|
Pairwise sequence scores | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 3923 | pNG7204 | Hmu0023 | NP0946A | Hmu2765 | HQ3464A | HVO_0069 | Hbo1431 |
1222 | pNG7204 | 3841 | 903 | 1006 | 993 | 1056 | 1057 | 1002 |
1361 | Hmu0023 | 903 | 3620 | 1123 | 1171 | 1104 | 1149 | 1095 |
2524 | NP0946A | 1006 | 1123 | 3826 | 2156 | 2196 | 2213 | 2246 |
2913 | Hmu2765 | 993 | 1171 | 2156 | 3960 | 2489 | 2725 | 2600 |
3250 | HQ3464A | 1056 | 1104 | 2196 | 2489 | 4119 | 3133 | 3070 |
3455 | HVO_0069 | 1057 | 1149 | 2213 | 2725 | 3133 | 4017 | 3311 |
3287 | Hbo1431 | 1002 | 1095 | 2246 | 2600 | 3070 | 3311 | 3970 |
565 symbols consensus MSAESPENVLFVVLDTVRKDHLSPYGYDRPTTPTLDSFADEATVFEQAVAPAPWTLPVHA #oth 1353442...21.1.12.1121221.112111.4.322142122113.212....1.2.. pNG7204 ::LKQRP:::LI::::A:ARTVL:-:LESGLM:::SRI:SDG:T:TD:T:T::::::S:: Hmu0023 ---MGSP:::L::::AT::::::C:::::::::E::AV:QAG:RY:::I::::::P:S:: NP0946A --MAADP:::V:::::::::::T::::::::::A:A::::::R:Y:E::SQ::::::A:: Hmu2765 :TGADGT::::::::::::::::A::::E::::::EA::E::A:::H::::::::::::: HQ3464A :L:::::::::::M::::::::::::::::::::::::TTD:::::E::::::::::::: HVO_0069 :T:::::::::::M::::::::T::::::::::G::R::::::::::::::::::::::: Hbo1431 ::S::::::::::M::::::R:T::::::::::N:E:::E:::::::::::::::::::: consensus SLFTGLYPSQHGATQENPYLE-GATTLAETLSAAGYDTACYSSNAWITPYTHLTAGFDDQ #oth 11...4.1.5.1252231222323212.242.11..4.212.2121111124112..323 pNG7204 GM:::K:T:S::VHAG:HIFDPDSEP::SRI:N:::R::GI:G:V::S:EFGFD::::EF Hmu0023 :M:::R:::G::SFGTQ:LG:YDGA:V::L::::::A:FGF:NSHHTSIEQEFDR::--- NP0946A :::::Q:::V::::::S:::SAETA::::AV::S::T:T:F::::::::::R::::::E: Hmu2765 :::::::::E:E::::D:::D::::::::S:::::::::::::::::::::N:::::::H HQ3464A :::::::::::::S::::::::::::I:Q:::::::Q:::::::::::::::::D::::: HVO_0069 :::::M:::::::N::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::D::AE: Hbo1431 :::::M:::R:::D::::::::::::::Q:::::::::::::::::::::::::D::T:: consensus ----DNFFEV--MPGEFLSGPLARAWKTMNDSDRLRTLADRLVSLGNTAHEYLAGGEGAD #oth 1111.3122222112442433323523132133422232.41243224322322442232 pNG7204 SMKW:L:WDAPELSSVISNRNTTATGD:IL:VF:GQGPV:L:KGTLT:GYAKF-LA:RH: Hmu0023 :::::YYHDILAL:---------:FMD::YE-----PSL:F:RF:PRYFRDGYDISDFQR NP0946A :::::S:::A::L::SV:ATAA:DL:SWVL::-:::P::::::AA::AV::R::ARGR:A Hmu2765 ::::::::QI::::S:L:::::::I:Q::::::T::GV:::M:Q:::KF:::F:SEG:G: HQ3464A ::::::::::::::::::T:::::::::L::NES::::::T:::::::::::F::::::: HVO_0069 :::::::::::::::::::::::K:::::::::A::::::K::::::::::::::::::: Hbo1431 :::::::::::::::D:::::::KM:::L::N:S::::::K:::I::V:::::::SD::: consensus SKTPAVIDRTIDFID---DADGPFFTFINLMDAHLPYHPPEEFREEFAP-GVDSTEVCQN #oth 322223222244222111321232.3.2.2222.1..3..241443121122.2532212 pNG7204 DGAHHTTS::VEWLEQNGTE:D:::Y:L:YVEP::::E::AP:LD:YL:D:A:PSR:SDL Hmu0023 R:LETQVR:------:::-::::::G:::FNAT:A::R::::::AP:EE:RF:DWDAVDE NP0946A :R:::IV:::QQ::E:::G::::W:A:L:::::::::Y:::QY:QQ::::D::PGA:::: Hmu2765 T:::::::K:M::::::::SE-N:::::::::::::::::::YV:Q::::::::A::::: HQ3464A :::::::::::E::::::T:::E:::::::::::::::::AS::::::::D:::DA:::: HVO_0069 ::::::V:Q::::::::::SE-E::A:V::::::::::::::YK:R:::::::::::::: Hbo1431 :::::::::AMT::E:::GSE-QS::::::::::::::::DR:AR:::::::::::I::: consensus SK----------EYNAGAREIDDAEWEDIRGLYDAEIAHIDAQLGRLFDHLKETGRWDDT #oth 2211111112222123.133323312232331.1..1112.22.31.134.333242.1. pNG7204 NQ:::::::DPWQ:V::DQ:LT::DV:IFK:::E::L:YL:T::E::Y:T:A:QCIL:E: Hmu0023 TAARKVGDDEGY::IL:DVTMSPT:::LVECW:::::RYV::L::E:::C:RRQ:VY::: NP0946A ::::::::::::A:::::::V:E::F:A::R:::::LR:L::E:::::EF:RTS:::::: Hmu2765 :::::::::::::F:C:::D::::::D::E:::::::R:::D::D:::T::::::Q::E: HQ3464A :::::::::::::::::::S::AE::A::QA:::::::::::::::::GW:QQE:L::E: HVO_0069 ::::::::::::::::::Y::::D::D::::::::::::::D::T:::::::::D::::: Hbo1431 :::::::::::::::S:::D::EE:::A:::::::::::::D:::::::W:::::::::: consensus MVVVCADHGELHGEHGLYGHEFCLYDPLVNVPLLVKHPEL-D-----PERRSDQV-ELVD #oth 211131....22..11222.1132113.21..12123.4211111112323533111.3. pNG7204 AIILVG::::NI:::::MD:QY:::ET:IH:::VIRY:::F::::::E:EV:GP::::R: Hmu0023 L:::T:::::HF:::::AY:Q:S:FEE:L:::::::W::G::RPSPA:GTV::RLVS::: NP0946A A:::::::::::::F:R:::::AV:E:::::::::DA:GI:E::::::G:DRQ:::::L: Hmu2765 ::::A::::::::::::::::::I::::::::CM:::::I:E::::::::DDET:V:::: HQ3464A ::I:::::::::::::I:::::::::Q:::::::I:::Q::::::::AA::H::::::I: HVO_0069 ::::::::::::::::::::::::::::I::::M::::D::::::::A:::G:::::::: Hbo1431 :::::::::::::::D::::::G::::::::::M::::A::E:::::ED:HE::::::I: consensus LYHTVLDAAGVA---PAAPDVDAVALDRTRSLLS--YREF---A-----DPGQDR-DGDY #oth 112112143122114236443323323231112233112111123333324245532133 pNG7204 ::P::T:L::AE::Q::DT::STHS:VP------::----:::-:::::-RDGTVPVR:R Hmu0023 :VP:ICEW:::::::-VPDE::GR::--------::----:::-:::::-T:D:-::R:A NP0946A ::D::::I::A::::E::SS:G:RPFEPE:::CR::----:::-:::::-::R:IE:::: Hmu2765 :::S::::T::::::-----G:G:S::PA:::::TE::::::::GTASNGA:AHGPR::V HQ3464A ::::::::VDIDGGN:NS:GET:I:R::::::::DS::D:ESH:GSPDS::A:QSS::S: HVO_0069 :::::::SL::EGGE::T:GD:::G:::::::::AD::::::::QSSND::::R::::Q: Hbo1431 M:::::::LD:EGGT::E::D:::::::::::::AS:::::::SKASND:S::I::::E: consensus AFIEYSRPVVELKQLEEKASAAGISLDEDSRFYSR-MRAARRPDAKYIRIDRIPDEA--Y #oth 212..32.21213212322321123232232211.212.212224.2124312211221. pNG7204 :IA::LV:QPSMDS:R:AVE----:F::AATRFD:PL::IKTT:W:F:EA---::DTEL: Hmu0023 V:A::D::YPP:RERLQQYD----:FEA----:D:GLQ:V:TETH:L::PT--VG::TL: NP0946A G::::D::::::E:::R::A::::E::::G::::::::::::::G::::NE:LS::G::: Hmu2765 G:V::HQ:::::R:::G:::::::A:ET:::::::::G:::S:EG:::HCT::::::::: HQ3464A :::::::::::::::::::A:::V:IS:::::::::::::::T::::V:::::::::::: HVO_0069 ::V:::::::::::::::::S:::T:P:::::::::::::::T::::V:::::::::::: Hbo1431 ::::::::::::::::::::S:::T:S::::::::::::::::ES::V:::::::::::: consensus RLDSDPGETEDVA--------------EADDDAIEATEAALADFEDRVGGAWTDA---DD #oth 1213.23.43443111111111111115332243442123.4522233343231411244 pNG7204 DR:D::I:WI:::::::::::::::::SIHP:IC:LLGTD:R:ELG:LARGTS:S:::-- Hmu0023 ::TG:-::V:---::::::::::::::VS::E----R:::::QRL:ETLEPLP:T:::-- NP0946A :::::S::STEA-::::::::::::::A:::PI::::::::CR:::::AVG:DGH:::TQ Hmu2765 :I:::::::::R:::::::::::::::GS::ELLVDL::E:S::V:::DAD:P:E:::A: HQ3464A ::::::D:QNS::DAMNADATDIDMNI::EA:::T::::T:TA::SA::::::::DGVSN HVO_0069 :I:D::E:::N:VDA::::::::::::DTG:E::AE::::::E:::AI:::::::::L:T Hbo1431 :::E::D::::LS::::::::::::::::G::V:::::S::SK::SNI:::::::::L:: consensus DVSGDSVDQMDDDAQDRLRDLGYLE #oth 23423535421242221.211..13 pNG7204 -------NTISANKKE::E:::::Q Hmu0023 ----SRTTEL::HVS:H:EKM:::- NP0946A GDG::PLGR::ET:KS::::::::: Hmu2765 GTD:EVL:S:::::K:::K::::ID HQ3464A ::T::T:AE::A:::E::::::::: HVO_0069 :::D::::::::E:::::::::::: Hbo1431 :::D:::E:::EE::E:::::::::