| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 1629 | HVO_1369 | pNG7303 | VNG0533 | HQ2281A | Hut2451 | hla1623 |
| 1066 | HVO_1369 | 1637 | 945 | 846 | 887 | 934 | 918 |
| 1117 | pNG7303 | 945 | 1648 | 912 | 951 | 991 | 1040 |
| 1253 | VNG0533 | 846 | 912 | 1764 | 1107 | 1155 | 1145 |
| 1305 | HQ2281A | 887 | 951 | 1107 | 1613 | 1168 | 1202 |
| 1370 | Hut2451 | 934 | 991 | 1155 | 1168 | 1642 | 1242 |
| 1402 | hla1623 | 918 | 1040 | 1145 | 1202 | 1242 | 1629 |
245 symbols consensus -----------------MDLDQFTAEHAPTEGAETFQLENSYTLDIDVDGTVMAKAGSMV #oth 11111111111111111.1211.232222223224.33..221.11222.3111...1.. HVO_1369 :::::::::::::::::::::E:VSA:::S::GDS:E::::KL::VAL::N::::::::: pNG7303 ::::::::::::::::::::QE:VRSN::AD:GDG::K::NRL:::PL:::::V:::::: VNG0533 MGCGGDLAHEAVRLRFV:NI:::N:ADTASDD:P-:AI::::::A:::::D::::::A:: HQ2281A :::::::::::::::::::I::::T::SS::T::M:E::::::::::IT::::::::::: Hut2451 :::::::::::::::::::V:E:::::::::TD:::S:::R::::VA:E:SLL::::::: hla1623 ::::::::::::::::::N:::::::N:::ASD::::R:::::::V:::::::::::::: consensus AYTGDISFTGKSSAEGGITGFLKEAATGEGTPIMRAEGTGHLYLADQGKKVQILELDAGE #oth 1.1.231.1112231..11.22.1111...112.411.3.21.2.142.1..213.2111 HVO_1369 G:::::::ER::A--::LK:M::QK:::::DVM:Q:T::::::::::::E:::::::::: pNG7303 ::::EVT::::::V:::::::V:::VS:::::V:E:::S::::V:EN:::::V:A::D:: VNG0533 ::::EF:::::R:::::L::II::::::::::::::::::T:::::AQ::::::::A:DD HQ2281A ::K:NL::::Q:::::::::::::::S:::::V:TV::D:Q::::::Q::::L:K:::D: Hut2451 :::::L::::QATP:::::::I:::::::::::::V::::::::::HE:E::L:R::D:: hla1623 :::::::::::A::::::::::::::::::::::SV::E::V:F::D:::::VV::G::: consensus SITVNGEDVLAFESSLSYEITTIDSLAGAFAGGLTNVYLQGPGHVALTTHGDPIVLEPPV #oth 311...2......24222214232.11.331..12..313...31.1....1.2.242.. HVO_1369 ELS:::N::::::::VNWD:KMLT:V::TSS:::F::F:E::::::I::::E:::VPT:: pNG7303 ::S:::T:::::::TID:::N:VG::S:MA:::::::::T:::E:::::::::L:MT::: VNG0533 R:::::::::::::E::::V::M:::::S::::F:::AIS:::C:::::::::L:VA::: HQ2281A A::::::::::::NDV:FK:D:::::::SL:::::::::::::YI:I:::::::::DR:: Hut2451 ::::::::::::::G::::::E:::::::::::F:::S:::::::::::::::V:M:::: hla1623 :::::::::::::E::::::S::::::::::::FS::::E:::Y:::::::::::::::: consensus TTDPSATVAWSGT-SPSVEVNKNLSDMIGQESGERFQMEFDGPG---GFVVVQPYEEHA- #oth 4...3.....12122.222214332222.12...13.13.3242111...11.13..322 HVO_1369 K:::N:::::::NV:::SNRDIDIKGLL:RS:::SY:L::A:E:::::::I:::F::V:P pNG7303 F:::D::::::SNL:::I:M::TFE--:::T:::SI::::T:DE:::::::I:QN::GSV VNG0533 :::::::::::A::T:::D::AS::::V:::::::::::::DA:TDS:::::::::::V: HQ2281A S:::::::::G:::D::I:::::::::V:::::::L::D::SSD:::::::::::::L:: Hut2451 ::::G::::::S::T:D::::T:V::::::::::::::Q:TD::::::::I::::::::: hla1623 A:::::::::G:::::N::::RS::::::::::::Y::R:E::D::::::::::R:::V: consensus ----- #oth 21111 HVO_1369 GQ::: pNG7303 TQSQS VNG0533 ::::: HQ2281A ::::: Hut2451 ::::: hla1623 :::::