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6 genomes BUD1535 7 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi
-

rrnAC1025

HVO_2168

Hbo2935

Hmu0557

Hut1786

Hut2873

- -

HQ3474A

Pairwise sequence scores
Consensus score2460 HQ3474A rrnAC1025 Hbo2935 HVO_2168 Hmu0557 Hut2873 Hut1786
1541HQ3474A 2595 1299 1348 1307 1394 1446 1354
1682rrnAC1025 1299 2483 1357 1368 1512 1393 1490
1759Hbo2935 1348 1357 2470 1397 1470 1519 1403
1727HVO_2168 1307 1368 1397 2439 1429 1466 1436
1880Hmu0557 1394 1512 1470 1429 2485 1524 1557
1834Hut2873 1446 1393 1519 1466 1524 2390 1558
1863Hut1786 1354 1490 1403 1436 1557 1558 2458

358 symbols
consensus       -------------MSDPAELYDTLRDEVGTVLIGNEDLVERLTIALLTRGHVLLEGVPGV
#oth            1111111111111112123213322313331.1.21323241.112.141.1.1......
HQ3474A         MTSNVNNDTESQSA:E:TRI:QSIQ:A::S::::Q:R:MRG::V:I::G::::V::::::
rrnAC1025       ::::::::::::::T:::V:::R::E:TE:::::::QILRHI:V:M::::::::::::::
Hbo2935         ::::::::::::::T::::::S::QT:AAR::::Q::ALK::::S:::QS:L::::::::
HVO_2168        :::::::::::::::A:E:V:E:IL::TSQL:V::::AI:A:::::::N:::::::::::
Hmu0557         ::::::::::::::TE::A::E:V::::::::V:HDE:::H::::::S::::::::::::
Hut2873         :::::::::::::::::::IH:AVQA:::S::::::::::::::::::D:::::::::::
Hut1786         ::::::::::::::::AEAV::A::E:I::::V::::I::Q::VS:::::::::::::::

consensus       AKTTLANLFARATGLQYRRIQMTPDLLPADITGTQVYRERTGEFELQRGPVFANLVVADE
#oth            1..12.522.5122.436.1.....2....1...41.1262.2.1121..1.3.2.2...
HQ3474A         G::LA:R:::T::::E:G:::::::V::::V::::::::T:::::FR:::::::V:::::
rrnAC1025       ::::I:T:I:N::D::HS:V::::::::::::::T::HQ:N::::::K::::T:::I:::
Hbo2935         ::::::AA::QT::::G:::::::::::::::::KI:::D::A:::E:::::S:::I:::
HVO_2168        ::::I:::::H:AN:D:Q:::::::V::::::::HI:::NL:::::::::::S:V:L:::
Hmu0557         ::::::QS::::S::A:T:V::::::::::::::S:::SQ::::Q::K::I:::::::::
Hut2873         ::::::D::::::::ESN:::::::I::::::::SI:::G::Q:::::::::::V:::::
Hut1786         ::::A:::Y:E::::T:K:::::::I:::::::::::::P::::::::::I:G:I:::::

consensus       INRATPKTQSALLEAMQEGQVTIEGETLELPDPFIVVATQNPIEMEGTFELPEAQRDRFQ
#oth            ....1..1......1.1.42.112.1..5..3..3.1..1..1.1....4.........1
HQ3474A         ::::::::::::::S:::QT::VG::::S::E::::I:::::::Y::::A::::::::::
rrnAC1025       ::::P::::::::::::::::S:::S:::::T::T::::M::L::::::K::::::::::
Hbo2935         ::::::::::::::::::T:::::::::N::T::M::::::::::::::G::::::::::
HVO_2168        ::::::::::::::::E:::::::::::K::Y::::::::::::Y::::N::::::::::
Hmu0557         ::::::::::::::::E::H::::::::A:::::V:I::::::::::::::::::::::L
Hut2873         ::::::::::::::::::RH::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
Hut1786         :::::::A::::::::::NH:::D::::P:::::M:I:::::::::::::::::::::::

consensus       FKLIVDIPNRDDEREILDRFDAEPELDPDDIEQVVDAEDIREAREVVTDVHVADSVKEYI
#oth            2.24333.32321342.2..135.4.31223321224241441144.53211233131.1
HQ3474A         L::S:SA:E:RKQLKL:::::DR:::S::::T:S:SR:QLLT:QAI:R::Y::TP:::::
rrnAC1025       M::VTE:::SE:::A:::::::N:T::A:S:S::ISRDELLD::T::PGT:IE::I::::
Hbo2935         ::IAI:::S::KQA::::::NY::N:G:::L:::LS::::AS::TK:KN::::EP:RD:V
HVO_2168        ::VV::L:E:A::::::E:::RS:S:K:S::SN:I:DA::G:::Q:::G:::D:K:FD::
Hmu0557         L::T::::D::E::RV::::NDA::::AESV:::::T:TLTA:::::S::::::::R::V
Hut2873         M:::AGL:D::::T:L:R::::D:D:G:SRA:R::T::E::::Q:R:A:TY::QA:Q:::
Hut1786         :::::ET::Q::::QL::::::::T::A:R:Q::::E:R::SL:DQ::EQY:D:::::::

consensus       LDIVEATRDHPDVDHGASPRASLALLNAAKARAAIQGREYVIPDDVKSLARPVLAHRLVL
#oth            121221.24344243.3.1.121512421..4.1142.5....2.1.51.64313..111
HQ3474A         I::I:::NNDETLT::C::::AIS::SV:::E::L:N:Q::::G::::::TET::::V::
rrnAC1025       :A::G:::::RN:I:::::::TID:Q:T:::V:RLN:::::::::::EM:L:::R:::IM
Hbo2935         :::A:G:QET:::S::I:::G::H::Q::::H:::E::H::::::::T::VSA:::::::
HVO_2168        ::L:G:::T:AA::F:::::::::F:R:G::A:::R::D::::::::R::PIIMS:::::
Hmu0557         ::L:A::::::::E::G:M::::G:::V:::::::H:::::::::::A:::A::L:::::
Hut2873         ::L:::::TSSH:EY:::::::I:F::T::::::::D:A::::S::::::E:I:S:::::
Hut1786         :G::::::SS::I:V::::::T:T:MD:G::::::H::G::::::I:Q::K:::R:::I:

consensus       STDAELSDREPEAVIEEILDSVPPPE-----RDDDSADAPATEVA---------GDAE
#oth            321.112233252121313332221211111423344645234431111333445362
HQ3474A         G:::::::LTTNS:L:D:MTET:T::DIDPKSESE:KSDIE:NTD::::TESSIH:G:
rrnAC1025       NS:::::QITA::::::::Q:IT::G:::::S:T:HSVDVE:A:G::::DGGTKR:S:
Hbo2935         :::::IG:V::::I::G:::TTT::S::::::G:VT:Q:::VGDG::::::GRTKQKD
HVO_2168        G:E:DI:G:D:RD:V::VV:T::T:::::::VGL:E--STT:S:::::::::::::DD
Hmu0557         TA::::::VS:AS::DDV:AD:T::G:::::G:SETEL:A:::M:DVEESATDG:SV:
Hut2873         ::::::::L:TG::V:::I::IE::S::::::ELVVE:E::AS:D:::::::::----
Hut1786         ::::::T::SAD::::S::Q:::AT::::::P::A::HPRED:IP:::::::::SS::