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Pairwise sequence scores | |||||||
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Consensus score | 2680 | VNG2347 | hla0450 | HQ1480A | Hmu0537 | rrnAC3298 | HVO_0061 |
1983 | VNG2347 | 2734 | 1837 | 1890 | 1261 | 1355 | 1368 |
1895 | hla0450 | 1837 | 2718 | 1891 | 1200 | 1327 | 1306 |
1940 | HQ1480A | 1890 | 1891 | 2722 | 1276 | 1285 | 1386 |
1652 | Hmu0537 | 1261 | 1200 | 1276 | 2560 | 1590 | 1579 |
1895 | rrnAC3298 | 1355 | 1327 | 1285 | 1590 | 2594 | 1861 |
1843 | HVO_0061 | 1368 | 1306 | 1386 | 1579 | 1861 | 2685 |
369 symbols consensus MNRAAYILKRLALSIPVLIFGTTMTFAIIYLGPIDPVLAIL--GQQANPEAARQLRISLG #oth 11.55.221.23121..331.2.31111211..11.1421.11.42321412122134.1 VNG2347 :::PL::A:::L:GV:::L::L:L::L:L:::::::::::::::KD:T:T:::N:E:::: hla0450 :::G:::I:::G:AV::MM::I::S:L:L::::::::GS::::::::T::DI::::ME:N HQ1480A :::FI:::::F::A::::L::L::S:L:M:K:::::::S:::::RD:::::::::::::: Hmu0537 VS:LR::A::V:::V::VWL:::::W::::::::::ATRL:SE::TQ::A:YEAA:TQ:: rrnAC3298 :S::T:M::::V:::::I:::::V:::::R:::LS:AA::::::P:GDAR:I::IEQR:: HVO_0061 :S:WQ:F:R:VLM::::V:::::I:::L:R:::L:::S::::::T:Y::Q::E:I:TN:: consensus LNQ--G---PLWEQYFDFMSDLFTFDLGQSWVIARGTPVAALIIGRAPRTIWLGFWSVLI #oth 234221322.1131.342243121111.21.42332331532.342212.1...1.1.21 VNG2347 IRYPN:SLV:::V::KN:LVNMV:::F:T::A:::DQ::::M:V::L:A::::::::::V hla0450 YIDAA:NPV:::::::GVV:::::L:F:E::T:Q:E:::TE:::N:M:A:L:::::::I: HQ1480A IIRPN:TPI::::::GMVLR::V::QF::::I:Q::AS:QSV:L::MAP:L:::W:::V: Hmu0537 :D:::-::::PLQH:::W:GS:L::::::T:LLYQ:SD:N:::LDFL:::L::::::::: rrnAC3298 ::E::-::::::::::E::::::L::::::::VNS:::AID:::SY::::::::::A::: HVO_0061 :::::-::::::S::L:::YR::::Q::::::::P::TAYE::EIY::::::::::::V: consensus ALGIGIPLGLYAGLNANTWSDYAASFGGIVWRAMPNFWLAVMLSGLLSAGGALFG--F-W #oth .132.1.1.1...122.142..3..21..1.........111132312222324311131 VNG2347 ::FV:::V:::::::S:S:::::::::::::::::::::::::::::T:::V:D:::-:Y hla0450 :::A:V::::::::R:::LR::T::GF::::::::::::::II:::IT:::::EF::-:Y HQ1480A ::L::::V::::::K::::G::V::G:::I::::::::::::IA:S:::::V:SW::-:Y Hmu0537 :VC::V:::F:::MRS::A:::V::M:::::::::::::GI::LAV:GSSQ:I:::::D: rrnAC3298 :::::::::F:::::P::F:::F::::::::::::::::::I:VTV::QSEQ::::::S: HVO_0061 ::FV:::::F:::::P::P:::::::::::::::::::::I::VTA::QL:TWTNGL:A: consensus RSFIVETDVVGTPPALARLFTPIDPFAGDPGLEL--IP-PNLENFAAAFKWILPAALVLG #oth 33331312132113215513243242443143333311211323245.1.211.1.1... VNG2347 GD:LIK::::::SN::QH::SG::::::V:V::FFW::V:::GPM:E::::::::::::: hla0450 :TA::::P:S:::D::NN:::TV:I:::V:Y:::LF::V:::GPMFV::::::::::::: HQ1480A :A:G:N:::I:::A:VRQ:::V::::GAA:IIG:VI::I::V:::II::::::::::::: Hmu0537 Q:LWI:L:ALTGS:D:S::H:-------------::--:--V:G:L::T:KV::::I::: rrnAC3298 T::::::N::-:S:N::V:KN:T-RLIT:::QAW::--:---T:L:K:T:Q:::P::::: HVO_0061 QTW::R:N::-:::::DFFQS:VEQ:LE:::-GW::--:--T:S:VR:T:Q:A::::::: consensus SASMGNEMRIGRTAVLESINSKYVETAKAKGVSPRRIIWKHIGRNALIPLLPVIMGEAFL #oth .1...1.2.........22113.111.1...1.3.3112..11...21..1.1.12.111 VNG2347 :S:::::V::::::::::LR:E::D:::::::::::::V:::::::V::::::::::FY: hla0450 :S:::::V:::::::::::::::::::::::L::::::V::V::::V::::::::::FY: HQ1480A :::::::I::::::::::L::::I:::::::L:A::::I::V::::IV:::::::::FY: Hmu0537 :::::::::::::::::VR:ED::DL:R:::::E:ALV::::F:::::::V:I:TS:::: rrnAC3298 :::::T:::::::::::T:::::::::::::::::VLV::::F:::::::V:::TA:::I HVO_0061 :::::::::::::::::T:::N:::::R:::::G:SLV::::F:::::::V:I:T::::: consensus LIGGSVLVETVFSINGIGNLFFRAALNGDIPLVGTLMFIFILIQVGFNILQDFLYTIIDP #oth .2....1..3..2...1.2..11.1422.1.1212.112..222113.13..31..21.. VNG2347 :::::::::K:::::::::::I:::F:S:::VMMS:V:::::M:IL::L:::V:::Y::: hla0450 :V:::::::A::G:::L:::::N:V:GP:::::MA:V::::V::IL:::G::L:::Y::: HQ1480A :::::::::Q::::::L:::::::V:GP:::V:M::V:V::I:::L:::T::I:::VV:: Hmu0537 ::::::::::::::::::L:::N::TQ::L:::::::YV:::LI::V:L:::V:::V::: rrnAC3298 ::::::::::::::::::L::::::EQ::L:::::::YL:::LI::L::V:::A:::::: HVO_0061 :L::::F:::::A:::L:W:::N::I:::L::I::::::::::L::T::::::::::::: consensus RIGLDDT-- #oth .12133322 VNG2347 ::T:S::TE hla0450 ::S:GESE: HQ1480A ::T:E::EQ Hmu0537 :V::EGA:: rrnAC3298 :V:Y:A-:: HVO_0061 :V:Y:G-::