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6 genomes BUD1538 6 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi
-

rrnAC0151

HVO_2658

Hbo2869

Hmu2520

Hut2961

- -

HQ1954A

Pairwise sequence scores
Consensus score3147 HQ1954A HVO_2658 Hbo2869 Hmu2520 Hut2961 rrnAC0151
1926HQ1954A 3198 1766 1799 1839 1689 1783
2469HVO_2658 1766 3281 2153 2151 2083 2165
2596Hbo2869 1799 2153 3145 2238 2325 2376
2633Hmu2520 1839 2151 2238 3159 2228 2426
2534Hut2961 1689 2083 2325 2228 3206 2359
2708rrnAC0151 1783 2165 2376 2426 2359 3259

481 symbols
consensus       ----------------S-ETMAASAVASGTVRGYLSEMGPSWVAGAIAAGPATMASLLTA
#oth            11111111111111123423335133531242412321..2.2...1.....11111221
HQ1954A         ::::::::::::::::-:--:SQ:TGKQHSLSEKI:QL::T:L:::::::::S:::::SG
HVO_2658        :::::::::::::::MNEPRLDV:::TG:NW:::::::::::::::V::::::::TV:::
Hbo2869         ::::::::::::::::MS:MTGETG:Q:::A:::::::::::::::::::::S::::I::
Hmu2520         :::::::::::::::M:G::T::TRFGR::::S:VD::::A:::::::::::::G:::S:
Hut2961         ::::::::::::::::-:--::T:RD:::::KT::Q:::::::::::::::::::::IA:
rrnAC0151       MSAVFSGGLTQAGGMS:T::VDS:::S:::ISD:VEA:::::I::::::::::I:::V::

consensus       GAGFGYALLWVVVLSAGAGALAQYLAMRLGLLTERGIVAVVEDHLGESWAWLLVADAVLA
#oth            .131..31....22..32.121.1.111.1.1123.1142..24..23...2..3.1.21
HQ1954A         ::N::::::::::I::IF::::::::TK:A:E:NE:LIKT::RR::TK::::::::V::V
HVO_2658        ::T::::M::::::::VL::S::::S::::::::D:::S:::RE::DG:::A::::::::
Hbo2869         ::::::S:::::L:::V::TV:::::::::::SGQ:::TL::SY:::::::I::V:V:V:
Hmu2520         ::::::T:::::IV:::::::S:F:::::::::::::::::::A::::::::::::::::
Hut2961         :::Y::D:::::::::F:::::::::::::::::::::G::::::::::::I::L:::I:
rrnAC0151       :GA:::S::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::T::::::G:::::

consensus       AGVAQLVIMKTVASVSATITGIDARIWGVIWAVILAAGLAGRGYRFLELAAKVLVAAVVL
#oth            1.2......211.3..1131131.22..11.112.21....2...12.13..41.32..1
HQ1954A         ::F:::::::::::::GLLMPFG:ES:::::::F:TV::::G:::IA:IG:::V:TG:::
HVO_2658        ::L::::::QGL:N:::::::V:::V:::V:::V::::::::::::V::L::G::::::V
Hbo2869         :::::::::::::::::::::::::::::::::::L::::::::::::::::A:::::::
Hmu2520         S::::::::::::G::::M:::::G::::::GLV::V:::::::::::::::L::SL:::
Hut2961         :::::::::N:::::::::::L::G:::I:::::::V::::S::::V::F:::::S::::
rrnAC0151       :::::::::::::T::::V::::::::::V::L::::::::G::::::::::I::LL::V

consensus       AFVASLFVVPIDAGAAAAGLVPSVPSG--GALVAAGILGGAVHITLITMHSYTMRARGWT
#oth            ..2..212....211.13..2.22.31111.32..111.....1.1...11..11..1.1
HQ1954A         ::I:::::::::S:::VS::F:T::I:::::IA::::V:::::V:I:::QT::VK:::::
HVO_2658        ::L:::VL::::PA:::G::::RI:::VD:::::::::::::::::::::::::::::::
Hbo2869         :::::A:I::::::S:VQ::I:TL::N::::::::::::::::::::::::::::::::D
Hmu2520         :::::::::::::::::::::::L:A:::S:VM::::V::::::::::::::::::::::
Hut2961         :::::V::::::PA:::S:::::::G:::S:A:::AV::::::::::::::::::::E::
rrnAC0151       ::::::::::::::::V::::::::::::S::::::::::::::::::::::::::::::

consensus       ERDYDLATFDVGASMLVAFGIYSLAIFLVAASVLSSP-----DLTTVGAAQALGPIAGDN
#oth            431211.11.122...11..21.211...1.11.323122122.2111..1..1.11.43
HQ1954A         QS:A:I:R::ISV:::::::VF:I:T:::::GA:FGN:IDAQG:QAI::::::E::::SF
HVO_2658        T:::G:::::::::::::::V:::::::::::::H::EVAAG:::A:A::::::::::A:
Hbo2869         :S::G::::::I:::::::::::IS::::::::::D::::::N::::::::::::LV:P:
Hmu2520         :::S::::::I:::::LV::L:::::::::::::T:T:::::::::I::::::::::::S
Hut2961         ADE:::::::::I::::::::::V:::::T:::::D::::::N:S:::::E::::LV:ER
rrnAC0151       RE::::::V::::::::::::::::::::T::::T:G:::::::::::::E::::LV::S

consensus       AQWLFLLGLGGAAVSTLGGNTIVPPFLIADKLGWGTTVEDSRYRALLAAVALLSAPGAFI
#oth            .321..2..3........1..2..1112...11.2.221.4...2..112..2.22.1.1
HQ1954A         ::RV::I::L:::::::::::L::VYV:::::T:E:N:::T:::V:::GT::V:GA:V::
HVO_2658        :K:::::::L:::::::::::V:::::V::::::::DLS:G:::::::G:::F:GV:::L
Hbo2869         :K::::::::::::::::::::::::VV:::::::::::::::::::::F::::::::::
Hmu2520         ::::::V::A::::::::A::::::::::::F::D:D:S:A::::::VG:::::I:::::
Hut2961         :EV::::::::::::::::::::::::L::::::::::::::::G::::F::::::::::
rrnAC0151       :R:::::::W:::::::::::::::::L:::::::::I::N:::G:::::::::::::::

consensus       GGAVLGQLVLVLALGTVGTPFAIAVVLYLLN-SDAVPRPNSTAANLGGVALLAVTGGLAA
#oth            1.31211...1..3.11.....1.2..1...1241123311222.31.22222.223..1
HQ1954A         P::F:::::::::V::::::::L:L::V:::D:QTTGD:P:V:I:I::I:VFS:ASI::G
HVO_2658        :::FFPL::::::F:L:::::::::::V::::G:::SE::::P::::::V:F:::TV:::
Hbo2869         ::Q:I::::::::::::::::::::::::::::E:::KS:A:L::A:::GI:L:S:A:::
Hmu2520         P:N:::::::I::V::L:::::::I:::::::T:T:S:Q::::T::::::::::::V:::
Hut2961         ::E::::::::::I:::::::::::::::::::G::::V::LP:::A:::::::::::::
rrnAC0151       ::N:::::::::::::::::::::L::::::::A:::ES::LL::V::L::I::S:::::

consensus       NFVREQA---------AGGVG-PLSGFVLAFAAALGLATLGLLGKFVREELGAA------
#oth            ..122231111111113221312.122.14.122234.232.211221131343332111
HQ1954A         :::IS:I:::::::::TS:LT:L:::S::L:::VILF::IL:I:SHL:AQ::D:STTAIS
HVO_2658        ::::SR::::::::::LSDL:D:::V::VV::::M:A::::::::::::TV:RPTAA:::
Hbo2869         ::::G:I:::::::::::::E:L:::A:::::VI::V:IVV::::Y::::VSV:::::::
Hmu2520         ::::::V::::::::::A::::::::::VT:G::IA::::V:G::Y:::::L:-::::::
Hut2961         ::L::T:TIEFFREAT::N:D:V:TAA::S:GVI:SI::::::V::FQ:RVAGTVP::::
rrnAC0151       :::V::L:::::::::G:::::::::::::::I:::::MA::G:::L::::L:-::::::

consensus       -
#oth            1
HQ1954A         E
HVO_2658        :
Hbo2869         :
Hmu2520         :
Hut2961         :
rrnAC0151       :