|
Pairwise sequence scores | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 1022 | HVO_1408 | rrnAC1471 | pNG5047 | Hut0473 | rrnAC0416 | NP2808A | Hmu1611 | hla1838 |
698 | HVO_1408 | 1062 | 542 | 574 | 547 | 590 | 585 | 573 | 648 |
670 | rrnAC1471 | 542 | 996 | 604 | 662 | 542 | 514 | 552 | 560 |
651 | pNG5047 | 574 | 604 | 994 | 699 | 519 | 525 | 510 | 545 |
688 | Hut0473 | 547 | 662 | 699 | 1019 | 549 | 503 | 541 | 627 |
748 | rrnAC0416 | 590 | 542 | 519 | 549 | 1026 | 558 | 621 | 637 |
700 | NP2808A | 585 | 514 | 525 | 503 | 558 | 1019 | 587 | 659 |
742 | Hmu1611 | 573 | 552 | 510 | 541 | 621 | 587 | 1089 | 679 |
815 | hla1838 | 648 | 560 | 545 | 627 | 637 | 659 | 679 | 1105 |
149 symbols consensus ----------MFASAGAGELFLLGRLLFGGVLAFMGLNHFLNTDQMAGYAEFKGLPAPRA #oth 111223333342423432221121.2...31...1.21..43435.22..13....1.32 HVO_1408 :::::MSVALQ:::P::DIA:::A:V:::A::::::::::::L:H:T::::M:::::::L rrnAC1471 ::::::::::-M:PELNVV:LVA::V::::::::T::S::TQ:E:::::::Y:::::::F pNG5047 :::::::::::AITGAE:VAL:I::I::::::::T:::::FE:EE:T::::Y::::::K: Hut0473 :::::::::::AFTGTE:IVL:A::I:::I::::::::::MQRE::T::::Y::::::GF rrnAC0416 :::::::::MA:E:::::::::::::::::::::::::::Q:AG:::P:::A::::::V: NP2808A ::::::::::::E::::DIV:V:A:V:::AT:::T:V::::D::G::E::::::::F::: Hmu1611 :::MIPLQSEL:::::S::::::A::::::::::::M:::T::AD:V:::Q:::::::KL hla1838 MSAELTTIPLQ:D:PF:::::::::::::VT:::::::::MDV:T::::::::::::::F consensus SVLASGGLLILGGLGVAAGVFPVLAAGALAGFLLVSAVTMHDFWAVPD-EERQDEMTSFL #oth 1.33..32.232.22142.13.122122214..2312241.1..2222112313.113.. HVO_1408 G:VV:::M:VF::::I:L::::A:::::V:V::I:GTPVF:::::::E:DQ:ES:::G:: rrnAC1471 ::::::::::::::::TV:::::V::V:::V::I::::A:::::::::::D::::LN::: pNG5047 G::L::V::::::::II:::L:AVS:VVI::::I:::LIF::::::SE:::Q:T:::Q:: Hut0473 ::I:::IV::A::V::L:::Y::VG:V:::::::I::::::::::::E::DQ:::::A:: rrnAC0416 ::YG:::::LVS:VL:IL:AY::I::::::T::VA:::M::N:::::::DQM:::::Q:: NP2808A :::L:::::VF:::S:V:::V:AIG::G::L:::A:::::::::NMDG:::A:N::NA:: Hmu1611 ::VG:::::LFA:A:I:V:A::::SGF::GL:::L:G:A:::::SMD:P::::N:::::: hla1838 ::I:::LV:V:::::::::A::::::::::A:::I:::::::::SID:P::::S:::::: consensus KNVAGAGGALVFLAVGGTSWPYSVGIGLF #oth ..3421.1.1232.42342.212211322 HVO_1408 ::LVML::::::::LS::T:S:AI:LT:: rrnAC1471 :::TL::::::VA:SATGT:AL::::SPL pNG5047 ::I:L::::::IV:I:PQ::A::L::TVL Hut0473 ::FVM::::::VA:A:TQ::A:::::::: rrnAC0416 ::I:L:::::SL:::A::::::T::LS:: NP2808A :::F::::::A::::A:ST:::ALN:::V Hmu1611 ::LF:::::FA:A:L:AIA::::::LA:: hla1838 :::Y:::A::AL::::::A:::AL:L:::