Home |  Text search
6 genomes BUD1587 8 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi
-

rrnAC0904

-

Hbo0554

Hbo2809

Hmu1584

Hmu2875

Hut1712

-

NP0726A

HQ2309A

Pairwise sequence scores
Consensus score1820 Hbo0554 Hut1712 HQ2309A Hbo2809 Hmu2875 NP0726A rrnAC0904 Hmu1584
1279Hbo0554 1807 1443 1117 1069 1059 1057 1060 1069
1206Hut1712 1443 1805 1130 1053 997 1039 1054 1063
1296HQ2309A 1117 1130 1803 1251 1066 1131 1222 1176
1347Hbo2809 1069 1053 1251 1814 1125 1244 1230 1216
1402Hmu2875 1059 997 1066 1125 1847 1276 1327 1377
1433NP0726A 1057 1039 1131 1244 1276 1832 1386 1344
1556rrnAC0904 1060 1054 1222 1230 1327 1386 1831 1545
1548Hmu1584 1069 1063 1176 1216 1377 1344 1545 1834

247 symbols
consensus       MNLDNQTCVVTGSSRGIGRGIAEDLGAHGANVVVNYRSSEAAAEAVVETIEDAGGTAIAV
#oth            122342..11..2.1....111222144.23.21.....241.4221141125..3.221
Hbo0554         --MRPK::::::::N::::::::RF:EE:C:::::::::KE:::EA:::V:AS::S::::
Hut1712         --MEPK::::::A::::::::::RF:EA:CK:A::::::GE::RE::::::::::S::::
HQ2309A         :::E:R::::::A::::::::::E:ADE::::A::::::K:E:ND:::::R:::::::TA
Hbo2809         ::TNKR:::I::A::::::A:TKE::QS::::I:::::::S::YD:A:S::EN::::VP:
Hmu2875         -M::G:::L:::::::::::::T:VA::::T:::::::::R::::::DE::AD::E:V::
NP0726A         -M:ED:::L:::G::::::AV::E::RN::D:AI:::::::::::TA:AVREE::N::T:
rrnAC0904       ::::::::::::::::::::::K::::::::::::::::::E:R::::D:RER::::::A
Hmu1584         ::::G:::::::::::::::::K::A:::GD:::::::::NE:G::::D:::D::::M:A

consensus       QADVSDIDQVEAMREAVHDAFGPVDVLVNNAGITIDKKFENMTREDWDTVIDVNLGGVFN
#oth            21.123523133.23423331.43.111.....13.33.32.1432.25.1..1.2.2.1
Hbo0554         ::::T::E:::Q::::A:E:::Q::::::::::NQ:VL:KE:SH:E::V:L::H:D:A:H
Hut1712         K:::TEPE::Q::A:D:E::::T::::::::::NQ:VF:KE:SH:Q::::L::H:D:A:H
HQ2309A         ::::T:FSAIKS::DR:::N::A::I:I::::::K:TT::K::PDQ:KS::::::N:T::
Hbo2809         :::::::S::K:::DT::GE::SI::::::::::V::T:T:::EA::KQ:::::::::::
Hmu2875         RG:::SY:A::R:HTRI:::V:::::V:::::::V:RT:GE::::::EA:::::::::::
NP0726A         :::I::YE:::::::T:TAE:::L:::::::::::::::::::KN:::R::::::::A::
rrnAC0904       ::::AKL:E:R::::K:A:E:::A::::::::::::::::::::D::E::::::::::::
Hmu1584         :::I:EQ:D::S:AA::::T::S::::::::::::::::::::::::E::::::::::::

consensus       CTKAFYDDIKDAEQGRLINISSVVGQQGNYGQANYATAKSGLFGFTRTLALELASEGSTA
#oth            3133.12.155126.....1..11111..3..1...12.1.21....11.1.1.42.1..
Hbo0554         ::QV::::LV::::::::::::I::KG::F:::::::::A:I::::::::::::R::T::
Hut1712         ::QT:::::AA::S::::::::I:AKG::L:::::::::A:I::::::::Q:::R:::::
HQ2309A         A::V:FS:::SSN:::::::::I::K:::F:::::::S:::I:::::::::::::S::::
Hbo2809         :::T::E:::K:NE:::::::::I:K::::::S:::AS:::ML::::SI::::::S::::
Hmu2875         VSHC:::::CE::D:::::V::::::::::::::::A:::::::::::::::M:AT::::
NP0726A         ::HC:FE:::S::N:::::::::::::::::::::::T::::::::::::::::::::::
rrnAC0904       G::::::::R::DH:::::::::::::::I:::::::T::::::::::::::::HT::::
Hmu1584         ::N::::::EQSDT:::::::::::::::::::::::T::::::::::::::::DT::::

consensus       NCVAPGFVATDMLEEVPERVQEKILRDIPLNRFATVEDIAGVVRFLASEESSYMTGQVID
#oth            .11...124.2.1221.24122323531.13.2132111151.2.1..2211111.1112
Hbo0554         :::::::IS:R:V::L::K:K:R:RN:T::G:LG::KEV:E::A::::DR::FI::EI::
Hut1712         :::::::IE:S:VTDL::SII:QVEE:T::G:IGD::EV:D::A:::::R::FI::E:::
HQ2309A         :S:::::TK::::TD::DT:KNS:KD:::MS::GE::::SH::K::::::A::IS:E:::
Hbo2809         ::::::YTR:::VDD:::DI:D:LRSK:::::::EP:E::N:::::::::::::::E:::
Hmu2875         :::::::::::::D:::Q::::R::QR:::D::::I::::P:::::::P::R:::::::G
NP0726A         ::I:::::E:::::T:::::::::::R:::::::RP::VS:I:::V::PD:::::::::A
rrnAC0904       ::::::::K:::::::::::::::::E:::D:::R::::::I:::V::::::::::::LG
Hmu1584         ::I:::::::::::::::::::::::E::::::::::::S:I:::V::::::::::::LG

consensus       VNGGMDL
#oth            1..1211
Hbo0554         I:::K::
Hut1712         :::::::
HQ2309A         :::A:::
Hbo2809         :::AI::
Hmu2875         ::::::W
NP0726A         :::::EW
rrnAC0904       :::::EW
Hmu1584         :::::EW