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Pairwise sequence scores | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 2509 | HQ1697A | NP3944A | VNG0709 | hla0070 | HVO_1041 | Hbo0536 |
1470 | HQ1697A | 2634 | 986 | 1081 | 1139 | 1227 | 1346 |
1549 | NP3944A | 986 | 2620 | 1228 | 1321 | 1251 | 1259 |
1557 | VNG0709 | 1081 | 1228 | 2517 | 1195 | 1309 | 1286 |
1721 | hla0070 | 1139 | 1321 | 1195 | 2679 | 1352 | 1478 |
1863 | HVO_1041 | 1227 | 1251 | 1309 | 1352 | 2564 | 1686 |
1988 | Hbo0536 | 1346 | 1259 | 1286 | 1478 | 1686 | 2551 |
378 symbols consensus --------DVHRIQLGNTVFEGRNNAYLL----DGATTTLVDTGVATPEVRAELRAGLDE #oth 12222224324222.1.11...3.22.1.1221222311.1.2.212242142.232.24 HQ1697A :::::MTV::RQ:::::A::::N::::::::::::DV:::I:V:I::T:T::::E:E:TT NP3944A MTDPALPFELGVLS::::A:::N:SS:V:GTE:PE:::::I:::::E:TTEQQ::D:::R VNG0709 MSTHTLPCV::QF::T:AA:::::SV:::GVGD:A:P:::::::I:::A:E::::TA::D hla0070 ::::::::-:K:::::::::::E:DV:::::::::E::A:::::::L:D::G::E:::A: HVO_1041 ::::::::-ME::R::::::::L::::::::::P:DRP::::A::::DS::RD::E:::A Hbo0536 :::::::M:L:::R:::::::::::::::::::S:EV:::::V:ASLD:I:DD:D::::: consensus AGLGVADIDAILLTHWHADHAGLAGEIQAESGATVYVHEADAPLVAGDADAVAAERDIRR #oth 4.3121221213...1.3..1....11.121113.11.11..421223522343423424 HQ1697A ::VSLSS::Q::::::::::T:::::::DV:::::RA:AD::D:I:TGKNS-TKR:EV:Q NP3944A Q::S::::ERVF:::H:S::::::::::::::C::::::::::::EQ:SA:M::QSERL: VNG0709 R:TSF:A::R:::::::H:::::::T:::DGD::::::::::AM::Q:::::SGMAATQA hla0070 Y:::F::V:::A:::::P:::::::::::::D:D::::::::S::D:SDAPLFLD::LQ: HVO_1041 ::Y::::L:::V::::::::::::::L::::::P::::AD::GI::::P:::::::S::E Hbo0536 V::::S:::Q::::::::::T:::::L::::::V:RA:::::::I::ET:::H::::::L consensus QRFDEWGMPEAKQAELLAFLDA-HDDLGGRPADVTPLTDGDRIDAGDGELEVVHLPGHAA #oth 42211.12.242231133.114132114.3221.11241.23231.2331113.1...1. HQ1697A ::LE:::V:::::D:::S:::R:FNGI::ESV::D:V:::QK:S:::I::T:K:::::T: NP3944A VTI:R::::D:::T:::R:::::T:GI::::PT::TFDG:E:F:L:SVT::A::M::::: VNG0709 AYL::::::AD:::::ND:::T:::G:Q:Q:::::::S:::TVQL:GLDA:::::::::: hla0070 ET::R:::::PDRER:T::F::VSA::S:::::::TFG:::V::::GVA::AM:::::T: HVO_1041 R:::::RI:DEPL::VT::::G:::::R:DRV::::VE:::::A:::::::::::::::: Hbo0536 :::::::I::G:RE::VS::EM:::::E:ES:::::::::E:::::::::::H::::::: consensus GLTAFAFD----------G-DDAGREAFVGDAILPKYTPNVGGADLRVDRPLATYLDSLA #oth .13112222111111111134343311.2..12..2....1....1..121132.321.3 HQ1697A :HVGYHYS::::::::::-::KKETF:::::VV::E::::I:::::::ES:VS:::N::D NP3944A ::AGY::E::::::::::-:GRD:T:L:S:::L::Y:::::::::::::GA::A:::T:: VNG0709 ::V:YVVE::::::::::-:R:GR:::::::::::::::::::::V::E:::QR:R:::Q hla0070 :::G::::PREVPDHESV:GA::TA:L:A:::L::::::::::::V:::G:::A:AE::V HVO_1041 ::S::::::::::::::::EPG::::::::::::::::::::::::::::::E::::::: Hbo0536 ::::::::G::::::::::S:GN:E:::::::::::::::::::::::E:::Q::VE::V consensus RIIARDLDRAWPGHRDPIDDPAARAATIAAHHRERTERVVDVLRDHGPADAWTVSAALFG #oth 21333132211....21132.23.122.33..22..1.12211333.1222.2..12... HQ1697A :LSKME:EHV:::::ER:IN::P:VD::CT::VK::R:LY:::TE::TT:V:N::::::: NP3944A G::E:EYS:::::::G::I::TG:::D:V:::::::::::S:::S-:::TP:E:::E::: VNG0709 ::E:L::::::::::G:VFA:::::RD:::::D::::::L::V:AR::VS:::::D:::: hla0070 :::E::F:A:H:::::R::::SR:::::LD:::H::R::L:::A:E:::T::E::::::: HVO_1041 :LA:L:FE::::::::::S:::G::RV::E::::::::::S::D::::::::::::R::: Hbo0536 SL:DW:V::::::::::::::S::::::LE::::::::::NT::::::::::::::R::: consensus ELEAIHILHGPGEAFAHLDHLVEAGVVA-----------RRGNA--YRLVDA----DPDI #oth 2.35..1.......2...12.232213311111111111352552222123211112124 HQ1697A ::DT::::::::::::::MC:::S:I:ERVENDTRVDPV:::HSQQ::IINPEIAS:I:: NP3944A S:SG::V::::::::::::::S::R::T:::::::::::ESDGT::FE::VS::::::EL VNG0709 ::HD::V:::::::Y::::D::HE::--:::::::::::-----::--::ES::::Q:GE hla0070 D:SE::V::::::::::::::AD::IIE:::::::::::PD:T::::::I:P::::E::V HVO_1041 D:::::::::::::::::::::AE:::::::::::::::PPDDRGR:E:L:::::::::F Hbo0536 :::N::::::::::W:::::::H:D:A:::::::::::::E::E::::::E::::::::: consensus DALFPTTAG--------- #oth 331324455422222111 HQ1697A ETILL:SSPR:::::::: NP3944A :P:::DV::TRTEEMS:: VNG0709 Y::AASA--::::::::: hla0070 :::::::PLDDAVDGSEA HVO_1041 :E:VAVPETKR::::::: Hbo0536 S::::K:KY:::::::::