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6 genomes BUD1606 6 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi
-

rrnAC2590

HVO_2976

Hbo1554

- -

hla0582

NP1810A

HQ1036A

Pairwise sequence scores
Consensus score4501 NP1810A HVO_2976 HQ1036A Hbo1554 rrnAC2590 hla0582
3195NP1810A 4624 2943 2999 2882 2866 2910
3990HVO_2976 2943 4548 3646 3783 3302 3320
3873HQ1036A 2999 3646 4489 3786 3162 3199
3943Hbo1554 2882 3783 3786 4565 3197 3254
3571rrnAC2590 2866 3302 3162 3197 4699 3548
3615hla0582 2910 3320 3199 3254 3548 4595

653 symbols
consensus       MTQVIWIVVAVLALFTVGYLGYSRYLAQFVELDDSRETPAHKYEDGQEYVPAKKPVLLGH
#oth            .121..1.32.122.111.2..11..11.111..21...............11.......
NP1810A         ::SI::::AI:::S:::A:I::G:::S:::D:::D:::::::::::::::::::::::::
HVO_2976        :V::::L::T::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
HQ1036A         :V:I::L::::M:::::::::::K::S:::D::::::::::::::::::::SA:::::::
Hbo1554         :V::::L:I::::::SA:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
rrnAC2590       ::::::::L:::VT:S:::::::K:::R:L::::DN:::::::::::::::S::::::::
hla0582         ::N:::::::::GT:::::M::::::SR:::I::E:::::::::::::::::::::::::

consensus       HYSSIAGGAPIVGPITAGVVWGWVPALAWIAIGNPLMGSVHDFVSLSASLRHEGKSIGYI
#oth            .1...............122...1..11.1......2.1....2..12.2..1.1.....
NP1810A         :::::::::::::::::AFI::::::VL:V::::::I:A::::T::TS:I::::::::::
HVO_2976        :::::::::::::::::::::::L::::::::::::L::::::::::S::::D:::::::
HQ1036A         :::::::::::::::::::L::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
Hbo1554         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::R:::::
rrnAC2590       ::::::::::::::::::A::::::::L:::::::::::::::::::G::::::::::::
hla0582         :F::::::::::::::::AI:::::::L:V::::::::A::::I:::G:M::::::::::

consensus       IGEYVGERGKNMLLWFAFLTIILVVAVFALVVAIVFNAYPQAATASLVYIGLAVLFGVYL
#oth            1...1..1..1........1.1..11.....111.11.1.311..122..2..221.11.
NP1810A         :::::::::::::::::::L::::AG:::::IGV::D:::AV:::GVL:::::L::::W:
HVO_2976        :::::::::::::::::::::V::::::::::::::::::E:::::::::V:::::::::
HQ1036A         V::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::I:::::::L:AW:
Hbo1554         :::::::::::::::::::::::::G::::::::::::::E::::::I:::::::L:A::
rrnAC2590       ::::I::G::::::::::::::::::::::::::::D:F::VT:::F:::V::LV:::::
hla0582         ::::::::::D:::::::::::::::::::::G::L::::S:::::F:::A::FA:::::

consensus       YQLNLPFIPGTVIFVAGMFAGVWVGIQYPIALFEPAGR--APAGTFVLLS----GTG-SW
#oth            ..1111.13..23..221.11.12..12.3.112322221211213..321111222231
NP1810A         :::::S::G::::::::V::T::::::::::F:---:E::H:D:V:::S-::::E:APVF
HVO_2976        :::::::LL::AV::VA::V::YA:::F::::::::A::::::E::::F::::::S::::
HQ1036A         ::FD::::A::A:::SL::V:::::::::L::VP--:D::Y::Q:I:::-:::::SQP::
Hbo1554         :::D:::::::IA::VA::V:::::::::L::::::S::::::Q:T:::::::::I:TW:
rrnAC2590       ::::G::L::::L::::V::::Y:::LN:V:::PAV:ETSY::::L::ADVLNL::::Q:
hla0582         :::DG:::::::V::::V:::::L:::::F::::L::DASHT::::::F:::::S:::::

consensus       LPG--AGALGANTAAWVPIILVYGAIASALPVWVLLQPRDYLSSFLLYAGVGGALLAIIV
#oth            2.222231323.2...113212.113..1....1..........1...1....2.1.11.
NP1810A         I:ELLGS:---:I::::ITL:L::GA::I:::::::::::::::Y:::T::::G::::::
HVO_2976        ::::::SSFNG:::::::L::::::::::::::::::::::::::::::::::::V::V:
HQ1036A         ::A:::::F:::::::I::V:I:::::::::::T::::::::::::::T::::::::V::
Hbo1554         ::A::SDS:::::::::::::::::F::::::::::::::::::::::T::::::::V::
rrnAC2590       I::SS:T:MNP:R:::::::M::AG::::::::::::::::::::::::::::S:V:V::
hla0582         V:::::::::G:::::::V::::A:L::::::::::::::::::::::::::::::::::

consensus       GTIFG-----A-TATQPLVT--NLEPFYGFIGREGA--------PLFPLLFITIACGTIS
#oth            .122222223122333112211223122..3.321211111323....1..2........
NP1810A         :VFLTGPSAA:VD:GASFDI::Q::AW:::F:G:SPFAGALPLM:::::::L::::::::
HVO_2976        ::F:T:::::-:NP::::::::::::Y::::::S::::::::::::::::::::::::::
HQ1036A         ::VL::::::-:::N:::T:::::A:::::::QN::::::::::::::::::::::::::
Hbo1554         ::VG:ALGIS:V:PS:::::::::D::::::::S::::::::::::::::::::::::::
rrnAC2590       :::::::::T:A:E:GS::IADSMGA:N::W:V::::::::GLA::::::::::::::::
hla0582         ::::N:::::-::S:E:::VADSI:::T::L:V:SV:::::APF::::M::V::::::::

consensus       GFHSLVSSGTTAKQLNRESDARLIGYGGMLGEGLLATVALSTVAVVA----PDVGGGIGL
#oth            ...........1..111.1...3.............2...3.1.22122311222...12
NP1810A         ::::::::::::::::::T:::::::::::::::::S:::V::::::VPET::--:::A:
HVO_2976        :::::::::::S::::K:::::V:::::::::::::::::A:::II::::::::::::::
HQ1036A         ::::::::::::::IS::::::A:::::::::::::::::V:::L:::::::::::::::
Hbo1554         ::::::::::::::::::::::I:::::::::::::::::I:::L:::::::N:::::::
rrnAC2590       ::::::::::::::::K:T:::::::::::::::::A:::::L::AGFAD::A--::::A
hla0582         ::::::::::::::::K:::::::::::::::::::A:::::L::AGVAS:DAAA::::G

consensus       ALPNFATGGGIILTSLGIPASFGAPFMALVLVSFLLTSTDTAVRLGRYMMEEIVGTPESP
#oth            ...1..2...311111.1.332.21......11.....1...1......1..11.22323
NP1810A         ::::::Q:::A:::A::::FAL:EV::::::SA:::::M::::::::::A::AI::::TS
HVO_2976        :::T::A:::V::S:F:::TD::G::::::::::::::::::::::::::::::::::T:
HQ1036A         :::T:::::::L:::F:::T:::::::::::::::::::::::::::::::::I:::::S
Hbo1554         :::T::::::V::::F:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::G::
rrnAC2590       ::::::::::::F::::::QT::::::::::::::::::::::::::::::::::LRAGE
hla0582         ::::::A:::T::::::L:::Y::::::::::::::::::::A::::::::::::PQS:G

consensus       V--------------GEFAANRYGNAVVQAIPAYLLVASGSWATLWQLFGGANQLLAALA
#oth            3221221111111112121321.2.2411432.12112..2.11..2...........1.
NP1810A         :::::::::::::::Q:YG::Q:V:TG:IVVA:F::::::R::D::T:::::::::::M:
HVO_2976        :::::::::::::::E:::T::::::F::SL:::I:IT::::L:::::::::::::::::
HQ1036A         :::::::::::::::QS:::D:::::A::T::::V:I:::::::::::::::::::::::
Hbo1554         L:::::::::::::::S::VD::::::A::L::::::T::::L:::::::::::::::::
rrnAC2590       TASGFNVGGGIRSTL::IGRG::T:PL::::::::M:I::E:L:::A:::::::::::::
hla0582         SETGLS::GGI:::::S::RG::T:P:::CGI:::::I::E:::::T:::::::::::::

consensus       LLTATVWLANWDDSKQLLSTGVPMAIMVTITVLGLLWLAFYDNLYAKLLNDAWMAAAGTL
#oth            ...2.1.....112...3...2.122.231.23..1.11223221431223322223224
NP1810A         :::V:I::::::ET:::V:::::LL::AV::IA::::VSM:QV:GGR::GITAE:ETSA:
HVO_2976        :::::::::::::::::::::L:::L:T:::S::::::::H::V:::FM:PE:::S:::F
HQ1036A         ::::::::::::E::::::::G:::V::G:::S::::::::S:I:T:F:::::::E:TIV
Hbo1554         :::::::::::SE::::I:::G::VV::F:::M::::::LH::V:::F::::::ES:T::
rrnAC2590       :::::::::::::N:::Y:::::::::T:::I:::S:::::S:::QN:IQG---G:E::A
hla0582         :::G:::::::::::::V:::::::L::VV:::::S:V::KEQ::DQ:IQG---G:Q:IG

consensus       AIVSAVVQIVLALVLIYLALSLVRMGYDNIRNVRERGGAGAA--G----PSDD
#oth            323.1411222.22.22.1.1.122..3.2443135233213113122232..
NP1810A         G:G::IA::LI::T:VV:::::L::::G:L:EMGRI:D:P::TD:GDGSRD::
HVO_2976        :M:::::::::::::V:::::::KI:::::KDA:SS::G:GR:::GRPQ::::
HQ1036A         Q:L:::A::S::F:::::G::::::::E:VQ:I::GD:T::F::S::::L:::
Hbo1554         SM:::A::V:V:F::M:::::::L:::R:::R:::NPSE:GF::S::::SG::
rrnAC2590       ::A:ST::M:::::::G:::A::KK:::::ST::D::P:S:V::E:::::G::
hla0582         :Q:::G:RVL::VL::::::::::I:::::T:::S-:SEP::::K::::::::