6 genomes BUD1564 11 proteins a Hsa Halobacterium sp. NRC-1 b Hma Haloarcula marismortui f Hvo Haloferax volcanii g Hbo Halogeometricum borinquense h Hmu Halomicrobium mukohataei i Hut Halorhabdus utahensis j Hla Halorubrum lacusprofundi q Nph Natronomonas pharaonis x Hwa Haloquadratum walsbyi - rrnAC1961 rrnAC2353 HVO_0566 HVO_1711 HVO_A0149 Hbo0964 Hbo3122 - Hut1749 hla1764 hla2748 - HQ2539A

Pairwise sequence scores
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2608	HVO_A0149	5158	2211	2260	2126	2275	1760	2139	2290	2226	1928	1509
3141	rrnAC2353	2211	5208	2652	2560	2614	2070	2313	2507	2368	2224	1773
3135	hla2748	2260	2652	5665	2883	2821	2095	2156	2424	2302	2121	1790
3037	Hbo0964	2126	2560	2883	5296	2976	1843	2157	2349	2257	1999	1662
3187	HVO_0566	2275	2614	2821	2976	5217	1874	2292	2428	2339	2064	1789
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1690 symbols
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Hut1749         ::::::::::::::::::----------------::------------------------

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HQ2539A         R::AI::::AA::::Y:::::::A::::::::::::::D:D:::I:::::::LV::::::
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Hbo3122         :T:::::H:SA::::Y:::::::A::::::::::::::N:::::I::::T:D:V::::::
rrnAC1961       E::T:K:::DS::::S::::::L:V:::::::::::ML:D::::::::S::::I::::::
Hut1749         -------------------------:::::::::::-----:::----------------

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hla2748         ::T:I::V:ETD:A::TRH:V:::D::L:R:TIDV:DDGHANVD:::LS::VYAR:::::
Hbo0964         ::T:IV:::ETPYGP:T:::C:V:ET::::FDASEAD:::::::-ENLAV::CIG:::G:
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hla1764         ::P:::::Y:::::::::F::VVSDT:L:::::::::::::::P::::::::ACA:S::M
HQ2539A         E:::::::F:::G::I::F:::I::::L::::::Q::::::::I:T::H:T::::L::E:
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Hut1749         ---------------------------------:---:::::::----------------

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HVO_A0149       ::G:::::V:D::::::::::::::N::::::GT::EFVECTP:VL:::::::AAESRS:
rrnAC2353       :TGQQSL:M:GN:::::::S::A:::S:::FIGV::E::T:A:::::::S:LV::::VS:
hla2748         ::N:::::RYD:::::::::I::::AD:::F::SD::FT:L:::L:TT:P:L:::A:TDL
Hbo0964         :::QIA::R:G::::::::::::::AE:T::V:SA::FEEL::EAFGT:ESFV::E:TTY
HVO_0566        :::L::::T:G:::::::::::A::AE:::F::S:PAFEH:E:RV::G:::L:SEGEV:L
hla1764         VEG:::N:V::EAGPQSGSV::::::T:::F:T:::::SAAH::RLRTVS:L:GESGEG:
HQ2539A         :E::::R::::NGGPGNTH:::::::N::::IT:::::S::::::::::::::SSET:T:
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rrnAC1961       S:SG::S:::::AGPDNSRVL::::::::::::S:::::A:A::R:::LA:::E:S:I::
Hut1749         ------------:::::::---:::::::::::::::::S::::R::Q:E::V::A:V::

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#oth            .266672411233.1232324112343.54543112221122472611111111111111
HVO_A0149       :EFGASEE::ES::T:G:G:RVAF::::E:SLV::-:-::::IETQ::::::::::::::
rrnAC2353       ::DTGAR:::::T:T:G:LL:::FV:::GVTL:::-:-::T:A:D:::::::::::::::
hla2748         ::DRDG::::EE::::E:I:D::F::::V:TVG::-:-::T:RE::::::::::::::::
Hbo0964         ::PVTD::::EGH::::::GVV:TT:::T:TVA:Y-:-::TSRS:H::::::::::::::
HVO_0566        ::PRTD:C::EGQ:::A::GTV:F::S:A::VGH:-:-::T:DT::::::::::::::::
hla1764         :HRGEI:QR::S::TP::::R::F:R:::TE:V::ASRAVL:RR::RETVDDAKDAISDG
HQ2539A         ::::::EQ::::H::S:I:::::::R::::VQ::::T::::::Q:V::::::::::::::
HVO_1711        ::::::::::::H::::::::::::QE:::::::::T::::::::M::::::::::::::
Hbo3122         ::::::::::::H::::I:::::::P::::::::::T::::::GTL::::::::::::::
rrnAC1961       ::SEPVE:RDQ:::T::FL:T:::DRS::SKD::::S::::N:D:V::::::::::::::
Hut1749         ::GS:TRA:DQ::::::FL::::::EV::GS:::::S::::::D:I::::::::::::::

consensus       -DREDALSDLRRCATEHDDADDLRAAARERAEVTVPDHVPRQDLVRADLRVLSLLSAPSG
#oth            14.54124524644554644242362164375462365524564225.221.2..3235.
HVO_A0149       :S:S::::AVAT-R:RRPNS:SASLL:TA:QAGQY:TVTD:--::AT::S::E:::::T:
rrnAC2353       :::DT:::TID:LVSD:YTSET:LE:GQAQRRW:::AET:NRES:V:::::::::::AN:
hla2748         :T::A:RDR:AKLFDTL::P:A:A:::G:TIP-S::ES::A:ES:V:::::::::::E::
Hbo0964         :T:::::DVV:SA:ADY:AEKLA:V::DTTNT:A---DA:YG:A:AT::H::::::GRR:
HVO_0566        :G:::::DRV:DLVAR--:L::::ER:ATEV:GA::::-RESAAM:D:I:::::::GAL:
hla1764         P::QRRIEE:S:I::AYP::::::E::EG:GP-::::D:::RSV:AG:::A:D::T:E::
HQ2539A         :S:DE::::::N::V::KS:::I:T:::::::IS:SN:I:::QI::::::A::::Q::A:
HVO_1711        :A:T:::A:::H:SVQ:AT::A::D::::Q:::F:::GT::ERI::::::A::::T::::
Hbo3122         :T::E:::::TH::L::AS::SI::::::::::Y::E:::::::::S:::A::::T::T:
rrnAC1961       ::::T::L::AD:V:::TTS::::Q:G:::TRID:AESM::S::I:M:::::D:::S:T:
Hut1749         :::GT::A:::T::L:::S::S::::::D:TV::::QS:::S::::T:M:::D::E:R::

consensus       ARIAGPEFDPFYAHSGGYGYTWFRDDAEISRFLLEADDRLDLDLDDWHARSAEFYCRTQL
#oth            31..1.1...1143......1....11122431241246222335452742.323342.3
HVO_A0149       ::::::D:::::QY::::::::::::G:V:T::::::ES:GF:AAEA:RQ:::::L::::
rrnAC2353       ::::A:D:::Y:VT::::::::::::::::A::::::GTF::G::S::Q::::::::::Q
hla2748         L:::::D::::::T::::::::::::::::T:V:G::::IG:G::::::::::M:VA::R
Hbo0964         L:::::D:::Y::Y:::::::::::::::::::F:S:RY:::A:::::D:::RA:RE:::
HVO_0566        L:::::D:::Y::Y::::::::::::::::T::F:S:E::::G::A::E:::RA:::::R
hla1764         ::::A:::::::ST:::::::::::E::T:LA::G:S:E:G::A:EELLAT:S:F::::D
HQ2539A         SH:::::::::::::::::::::::E:::::Y::D:GSM:NI:VQSQLKTV:A:F:D:::
HVO_1711        ::::::::::::::::::::::::::::VTQA:AH:::AFG:::G:RL:T::::::Q:::
Hbo3122         :H::::::::::T::::::::::::E::V::Y::AS::::::E:T:RL:T::R:F:ES::
rrnAC1961       G:::A:::::::SN::::::V::::::SV::H::::G::::I:TVEMLTE::A:L:DS::
Hut1749         GH::A::::::F:N::::::V::::::::ATH::A:G:::G::VTGAVE:::A:H::Q::

consensus       PDGSWPHRVWAVDGSLAPGWANARVE---NGSDPEYQADQTASVVAFLARLL-ERRDELD
#oth            5..2....1.153152.....1122.1125464531.1..111.332..54144367754
HVO_A0149       :::R::::::PMN:R:::::::GHI::::-:TETQ:::::::::LV:::EY:SAH:QS:R
rrnAC2353       ::::::::::PG:ET:::::::::L::::S:::AD:::::::::TS:::TY:RTG----E
hla2748         ::::::::::PR::A:::::::::I::::D:P:VD::::::G::I:Y::QA-:-:AAGV:
Hbo0964         D:::::::::PFS:E:::::::G:L::::S:::VD::::::G::::Y:::Y-:-----:N
HVO_0566        E:::::::::PF::::::::::::L::::S:D:AD::::::G::I::::AY-:-HDRCA:
hla1764         A::::::::::DS:KV::::::::I:GANATAG:ND:L::P::::::::::-:R:TTD:P
HQ2539A         T:::::::A:::::::::::::::::::::SEK::::::::::::TY::SV:N:HG:AFN
HVO_1711        E::T:::::::::::V:::::HG::::::GTG:E::::::::::::A::S::A:::::::
Hbo3122         D:::::::A::::::::::::H::::::::S:K::::::::::::T::::I:::::T:::
rrnAC1961       S::R:::::::DT:AI::::::::::::H:AES:::::::::T:T::::T::RTH:SKM:
Hut1749         :::T:::::::::::::::::::N::::H:DDSL::::::::::T::::T::R::HG:::

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HVO_A0149       NVT:EAIESA:QSG:::::SS:E::CF:TV:E:::::TN::::::::K:VQ::STI:A::
rrnAC2353       PADPECIEA::G:::ESI::::::::::IA::::::::Q:::::::::::H:::::::::
hla2748         ---:EKLDA::VA:LA:::E:::A::R:VV::::::DSA:::A::T:::::::SEL:LHG
Hbo0964         :TGD:::I:::E::LA::N::::S::R:IT::::::::S::::::::::::G:::L:A::
HVO_0566        :D:RTDIE:::S::L:S:::::D:::::VD::::::::T:::S::::::::::::L:L::
hla1764         P:WR:::DD:I:D:I:F:RE:TEP::::RR:::C:::AL::::::G::Y:R:F:::::::
HQ2539A         QNEI::IQSAI:DGIEA:::S:TA::::::::::::::V:Q:V:::::::::::T::N::
HVO_1711        ::::G:L:S:V:AG:S:::SS:ES::::K:::::::::G:::::::::::Q:::T::T::
Hbo3122         P:::GD::DAIE:GIEC::E::E::::::R::::::::::::::::::::Q:::T::Q::
rrnAC1961       A::TAM::::IQT:::T:IEDI:AND:::::::V::DS::Q::::T:::I::F:::G:::
Hut1749         :::TVE::::VVD:::A:TRNI-:::::A::::V::DAV:Q::::::RYI::LS::::::

consensus       -----------------------APLDDDLREHAAAQADTVYEGLDALWDPDREVYALR-
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HVO_A0149       :::::::::::::::::::::::VTC:ATT::R::TR:TQ:FDA::MA:V::EGI::::L
rrnAC2353       :::::::::::::::::::::::::VCAT::D::RS::E::LSS:::::TG::--:::::
hla2748         DGLDASALDRNGDADAPGRDLDP:I:P:::AA::RD::VR::DA::D::V:E:GC::::E
Hbo0964         :::::::::::::::::::::::T--:S::AAE:K:R::E:::AI:DF:A:S:GI::::E
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HQ2539A         :::::::::::::::::::::::T:::PA:CK::TG::M:::Q::::::SHRD:Q:::::
HVO_1711        :::::::::::::::::::::::::VN::::::::E::TA::::::E::SEE:::::::I
Hbo3122         :::::::::::::::::::::::::VS::VAD::::::T::F::I:Q:::DEY:::::::
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Hut1749         ::::::::::::::::::::::::::RKPI::R:REA:E::FG:::Q:::EET:S:VM::

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HVO_A0149       D:::DG::D::::V::T:FS::::YLA:RDI:::::::::::D:G:T:::::::::::::
rrnAC2353       ::::EH:::I:N:::::::::PA:C:VAA:AI::::::::::DLPAET::::::::::::
hla2748         ::::TPE::T::::::S::::AS:::SF:A:GGDGEAEGHSG:V:AE:::::::::::::
Hbo0964         YADDHEESG::::C::::::::::::T:A:VG::::::::::E::VE:::::::::::::
HVO_0566        ::::VA::E::::Y:::A:::AS:::T::R:::::::::::::V::::::::::::::::
hla1764         ::::ASAESR:::S:AS:F::AS:AT::AA:RDERN::::::E:GA:GGSTPEIDTTPAA
HQ2539A         ::::::::ER:I:A::GSF:::K:FA:::K:T::::::::::GL:ETG::::::::::::
HVO_1711        ::::DGN:G:::::::::F:::::VDA:ADI:::::::::::DV:SQT::::::::::::
Hbo3122         :::::QGD:::S::::::FS::::FVA:::::::::::::::GLPETE::::::::::::
rrnAC1961       :::::TN::P:H:I:A:G:H:A::LQ:::SV:RT:::::::::LS:QH::::::::::::
Hut1749         ::::::ENYA:R:T:A:S::::::V::::HI:GA:::::::::::::C::::::::::::

consensus       --------LDRLVSHVETTLDGLYRDPDD---VAGLVRFEGDDWRRGEQDSEKVWTVSTA
#oth            11111111341144.2522355.62425324114..3.121.6..535.461.1.122.3
HVO_A0149       :::::::::R::ER:LH:AFSR:WKET:::::IS::T:::D:T:::RG:G:::::::::G
rrnAC2353       ::::::::R:::YT:::::::::E::TG::::IR::I::::::::::S::R::I::::::
hla2748         ::::::::::::::::::VV:::AHES:E:::IS::I:Y:::G:::AG:L::::::::::
Hbo0964         ::::::::IE::::::::VI:E::H::AESS::E::I:Y::::::MR:::H::I::::::
HVO_0566        :::::::::::::R:::SVF:::WH::::SE::K:::::::::::MR::S::::::::::
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HVO_A0149       :::Y::EKSIR:FSST:EY:PE----KW:DR:F:EIDL::S:CLPS:::P::F::T:A::
rrnAC2353       ::::S::Q:GA::R:A:::S::::AYT:S:::LGEI::G:S:VQSS:::P::L:::::::
hla2748         :::::C:::::::::::::P:::EMV::::E:LAHVS:G:T:CEPTS::P::F:::::::
Hbo0964         :::H:::S:SA::::S:::A:NE::A:T::::LA:V::::::::EG:::P::::::::::
HVO_0566        ::::TGV:::A:::AH::::::GT:ADEG:A:L::V::::::C::E::::::F::V::::
hla1764         :::T:::::GG:IRE:-::GD::DLFSA:::::A:CE::::FVN:::LI:::A::::DL:
HQ2539A         ::TS::::A:::FETH:RP:V:DTLFGW:T:::KI:R::::::SEM::F::::::N:DI:
HVO_1711        :::::::KFG::CDRLGK:S:R--:V:::TN::E::Q::::F:::::::::::::::RF:
Hbo3122         :::::::TF::::DEYGRQKK:DL:::::TE:::::R:N::F::AG:::S::::::::T:
rrnAC1961       M::L:::RVGDM:N::-::E:GD:Y:D::S:::E::EE::::::::::::::A::::AL:
Hut1749         :::L:::Q::T::ESHGR:GES--:::::GE::::FSA::::::P::::T:::::::SH:

consensus       SATPLGWSHALRLATTALLDE--ALP-------GP---P-WTTGEK-G-GT-ADH---DP
#oth            211.11.1..2.242326254531113234334115431311112121321311142512
HVO_A0149       ::::::::::I::::H:S---::---:::::::--:::-:------:-:--:---:::--
rrnAC2353       CG:::::P:::::::V:H::D::---:::::::--:::-:------:-:--:---:::--
hla2748         :::::::P::I::::V::::D::---:::::::--:::-:------:-:--:---:::--
Hbo0964         :::::::P:::::::V::M::Y:---:::::::--:::-:------:-:--:---:::--
HVO_0566        :::::::P:::::::L:T::A::---:::::::--:::-:------:-:--:---:::--
hla1764         G:::IA::::::IDA:VT:ARHG:::VPHDEPR::DEA:H::::R:F:V::P:::KAA::
HQ2539A         ::::I::::::::YA::V:E:HD:::APKSAPS::GRQ:R::::::Y:V::V:::TAS:S
HVO_1711        :::::::P::I:ME:::I:ADID:::APKPAPT::ENR:R::::::Y:I::V:::YAE::
Hbo3122         ::A:::::::M::HA:S::S:YD:::APKPAPS::ESR:R::::::Y:V::V:::TED::
rrnAC1961       :::::::::::::HA::R:G:LN:::TTSAGTE::SER:T::::::Y:I::V:::DEQ::
Hut1749         ::A::::::::::HV::::::AD:::TT:AEIE::TER:T::::::F:LL:A:::YED::

consensus       SRVWFTLTEG-LTE-R-PRVD-MN-RT-DFL----D----YT-RTH-ETR--D--D--ER
#oth            222121112122113121221311311312123332223412211231223423222221
HVO_A0149       ----------:---:-:----:--:--:---::::-::::--:---:---::-::-::--
rrnAC2353       ----------:---:-:----:--:--:---::::-::::--:---:---::-::-::--
hla2748         ----------:---:-:----:--:--:---::::-::::--:---:---::-::-::--
Hbo0964         ----------:---:-:----:--:--:---::::-::::--:---:---::-::-::--
HVO_0566        ----------:---:-:----:--:--:---::::-::::--:---:---::-::-::--
hla1764         VP::::::::A:::A:F::I:V::V::F:::V::A:PETG::V::FD::SHVTATETV::
HQ2539A         ::::::::::S:::L:Y::::L::F::V:::ITSAAGDSE::A:::N:::QD:QT:TI::
HVO_1711        ::::::::::A:::V:F::::L::L::L:::VVDA:PDDE::A:::N:::RD:HA:TV::
Hbo3122         ::::::::::S:::V:F::::L::L::L:M:VVDA:PESS::A:::N:::RD:AA:TI::
rrnAC1961       ::::::::::A:::A:Y:Q::M::L::L:::VRCT::ETD:AV:::R:N:RT::::SVR:
Hut1749         ::I:C:::R:AV::V:F::::L::L::L:::IRSS:GE::::V:::R:::RA::::SV::

consensus       R-E---D--L--RHV--ETGDG-GH-W-LTVEYA-DP-HDA-LADV-F-------Y----
#oth            231453122142222331211131131311121241232112211251335135312224
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rrnAC2353       -:-:::-::-::---::-----:--:-:------:--:---:----:-:::::::-::::
hla2748         -:-:::-::-::---::-----:--:-:------:--:---:----:-:::::::-::::
Hbo0964         -:-:::-::-::---::-----:--:-:------:--:---:----:-:::::::-::::
HVO_0566        -:-:::-::-::---::-----:--:-:------:--:---:----:-:::::::-::::
hla1764         TT:PTV:DA:AYTQTIC:::::H::S:T::::::V:TDG::I::::A:EGS::RE:DVYA
HQ2539A         :A:AID:ES:LF:::IT:::::R::Q:N::::::S::A:::L::::T:DAHDNNE:ELYI
HVO_1711        :A:IVD:DA:VF:::VT:::::R::E:E:::::VL::E:::I::::Q:ESIDGDE:ELYT
Hbo3122         :A:MAE:DA:LF:::IT:S:::R::E:T::::::T::E:::L:::IS:EATDDNE:DLFA
rrnAC1961       :V:PVD:EA:LY:::FT:::::Q::E:T:::D::T::E:::IV:::S:SSADDKS:DVFS
Hut1749         :V:PLD:ES:RF:::FV:::::R::E:E::::::V::A:::L::::D:EAADGED:DLFA

consensus       -ADT-L-N-G--DRG-R-G----YHLVAR---A----------L-D--G--YSVA-A---
#oth            322232323245212313234242212212452324554452112144153222151332
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rrnAC2353       :---:-:-:-::---:-:-::::------:::-::::::::::-:-::-::----:-:::
hla2748         :---:-:-:-::---:-:-::::------:::-::::::::::-:-::-::----:-:::
Hbo0964         :---:-:-:-::---:-:-::::------:::-::::::::::-:-::-::----:-:::
HVO_0566        :---:-:-:-::---:-:-::::------:::-::::::::::-:-::-::----:-:::
hla1764         LV::TIT:V:SN:::D:VDDSDG:::L::NND:AERSTGK::::V:DD:DSFE::L:IDS
HQ2539A         I:N:A:T:S:AT:::I:L::SDQ:Q::::DTE:YDQTGETKPL:I:EH:QE::::A:ITS
HVO_1711        I:::A:A:T:TK:::I:L:QLGS::::::DAG:FDAGDGHEPL:I:QD:RE::::I:LTA
Hbo3122         V:::A:V:T:GE:::L:L:QMGS::::::DAGPYDQQGKTRPL:I:RE:NE::::I:MTA
rrnAC1961       V::IA:TSTITE::AI:Y:QPGS::::G:NPR:Y:TDQTDNDL:V:EN:DA::I:V:MAA
Hut1749         V:::S:T:T:TAE::L:L:EPGAH:::::DPT:Y:TGETDDPL:V:EE:EA::::M:MTA

consensus       --RF-WATV--AGS--L--LF--G--P------D--N-VL-GR-G-G-----T-ALGFA-
#oth            342121221421113425522231332545353232131141232313435223121112
HVO_A0149       ::--:----::---::-::--::-::-::::::-::-:--:--:-:-:::::-:-----:
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hla2748         ::--:----::---::-::--::-::-::::::-::-:--:--:-:-:::::-:-----:
Hbo0964         ::--:----::---::-::--::-::-::::::-::-:--:--:-:-:::::-:-----:
HVO_0566        ::--:----::---::-::--::-::-::::::-::-:--:--:-:-:::::-:-----:
hla1764         DDG:E::S:LA:::DKAGA::AD:DRGEGTETATG::V::A:LV:S:TEVSDAV:::::E
HQ2539A         TS::D::::SV:::AY:SK::SE:TV:EQIAEV:DE:V::V::V:N:TAVTE:L:F:::E
HVO_1711        AG::E::::GV:::RY:AEF:SK:EL:SAQERI:DE:V::V::I:T:DELGE:L:::::E
Hbo3122         AG::D:G::GV:::DH:SE::SE:EL:NAQESV:NE:V::V::I:S:TNLGE:I:::::E
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Hut1749         TT::D::::AA:::DH:KD::AD:EL:PPKDDV:NE:I::L::I:S:ERTVE:L:::::R

consensus       -ADTAAALGEA-GAL-RGY------Y-D-W--FLADK--P-SVA-D--LA-QYR--LM-L
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HVO_0566        :----------:---:---::::::-:-:-::-----::-:---:-::--:---::--:-
hla1764         N::::::::::R::IS::FADISES:VET:REW:::RKF:A::TG:AD:ET:::FA::T:
HQ2539A         D::::G:::::A:::T:::ETVRSS:I:S:KT:::::PL:D:::D:PT::S:::VS::T:
HVO_1711        H::::::::::A:::T:::ETARAA:V:S:AD:::::EL:G:::G:DD::A::KTA::S:
Hbo3122         H::::::::::A:::T:::ETVRTS:A:S:AE:::::EL:A:::D:ET::N:::AC::A:
rrnAC1961       Q::::::::::D:::D:::ETVSAE:A:S:GD::S::QL:D:::D:EA::N:::TA::T:
Hut1749         Y::::::::::T:::D:::GMAEAA:D:T:AA:::::PV:AAI:D:ED::A:::TA::S:

consensus       -AVEDKT--GA-IASPSVPWGEAV-A-E-KGYGYNFVWSRDLYQVFTVF--VG----A--
#oth            311111233112211111111222623132111111111111111122233223333233
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hla1764         A:::::RHD::G::::::::::TEY:A:DR:::::::::::::::::ALIE::EVERGAD
HQ2539A         R::::::FL::G::::::::::::A:D:A::::::::::::::::::::DA::DIDT:TE
HVO_1711        R::::::YL::GL:::::::::::P:E:A::::::::::::::::::::EA::DVET:ID
Hbo3122         R::::::FL::G::::::::::::TSD:P::::::::::::::::::::EA::DVET:AD
rrnAC1961       L::::::YH::S::::::::::::H:E:P:::::::::::::::::S::DAI:SLDI:TD
Hut1749         L::::::YH::S:::::::::V::D:D:P::::::::::::::::::::ET:DELAI:TS

consensus       -L-YIY--QQD--GFIPQNTY-NGRTRWGGEQMDNISFP-VMA--L-E-GV-F-D--Y-Y
#oth            213121531114411211111321211111111111211311134142312423234141
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rrnAC2353       :-:---::---::--------:-----------------:---::-:-:--:-:-::-:-
hla2748         :-:---::---::--------:-----------------:---::-:-:--:-:-::-:-
Hbo0964         :-:---::---::--------:-----------------:---::-:-:--:-:-::-:-
HVO_0566        :-:---::---::--------:-----------------:---::-:-:--:-:-::-:-
hla1764         A:A:L:NT:::DD::L:::::ID:::::::::::::A::S:::WQ:Y:H:ISPG:TD:T:
HQ2539A         A:Q:::RY:::NR::::::::L:::::::::::::::::Q:::WT:RQH::T:D:VE:G:
HVO_1711        A:E:::TY:::DR::::::::L:::::::::::::::::Q:::YM:H:R::T:D:VA:G:
Hbo3122         A:E:::EY:::RR::::::::L:::::::::::::::::A:::YM:A:R::T:D:VG:D:
rrnAC1961       Q:E:::EY:::DA::::::::V::T::::::::::::::Q:::YR:A:S::D:E:VE:S:
Hut1749         Q:E:::AF:::ET::::::::V:::::::::::::::::Q:::AQ:Y:R::G:EEAD:D:

consensus       -NV-RSA-YVARNGP-TAQERWEEE-G-SPSSIAAEIAGL--A---A---GH--------
#oth            422321231222211311111111121211111121111143224214322211111111
HVO_A0149       :--:---:-------:---------:-:------------::-:::-:::--::::::::
rrnAC2353       :--:---:-------:---------:-:------------::-:::-:::--::::::::
hla2748         :--:---:-------:---------:-:------------::-:::-:::--::::::::
Hbo0964         :--:---:-------:---------:-:------------::-:::-:::--::::::::
HVO_0566        :--:---:-------:---------:-:------------::-:::-:::--::::::::
hla1764         DQ:R::LG:I:A:::E:::::::::A:F::::::::::::CCGAAL:VAEADRIEAGNAG
HQ2539A         Q:IK:::D:::::::P:::::::::S:Y::::::::::::TC:SDI:IEE::::::::::
HVO_1711        E::KY::D:::::::P:::::::::A:Y::::::::::::GC:AAI:LDE::::::::::
Hbo3122         V::K:::D:::::::P:::::::::A:Y::::::::::::AS:AAI:IDE::::::::::
rrnAC1961       E::R:::E::V:H::E:::::::::A:F::::::::::::AC:AKL:LDT::::::::::
Hut1749         V::A:::D:::::::D:::::::::S:Y::::::T:::::TA:SYL:SET::::::::::

consensus       -------------ADAL-W-ALAD-W---VE-WTAT-TGT-RH--TPYY-R-T-DG-P--
#oth            111111111111421114132211312531251211511121244211131223213123
HVO_A0149       :::::::::::::----:-:----:-:::--:----:---:--::----:-:-:--:-::
rrnAC2353       :::::::::::::----:-:----:-:::--:----:---:--::----:-:-:--:-::
hla2748         :::::::::::::----:-:----:-:::--:----:---:--::----:-:-:--:-::
Hbo0964         :::::::::::::----:-:----:-:::--:----:---:--::----:-:-:--:-::
HVO_0566        :::::::::::::----:-:----:-:::--:----:---:--::----:-:-:--:-::
hla1764         SGSGPDADSDSLR::::A:L::::D:TTR::E:C::A:::E::AE::::L:V:A::D:ES
HQ2539A         ::::::::::::T::::T:I::::E:TEN::T::::N:::D::LN::::V:V:R::N:DA
HVO_1711        ::::::::::::TD:::V:L::::D:AER:DD::::R:::D:NTH::::V:I:R::E:DA
Hbo3122         ::::::::::::D::::I:L::::D:TDN::S::::R:::E::DTV:::V:I:RG:D:DA
rrnAC1961       ::::::::::::E::::V:LS:::Q:ANN::A::::E:::E::TN::::A:V:L::N:EM
Hut1749         ::::::::::::D::::V:Q:V::E:AAS::S::::T:::D::TT::::V:VAR::D:DA

consensus       G-LRTLAN-GPTLDER-IID-GFLELVRLGIKPA-D--I-NS--EVD-TIRVD----P-F
#oth            142112112111211122212111112111221231332311352113212113342222
HVO_A0149       -:------:-------:---:-------------:-::-:--::---:-----::::-:-
rrnAC2353       -:------:-------:---:-------------:-::-:--::---:-----::::-:-
hla2748         -:------:-------:---:-------------:-::-:--::---:-----::::-:-
Hbo0964         -:------:-------:---:-------------:-::-:--::---:-----::::-:-
HVO_0566        -:------:-------:---:-------------:-::-:--::---:-----::::-:-
hla1764         :RP::I::D:::Y:::E:V:G:::::::::V:::D:DVVR::VSV::DS::::TPYG:AW
HQ2539A         :Q::::::N:::::::E:::A:::::::::::::T:ET:R::IA:::S:::::SPQG:A:
HVO_1711        :H::::::N:::::::E:::A:::::T:::::::G:EI:R::LK:::E:::::TPHG:A:
Hbo3122         :H::::::N:::::::E:::G:::::::::::::D:EV:Q::VT:::S:::::TPYG:A:
rrnAC1961       :H::::::D:::::::N:::G::::::::::::DD:ET:R::LV:::D::S::TEYA:G:
Hut1749         :Y::::::D:::::::NV::A::::::::::T::D:PV:E::LV:::D:::::VGDAAG:

consensus       YRYNGDGYGER-----GAPW-----GKGRLWP--TGERGEYEL-----------------
#oth            111211211123242412113334312111112211112121111111111134233344
HVO_A0149       -----------:::::----:::::-------::---------:::::::::::::::::
rrnAC2353       -----------:::::----:::::-------::---------:::::::::::::::::
hla2748         -----------:::::----:::::-------::---------:::::::::::::::::
Hbo0964         -----------:::::----:::::-------::---------:::::::::::::::::
HVO_0566        -----------:::::----:::::-------::---------:::::::::::::::::
hla1764         :::V::A:::LARSDP:G::AGTGD:R:::::IF:::::::::RARADGPDAFGGTDEDA
HQ2539A         :::::::::::AVEDE::::SVESK:::::::IF::::::::::::::::::MHGTETGD
HVO_1711        :::::::::::ERDEE::::SVDAK:::::::IF::::::::::::::::::LAGTEDGD
Hbo3122         :::::::::::ERDEE::::SIESK:::::::IF::::::F:::::::::::LNGTEEGP
rrnAC1961       :::::::::::GRDDQ::::TVEHK:::::::LL::::A:::::::::::::::HRDDPD
Hut1749         :::::::::::EVGDK::::SVEHS:::::::LL:::::::::::::::::::::LAETE

consensus       --P---L--MA-F-NSGRM-AEQVWDR-H-T-Y-WEFGEGTG-ATPLAWSMAQ-VRLAHG
#oth            342433133125221211122112111325142312122111311111121122211122
HVO_A0149       ::-:::-::--:-:-----:-------:-:-:-:--------:----------:-----R
rrnAC2353       ::-:::-::--:-:-----:-------:-:-:-:--------:----------:------
hla2748         ::-:::-::--:-:-----:-------:-:-:-:--------:----------:------
Hbo0964         ::-:::-::--:-:-----:-------:-:-:-:--------:----------:------
HVO_0566        ::-:::-::--:-:-----:-------:-:-:-:--------:----------:----D:
hla1764         LE:DAL:ET::G:G:::::LP::::::E:P:N:G::::::::G:::::::::GFI:::::
HQ2539A         LA:QNL:ET::E:A:::::I:::::::E:G:E:N:V::::::A::::::::::Y::::::
HVO_1711        LA:DNL:RT::A:A:::::L:::::::E:A:DFN::::::::S::::::::::Y::::::
Hbo3122         LA:ENL:ET::G:A:::::L:::::::E:S:A:N::::::::A::::::::::F::::::
rrnAC1961       IP:ENA:QM:QDVA:::::I:::I:::G:A:E:D:::A::::S::::::::::Y::::::
Hut1749         MTAMEC:ES::Q:G:E:::I:::::::DVE:D:G::::G:::A::::::A:::Y::::::

consensus       VDAGEPVETPAFVRDRYVE---------P-L-V-T-F-G----V-G-T-A---AVKTP--
#oth            455144325254433233222523343115132424252263314131325332122262
HVO_A0149       :TR:TCT:-----------:::::::::-:-:-:-:-:-::::-:-:-:-:::-----::
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hla2748         -------:L:Q:TDRAVADD::::::::-:-:-:-:-:-::::-:-:-:-:::-----::
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