| |||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 5025 | HQ3161A | HVO_1943 | Hbo1813 | Hut0191 | Hmu0031 | rrnAC2444 | HQ2255A | Hbo3511 | Hmu2772 | rrnAC3056 |
| 2599 | HQ3161A | 5932 | 2229 | 2606 | 1947 | 1932 | 1884 | 634 | 973 | 903 | 1073 |
| 3028 | HVO_1943 | 2229 | 5585 | 2873 | 2073 | 2133 | 2078 | 785 | 956 | 1030 | 1050 |
| 3093 | Hbo1813 | 2606 | 2873 | 5568 | 2373 | 2178 | 2272 | 734 | 942 | 993 | 1030 |
| 2846 | Hut0191 | 1947 | 2073 | 2373 | 5681 | 2440 | 2465 | 685 | 856 | 948 | 993 |
| 2940 | Hmu0031 | 1932 | 2133 | 2178 | 2440 | 5573 | 2638 | 664 | 866 | 1016 | 1013 |
| 2898 | rrnAC2444 | 1884 | 2078 | 2272 | 2465 | 2638 | 5621 | 655 | 893 | 872 | 960 |
| 1304 | HQ2255A | 634 | 785 | 734 | 685 | 664 | 655 | 7311 | 1406 | 1728 | 1692 |
| 1643 | Hbo3511 | 973 | 956 | 942 | 856 | 866 | 893 | 1406 | 5096 | 1930 | 1850 |
| 1950 | Hmu2772 | 903 | 1030 | 993 | 948 | 1016 | 872 | 1728 | 1930 | 6624 | 2954 |
| 1971 | rrnAC3056 | 1073 | 1050 | 1030 | 993 | 1013 | 960 | 1692 | 1850 | 2954 | 6623 |
1289 symbols consensus -------------------------R-LAL---LV-IGS-LAVDYDIADVVGDRSQFLFV #oth 113324635445544443344335535313525435442547346567435373475554 HQ3161A :::::MNRSYISYRINEVSKMASRPSI::AIGIIAVTW:YVS:LA:::T:T:W:TP:::: HVO_1943 ::VTVAGESSSGSAGSTNTVFGVPAGL::TAAS::L::AF:::V:::T::::R:D::VLL Hbo1813 ::::VSSETRDTNASFSIDAI:SVP:AV::VGV::LTW:YVS:L:YVTN:::GS::L::: Hut0191 ::MNITDRNPDI::::::::::GLF:V:::GGA:LV:::FVG:VH::V::IS:PTALQ:: Hmu0031 ::::VSTAGRLGLGWPAVDGVPGRT:TA::VAVAAMLL:T:Q:L:FFI::::LP:R::A: rrnAC2444 MSAPVTERVRDRVPW:::::::GGS:I:::LATALA::AP:RTM:YLS:::::PTL::AL HQ2255A :::::::::::::::::::::::::-:---:::M:SAD:GGTD:N:G::DADN:VIPEEL Hbo3511 :::::::::::::::::::::::::-:---:::--:---:MDD:RTTLNTGDGP:IGRVI Hmu2772 :::::::::::::::::::::::::-:---:::--:---:M:D:ESLFE:G:T:DYSRVA rrnAC3056 :::::::::::::::::::::::::-:---:::--:---:-------------------- consensus VVLSLVLATVLARILRPRLALAVGAVLLSGGLGAYLLPLPQSQ--------LL-DT-ALL #oth 325665543344575643637344763465137535772345533115363224214213 HQ3161A 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--::--::-::-TQ:R::KISKI:V::::::::::::::::::---:--::::::--::- Hbo3511 --::--::-::--------N:Y:SL::::::::::::::::::---:--::::::--::- Hmu2772 --::--::-::-----G:E:A::SR::::::::::::::::::---:--::::::--::- rrnAC3056 --::--::-::-----:::::YQSQ::::::::::::::::::---:--::::::--::- consensus SI-LSPEVRFTVESPEPSYWRTGAYDRYTGDGWVRTGDTQPYDG-RLAGPPG--RSRTVE #oth 12313454213.4.4345..2323143.1.31.433342431623525634311443434 HQ3161A ::D:::Q:::::::SR:::::::::N:::::::::::E::::Q::Q:SL:::::S:QS:Q HVO_1943 ::S:::Q:::E:Q:TS:D::Q:ATF::::::::::::::RD:E:G:::::E:::P::L:R Hbo1813 ::R:::N:::::N::QS:::E:A::::::::::I:::S:D::N::::R::V:::A:Q::Q Hut0191 :LD:TSKL:YA:R:D:ET:::V::::L::::::::R:E:G:V:R:::GS::::::::::: Hmu0031 ::S:::::::::T:S::R:::I:SF:::::::::SQTNSRA:G:D::DE:::::PT:I:: rrnAC2444 ::S:T::I:Y::::E::R:::VAS::::::N::::::NPR:::DQ::DS:::::ET::LR HQ2255A --:------::::::RTG:::QSV:AT:::ST:ASETES:S:T::SIPNNERTIEQQRT: Hbo3511 --:-DT::H:::::::SA:::::S:AT:S:S::EQ:T:S:::S::DIS-:AA:::GERMT Hmu2772 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V::::::GGP:W:::S::::::::::::::::::Q::::::::::::::::::::::::: rrnAC2444 :TVGDGN:VERY:::::P:::::::::::D:S::A::::::::::::::::::::::::: HQ2255A --:----:G:L::::IQN::::::::::::--Q:PYN::::::::::::::::::::::: Hbo3511 :A::T:T:DSTT::::::AESQSPTDAST::PSDSGTSADGSADDGTADDGTTDDGTADE Hmu2772 :TPADQP:T:T:::::A::::::::::::D:::::PTERDDTADGYD::::::::::::: rrnAC3056 EEFAVGT::G::QTE:::DGGGQESGGDETEG:E:GADGTGDSDGTG::::::::::::: consensus ---------------------------------T--PGAP-VTNEVETNGTPVEGATVTP #oth 111111111111112222222232333334222353235724555237455237453553 HQ3161A :::::::::::::::::::::::::::::::::AMT:ENGAS:DATG:TSA:T:RS:T:: HVO_1943 :::::::::::::::::::::::::::::::::-::-ET::TE:GT:::A::AG:SPPG: Hbo1813 :::::::::::::::::::::::::::::::::-::----:NGT:DD::N::TPSDALE: Hut0191 :::::::::::::::::::::GDSQQQTFDESDISI:EYY:APD:::L::SN:SSG:::E Hmu0031 :::::::::::::::::::::::::::::::::-:::LT:::D:DTDAG:::L-:PQSR: rrnAC2444 :::::::::::::::::::::::::::::::::-:::LTETNGT:T:PTE::TATG:D:: HQ2255A ::::::::::::::::::::::::::::ITLNR:VVA::T::DIS::K:TN::T::P:RV Hbo3511 GATGDGTDEGDSDDTDKQTPGGTPSGPSFSLNR:PV:::D:::VT:TNS:DA:SDR::LF Hmu2772 ::::::::::::::::::::::::::::VSLNR:AV::V::::VT:TED:V::M::Q:LF rrnAC3056 :::::::::::::DSGDGQTVSQSGEFIVELNR:AT:::A::AAT:TRD:A:::::::SF consensus NGEPVG-T------------------------------------------AARPGEIPR- #oth 645433634441323322112332222433432442221111111111117777376244 HQ3161A Q:TDMNNNS::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::GSMAQT:GI HVO_1943 DI----:-::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::DE:L:VT:A: Hbo1813 S:SG:NA-::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::TPP::SV:GL Hut0191 ------:-::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::F::::NA:G: Hmu0031 GVN:EDSIST:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::T:V::S:-: rrnAC2444 T:T---:-::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::---------: HQ2255A :T:R::W:DATGTITTQLPYANTVTVSARPPGDQGKYLNEQTVATVEDMSLPAV:::::L Hbo3511 ::D:::V:DIEGQVVATVPYASNLTISLAPEGERASLI::::::::::::::DI:P::QD Hmu2772 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