Home |  Text search
6 genomes BUD1487 8 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi
-

rrnAC3402

HVO_0989

HVO_1332

HVO_2591

Hbo0452

Hmu2211

-

hla2766

NP5376A

-

Pairwise sequence scores
Consensus score971 HVO_2591 hla2766 NP5376A HVO_1332 rrnAC3402 Hmu2211 HVO_0989 Hbo0452
451HVO_2591 1043 327 320 284 329 328 347 315
552hla2766 327 1062 600 420 362 386 471 426
594NP5376A 320 600 976 389 401 384 461 477
584HVO_1332 284 420 389 977 540 529 490 457
669rrnAC3402 329 362 401 540 1232 769 517 475
614Hmu2211 328 386 384 529 769 962 480 462
711HVO_0989 347 471 461 490 517 480 952 605
659Hbo0452 315 426 477 457 475 462 605 986

179 symbols
consensus       ----------------------------------M-MSTNLLPEDLAEALVSTCRTAVGD
#oth            111111111111111111111112222222222356646543554541423331.1221.
HVO_2591        ::::::::::::::::::::::::::::::::::VTE::PTITRSV:D::::::::TLE:
hla2766         :::::::::::::::::::::::VGTHTLMYQTIDHG:MEHP:DASV:E:L:AA:::T::
NP5376A         :::::::::::::::::::::::::::::::::MRRV:EDQPNQQ:::E:Q:I::A::::
HVO_1332        ::::::::::::::::::::::::::::::::::-:-MS:::::EAE:K::TV:::::::
rrnAC3402       MRNSAVLVGLSPRLRPAIVVGIWNPEIKRVARLRSG:TR:I:S::::D:I:T:A:::T::
Hmu2211         ::::::::::::::::::::::::::::::::::-:::QSIIDPEFGDNI:T:A:::T::
HVO_0989        :::::::::::::::::::::::::::::::::::ELE:Q::::SR::SF:R::::V:::
Hbo0452         :::::::::::::::::::::::::::::::::::DADPD:VAA::S:SIRAA:::::::

consensus       SLRSVTYFTRDDFEQLYLRSDLEQDADLN------GFVEHERDGF-QARNAYRG------
#oth            3...211.24433312.1.41.343111411111121213.2411152553.34111111
HVO_2591        :::::VH::::::DV::V:RN:HDGDEAAARAASA:L::S::T:::GP:ET:NAGATGAT
hla2766         E:::L:::SE::V:::::::::SRT:::V::::::::A:S::H:::R:QSL:AD::::::
NP5376A         E:::I::::DE:V:::::::::DRT:::F::::::::A:L::N:::E:DEK::N::::::
HVO_1332        ::::L:::N:F:YV:V:::E::::E::::::::::S:IGN:WHD:KMTQD::::::::::
rrnAC3402       ::::::::::AN:::::::D:::::::::::::::D::G::WQ:YK:TK:::QE::::::
Hmu2211         ::::::::::AN:::::::E:::::::::::::::D::G::WQ:YK:TE:::QE::::::
HVO_0989        D::::::::H:RC::I:::N:::A::::T::::::::::::T:::::::T::::::::::
Hbo0452         T:::I::::PTS:Q:::::::::S::::A::::::::::::T::::H:TR::::::::::

consensus       SELGDYRFTVRAFENGYLTRVTANDHGVFVTTDGLSMRRFEELAEALRRILREQDGE--
#oth            121.1.32.2.2.22.123.225315..31...32233321132312533.32666421
HVO_2591        :DF:E:E::L:V:SD:FVG::VGG:R::I::::E:ELSE:::MEV::::M:ETTTAG::
hla2766         TQ::::Q::::V:::::::::I::::::W::::SMEID::::::S::AS:::SF:PM::
NP5376A         :Q:::::A:I:L:D::::::::L:::::W::::SM:ID:::::S:S::TA:SSA::-::
HVO_1332        ::::::EY:I:V::::::V:I:VE:F::::::::I::QD::A::A:TTE::D:WAI:E:
rrnAC3402       :::::::::::::S::::V:A:TERQ::LI:::::T:QSY::I:::IE:L:::ES:KE:
Hmu2211         ::::E:L:::::::::::L::::ERS::LI:::::::SSY::I:::IG:M:D::NE:::
HVO_0989        :::::::Y:::::DH::::::::D:K:::::::::TL::S::::S::GEL:::----::
Hbo0452         ::::::QY:I:::::::M::::R::::::::::R:TE::SK:V:S::HE::S::VS:AA