6 genomes BUD1490 7 proteins a Hsa Halobacterium sp. NRC-1 b Hma Haloarcula marismortui f Hvo Haloferax volcanii g Hbo Halogeometricum borinquense h Hmu Halomicrobium mukohataei i Hut Halorhabdus utahensis j Hla Halorubrum lacusprofundi q Nph Natronomonas pharaonis x Hwa Haloquadratum walsbyi - rrnAC0168 HVO_A0229 Hbo1117 Hmu1809 - hla0427 hla2429 NP4548A -

Pairwise sequence scores
Consensus score	979	hla2429	rrnAC0168	NP4548A	Hmu1809	Hbo1117	hla0427	HVO_A0229
480	hla2429	937	367	349	406	433	408	431
564	rrnAC0168	367	1015	395	497	454	449	471
526	NP4548A	349	395	1083	484	484	387	431
769	Hmu1809	406	497	484	977	626	594	607
730	Hbo1117	433	454	484	626	988	576	640
743	hla0427	408	449	387	594	576	994	677
760	HVO_A0229	431	471	431	607	640	677	970

148 symbols
consensus       -----------MDDIFVARLMSSDLHTVSPDTLVEDAAQLMLDNNISSVIVVDDDGALEG
#oth            1111112233312.1112.1.11333.2422132321.332213312.32111211424.
hla2429         ::::::::::::A::PIE::::TE:V:ID:GAAAA:::NR::ETGV::IL::::::H:A:
rrnAC0168       ::::::MLSTV:::V::G:I:::PVT::AA:ANAKAV:KR:::E:::::V:::A::::L:
NP4548A         MLIENVRHKAR:E::::G:I:::PVA:TQ:E:PIQE:::T:::QS:N:L:I:GE::HP::
Hmu1809         :::::::::::::::::G:::T::PV:::::::::::::::I:ES:G:L::T:::NDIR:
Hbo1117         ::::::::::::E:::::::::TT:::::V::::::::K::ME:GVG::LI:::GNQ:L:
hla0427         ::::::::MDEI::V::::::T::I:::T:::::::::AVL:::D:::AL::::::::V:
HVO_A0229       ::::::::::::E:V:::::::TT::::T:::::::::::I::::::::::::E:NR:::

consensus       ILTSTDFVDIVAKSQPKAQTTVERYMTTDVVTTTAQDSIQAVADLMLEHGFHHLPVVDED
#oth            11.2..1.4212343131323.121.2314312212321332.241332141.2...232
hla2429         LI:A::::SL:RRND:EDE:P::AF::::I::VSPD::VEEL:EP-TDR:YT:::::TA:
rrnAC0168       ::::::::E:A::GGDT:GLD:SEF::::L::V::N:PVE:A:SV::D:SV::::::::T
NP4548A         ::::::L:HV::DQT:IDDSR::E::NQVDTV:::NT:::EA::T:MAR:T::::::EDE
Hmu1809         ::::::::E::KE:D:::::::::::S:::L:::::EQ::::::::::A:I::V:::::T
Hbo1117         :::T::::Q:::ER:::D::P:SE:::S::::::::VP::D:::T:MQ:::::V::::D:
hla0427         :::T::::::::::::::E::::::::R:PI:AG::::VS:::S::V::::::V::::G:
HVO_A0229       :::T::::::::::::::::::::::::::I:AG:::::LS::ES:T::::::M:::::E

consensus       EGVIGIISTTDLTAYVSTAEAPSPS---
#oth            3221.122.1.212.1.56433233111
hla2429         SKLV::V::::::T:::EQR-----:::
rrnAC0168       :::V:MLT:::M:::::GI:QS:APVLG
NP4548A         A:L:::LT:::::::L:DNW::::::::
Hmu1809         ::::::::::::::::::VQT:::A:::
Hbo1117         ::::::::::::AS:L::::::::::::
hla0427         TP-::::T:S:FA::::SP:TL::-:::
HVO_A0229       :::::M:A:S::A::L:QTGQLAR::::