA:::VA:::AW:A::N:S:::QV:Y:L::V:::LLF:L:F:L::A
rrnAC2721       ::::K::::::::::::::::::F::::::::::::::::::::::::::::::::::E:
Hmu3037         ::::K:::L:::V::::::::::V::::::::::::::::::::::::::::::::::::
Hut0401         V:N:::::L:::F::::::::::::::::Q:P::::::::::::::::::::V:::YGKK
HVO_0244        ::::T:::V:::F:::V::V:::L:Y:A:::PS:::::::::::::::::::::::D:K:
Hbo1253         :::::G:::::::::::::V:::L:::V:Q:PS:::::::::::::::::::::::Y:GK

consensus       EASRAHPFGYGKAQFFYSFLVSVLLFGIAGWESAKHGYNAIMHGGHGGGGHAG----FLL
#oth            22215....2..2.1111.1.112...11.111211.13212322133234212212333
NP0120A         G:::K::::R::E:YVFA:V:TM::::VT:YAAVRE::ET:GTPARDVDV---::::---
rrnAC2721       :RD:R::::::::::::::::::F:::::::::::::::QLTA::::::::::EAVE::F
Hmu3037         S:DQQ:::::::S::::::::::F::::::::::::::SQLTG::::::Q:::ETVD::F
Hut0401         S::::::::::::::::::::::::::::::::::::F:::::--:EAAALS:T:::VTQ
HVO_0244        GETQS::::H::S::::::::::M::::::::::::::D:L::P::::::E:-::::LV:
Hbo1253         :E::T::::::::::::::::::::::::::::L::::D:::::::AL::M--::::VT:

consensus       LGFTPPAW----WVNYTVLIGAILFESYAFYKARAEMRRQIDEYEWSGLREAFRKTSDVT
#oth            32344233111231.131.31123..32.14.13122222233331413311..211111
NP0120A         --------::::TI::I::GV:L::::A::::SYQAV:EEA:TEGFRS:FDT::RSK:AP
rrnAC2721       FS:Q::::LDPL::::::::::FV::T::LI::::::K::::RNN:::Y:::::::::::
Hmu3037         :SYA::G:LDPV::::::::::FV::AW:L:::::::K::MGDHD:TSY:::::::::::
Hut0401         F:M:V::I:::::::::::V:G::::GW::S::Y:G:QSD::::G:N:FL:::::::N::
HVO_0244        :::EIEPV::::L::VAI:L:::A::::::L::N::L::::E:::::::V::::E:::::
Hbo1253         A:Y:F:G:::::Y::VV::V:::G::::::K::A::L::::R::::D:IVD:::::::::

consensus       TLTAFTEDTIALLGAVIALAGVGLTDLTGNALFDAIAALLIGLLLMGFALALAWENKRLL
#oth            1...2..111.13.322..3.25.224...331.242122..21..11121....111.1
NP0120A         L:::A::NLV:VV:VLV:::::Y:::V:::TTY:::GSAV::::::SV::G::::SRG::
rrnAC2721       ::::L:::::::A:I::::V:LV:EQM:::PF::RVS:::::IM::::::::::::::::
Hmu3037         ::::L:::::::::I::::T:IT:EQ:::::V::QLS::::::M:::::::::::::::I
Hut0401         ::::::::::::I:L:L::G::F:::F:::P::::T:::::::M:::::I::::::::::
HVO_0244        :::::::::V::V:::L::::I:::E::::E::::G::::::I::::::I::::::::::
Hbo1253         :::::::::::::::G:::V::I:SEI::::VY:::G:VC::V:::S:SV::::::::::

consensus       LGESLPEDEEQRLRDIVRNHPGVAEIDDFRTVYFGPEEVLVAADVQFDPGLDTEEIDDHI
#oth            2..112431133.221134422.431221.1212..1311.33123.333.1.431134.
NP0120A         V::GVTRR:RR::L:AIAAAD::NAVV:L::MHL:::S::::CEID::ND:::RG:EAA:
rrnAC2721       ::::::T::::::::::MQNEH:D:VIG::::::::N::I:F::L::::A::::A:::E:
Hmu3037         :::::QP:V:AE::::::S::::TS:IG:::::::::::::T:::::ED::E:D:::ER:
Hut0401         :::::::S::K:::K:I:EWD:::::V::::::::::N:::SS::A:GS::::S:::T::
HVO_0244        I:::V:V::::A:::::K:D:R:VH::H::AS:V:::KL:::L::S:::E:::::L::::
Hbo1253         :::::::QV:KS:QS:::::::::HV::::::HV:::K:::T:::S:NS::E:ND::TD:

consensus       TAIEDALKAADPRIRKVYIEPEL-------
#oth            133.4333134432421.2.1.32122211
NP0120A         D:V:V:VRDVV:EANRI:V:A:SRPVTADR
rrnAC2721       :TL:S:MQDTNGD:::::::::::::::::
Hmu3037         ::::AQ:::TGAG:Q:::::::S:::::::
Hut0401         :DM:N:IID:Y:D:::::::::TKPSQDD:
HVO_0244        :E:::E:::::D:VHF::::::::::::::
Hbo1253         :E:::K:::E:K:VKF::L:::V:::::::