|
Pairwise sequence scores | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 4408 | Hmu0536 | VNG2349 | hla0449 | HQ1481A | rrnAC3299 | HVO_0062 |
1919 | Hmu0536 | 4957 | 1095 | 1128 | 1131 | 1582 | 1510 |
3057 | VNG2349 | 1095 | 5073 | 2839 | 3016 | 1308 | 1313 |
2984 | hla0449 | 1128 | 2839 | 4871 | 3111 | 1299 | 1271 |
3148 | HQ1481A | 1131 | 3016 | 3111 | 4761 | 1390 | 1421 |
2386 | rrnAC3299 | 1582 | 1308 | 1299 | 1390 | 4768 | 2872 |
2348 | HVO_0062 | 1510 | 1313 | 1271 | 1421 | 2872 | 4711 |
917 symbols consensus -------------------------------------MPDDSELSRRRFLKATGAAAATA #oth 111111111111111111111111111111111111223353434..3..211.23.211 Hmu0536 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::MDVMPEDTT::G::TVA::G:::: VNG2349 MRTRAHSFHALVALHRPRSRGLDEELKYMLLSPMTMTGDGM:NT:::::::::::::L:: hla0449 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::S:KD::R::Q::RV:::S:L:: HQ1481A ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::V::::VN:::::R::::V:::V rrnAC3299 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::RS:SME::S::::::S:::A: HVO_0062 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::TNK:::::::::::G::TA: consensus ALAGCS-----------DGSDGEEPTDAED-------SGGESS-EQS----YPY---E-- #oth 32...1111112233333222222323233111121242.33343333222111233123 Hmu0536 -:::::::::::SGPSEESTATD::::ST::::::::D::DE:A:P:::::---:::-:: VNG2349 TV:::::::::DSTSDA:::G:S:::::PT:::::::TT:::TDY:PDFDK:::GID:TK hla0449 GI::::GDSGGEPSDGG::::::DGS:S::GSDGEDG:D::DGSD:LMPSS:::GAN:NR HQ1481A GV:::::::::::::::Q:::::TE:ETQT::::PDD:::P::M:F:RPSS:::SPG:TD rrnAC3299 :::::::::::::::::--::SD:TEG::E:::::::GT:---:---::::---:::-:: HVO_0062 :::::T:::::::::::-:G::::T:TT:S:::::::-::---:---::::---:::-:: consensus ---AR-VMEEAG-GPDN---L-W-QY-SP-W-E-ANT-RARLE-----M-I--A-F--LL #oth 232113111111211112221312113112121211131111122222131231212211 Hmu0536 :::--:------:----:::-:-:--:--:-:-:---:-----:::::-:-::-:-::-- VNG2349 VAE::K::::::Y::::KYE:N:L::Q::T:K:M:::I:::::QAHIE:T:ND:N:SS:: hla0449 ISE::A::::::Y::::RFS:D:L::N::A:E:I:::L:::::SVHVD:N:SK:D:GA:: HQ1481A VQS::S::::::F::::RYE:S:T::T::T:K:I:::V:::::SAYID:S:SE:D:GA:: rrnAC3299 :::--:------:----:::-:-:--:--:-:-:---:-----:::::-:-::-:-::-- HVO_0062 :::--:------:----:::-:-:--:--:-:-:---:-----:::::-:-::-:-::-- consensus E-T--G---AFTLGW-ADYP---NF-QLV-P-NT-Y-------NGARL-W-ED---D--- #oth 121221222111111211113221131112121121222223111111212112221232 Hmu0536 -:-::-:::------:----:::--:---:-:--:-:::::::-----:-:--:::-::: VNG2349 :T:KQ:EHE::::::V::::RPR::M:::Q:D::I:GGETAA::::::Y:K::ANS:PGV hla0449 :R:EK:EMD::::::I::::GVR::A:::D:D::I:DAEGASP:::::F:S::SYT:PEV HQ1481A :T:EK:SHE::::::I::::APQ::L:::D:E::V:DADGYTP:::::F:S::ANT:TPI rrnAC3299 -:-::-:::------:----:::--:---:-:--:-:::::::-----:-:--:::-::: HVO_0062 -:-::-:::------:----:::--:---:-:--:-:::::::-----:-:--:::-::: consensus R------------NPGASDDATQTRADAGTNL--EGGLWESAAL-P-YH-----FWYDR- #oth 123232223223311154232432352243421124432332112121122333111112 Hmu0536 -::::::::::::--D::::S:SSVSNTLQMM::----------:-:--:::::-----: VNG2349 :EFMTEQYERLVS:::Q:E::I:::K::A::M:::E:I::::::I:V::NLAQS:::::L hla0449 :SAMSEAFAQLSE:::NK:E:ESA::E:TLR::::KL:::::::L:V::SVEDV:::::V HQ1481A :EYIASQFNRIQD:::LNES:V:::N::VG:I:::A::::::::L:I::SVSEQ:::::V rrnAC3299 -::::::::::::--:GM:STDDSGG:V::D:KE::D::RV---:-:--:::::-----: HVO_0062 -::::::::::::--DETTT::T:EE:T::E:::S:SVFNRI--:-:--:::::-----: consensus -YNPP--M--S--K----V-G--G---L-GTSGTFNTLDPIAAGNTASGIKIMQMFDALM #oth 21111221231231223213123122212142213321..1212213..43222411312 Hmu0536 :----::-::-::-::::-:-::-:::-:-SP:PVQ:::::N:--KG::VGFN:YGSS:L VNG2349 D::::GA:DS:KQ:TNNA:A:ID:KGR:S:I:S:::S:::V:S::::::A:V:DL:::PT hla0449 D::::GG:GV:RA:TSTS:Q:LE:SDT:K:::A:::A:::::S::::::S:V:DI:::PL HQ1481A S::::SG:GG:RS:ENVS:D:IM:KDR:S:::A::SA:::::S::::::G:::N::::P: rrnAC3299 :----::-::-::-::::-:-::-:::-:-NT::MT:M:::E:TD:Q:::V:Q::::P:: HVO_0062 :----::-::-::-::::-:-::-:::-:-L:::IT:M::V::TD:S:::I:Q:V::C:: consensus NYPNGRPEVENLLIADYEVSDDLTEYTFQLKDGVQFHGDYGEVTADDVVYSIRRLAESSN #oth 213125332122213..2211.221.11111212311112212..1.21.121..22.3. Hmu0536 DF:::EYPP:GAV:E::SM:::GLT::::::Q::S::-:GT:L::::::::F::::G:E: VNG2349 ::E:::T:IT::::T:::TN:::S:::LTF:E::::::::::M:::::::::::::::T: hla0449 ::V::TV:::P:::E::TTN::::::E:T::Q::::::::::L::::M:::::::V:::: HQ1481A :::::DT:::P:::S:::::::::::E:T::E:I:::::::::::::::::::::V::N: rrnAC3299 :::DSQ:A::G:MA::::::E:F:T:::::::ATFHN::--T:::S:F::AFE::TA::: HVO_0062 S:Q:AL:T:::E:A:::T::::F:T:::::A:ATYHN:E--T:::S:FI:AWE:::A::: consensus STNAYFII-SSLGIEHET-------DEDG---NYVPGSLGVEATD-DYTFRITLESPFAY #oth .213213212222121.32222222223111132222221.113211122332.431.52 Hmu0536 :R:RDD::GETMT:D::KDASRTEPADEESLAD::::::A:D:V::::::EF::A:::Q: VNG2349 :::QS:A:::T::::::V:::::::::N::::-A:KRAT::::V:::::V:L::::::P: hla0449 :::T::P:::V:N:DR:E:::::::::::::::V::::VA::::G:::::SV::RNS:G: HQ1481A :::T::PN::V:N::R::::::::::A::::::VI:D:T:::::G:E:S:::::QQ::S: rrnAC3299 :SR:::VL:D:::VT:::TTETVDGE:QE:::V:QS:T:::::I::ET:LE:Q::::::S HVO_0062 :RR::::L:D:I:V::::::::::::DE::::::::::::::VGETETELVVN:SE::HD consensus TLEVLAYSAFSAVPEGIVGDIEGYDGEMEYTEFSSS---NPV--GTGPFEFDEWNSGNGG #oth 1.2222122.132.1.22..11.11.114141.2231111.211.4..12132.22.311 Hmu0536 ::SQI:GGT:AIL:A:S:::VD:::::Y::N::F:TAGDG:AYA:L::::V::::K:D-- VNG2349 A:D::T:G:::V::::::::::::E:D:P:P:::A::::::::::::::T:V::D::::: hla0449 A::::S::::::::::::::V:::::D:D:QQ::T-:::::::::C::YV:E:::::V:: HQ1481A :::::::::::VI::::I::::::::::SQ::::TT:::::I:::::::T:V:::::::: rrnAC3299 :::M::::S::P::::M:::::::E:::TQA::::::::::::::N::::::T:D::T-- HVO_0062 :::MF::TS:A:L::::L:::::H:::::::::A:N:::::I:::A:::::AF:EQ:T-- consensus AARVSAFDDYHGQAAAIDGIDDAIIEDDTARYNYFLNENADLA--GIPTAQYDPGL-SSE #oth 233222121.11251332114421223321311112.2...3311311.1211.223223 Hmu0536 :L:LT:::::Y:EGPEL::VTITVV:SANT:FSR:Q:G::::MQED:S::AFN:ES:V:I VNG2349 SYSAD::E:::DG:P:::::::T::S:::::::::::::::::::::::SK:::S:H::G hla0449 EF:A:::T::::GEP:AAN:Q:::LSEPN:I::R:::::::VS::A:::S:F::::::DL HQ1481A SFT:DR::E::::Q:::E:::S:::T:T::S::::::::::V::::::::K:::EK:V:I rrnAC3299 E:::::Y:::Y:ES:SV::VHF:V::N:S:N:::AM:R:::IF::EL::::::::KV:V: HVO_0062 ::A::KY:::Y::V:QV:NVRWQ:::::::::::AM:::::YF:::L:::::::::AQV: consensus EEDDGGRQIGTYGPLRNDKTVNYSRVPTIDTFYVGFNMEKVPKPVRQAMAYVMNQDQFVE #oth 223322134.1.1233113.2.2342121422.22.1143..11..2.2..131223323 Hmu0536 ::TS:S:SV:::-TFDDGT::::GEI:ALR:E:IV::CLE::L:::R:F::A::::EIAK VNG2349 :TLP:::KL:::::ME::::::S:S:S::::Y::::::T:::::::K:::::I:RE:::S hla0449 TSQ::AQ:T::::::G::Q:::M::T:::::::IA::::N:::::::::::::TG:D:T: HQ1481A :ST::SQEF::::::E::::::MA:T:::N::::::H::::::A::::::::T:RE:::D rrnAC3299 ::::Q:::::S::E:::GA:A:::A:SN:GV::L::::AS::::::::V::A:::HTV:: HVO_0062 ST:EY::E::::::V::G::L::VG:::LSIY::::::N::::A::::F:::L::::M:S consensus DVFKGRGEPAYHLTPPQIFP-----------------GGAQAYND-----YPY------- #oth 4.1.11.33.2221.13311111111111111111112.423233333331112222232 Hmu0536 N:Y::T:Q::::M:::AAY:TFEDGVSSAETYDRHAEN:Y:SVTEFGADG:::GYGETLL VNG2349 :::::::VG:F::Q:::L:S:::::::::::::::::D:QEG::N:::::---::::::: hla0449 S:::::::S::::::::::::::::::::::::::::::GEG:A::::::---::::::: HQ1481A :::::::V:::::::::VY::::::::::::::::::::TS:::S:::::---::::::: rrnAC3299 Q:::Q::::::NF::KS::::::::::::::::::::::::N:::RAENE:::GYDDSQL HVO_0062 E::::::SA:EFF:::T:::::::::::::::::::::::::AS:LVSSD:::SAGETDI consensus --AR-VME-AGYG---------T--------------L---L-S--I--------F-T-- #oth 321121112111122322233313231332232322212221312212232332313122 Hmu0536 DE::S:::Q::::ENDRYEITA:TIAGDSAYGSVFTR:QSK:R:AY:DMSIEESQ:G:II VNG2349 ::--:---:----:::::::::-::::::::::::::-:::-:-::-::::::::-:-:: hla0449 ::--:---:----:::::::::-::::::::::::::-:::-:-::-::::::::-:-:: HQ1481A ::--:---:----:::::::::-::::::::::::::-:::-:-::-::::::::-:-:: rrnAC3299 GE::S:::E::::ENERFAMEL:IYE:SGVWSETASI:RDQ:Q:VY:DLEVNQAP:N:LL HVO_0062 EA::Q:::E::::PDNQFEVQW:QYN:NNAWEEMASI:RDQ:A:AH:NMQIQKAD:S:LL consensus -R--NG--E---LG-----P-P-NFL--L----------------HWQGE---------- #oth 212211321323112322212121112212222222233211111212212222222123 Hmu0536 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11112123221222311 Hmu0536 ::::N:TFDQ:TKGE:: VNG2349 --:::-::::-:::::: hla0449 --:::-::::-:::::: HQ1481A --:::-::::-:::::: rrnAC3299 ::PSR:KMNT:SLGDRE HVO_0062 ::PSR:KLNT:TLNR::