|
Pairwise sequence scores | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 900 | HVO_0440 | VNG1015 | NP1338A | pNG7100 | Hut2702 | hla0020 |
389 | HVO_0440 | 917 | 330 | 343 | 293 | 275 | 257 |
518 | VNG1015 | 330 | 886 | 366 | 427 | 369 | 372 |
493 | NP1338A | 343 | 366 | 925 | 398 | 380 | 398 |
747 | pNG7100 | 293 | 427 | 398 | 909 | 607 | 654 |
676 | Hut2702 | 275 | 369 | 380 | 607 | 860 | 633 |
694 | hla0020 | 257 | 372 | 398 | 654 | 633 | 924 |
142 symbols consensus ---A-TATQGVSLDTDSLTGLHWIGIIAALVTAAVHLLLGVRLAPSG----LGISFILAG #oth 11213253444434332.331.12.141.211122.121.133333311112.11133.1 HVO_0440 :::-:M::DA:TEPS:D::R::YV:VAL:A::GVI::V::AGALAANPADP:::A:VG:A VNG1015 MTA:S:SRS:IG:A:::::P:::L::VL:VA:GVL::V:::S:GLP:::::::G:LFV:: NP1338A :::-:-M:RNA:GEAGQ::P:::V::G::::::G::FF::AQDLDGL::::F::::LF:: pNG7100 ::M:A:E:::R:::VA::DSR::L::::::::::I::::::::::::::::::::::::: Hut2702 :::-:-----:Q:R:E::G:::::::L::::S:G::::::::M::::::::M:::::::: hla0020 ::M:T:GA:QPAV:VG::N::::::::::::S::::::I:::MF::A::::M:::::::: consensus LGFLGGIALILIG--YRRRLVYALGIPFTLGQIVLWYAINFA-GPKSFPADVGTLGAADK #oth 3.12112222231114..12.111.11.122.1311232.334232121223122122.. HVO_0440 G::AA::VGV:R:DER::SR:VL::::::A::V::YV:L:--:----W:NIF:IG:V::: VNG1015 V:Y:::T:A::V:::V::::::L::::::I:::AA::VV:AP:---::S:----::I::: NP1338A I:::A:::A:VV:::W::::::L::V:::A::::::L:L:QPIP:I:A:E------:V:: pNG7100 :::::A:::VAL:::I:::::::V::::::V::L:::YV:::A::::::::::::::::: Hut2702 :::::A:V::::D::::::A:::V::::V:A::G::LL:::VN:S::::::I:::::V:: hla0020 :::I::VG:LV:D::::::A:::V::L:::V::::::V::::G:T::::::::::::I:: consensus VAQLVLIAVLVALLRR------ #oth 21.11.211.21.122331111 HVO_0440 LV::A:L:::F::Y::DA:::: VNG1015 :V:VA:::::AV:YA:AT:::: NP1338A :::V::V::::V::Y:EGLPGR pNG7100 L:::::L::::::::-:::::: Hut2702 ::::::VGI::::::S:::::: hla0020 I::V::::::::::::::::::