|
Pairwise sequence scores | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 1297 | pNG6091 | Hbo1286 | rrnAC0161 | HVO_0163 | NP3936A | hla1546 | pNG7146 | Hmu0307 |
748 | pNG6091 | 1319 | 582 | 604 | 747 | 524 | 513 | 549 | 545 |
728 | Hbo1286 | 582 | 1310 | 544 | 694 | 447 | 463 | 508 | 454 |
812 | rrnAC0161 | 604 | 544 | 1254 | 679 | 567 | 595 | 597 | 559 |
913 | HVO_0163 | 747 | 694 | 679 | 1325 | 594 | 618 | 553 | 599 |
734 | NP3936A | 524 | 447 | 567 | 594 | 1277 | 626 | 568 | 606 |
832 | hla1546 | 513 | 463 | 595 | 618 | 626 | 1280 | 621 | 683 |
796 | pNG7146 | 549 | 508 | 597 | 553 | 568 | 621 | 1291 | 850 |
812 | Hmu0307 | 545 | 454 | 559 | 599 | 606 | 683 | 850 | 1316 |
177 symbols consensus MSDTRARIRRHVDSNPGVHFNALTRALDIATGQVQYHLRRLLRAGRIVREEIYGRTHYFP #oth .23215114421543..2..132414..1.1..2.1.211.545332553335.11..13 pNG6091 :THQ:D::HEYIATH::E:::::::R::L:P::::::::K:QNQE:V:NLPL::::::YT Hbo1286 :T:::IQ::TY:::H::I:::G:V:S::L:P::::H:V:::IDSD:L::::F::::::Y: rrnAC0161 :::::V::Y::IE:::::::RE::::::L:::::::::S::---D:VHS:SVN:::::YT HVO_0163 ::E::T:VAD:IKH:::::::E:V::::L:P::::H:V::::SDETVR:S:F:::::::: NP3936A :::::::VKS::E:::::::::IS:E:::::::T:::I:K:::EN:LTSM:LC::::::: hla1546 :P::::::::::RET::::::RVG:D:::::::A:::::::V:D:E:AV:R:G::A:::D pNG7146 ::TVTEQV:S::::K::::::::AAD:::::::A:::::K:R:::D::A:::Q:K:::YS Hmu0307 ::TV:EQV:ES:SA:::I:::E:::R:::::::A:::::K:V:::D:NT:::R::::::D consensus PEFDPWERRAIALLRRETARDILGHLLEAGPARPDELADRLDVARSTLEWHLSHLVEAGI #oth 333231.1333.231...1.41144122514422441224212..1.111.144.41642 pNG6091 ::Y:A:::G:::V::::::::::FCV::Q:TSS:NAVTES:GI::G::::::D::T:QNL Hbo1286 :GLTE:::ATV::YH:::::N::TT::D:EE:::AS::ED:G:::::::::VG::E:E:: rrnAC0161 SS::S:::H:::F::::::::::LT:I:RET:::::V::H::I::::::H::RG:::YD: HVO_0163 ::::A:::G:L::V::::::::::::::H:D::::DV::DIG::::::::::D::::RDV NP3936A LGYSEH:QAGF:::::::T:ELVVL::DE::MA::D::TEA:I::::V:::::N::DCEL hla1546 :A:::::::TV:F:::::::E::VR:HAD::T:STT:::E::L::::VS::V:N:::S:: pNG7146 R:Y::::::VL:FA::::::T::L:::::ESLSA:::::::G:::::VS::V:A:AD:A: Hmu0307 R:H::::::T:::V::::T:S:V:::::D::LASV::V:::::::::VS::VES:I:::V consensus VEKSRDDRNRVTLALTRPEATARLLAEVSPSLPDRLVDRFTRLVDH------LFEG- #oth 31.42255232313244133143.14524121421421114.211512133434263 pNG6091 I::H::VN:H:::VAAERTE:::::E:I::::S::MI::::::::N:::::L:AD:S Hbo1286 :R:E::I::::::V:E::A:::A:::----R:DSET:GTAG:D:E:STGAETPVDAD rrnAC0161 :::R:-:SG::::::C::DL:VE:::A:E:TVSS::SG:::::L:R:::::::::SE HVO_0163 :R:E::LH:::::V::H::R:T:::DD::::::E:F::::D::L:::::::::V::: NP3936A A::QY-EGRS:RVHV:E::LLRE::V:ID:T:::::::::S::::S:::::::L:P: hla1546 ::::--:ERPMH:S:AF::R::T:FD:::::::::I::::V:T::S:::::::::-: pNG7146 L:::YGE:G::VV::SD:D::Q::::V:R:::T:::I::::::::E::GLAAASDDD Hmu0307 A:::YGQ:G:AVV:::::TE:R:::QT:E:::A:::::::S::::DSLGRDGYSNN: