|
Pairwise sequence scores | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 3147 | HQ1954A | HVO_2658 | Hbo2869 | Hmu2520 | Hut2961 | rrnAC0151 |
1926 | HQ1954A | 3198 | 1766 | 1799 | 1839 | 1689 | 1783 |
2469 | HVO_2658 | 1766 | 3281 | 2153 | 2151 | 2083 | 2165 |
2596 | Hbo2869 | 1799 | 2153 | 3145 | 2238 | 2325 | 2376 |
2633 | Hmu2520 | 1839 | 2151 | 2238 | 3159 | 2228 | 2426 |
2534 | Hut2961 | 1689 | 2083 | 2325 | 2228 | 3206 | 2359 |
2708 | rrnAC0151 | 1783 | 2165 | 2376 | 2426 | 2359 | 3259 |
481 symbols consensus ----------------S-ETMAASAVASGTVRGYLSEMGPSWVAGAIAAGPATMASLLTA #oth 11111111111111123423335133531242412321..2.2...1.....11111221 HQ1954A ::::::::::::::::-:--:SQ:TGKQHSLSEKI:QL::T:L:::::::::S:::::SG HVO_2658 :::::::::::::::MNEPRLDV:::TG:NW:::::::::::::::V::::::::TV::: Hbo2869 ::::::::::::::::MS:MTGETG:Q:::A:::::::::::::::::::::S::::I:: Hmu2520 :::::::::::::::M:G::T::TRFGR::::S:VD::::A:::::::::::::G:::S: Hut2961 ::::::::::::::::-:--::T:RD:::::KT::Q:::::::::::::::::::::IA: rrnAC0151 MSAVFSGGLTQAGGMS:T::VDS:::S:::ISD:VEA:::::I::::::::::I:::V:: consensus GAGFGYALLWVVVLSAGAGALAQYLAMRLGLLTERGIVAVVEDHLGESWAWLLVADAVLA #oth .131..31....22..32.121.1.111.1.1123.1142..24..23...2..3.1.21 HQ1954A ::N::::::::::I::IF::::::::TK:A:E:NE:LIKT::RR::TK::::::::V::V HVO_2658 ::T::::M::::::::VL::S::::S::::::::D:::S:::RE::DG:::A:::::::: Hbo2869 ::::::S:::::L:::V::TV:::::::::::SGQ:::TL::SY:::::::I::V:V:V: Hmu2520 ::::::T:::::IV:::::::S:F:::::::::::::::::::A:::::::::::::::: Hut2961 :::Y::D:::::::::F:::::::::::::::::::::G::::::::::::I::L:::I: rrnAC0151 :GA:::S::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::T::::::G::::: consensus AGVAQLVIMKTVASVSATITGIDARIWGVIWAVILAAGLAGRGYRFLELAAKVLVAAVVL #oth 1.2......211.3..1131131.22..11.112.21....2...12.13..41.32..1 HQ1954A ::F:::::::::::::GLLMPFG:ES:::::::F:TV::::G:::IA:IG:::V:TG::: HVO_2658 ::L::::::QGL:N:::::::V:::V:::V:::V::::::::::::V::L::G::::::V Hbo2869 :::::::::::::::::::::::::::::::::::L::::::::::::::::A::::::: Hmu2520 S::::::::::::G::::M:::::G::::::GLV::V:::::::::::::::L::SL::: Hut2961 :::::::::N:::::::::::L::G:::I:::::::V::::S::::V::F:::::S:::: rrnAC0151 :::::::::::::T::::V::::::::::V::L::::::::G::::::::::I::LL::V consensus AFVASLFVVPIDAGAAAAGLVPSVPSG--GALVAAGILGGAVHITLITMHSYTMRARGWT #oth ..2..212....211.13..2.22.31111.32..111.....1.1...11..11..1.1 HQ1954A ::I:::::::::S:::VS::F:T::I:::::IA::::V:::::V:I:::QT::VK::::: HVO_2658 ::L:::VL::::PA:::G::::RI:::VD::::::::::::::::::::::::::::::: Hbo2869 :::::A:I::::::S:VQ::I:TL::N::::::::::::::::::::::::::::::::D Hmu2520 :::::::::::::::::::::::L:A:::S:VM::::V:::::::::::::::::::::: Hut2961 :::::V::::::PA:::S:::::::G:::S:A:::AV::::::::::::::::::::E:: rrnAC0151 ::::::::::::::::V::::::::::::S:::::::::::::::::::::::::::::: consensus ERDYDLATFDVGASMLVAFGIYSLAIFLVAASVLSSP-----DLTTVGAAQALGPIAGDN #oth 431211.11.122...11..21.211...1.11.323122122.2111..1..1.11.43 HQ1954A QS:A:I:R::ISV:::::::VF:I:T:::::GA:FGN:IDAQG:QAI::::::E::::SF HVO_2658 T:::G:::::::::::::::V:::::::::::::H::EVAAG:::A:A::::::::::A: Hbo2869 :S::G::::::I:::::::::::IS::::::::::D::::::N::::::::::::LV:P: Hmu2520 :::S::::::I:::::LV::L:::::::::::::T:T:::::::::I::::::::::::S Hut2961 ADE:::::::::I::::::::::V:::::T:::::D::::::N:S:::::E::::LV:ER rrnAC0151 RE::::::V::::::::::::::::::::T::::T:G:::::::::::::E::::LV::S consensus AQWLFLLGLGGAAVSTLGGNTIVPPFLIADKLGWGTTVEDSRYRALLAAVALLSAPGAFI #oth .321..2..3........1..2..1112...11.2.221.4...2..112..2.22.1.1 HQ1954A ::RV::I::L:::::::::::L::VYV:::::T:E:N:::T:::V:::GT::V:GA:V:: HVO_2658 :K:::::::L:::::::::::V:::::V::::::::DLS:G:::::::G:::F:GV:::L Hbo2869 :K::::::::::::::::::::::::VV:::::::::::::::::::::F:::::::::: Hmu2520 ::::::V::A::::::::A::::::::::::F::D:D:S:A::::::VG:::::I::::: Hut2961 :EV::::::::::::::::::::::::L::::::::::::::::G::::F:::::::::: rrnAC0151 :R:::::::W:::::::::::::::::L:::::::::I::N:::G::::::::::::::: consensus GGAVLGQLVLVLALGTVGTPFAIAVVLYLLN-SDAVPRPNSTAANLGGVALLAVTGGLAA #oth 1.31211...1..3.11.....1.2..1...1241123311222.31.22222.223..1 HQ1954A P::F:::::::::V::::::::L:L::V:::D:QTTGD:P:V:I:I::I:VFS:ASI::G HVO_2658 :::FFPL::::::F:L:::::::::::V::::G:::SE::::P::::::V:F:::TV::: Hbo2869 ::Q:I::::::::::::::::::::::::::::E:::KS:A:L::A:::GI:L:S:A::: Hmu2520 P:N:::::::I::V::L:::::::I:::::::T:T:S:Q::::T::::::::::::V::: Hut2961 ::E::::::::::I:::::::::::::::::::G::::V::LP:::A::::::::::::: rrnAC0151 ::N:::::::::::::::::::::L::::::::A:::ES::LL::V::L::I::S::::: consensus NFVREQA---------AGGVG-PLSGFVLAFAAALGLATLGLLGKFVREELGAA------ #oth ..122231111111113221312.122.14.122234.232.211221131343332111 HQ1954A :::IS:I:::::::::TS:LT:L:::S::L:::VILF::IL:I:SHL:AQ::D:STTAIS HVO_2658 ::::SR::::::::::LSDL:D:::V::VV::::M:A::::::::::::TV:RPTAA::: Hbo2869 ::::G:I:::::::::::::E:L:::A:::::VI::V:IVV::::Y::::VSV::::::: Hmu2520 ::::::V::::::::::A::::::::::VT:G::IA::::V:G::Y:::::L:-:::::: Hut2961 ::L::T:TIEFFREAT::N:D:V:TAA::S:GVI:SI::::::V::FQ:RVAGTVP:::: rrnAC0151 :::V::L:::::::::G:::::::::::::::I:::::MA::G:::L::::L:-:::::: consensus - #oth 1 HQ1954A E HVO_2658 : Hbo2869 : Hmu2520 : Hut2961 : rrnAC0151 :