|
Pairwise sequence scores | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 971 | HVO_2591 | hla2766 | NP5376A | HVO_1332 | rrnAC3402 | Hmu2211 | HVO_0989 | Hbo0452 |
451 | HVO_2591 | 1043 | 327 | 320 | 284 | 329 | 328 | 347 | 315 |
552 | hla2766 | 327 | 1062 | 600 | 420 | 362 | 386 | 471 | 426 |
594 | NP5376A | 320 | 600 | 976 | 389 | 401 | 384 | 461 | 477 |
584 | HVO_1332 | 284 | 420 | 389 | 977 | 540 | 529 | 490 | 457 |
669 | rrnAC3402 | 329 | 362 | 401 | 540 | 1232 | 769 | 517 | 475 |
614 | Hmu2211 | 328 | 386 | 384 | 529 | 769 | 962 | 480 | 462 |
711 | HVO_0989 | 347 | 471 | 461 | 490 | 517 | 480 | 952 | 605 |
659 | Hbo0452 | 315 | 426 | 477 | 457 | 475 | 462 | 605 | 986 |
179 symbols consensus ----------------------------------M-MSTNLLPEDLAEALVSTCRTAVGD #oth 111111111111111111111112222222222356646543554541423331.1221. HVO_2591 ::::::::::::::::::::::::::::::::::VTE::PTITRSV:D::::::::TLE: hla2766 :::::::::::::::::::::::VGTHTLMYQTIDHG:MEHP:DASV:E:L:AA:::T:: NP5376A :::::::::::::::::::::::::::::::::MRRV:EDQPNQQ:::E:Q:I::A:::: HVO_1332 ::::::::::::::::::::::::::::::::::-:-MS:::::EAE:K::TV::::::: rrnAC3402 MRNSAVLVGLSPRLRPAIVVGIWNPEIKRVARLRSG:TR:I:S::::D:I:T:A:::T:: Hmu2211 ::::::::::::::::::::::::::::::::::-:::QSIIDPEFGDNI:T:A:::T:: HVO_0989 :::::::::::::::::::::::::::::::::::ELE:Q::::SR::SF:R::::V::: Hbo0452 :::::::::::::::::::::::::::::::::::DADPD:VAA::S:SIRAA::::::: consensus SLRSVTYFTRDDFEQLYLRSDLEQDADLN------GFVEHERDGF-QARNAYRG------ #oth 3...211.24433312.1.41.343111411111121213.2411152553.34111111 HVO_2591 :::::VH::::::DV::V:RN:HDGDEAAARAASA:L::S::T:::GP:ET:NAGATGAT hla2766 E:::L:::SE::V:::::::::SRT:::V::::::::A:S::H:::R:QSL:AD:::::: NP5376A E:::I::::DE:V:::::::::DRT:::F::::::::A:L::N:::E:DEK::N:::::: HVO_1332 ::::L:::N:F:YV:V:::E::::E::::::::::S:IGN:WHD:KMTQD:::::::::: rrnAC3402 ::::::::::AN:::::::D:::::::::::::::D::G::WQ:YK:TK:::QE:::::: Hmu2211 ::::::::::AN:::::::E:::::::::::::::D::G::WQ:YK:TE:::QE:::::: HVO_0989 D::::::::H:RC::I:::N:::A::::T::::::::::::T:::::::T:::::::::: Hbo0452 T:::I::::PTS:Q:::::::::S::::A::::::::::::T::::H:TR:::::::::: consensus SELGDYRFTVRAFENGYLTRVTANDHGVFVTTDGLSMRRFEELAEALRRILREQDGE-- #oth 121.1.32.2.2.22.123.225315..31...32233321132312533.32666421 HVO_2591 :DF:E:E::L:V:SD:FVG::VGG:R::I::::E:ELSE:::MEV::::M:ETTTAG:: hla2766 TQ::::Q::::V:::::::::I::::::W::::SMEID::::::S::AS:::SF:PM:: NP5376A :Q:::::A:I:L:D::::::::L:::::W::::SM:ID:::::S:S::TA:SSA::-:: HVO_1332 ::::::EY:I:V::::::V:I:VE:F::::::::I::QD::A::A:TTE::D:WAI:E: rrnAC3402 :::::::::::::S::::V:A:TERQ::LI:::::T:QSY::I:::IE:L:::ES:KE: Hmu2211 ::::E:L:::::::::::L::::ERS::LI:::::::SSY::I:::IG:M:D::NE::: HVO_0989 :::::::Y:::::DH::::::::D:K:::::::::TL::S::::S::GEL:::----:: Hbo0452 ::::::QY:I:::::::M::::R::::::::::R:TE::SK:V:S::HE::S::VS:AA