|
Pairwise sequence scores | ||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 3606 | VNG6313 | HVO_0548 | Hbo0984 | pNG7169 | rrnAC0143 | HVO_2093 | hla0977 | NP4702A | HVO_1262 | VNG2123 | rrnAC1870 |
2261 | VNG6313 | 3608 | 1900 | 1946 | 1907 | 2059 | 2025 | 1910 | 1956 | 1836 | 1804 | 1637 |
2597 | HVO_0548 | 1900 | 3624 | 2640 | 2065 | 2158 | 2213 | 2066 | 2061 | 2108 | 2006 | 1806 |
2598 | Hbo0984 | 1946 | 2640 | 3761 | 2061 | 2227 | 2224 | 2109 | 2167 | 2011 | 1905 | 1756 |
2532 | pNG7169 | 1907 | 2065 | 2061 | 3596 | 2549 | 2661 | 2061 | 2074 | 2033 | 1905 | 1834 |
2749 | rrnAC0143 | 2059 | 2158 | 2227 | 2549 | 3611 | 2710 | 2127 | 2188 | 2028 | 1980 | 1814 |
2724 | HVO_2093 | 2025 | 2213 | 2224 | 2661 | 2710 | 3607 | 2212 | 2150 | 2140 | 2029 | 1991 |
2777 | hla0977 | 1910 | 2066 | 2109 | 2061 | 2127 | 2212 | 3596 | 2660 | 2466 | 2339 | 2145 |
2681 | NP4702A | 1956 | 2061 | 2167 | 2074 | 2188 | 2150 | 2660 | 3543 | 2438 | 2261 | 2035 |
2603 | HVO_1262 | 1836 | 2108 | 2011 | 2033 | 2028 | 2140 | 2466 | 2438 | 3591 | 2250 | 2151 |
2535 | VNG2123 | 1804 | 2006 | 1905 | 1905 | 1980 | 2029 | 2339 | 2261 | 2250 | 3664 | 2134 |
2289 | rrnAC1870 | 1637 | 1806 | 1756 | 1834 | 1814 | 1991 | 2145 | 2035 | 2151 | 2134 | 2937 |
526 symbols consensus -MMLEFEPRTYDDIDPDRRPSLAAALVPVLGMLVFLGVGSAVLGLDPQFPLLWGIAFTGL #oth 135552324433233445212274114125333431331546321222711322152215 VNG6313 :-:V:::::S:E:F::EK:::FGQ::L:IA::IT::A::IVL::::A:M::::::::::V HVO_0548 MAT:S:::L:::::PEAE:::::Q:::::V::::::S::VIW::::::L::::::IL::A Hbo0984 MAT:S:::L::G::PE:E:::FR::::::F::::::S::AIA:D::::L:::F::::::I pNG7169 ::SS::DIKL::::::ED::::VE::I:II:::TA::I:IGIY::::::::::::::::: rrnAC0143 :-:V:::::LF:::::SE::::G:::::IA::I:::S::LIAFD:::::::F:::::::: HVO_2093 ::G:A::::L:EEL:A:D::::LE:::::F:::::::::IV:Y::::::::F:::S:::: hla0977 ::ARS:T:T::E:L::::::::::::I:::AVVA:::I:::::::::HP::::S:::V:G NP4702A ::A:D:T:K:V:::A:E::::FRL::A:::AVVL:::::::::::::HV::::S:V:::A HVO_1262 MGTDRYT::S::::A::Q::::KQ:::::::LVA:::L:::W:::::HI::I:S::LV:: VNG2123 :-:SD:T:LA:E:::DA:K:T:TE::::::VVV:S:::::GY:::A:HA::::S:T:::: rrnAC1870 :----------------------------------------------------------- consensus FGRYWLGYSWEELYDGIANGLLMGLQAILILFTIYALIATWVAAGTIPGLMYYGLELLSP #oth 4333542441643342276326..23121.2121.21111.24.....421.2..3312. VNG6313 IA::GW::T:D::F:::S:SIV:::G::F:::I::M:::S::D:::::FI::W:::F:T: HVO_0548 V::::::LP:TR:SA::RD:IN:::S:L:::LVV:M::S::T::::::A:I::::DF::: Hbo0984 V::::Y:TT:AKM:E::VD::R::M:::::I:V::M::S::TG:::::S:I::::::::: pNG7169 :SYFRFDI::D:M:S::THT::::I:VVF:::IV::::S::IQ:::::T::::::D::H: rrnAC0143 :A::H::L::S:::::::SS::::MRV:::M::V:::::S:IQ:::::S:::F::::FT: HVO_2093 :S:::::I::A::::::TDS:H::I:V:::M:VV::::::::::::::S::::::D::T: hla0977 ::-L::::D::::F:::::::V:::::L::I::::G::::::S:::::::::::::I::: NP4702A ::Q:-:::::PD::E::S::::::::::::I:::::::::::D:::::AM::F::::::: HVO_1262 L::FVW::T::D::E::ERS:A:::::::::::::GVVS:::::::::T::::::D:::: VNG2123 :A::H:::D::RVS:AALA::R::::::::::V::G:::::TS::::::::::::GA:T: rrnAC1870 ----------------------::::::::::I::G::::::S::::::::::::SI:T: consensus AVFLPVAAILAAVVAFAIGSSWTTAGTLGVAFIGIGSGLGIPEPMTAGAILSGAYAGDKQ #oth 72.1.3112234222111.....1111..1111...2...31511.1..121.1.2...1 VNG6313 :::V:L::L:SF:::T::::::::::S::I:LV:::::::::A:L::::::::V:M:::: HVO_0548 :::::::TL:S:::T::::::::::A::::::::::::::M:DA:::::V:T:::T:::V Hbo0984 SI:::I:T::::::::::::::::::::::::::::T::::::::::::V:T:::T:::V pNG7169 I::::LT::IT:AIT::::::::A::::::::::::::::L::::::::::T:::T:::: rrnAC0143 M:::::::::S:IIS::V:::::::::::::L:::::::::S:::::::::::::T:::: HVO_2093 TI:::IT:V::SI:T::::::::A::::::S:::::A:::::A::::::::::::M:::: hla0977 TT:::A::VV::::::::::::::V:::::::V:::A:::V:A:::V::V:::::::::: NP4702A R:::::::::::::::::::::::V:::::::V:::T:::V:G:::V::VI::::::::: HVO_1262 Q::::AT:L:VGIAT::::::::AV:::::::::::::::V::::::::::T:::::::: VNG2123 ::::::T:::::::::::::::::V:::::::V:::::::::L:::::::V::::::::: rrnAC1870 D::::AT:L::M::::S:::::::::::::::::::::::V:T::::::::::::::::: consensus SPLSDTTNLAAAVTNTDLYDHIRAMRAGTAIAFGLSVVLYAVLGLRA--SGAIPAG-RIA #oth ..1....1..11.1122.42.123.16215313511122134.1251224.432431311 VNG6313 :::::::L::SG:SDV::W::V:G:FPN:I:VGVI:LA:::::::M:ETG:TGGT:AEV: HVO_0548 ::F:::::::::::::E:LT:V:T::V:::::LAI:L:A::A:::T:::::S::::::V: Hbo0984 ::::::::::::::::::MT:V:T::V::G::ML::LA::TY:::T:::T:N::P::::: pNG7169 ::::::::::S:::::::::::N::::::FL::SIA:::::G::I:::::::::VD:::: rrnAC0143 ::::::::::::::D::::E::N::::::LA::TIA:::::G:::::::A:::::N::V: HVO_2093 ::::::::::::::::::F::VN:::DSSLV:::IA::::::::VQ:::::N::V::::: hla0977 :::::::::::G:::::::T:::R::T:::V::::A:LGFLA:::::::::E::V::::: NP4702A :::::::::::G::::S:::::YR::T::::::::A:LGF:A:::Q:::G::V::D:::: HVO_1262 ::::::::::::::::::::::::::N:::V:::::L:GFVI:S:GI::T:T:::::Q:: VNG2123 :::::::::::::::A::::::NG::L::::::::::LA:::::VLIVDG::A---:NVT rrnAC1870 ::::::::::::::::::::::::::N::VL::::::L:::::::::::V:E::T:::V: consensus EIQGALAGSYAISPLVFLPLVVTFGLALRGYPALPTLVAGVFAGAFTSILVQG----AGF #oth 411222511142221213.132..2..33.22.113133.21112513433..121263. VNG6313 Q:::G:::T:TL:V::L::::I:::::IK::::::S:G::::SA:GV:::I::::::R:: HVO_0548 :M:A:I:::::VT::::A::::::V::::::::::SI::::V::T::QLF:::PVSVDT: Hbo0984 :::T:IS:T:TV:::T:A:::L::A::::::::::AITS:::::VA:Q:F:::PISIE:: pNG7169 :::T::T::FT::::A:F::L::::::IY:IS:I:A:G:::::::I::AVL::::::NS: rrnAC0143 S::A:IEST:VV:::::::VI:::::::::I::::::GT:::::VG:AM::::::::T:: HVO_2093 ::::::T::::::V:T:A::::::::::Y:V::::::G:::::::L::VVM::::::TA: hla0977 D:::::G:T:::TL:A:I:::::::::::::A:::::::::::::I:T:::::::::S:: NP4702A :::T:VD:T:NL:LF::A::AI:::::::::::::V::V:T:::VC:A::::::::::A: HVO_1262 :::T:::S::D:TL:A::::A::::::AA:::::TV:L::A:::::::::::::::::S: VNG2123 A:S:P::::::LG::::::::::::::F:::::::S:::::::::L:T:A::::::::S: rrnAC1870 ::::::::::DL:V::L:::I:::::::Y:I::::::::::::::::T:F:::::::RS: consensus VAAWNVAQSGTAP----------ETGSELVNNLLASGGLTGSAWTITVVVAALSLGGLLE #oth 361153244..31111111111121.322.14..412.36.12.32112311.31..21. VNG6313 AE::QIIY:::G:::::::::::K::VD::::::ST:::E::I:V::I:FG:::I::I:: HVO_0548 :G:::::FA::::::::::::::S::V:T:DS::::D::L:::::M::IL:S:::::I:: Hbo0984 :R:ME:::::::AGSGAGLAAEFK::::I:::::FTE::I::S::::::::::A:::I:: pNG7169 TSV:T::::::S::::::::::::::M::::G::::::MV:G::AV:IAI:::A::::F: rrnAC0143 G:::SA::::::::::::::::::::M::::G::E::::::G::IV:IAI:::A:::::: HVO_2093 G:V:SI:::::S:::::::::::S::M:::DG::::::MI:G::VV:IAI:::::::M:: hla0977 :::::TFMY:::::::::::::::S::D:::E:::T:::::::::::::::::A:::I:: NP4702A :P::E:FM:::::::::::::::::::::::D:::T:::::::::::I:::::V:::::: HVO_1262 :T::QTFM:::G:::::::::::::::::::S::::::VS::::::A::::::T:::::: VNG2123 T:::DIFLN::T::::::::::::::::::::::TT::IA::::::A::::::::::::: rrnAC1870 T:::T:FLD:::::::::::::::::TA:::D::::::IS::::::A::::::::::::: consensus RTGVLAVLAHHLGRAVRSVGSLTAGTAVSAISMNALAAQQYMSIVVPGMTLRNLYDEFGL #oth 41.2121121335544612331233.2222453.222.2..2...2.131114112131. VNG6313 A::::S:I::NTAK::D:::GA:LV::LGPLVI:::T:D::::::I::::F:D:N::YD: HVO_0548 :::CI:::::::R:VLT::A:::V:::A:SLA:::I::D::::::::::SF:G:::D:D: Hbo0984 :::::::I:Y:I:ESLH::::::::::L::FG::I:::E::::::::::S::G:::D:D: pNG7169 C::II::::::::QLSK::::::GI:VL:SV:::V:::E::I::::::V::GS::E:K:: rrnAC0143 :A::::::S:::::LCH::A:::GV:::::V:::I:::E::V:::::::::G:::N:Q:: HVO_2093 :A:I::::::::::LS:G:A:::GV:::::V:::V:::E::I::::::I::::::E:Q:: hla0977 :::::::I::SFTSS:K:P:A:V:::G::::VI:::T::::::::L:SV::::T:::::: NP4702A H:::::::::::SQG:Q:S:G:I:::G::::LI:::T::::::::L:::::::::E:::: HVO_1262 Q:::::::::R:Q:GI::PRL:V:S:G:::MLT:::T:::::::::::::::DT:::::: VNG2123 :::::PT:T:::T::IW:PE::V:::G:A::AT::FS::::::::::SVS::T::::YD: rrnAC1870 ::::::::::::AT:::GPR::VV::G::::FV::FS:::::::::::L::::::::Y:: consensus DSRNLSRAIEAAGTPTGALIPWHAGGVFMAGVL-----GVPTLQ-------YAPYYFFGF #oth 5354..112.22..212122..32.121.332211111114234111111111.1.2213 VNG6313 :GTS:::TL:ET::VSEPM:::NS::::::SA:::::::::V:S::::::::L::::V:I HVO_0548 E:::::::::S:::T:S:::::GT::AY::D::::::::::::::::::::::::::L:: Hbo0984 ::::::::V:::::T:S:::::N::::Y:VS:::::::D::VCSGAWCLDG:::F::L:: pNG7169 KTE:::::::SS::V:S:::::NS:A:::::T::::::::S:F::::::::::::::L:: rrnAC0143 K:Q::::::::S::T:S:::::SS::L::::T:::::::::::E:::::::::::::::: HVO_2093 Q:E:::::::S:::T:S:::::NS:AL::::T::::::::G::E:::::::::::::::L hla0977 ::DQ::::V::::::::::F:::::A:Y::::T::::::::::E::::::::::::L:A: NP4702A ::DE::::V:::::::::::::::::::::SAT:::::::A::S::::::::::::L::: HVO_1262 ::SD::Q:::S::::::::L::::::AY::::::::::::S:::::::::::::::M::Y VNG2123 NE:D::::V::::::::PFF:::::A:::T:A:YTSQP:AISWW:::::::W:::::::I rrnAC1870 S:DD::Q:::S::::::::F:::::A:Y:SA:F:::::::G::A::::::::::::::A: consensus LSPLVLFAMGLTGWRITYQ-------PATDPGAAGAV--AAAADDD #oth 1..221354333.445664111111553585485367113474331 VNG6313 :::ILVVI::F:::KMYMK::::::D:EES:EESADT::::----- HVO_0548 ::::I:V:I::S:::V:E:::::::GSD::A:LR::::::SFG::: Hbo0984 F::TI:IL::V::::::T:::::::SED:TV:IK:::::ESLG::- pNG7169 ::::I:IL::V:::Q:::T::::::EAEA:DHMTSN:::::P::S: rrnAC0143 ::::::LF::V:::Q:V:ADRADSEE:::G::G::--::SVT:GE: HVO_2093 ::::::LL::V:::Q::::::::::::GEA::D::DRRGSPSST:: hla0977 :::::::V:AA::YSLNVT::::::PA:DRAP::DEP:::V:T::: NP4702A :::::::::A:S:RGVPTT::::::SRDEH:HR:D--::------- HVO_1262 ::::::::FV:A:VGFS--:::::::-GNGTAQP:RA:::P::::: VNG2123 :::::::GLV:A:RGYDRA::::::GS::Q:A:PA:N:::::T::: rrnAC1870 ::::I:::TT:F:G:YD--:::::::-GSEQADSATS::S:V:::-