| |||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 5429 | NP2676A | HVO_0176 | NP0042A | rrnAC0759 | Hmu0460 | hla0598 | HVO_2500 | Hbo2182 |
| 2867 | NP2676A | 5355 | 2446 | 2501 | 2603 | 2216 | 2271 | 2414 | 2540 |
| 3937 | HVO_0176 | 2446 | 5434 | 3959 | 3929 | 2813 | 2764 | 3247 | 3135 |
| 4082 | NP0042A | 2501 | 3959 | 5540 | 4169 | 2893 | 2916 | 3208 | 3335 |
| 4166 | rrnAC0759 | 2603 | 3929 | 4169 | 5498 | 2782 | 2987 | 3210 | 3441 |
| 3653 | Hmu0460 | 2216 | 2813 | 2893 | 2782 | 5409 | 3462 | 3251 | 3387 |
| 3795 | hla0598 | 2271 | 2764 | 2916 | 2987 | 3462 | 5729 | 3384 | 3623 |
| 4140 | HVO_2500 | 2414 | 3247 | 3208 | 3210 | 3251 | 3384 | 5449 | 4076 |
| 4305 | Hbo2182 | 2540 | 3135 | 3335 | 3441 | 3387 | 3623 | 4076 | 5454 |
817 symbols consensus MS-DEELAKDLGLLAALTIGIGTMIGAGIFVLPGEAAAIAGPVVVVSFVVGGVIALFNAL #oth 12122...1.11122.211.1.......1....2313562.132222.221.2112211. NP2676A :::-D:::T:IT:TG:VAV:V:::::::V::::SLVV:EI:::L:AA:LLA:LV::L:G: HVO_0176 ::::::::::::::S:::::::::::::::::::V::ST::::::A::::::L:::V::: NP0042A :A:::::::::::VS:M:::::::::::::::::V::HD:::I:::::IF::FV:MV::: rrnAC0759 ::::D::::::::VS:M:::::::::::::::::V::NA:::::::::::::L::MV::: Hmu0460 :::E::::::::P:::::::V:::::::::::::::ILKS:SLAP:A::L:::::M:T:: hla0598 V:G:G:::::::P:::::::::::::::::::::T:V:R:::LAALT::L:::::::T:: HVO_2500 :T::::::::::PV::::::V::::::::::::R::YG::::A::L::::::::S::T:: Hbo2182 VT::::::::::P:::::::V:::::::::::::::::::::::A::::::::VSI:T:: consensus SASELGTAMPKAGGGYYYVNRALGPLFGSIAGMGNWMGLAFASAFYMIGFGQYLATLVGL #oth 11........21..21311122...1..11..311.1..11.1...43...512453143 NP2676A VV::::::::A:::SHHW:T:T::::::TV::VAD:L::TV:T:::AL:::V::DVV:E: HVO_0176 :V::::::::::::::-:::::::::::::::L:D:::::::::::S:::::::::::PM NP0042A :V::::::::::::::::I:KS:::M::::::::D:::::::::::C:::::::V:F::: rrnAC0759 :V::::::::::::::::I:KS::::::::::::D:::::::::::C::::::::VF:P: Hmu0460 ::::::::::RS::A:::::H::::::::V::WA::L::::::::::V:::R:I:RIF:: hla0598 :::::::::::S::A:F::::::::M:::V::WA::L::::::::::Y:::E:VNA:::: HVO_2500 ::::::::::::::S:::::H:::::::::::::::::::::::::V::::DF:VSV:SI Hbo2182 ::::::::::::::S:::I:H::::::::::::::::::::::::::L:::GFIIE::NV consensus P--VGLGVVSLSPVQVGALLAGAIFIAVNYVGAKETGGLQTVIVIILLAILTVFTILGFL #oth 213233242314431331231115.132..2..11..531321.551241.221234.43 NP2676A ::AIAF:::::::T:F::V:::LG:V:L:::::RV::WTEIAL:GFVVTV:V:LAAE:VR HVO_0176 :::---EFLF:NE::::::V:::V:VG:::I:::::::V:::::TV:::::AL:AVQ:W: NP0042A :::---SLLI::EI:::::I::::::VI::I::::::NI:::::T::::::::L::V::F rrnAC0759 :::---E:AF:N:I:I:::I:::::V::::I:::::::V:::::F:::S:::::AVA::F Hmu0460 SGS::V:P::ITV:KLT::AG::F::LI:::::::::R::N:::VL:IG::::::F::T: hla0598 D:P::::P:T:EAA::IG:AGALL::::::F:::::::I:I:::MS::G::A:::VV:L: HVO_2500 ::A:S:::::::S:::A:I:::LL::G::::::::::A::V::::T:VV:::A:S::::: Hbo2182 ::SI:::ILT:A:T::A::::::T::G::::::::::T::NI:::T:V::::::::::LT consensus SADLATLRG--------PFAPF---GYGAILPATALVFVSFLGFAKIATVAEEIKNPGRN #oth 632443131321111112312622123332.23.111...1..11111211..111.111 NP2676A TGR:GDVA:::::::::A:---::::GD:V:T::::::::Y::Y::V:ALG::LV::SKT HVO_0176 :F:V:::V:DG::::::GI:::::::::::::G::::::::::Y:::::::::L:::::: NP0042A :F:YG::V:EGLPAEQAG:::VATG::::::::::::::::::Y:::::::::L:::::: rrnAC0759 AF:Y:::A:AD::::::GL:::::::T::::::::::::::::Y:::::::::L:::::: Hmu0460 R:EPSN:--:::::::::A:TD:::-VVTT:ET:G:I:::Y:::VQ:TS::::::D::K: hla0598 N::MES::-:::::::::I::P::GTTSQV::V:GII:::Y:::VQ:TS::::::D:::: HVO_2500 E:::T:::-::::::::::::SELG::::V::G::::::::::::::T:::::::::::: Hbo2182 MT::S:::-::::::::::::N::::::S:::G::::::::::::::T:::::::::S:: consensus LPLAVIGSVVIVTVIYAILMVVMLGVVP---WPEL--SDAAPVIQAAQLAFP-----IGG #oth ..2.12..121..23.12324224211311134213234432353122241432222533 NP2676A ::R::L::I:V::LL:TV::L:VD:::D:::YDA:::A:E:AILA::EAL:-:::::--- HVO_0176 :::::::::A::::L::::VSI:::::::::::D::::QS::LT::T::::::::::-:: NP0042A ::I:I::::A:::::::::VT::::::S:::::::::::S:::D:V:RV:::ESIGP::: rrnAC0759 ::I:I::::G:::::::::VSM::::::::::::::::QD:::A::::::::ESIGP::: Hmu0460 ::R::::::::::::::LVL:I:SAA::QGFIADIIS:::ENP:AVVEVG--:::::NYI hla0598 :::::L::::::::V::LFL::L:AA:::::-T::VANNETA:VD::R:L:GNYSVFGYS HVO_2500 :::::V:::::::TM:::::I::AS:K:::::Q::SAAG:D::VEV:::S:ES::::AL: Hbo2182 :::::V::::::::M:::I::MLM:::N::::T:::AQSTT:::DV:EVV:SN::::TL: consensus LGALGAAVILFGGLLATASSANASILASSRINFAMGRDKIVTNWLNEIHPRFATPYRSIA #oth 3133223343311.1.111...1.111.1.11.1...22211321131.1112...1113 NP2676A -:TV:V::FALV::A:M:T:::V:VA::::VA:G:::MGL:AG:FDNV::::S::::ALQ HVO_0176 :AG:AVT:VTL:A::::V::::::::::A:::::::::RV::::::::::NY:::::::L NP0042A VATAA:::MTV:A:::::::::::::S:A:::::::::::::::::::::NY:::::::L rrnAC0759 VA:GA:::MTV:A:::::::::::::::A:::::::::::::::::::::NY:::::::L Hmu0460 Q:::MGGAL:::::::::::::::::::::::::::::R:::PA:::::::YG::::A:S hla0598 :::V::GML:I:::::::::::::::S::::::::::E::::PK::Q::D::G:::K::: HVO_2500 ::G:::GL:I:::::::::::::::::::::::::::::L::A::::::::::::::::: Hbo2182 ::V::GSL:::::::::::::::::::::::::::::::LI:A:::D:::::S::::::: consensus VTGALILVFIVALG-DIEVLAKAASVLHLIVYGLLNAALIVMRESDVPEYDPDFTVPLYP #oth 2..3312221233123234.1421.2...12.2.1132.1.2.243322.2.2.3..2.. NP2676A :::::VV:-L::V:::LLT::VL::A:::VG:T::A:S:V:V:Q--::D:E:::R::A:: HVO_0176 ::::V:IL::A:::R::::::::::::::V::A:M::::::F::T:-:::::A::::::: NP0042A L::GM:::::IL::QS::I:SQ::::::::::A:M::::::F::A:::::::::R::::: rrnAC0759 :::G::I:::AF::R:::::::::::::::::A:::VG:::F::T:A::::::::::::: Hmu0460 I::G:::L:::-I::::TL:SG:::G::::I:::::L::::::YVNPE::T:E:V::::: hla0598 L::::::::L::G::-V:S:STMG::::::::::::I::::::::E:EG:::::E::F:: HVO_2500 :::FI:VFSL::VD:::K:::::G:A::::::::::L:::::::::A:D:::E::::::: Hbo2182 :::V:::L::A-V::NVK:::::G::::::::::M:I::::::::::AD::::::::::: consensus ITPILGAVLSFGLIAFMDGIEIALSAGFVVGAVVWYLLYARGKTDKQGVLSKYILDRSEE #oth 321131433.21.243335432212322233223..22.1.442244.2.332233.323 NP2676A LVALAA:GA:VA:VFA:GLDVV:VTVAIG:::IG:::::G:HYATEE:L:P::LGQ:A:: HVO_0176 V::LV:MA::L::L::VG:E:LL::GL:::::::::FV:::NNA:R::L:GRH::S:GD: NP0042A ::::A:I:::L::VLVVG:::L::::L::L::IA::F::::HH:E:::::A:H::E:G:R rrnAC0759 ::::::::::L::V::::S::::::::::LV:::::FV::::::TQK::::D::S::E:Q Hmu0460 LL::::V:F::A:LV:VAEDALL::F:IAAA::L::G::::SR:E:::I:::H:IS::D: hla0598 :V::I:TLS::A::VYIEPRI::::::L:AF::L:::::::::VESR:::GAW:::::DD HVO_2500 ::::::::F:::::::L:P:::G::VL:::FGI::::F:::ER:::R:I::R:V:S::S: Hbo2182 AV::::::::::::G:::DK::::A::::I:SLA:::V:::::A:ES::::D:::::::R consensus LPDAAVSAATAVQPNGGG-------YRVMVALANPRTERDLITLASALAKQRDGTVLATH #oth 1.44112.16312.314411112234121.111..23.52.22.13.2.24421311111 NP2676A ::PL:A::VK:AR:ETV::::::::H:TL:::S:::::A::MA:GC:I:AAE::E:::V: HVO_0176 ::NTV:D::AT:A:::S:RIDDAPATTT:::VS::::::A:V:::A::::FDG:R::::: NP0042A M:SPV:D::E::A:::SA::::EESRTI::::S:::::SA:V:::G:::::Q:AD::::: rrnAC0759 :::QV:N::D::A:::A:::::::GPTI::::::::::SA:::::::::QHE::R::::: Hmu0460 M::::::::VG:::D::Q::::::::::::P::::EN:Q::::::::I::::G:::V::: hla0598 ::K:::::::S:::S:DD::::::::::::P::::A::EH:::::::I::::N:::V:VN HVO_2500 M::::::::ST:::D::-::::::::::::P:S::ES::::VS:GG:V::ANG::LVGV: Hbo2182 M:::::::::S:::D::Q::::::::::::P::::AH:T:::::::::::S:::::V:V: consensus IVQVPDQTALEAAADRRDRIDAESERLLADARADAETFDVDIETHTILSHRGFEEVFDAA #oth 1331.1.12.1313345142323233.125.23.22411.111.3112..334111.11. NP2676A ::TL:::VP:ARGPTYL::V:EDPRA::DT:SE:S-IL::PV::RV:Y::QAV::::AT: HVO_0176 VI::::::S:A::D:Q::::SKA::::M::::::V:QL::PVD:R:::::E:LA:::::: NP0042A ::::::::::::::::-:D:G::::::::::K::::A:::::::K:V:::::I::::::: rrnAC0759 :AT::::::::T::AN::::::T::S::DT:K::::A:::P:::K:::::::I::::::: Hmu0460 ::T::S::::A:::::S:E::KT::::::N::E:::::G::V::N::V::KSY:AI:::: hla0598 :AN:::::S::::R::GAH--EAAHD::DK::D:::::G::V:::VV::::V:::::::: HVO_2500 ::K::::::::S:REEY:F--::AD:::EQ::V::DEL::::::::V::::S:::::::: Hbo2182 :E:::::::::S:RE:G:F--E:AD:::ER::E:::::::P::::::::::S:::::::: consensus RTYGADLVVMGWGGDSHGAPGRAESALDELAHDLPCDFLVLKDRGFDPSRVLVPTAGGPD #oth 13541.411..222234222..111241.11421.2.21.132221.2.5112..1.143 NP2676A :RAD::S:::::R:RPTFIS:::A:VA::::::::::T:::::E::::::IVI::V:TDN HVO_0176 :QH:V:R:I::HS:-AKL:G::V:G:::::T::::::VV::DGEE::::E::L:::::HS NP0042A :SS:::T::::Y::-TRL:G::V:G::::::Y:::::::::NE:E::::K::L:::::YS rrnAC0759 ::NH::T::::Y::-TQF:G::::GT:::::::::::::::DGQDL:L:D::::::::LS Hmu0460 :SQT:::::::::P:A::S:::::::M:::TESV::::::FR::::::::I:L::::::: hla0598 :::::::T:::::E::::::::::::V:::::S::S::::FR:::::A::I::::::::A HVO_2500 E::N:::::::::P::::S:::::::VE:MTNA::Y:V:::::::::::N:::::::::: Hbo2182 :::D::IT:::::P::::::::::::I::::SS::::::::::::::::H:::::::::: consensus SDLSAAVARALQETFDAEVSLLHVAD---DRAAGRQFLEEWADEHGLSDAELLVETG-DV #oth 13.1151.34.2234244121.2.311313523.24.242.14421.5111331221211 NP2676A DA:C:G:::V:::::NTT:T::::V:GEGK:RG:ER:::D:::T:D:-:::TI:D:SG:: HVO_0176 :::::E::::::A:T::HI:V::::::::EV::::G:::Q:VA::D:HGV:Q:::::::: NP0042A :T:::D:::::RD:L::D::V:Y::::DG:TE:::E:IT:::TNQ::E:::::::::::: rrnAC0759 ::::::::K::E:::GVA::::::V::PGEEES::::MY:::A:::::::::RI:::::I Hmu0460 :E:::T::KL::AEY:S::T::N:DE:::N:E::A:::::::V::::T:::R::KS:::I hla0598 ::::G::::M::AE:GG::T::::::::::E:E::A::S::::Q::::::T:RI:S:::: HVO_2500 :::::SI:SV:R:FC:::IE::::::::::A:E:ER::R:::::RD:GG:T:T::::::: Hbo2182 ::::::::VT:R:QY:ST::::::T::::NK:E:E:::T:::ES::::::::I::QSVN: consensus EAAIERAARDATLLIVGATERGLLSRLVRGSLVLDVVDDVDCSVLLAERPRDRSLRERLF #oth .44.33213.4111211..13...2.1.2211231.2231112..1..3434.1132..1 NP2676A :R::AE::A:H:M:LIS::::::::::::RT::Y:::EE:::T:::::::GT:::::::I HVO_0176 :TV:GE::A:KS:VL:::::T:::::::G:::A:S:L::LETT::::::::R:::::::: NP0042A :S::::::T:R::VV::::G::::A:I:G:::TFS:LEEL:T:::M::::E::::L:::: rrnAC0759 ::T:::LG::YS:V::::::::::::I::::::F::IETL:TP:::::::SS:::::::: Hmu0460 :T::RN::D:::::LI::::E:::R:::SK::::::::::E:::::::TH:::G:L:::: hla0598 ::S:::::::::M:::::::K:::::::S:::::::LNE:E:::::::KRG::GIVG::: HVO_2500 :::::SH:T::S::V:::::::::::::G:TV:M::::::E::::M::QS:A::I:K::: Hbo2182 :EG:::H:::::M::I::::::::::::::T::::::NK:::::::::QT:S:::K:::: consensus G------------------------------------ #oth 1231111111111111111111111111111111111 NP2676A ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_0176 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP0042A :RN:::::::::::::::::::::::::::::::::: rrnAC0759 :RE:::::::::::::::::::::::::::::::::: Hmu0460 -:::::::::::::::::::::::::::::::::::: hla0598 :SGTRSNDIVETDETPADTGVTPEPSTPEIDDSDAEK HVO_2500 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hbo2182 :RN::::::::::::::::::::::::::::::::::