Home |  Text search
6 genomes BUD1554 6 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi

VNG0738

-

HVO_1826

Hbo1656

Hmu0400

-

hla1133

-

HQ1071A

Pairwise sequence scores
Consensus score1101 VNG0738 Hmu0400 hla1133 HQ1071A HVO_1826 Hbo1656
572VNG0738 1088 452 450 410 396 390
675Hmu0400 452 1080 491 434 483 444
709hla1133 450 491 1178 473 545 551
712HQ1071A 410 434 473 1118 525 586
766HVO_1826 396 483 545 525 1132 714
751Hbo1656 390 444 551 586 714 1107

162 symbols
consensus       MAERLPSDHESVQSYRASIARSGGTRRPCLRLPAD--------------LSLAAGDVIRL
#oth            13311111124.314.232212.111.12222.312111111111111343233112112
VNG0738         :T::V--T::T:::G:G:VV:A:::::LAVQV:::S::::::::::::AA::PV:::V:V
Hmu0400         V:D:::::::A:ETR:VEV:SV:R:D::RIE:::::::::::::::::::DV::::::EC
hla1133         :P-:V:::D:G:A:I:V:L::::::::::V:I:N:DELDGRVESGTCES::::::::::V
HQ1071A         ::G::::::DQ:::::::LI:::RI:::::Q::TE::::::::::::::IT:TEDE::::
HVO_1826        VP:Q:::::P:::TF::N:::::::::::::V:D:::::::::::::::VTA:D::FV::
Hbo1656         VS::V::::D::M::::T:::::::::::::::DE:::::::::::::VTAVED::I:::

consensus       VLDGEQYHARVSADADG-RVIRGAYDNRRLAREPGEGENRLVEWCADHDRAIGDAVELDV
#oth            4112333..22431232233211.2213.1.1311213.2.22.23342233.32122.1
VNG0738         ::::SEH::S:A:T::DTP:V::::ATP::::Q:NGAD:E:AA:L::AGLEA:RS:HV::
Hmu0400         :::::::::::ETTL::EPMLQH:A::::::::-:D::::::::F::S:C:::GS:H:::
hla1133         AI:R:E:::P:RS:SE:::I::::F::::::::::::A:::A::LDEN::EP::VIV:::
HQ1071A         L::EQ:T:::I:IT:ADEQ:::::FK:S:V:QA::::::L:EG::EK::LQ::::::V::
HVO_1826        H:G:TA::::L::::S::L::::::::K::::T:ND:::::::::RE::::D:::::::E
Hbo1656         S:G::LF::::T::SSS::LL::::::K::::T::::T:::::::EATS:DP:S:::F:E

consensus       LDAGFCYGLRAPGERTVYEATSRPNDSLASIARDLGD-DE--
#oth            132.24....5..4131.33243.231.22..3411441321
VNG0738         VA:::K::::::::TAT::S:GT:DEG::D::AS:::G:GA:
Hmu0400         VT::YT::::T::S:V::T::DS:D:::::::D:::E:--::
hla1133         VVP:EL::::I:::::::::NRG:RS::SD:::::--::G::
HQ1071A         ::::::::::S::D:V::SVP::::A::H::::N:-:Q:TTE
HVO_1826        ::D:YQ::::V::V:Q::RI:E::::::S:::EQF:PS::::
Hbo1656         ::::::::::E::K::::SVP::::E:::N::EKF-TR::::