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[E] (DdpA) COG0747 ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component
6 genomes BUD1549 6 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi

VNG2349

rrnAC3299

HVO_0062

-

Hmu0536

-

hla0449

-

HQ1481A

Pairwise sequence scores
Consensus score4408 Hmu0536 VNG2349 hla0449 HQ1481A rrnAC3299 HVO_0062
1919Hmu0536 4957 1095 1128 1131 1582 1510
3057VNG2349 1095 5073 2839 3016 1308 1313
2984hla0449 1128 2839 4871 3111 1299 1271
3148HQ1481A 1131 3016 3111 4761 1390 1421
2386rrnAC3299 1582 1308 1299 1390 4768 2872
2348HVO_0062 1510 1313 1271 1421 2872 4711

917 symbols
consensus       -------------------------------------MPDDSELSRRRFLKATGAAAATA
#oth            111111111111111111111111111111111111223353434..3..211.23.211
Hmu0536         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::MDVMPEDTT::G::TVA::G::::
VNG2349         MRTRAHSFHALVALHRPRSRGLDEELKYMLLSPMTMTGDGM:NT:::::::::::::L::
hla0449         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::S:KD::R::Q::RV:::S:L::
HQ1481A         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::V::::VN:::::R::::V:::V
rrnAC3299       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::RS:SME::S::::::S:::A:
HVO_0062        ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::TNK:::::::::::G::TA:

consensus       ALAGCS-----------DGSDGEEPTDAED-------SGGESS-EQS----YPY---E--
#oth            32...1111112233333222222323233111121242.33343333222111233123
Hmu0536         -:::::::::::SGPSEESTATD::::ST::::::::D::DE:A:P:::::---:::-::
VNG2349         TV:::::::::DSTSDA:::G:S:::::PT:::::::TT:::TDY:PDFDK:::GID:TK
hla0449         GI::::GDSGGEPSDGG::::::DGS:S::GSDGEDG:D::DGSD:LMPSS:::GAN:NR
HQ1481A         GV:::::::::::::::Q:::::TE:ETQT::::PDD:::P::M:F:RPSS:::SPG:TD
rrnAC3299       :::::::::::::::::--::SD:TEG::E:::::::GT:---:---::::---:::-::
HVO_0062        :::::T:::::::::::-:G::::T:TT:S:::::::-::---:---::::---:::-::

consensus       ---AR-VMEEAG-GPDN---L-W-QY-SP-W-E-ANT-RARLE-----M-I--A-F--LL
#oth            232113111111211112221312113112121211131111122222131231212211
Hmu0536         :::--:------:----:::-:-:--:--:-:-:---:-----:::::-:-::-:-::--
VNG2349         VAE::K::::::Y::::KYE:N:L::Q::T:K:M:::I:::::QAHIE:T:ND:N:SS::
hla0449         ISE::A::::::Y::::RFS:D:L::N::A:E:I:::L:::::SVHVD:N:SK:D:GA::
HQ1481A         VQS::S::::::F::::RYE:S:T::T::T:K:I:::V:::::SAYID:S:SE:D:GA::
rrnAC3299       :::--:------:----:::-:-:--:--:-:-:---:-----:::::-:-::-:-::--
HVO_0062        :::--:------:----:::-:-:--:--:-:-:---:-----:::::-:-::-:-::--

consensus       E-T--G---AFTLGW-ADYP---NF-QLV-P-NT-Y-------NGARL-W-ED---D---
#oth            121221222111111211113221131112121121222223111111212112221232
Hmu0536         -:-::-:::------:----:::--:---:-:--:-:::::::-----:-:--:::-:::
VNG2349         :T:KQ:EHE::::::V::::RPR::M:::Q:D::I:GGETAA::::::Y:K::ANS:PGV
hla0449         :R:EK:EMD::::::I::::GVR::A:::D:D::I:DAEGASP:::::F:S::SYT:PEV
HQ1481A         :T:EK:SHE::::::I::::APQ::L:::D:E::V:DADGYTP:::::F:S::ANT:TPI
rrnAC3299       -:-::-:::------:----:::--:---:-:--:-:::::::-----:-:--:::-:::
HVO_0062        -:-::-:::------:----:::--:---:-:--:-:::::::-----:-:--:::-:::

consensus       R------------NPGASDDATQTRADAGTNL--EGGLWESAAL-P-YH-----FWYDR-
#oth            123232223223311154232432352243421124432332112121122333111112
Hmu0536         -::::::::::::--D::::S:SSVSNTLQMM::----------:-:--:::::-----:
VNG2349         :EFMTEQYERLVS:::Q:E::I:::K::A::M:::E:I::::::I:V::NLAQS:::::L
hla0449         :SAMSEAFAQLSE:::NK:E:ESA::E:TLR::::KL:::::::L:V::SVEDV:::::V
HQ1481A         :EYIASQFNRIQD:::LNES:V:::N::VG:I:::A::::::::L:I::SVSEQ:::::V
rrnAC3299       -::::::::::::--:GM:STDDSGG:V::D:KE::D::RV---:-:--:::::-----:
HVO_0062        -::::::::::::--DETTT::T:EE:T::E:::S:SVFNRI--:-:--:::::-----:

consensus       -YNPP--M--S--K----V-G--G---L-GTSGTFNTLDPIAAGNTASGIKIMQMFDALM
#oth            21111221231231223213123122212142213321..1212213..43222411312
Hmu0536         :----::-::-::-::::-:-::-:::-:-SP:PVQ:::::N:--KG::VGFN:YGSS:L
VNG2349         D::::GA:DS:KQ:TNNA:A:ID:KGR:S:I:S:::S:::V:S::::::A:V:DL:::PT
hla0449         D::::GG:GV:RA:TSTS:Q:LE:SDT:K:::A:::A:::::S::::::S:V:DI:::PL
HQ1481A         S::::SG:GG:RS:ENVS:D:IM:KDR:S:::A::SA:::::S::::::G:::N::::P:
rrnAC3299       :----::-::-::-::::-:-::-:::-:-NT::MT:M:::E:TD:Q:::V:Q::::P::
HVO_0062        :----::-::-::-::::-:-::-:::-:-L:::IT:M::V::TD:S:::I:Q:V::C::

consensus       NYPNGRPEVENLLIADYEVSDDLTEYTFQLKDGVQFHGDYGEVTADDVVYSIRRLAESSN
#oth            213125332122213..2211.221.11111212311112212..1.21.121..22.3.
Hmu0536         DF:::EYPP:GAV:E::SM:::GLT::::::Q::S::-:GT:L::::::::F::::G:E:
VNG2349         ::E:::T:IT::::T:::TN:::S:::LTF:E::::::::::M:::::::::::::::T:
hla0449         ::V::TV:::P:::E::TTN::::::E:T::Q::::::::::L::::M:::::::V::::
HQ1481A         :::::DT:::P:::S:::::::::::E:T::E:I:::::::::::::::::::::V::N:
rrnAC3299       :::DSQ:A::G:MA::::::E:F:T:::::::ATFHN::--T:::S:F::AFE::TA:::
HVO_0062        S:Q:AL:T:::E:A:::T::::F:T:::::A:ATYHN:E--T:::S:FI:AWE:::A:::

consensus       STNAYFII-SSLGIEHET-------DEDG---NYVPGSLGVEATD-DYTFRITLESPFAY
#oth            .213213212222121.32222222223111132222221.113211122332.431.52
Hmu0536         :R:RDD::GETMT:D::KDASRTEPADEESLAD::::::A:D:V::::::EF::A:::Q:
VNG2349         :::QS:A:::T::::::V:::::::::N::::-A:KRAT::::V:::::V:L::::::P:
hla0449         :::T::P:::V:N:DR:E:::::::::::::::V::::VA::::G:::::SV::RNS:G:
HQ1481A         :::T::PN::V:N::R::::::::::A::::::VI:D:T:::::G:E:S:::::QQ::S:
rrnAC3299       :SR:::VL:D:::VT:::TTETVDGE:QE:::V:QS:T:::::I::ET:LE:Q::::::S
HVO_0062        :RR::::L:D:I:V::::::::::::DE::::::::::::::VGETETELVVN:SE::HD

consensus       TLEVLAYSAFSAVPEGIVGDIEGYDGEMEYTEFSSS---NPV--GTGPFEFDEWNSGNGG
#oth            1.2222122.132.1.22..11.11.114141.2231111.211.4..12132.22.311
Hmu0536         ::SQI:GGT:AIL:A:S:::VD:::::Y::N::F:TAGDG:AYA:L::::V::::K:D--
VNG2349         A:D::T:G:::V::::::::::::E:D:P:P:::A::::::::::::::T:V::D:::::
hla0449         A::::S::::::::::::::V:::::D:D:QQ::T-:::::::::C::YV:E:::::V::
HQ1481A         :::::::::::VI::::I::::::::::SQ::::TT:::::I:::::::T:V::::::::
rrnAC3299       :::M::::S::P::::M:::::::E:::TQA::::::::::::::N::::::T:D::T--
HVO_0062        :::MF::TS:A:L::::L:::::H:::::::::A:N:::::I:::A:::::AF:EQ:T--

consensus       AARVSAFDDYHGQAAAIDGIDDAIIEDDTARYNYFLNENADLA--GIPTAQYDPGL-SSE
#oth            233222121.11251332114421223321311112.2...3311311.1211.223223
Hmu0536         :L:LT:::::Y:EGPEL::VTITVV:SANT:FSR:Q:G::::MQED:S::AFN:ES:V:I
VNG2349         SYSAD::E:::DG:P:::::::T::S:::::::::::::::::::::::SK:::S:H::G
hla0449         EF:A:::T::::GEP:AAN:Q:::LSEPN:I::R:::::::VS::A:::S:F::::::DL
HQ1481A         SFT:DR::E::::Q:::E:::S:::T:T::S::::::::::V::::::::K:::EK:V:I
rrnAC3299       E:::::Y:::Y:ES:SV::VHF:V::N:S:N:::AM:R:::IF::EL::::::::KV:V:
HVO_0062        ::A::KY:::Y::V:QV:NVRWQ:::::::::::AM:::::YF:::L:::::::::AQV:

consensus       EEDDGGRQIGTYGPLRNDKTVNYSRVPTIDTFYVGFNMEKVPKPVRQAMAYVMNQDQFVE
#oth            223322134.1.1233113.2.2342121422.22.1143..11..2.2..131223323
Hmu0536         ::TS:S:SV:::-TFDDGT::::GEI:ALR:E:IV::CLE::L:::R:F::A::::EIAK
VNG2349         :TLP:::KL:::::ME::::::S:S:S::::Y::::::T:::::::K:::::I:RE:::S
hla0449         TSQ::AQ:T::::::G::Q:::M::T:::::::IA::::N:::::::::::::TG:D:T:
HQ1481A         :ST::SQEF::::::E::::::MA:T:::N::::::H::::::A::::::::T:RE:::D
rrnAC3299       ::::Q:::::S::E:::GA:A:::A:SN:GV::L::::AS::::::::V::A:::HTV::
HVO_0062        ST:EY::E::::::V::G::L::VG:::LSIY::::::N::::A::::F:::L::::M:S

consensus       DVFKGRGEPAYHLTPPQIFP-----------------GGAQAYND-----YPY-------
#oth            4.1.11.33.2221.13311111111111111111112.423233333331112222232
Hmu0536         N:Y::T:Q::::M:::AAY:TFEDGVSSAETYDRHAEN:Y:SVTEFGADG:::GYGETLL
VNG2349         :::::::VG:F::Q:::L:S:::::::::::::::::D:QEG::N:::::---:::::::
hla0449         S:::::::S::::::::::::::::::::::::::::::GEG:A::::::---:::::::
HQ1481A         :::::::V:::::::::VY::::::::::::::::::::TS:::S:::::---:::::::
rrnAC3299       Q:::Q::::::NF::KS::::::::::::::::::::::::N:::RAENE:::GYDDSQL
HVO_0062        E::::::SA:EFF:::T:::::::::::::::::::::::::AS:LVSSD:::SAGETDI

consensus       --AR-VME-AGYG---------T--------------L---L-S--I--------F-T--
#oth            321121112111122322233313231332232322212221312212232332313122
Hmu0536         DE::S:::Q::::ENDRYEITA:TIAGDSAYGSVFTR:QSK:R:AY:DMSIEESQ:G:II
VNG2349         ::--:---:----:::::::::-::::::::::::::-:::-:-::-::::::::-:-::
hla0449         ::--:---:----:::::::::-::::::::::::::-:::-:-::-::::::::-:-::
HQ1481A         ::--:---:----:::::::::-::::::::::::::-:::-:-::-::::::::-:-::
rrnAC3299       GE::S:::E::::ENERFAMEL:IYE:SGVWSETASI:RDQ:Q:VY:DLEVNQAP:N:LL
HVO_0062        EA::Q:::E::::PDNQFEVQW:QYN:NNAWEEMASI:RDQ:A:AH:NMQIQKAD:S:LL

consensus       -R--NG--E---LG-----P-P-NFL--L----------------HWQGE----------
#oth            212211321323112322212121112212222222233211111212212222222123
Hmu0536         S:AI::DM:VFG::DGMEY:G:Q:::RF:WGNNPGSQFT::::::R:GA:GSFYTEEYRQ
VNG2349         :-::--::-:::--:::::-:-:---::-:::::::::::::::::Y:::::::::::::
hla0449         :-::--::-:::--:::::-:-:---::-:::::::::::::::::::::::::::::::
HQ1481A         :-::--::-:::--:::::-:-:---::-::::::::::::::::::::-::::::::::
rrnAC3299       E:GR::EL:MYS::WVADW:A:D:::QL:NPPQTDTSLDFPISYVN::P:NGDAAQQ:AE
HVO_0062        E:GR::QL:AYT::WIADW:A:D:::QL:NPPQTDTSEQGPISYVN:TA:NGDAAQQ:AT

consensus       -A---------P----Q--R--A----E--NW--V--LP--------FW---VD------
#oth            312223322221222312312212333132112212211222333231122311322322
Hmu0536         T:MDAWENKYQ:DDST:QS:NE:FQTV:EM::AS:QE::TVNPVAQR::QEY::VEMHGV
VNG2349         :-:::::::::-::::-::-::-::::-::--::-::--::::::::--:::--::::::
hla0449         :-:::::::::-::::-::-::-::::-::--::-::--::::::::--:::--::::::
HQ1481A         :-:::::::::-::::-::-::-::::-::--::-::--::::::::--:::--::::::
rrnAC3299       E:YQAIAENPA:TEED:TA:ND:YLEM:NA::ED:AM::VYHELTEL::YDH::FAPPAG
HVO_0062        D:YQQVVNNPA:TDEA:QV:DE:YVDI:MA::ED:AM::VYNQKEEM::YDT::IEPFGG

consensus       MG---Q----V------
#oth            11112123221222311
Hmu0536         ::::N:TFDQ:TKGE::
VNG2349         --:::-::::-::::::
hla0449         --:::-::::-::::::
HQ1481A         --:::-::::-::::::
rrnAC3299       ::PSR:KMNT:SLGDRE
HVO_0062        ::PSR:KLNT:TLNR::