|
Pairwise sequence scores | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 4501 | NP1810A | HVO_2976 | HQ1036A | Hbo1554 | rrnAC2590 | hla0582 |
3195 | NP1810A | 4624 | 2943 | 2999 | 2882 | 2866 | 2910 |
3990 | HVO_2976 | 2943 | 4548 | 3646 | 3783 | 3302 | 3320 |
3873 | HQ1036A | 2999 | 3646 | 4489 | 3786 | 3162 | 3199 |
3943 | Hbo1554 | 2882 | 3783 | 3786 | 4565 | 3197 | 3254 |
3571 | rrnAC2590 | 2866 | 3302 | 3162 | 3197 | 4699 | 3548 |
3615 | hla0582 | 2910 | 3320 | 3199 | 3254 | 3548 | 4595 |
653 symbols consensus MTQVIWIVVAVLALFTVGYLGYSRYLAQFVELDDSRETPAHKYEDGQEYVPAKKPVLLGH #oth .121..1.32.122.111.2..11..11.111..21...............11....... NP1810A ::SI::::AI:::S:::A:I::G:::S:::D:::D::::::::::::::::::::::::: HVO_2976 :V::::L::T:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HQ1036A :V:I::L::::M:::::::::::K::S:::D::::::::::::::::::::SA::::::: Hbo1554 :V::::L:I::::::SA::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: rrnAC2590 ::::::::L:::VT:S:::::::K:::R:L::::DN:::::::::::::::S:::::::: hla0582 ::N:::::::::GT:::::M::::::SR:::I::E::::::::::::::::::::::::: consensus HYSSIAGGAPIVGPITAGVVWGWVPALAWIAIGNPLMGSVHDFVSLSASLRHEGKSIGYI #oth .1...............122...1..11.1......2.1....2..12.2..1.1..... NP1810A :::::::::::::::::AFI::::::VL:V::::::I:A::::T::TS:I:::::::::: HVO_2976 :::::::::::::::::::::::L::::::::::::L::::::::::S::::D::::::: HQ1036A :::::::::::::::::::L:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hbo1554 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::R::::: rrnAC2590 ::::::::::::::::::A::::::::L:::::::::::::::::::G:::::::::::: hla0582 :F::::::::::::::::AI:::::::L:V::::::::A::::I:::G:M:::::::::: consensus IGEYVGERGKNMLLWFAFLTIILVVAVFALVVAIVFNAYPQAATASLVYIGLAVLFGVYL #oth 1...1..1..1........1.1..11.....111.11.1.311..122..2..221.11. NP1810A :::::::::::::::::::L::::AG:::::IGV::D:::AV:::GVL:::::L::::W: HVO_2976 :::::::::::::::::::::V::::::::::::::::::E:::::::::V::::::::: HQ1036A V::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::I:::::::L:AW: Hbo1554 :::::::::::::::::::::::::G::::::::::::::E::::::I:::::::L:A:: rrnAC2590 ::::I::G::::::::::::::::::::::::::::D:F::VT:::F:::V::LV::::: hla0582 ::::::::::D:::::::::::::::::::::G::L::::S:::::F:::A::FA::::: consensus YQLNLPFIPGTVIFVAGMFAGVWVGIQYPIALFEPAGR--APAGTFVLLS----GTG-SW #oth ..1111.13..23..221.11.12..12.3.112322221211213..321111222231 NP1810A :::::S::G::::::::V::T::::::::::F:---:E::H:D:V:::S-::::E:APVF HVO_2976 :::::::LL::AV::VA::V::YA:::F::::::::A::::::E::::F::::::S:::: HQ1036A ::FD::::A::A:::SL::V:::::::::L::VP--:D::Y::Q:I:::-:::::SQP:: Hbo1554 :::D:::::::IA::VA::V:::::::::L::::::S::::::Q:T:::::::::I:TW: rrnAC2590 ::::G::L::::L::::V::::Y:::LN:V:::PAV:ETSY::::L::ADVLNL::::Q: hla0582 :::DG:::::::V::::V:::::L:::::F::::L::DASHT::::::F:::::S::::: consensus LPG--AGALGANTAAWVPIILVYGAIASALPVWVLLQPRDYLSSFLLYAGVGGALLAIIV #oth 2.222231323.2...113212.113..1....1..........1...1....2.1.11. NP1810A I:ELLGS:---:I::::ITL:L::GA::I:::::::::::::::Y:::T::::G:::::: HVO_2976 ::::::SSFNG:::::::L::::::::::::::::::::::::::::::::::::V::V: HQ1036A ::A:::::F:::::::I::V:I:::::::::::T::::::::::::::T::::::::V:: Hbo1554 ::A::SDS:::::::::::::::::F::::::::::::::::::::::T::::::::V:: rrnAC2590 I::SS:T:MNP:R:::::::M::AG::::::::::::::::::::::::::::S:V:V:: hla0582 V:::::::::G:::::::V::::A:L:::::::::::::::::::::::::::::::::: consensus GTIFG-----A-TATQPLVT--NLEPFYGFIGREGA--------PLFPLLFITIACGTIS #oth .122222223122333112211223122..3.321211111323....1..2........ NP1810A :VFLTGPSAA:VD:GASFDI::Q::AW:::F:G:SPFAGALPLM:::::::L:::::::: HVO_2976 ::F:T:::::-:NP::::::::::::Y::::::S:::::::::::::::::::::::::: HQ1036A ::VL::::::-:::N:::T:::::A:::::::QN:::::::::::::::::::::::::: Hbo1554 ::VG:ALGIS:V:PS:::::::::D::::::::S:::::::::::::::::::::::::: rrnAC2590 :::::::::T:A:E:GS::IADSMGA:N::W:V::::::::GLA:::::::::::::::: hla0582 ::::N:::::-::S:E:::VADSI:::T::L:V:SV:::::APF::::M::V:::::::: consensus GFHSLVSSGTTAKQLNRESDARLIGYGGMLGEGLLATVALSTVAVVA----PDVGGGIGL #oth ...........1..111.1...3.............2...3.1.22122311222...12 NP1810A ::::::::::::::::::T:::::::::::::::::S:::V::::::VPET::--:::A: HVO_2976 :::::::::::S::::K:::::V:::::::::::::::::A:::II:::::::::::::: HQ1036A ::::::::::::::IS::::::A:::::::::::::::::V:::L::::::::::::::: Hbo1554 ::::::::::::::::::::::I:::::::::::::::::I:::L:::::::N::::::: rrnAC2590 ::::::::::::::::K:T:::::::::::::::::A:::::L::AGFAD::A--::::A hla0582 ::::::::::::::::K:::::::::::::::::::A:::::L::AGVAS:DAAA::::G consensus ALPNFATGGGIILTSLGIPASFGAPFMALVLVSFLLTSTDTAVRLGRYMMEEIVGTPESP #oth ...1..2...311111.1.332.21......11.....1...1......1..11.22323 NP1810A ::::::Q:::A:::A::::FAL:EV::::::SA:::::M::::::::::A::AI::::TS HVO_2976 :::T::A:::V::S:F:::TD::G::::::::::::::::::::::::::::::::::T: HQ1036A :::T:::::::L:::F:::T:::::::::::::::::::::::::::::::::I:::::S Hbo1554 :::T::::::V::::F:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::G:: rrnAC2590 ::::::::::::F::::::QT::::::::::::::::::::::::::::::::::LRAGE hla0582 ::::::A:::T::::::L:::Y::::::::::::::::::::A::::::::::::PQS:G consensus V--------------GEFAANRYGNAVVQAIPAYLLVASGSWATLWQLFGGANQLLAALA #oth 3221221111111112121321.2.2411432.12112..2.11..2...........1. NP1810A :::::::::::::::Q:YG::Q:V:TG:IVVA:F::::::R::D::T:::::::::::M: HVO_2976 :::::::::::::::E:::T::::::F::SL:::I:IT::::L::::::::::::::::: HQ1036A :::::::::::::::QS:::D:::::A::T::::V:I::::::::::::::::::::::: Hbo1554 L:::::::::::::::S::VD::::::A::L::::::T::::L::::::::::::::::: rrnAC2590 TASGFNVGGGIRSTL::IGRG::T:PL::::::::M:I::E:L:::A::::::::::::: hla0582 SETGLS::GGI:::::S::RG::T:P:::CGI:::::I::E:::::T::::::::::::: consensus LLTATVWLANWDDSKQLLSTGVPMAIMVTITVLGLLWLAFYDNLYAKLLNDAWMAAAGTL #oth ...2.1.....112...3...2.122.231.23..1.11223221431223322223224 NP1810A :::V:I::::::ET:::V:::::LL::AV::IA::::VSM:QV:GGR::GITAE:ETSA: HVO_2976 :::::::::::::::::::::L:::L:T:::S::::::::H::V:::FM:PE:::S:::F HQ1036A ::::::::::::E::::::::G:::V::G:::S::::::::S:I:T:F:::::::E:TIV Hbo1554 :::::::::::SE::::I:::G::VV::F:::M::::::LH::V:::F::::::ES:T:: rrnAC2590 :::::::::::::N:::Y:::::::::T:::I:::S:::::S:::QN:IQG---G:E::A hla0582 :::G:::::::::::::V:::::::L::VV:::::S:V::KEQ::DQ:IQG---G:Q:IG consensus AIVSAVVQIVLALVLIYLALSLVRMGYDNIRNVRERGGAGAA--G----PSDD #oth 323.1411222.22.22.1.1.122..3.2443135233213113122232.. NP1810A G:G::IA::LI::T:VV:::::L::::G:L:EMGRI:D:P::TD:GDGSRD:: HVO_2976 :M:::::::::::::V:::::::KI:::::KDA:SS::G:GR:::GRPQ:::: HQ1036A Q:L:::A::S::F:::::G::::::::E:VQ:I::GD:T::F::S::::L::: Hbo1554 SM:::A::V:V:F::M:::::::L:::R:::R:::NPSE:GF::S::::SG:: rrnAC2590 ::A:ST::M:::::::G:::A::KK:::::ST::D::P:S:V::E:::::G:: hla0582 :Q:::G:RVL::VL::::::::::I:::::T:::S-:SEP::::K::::::::