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6 genomes BUD1607 6 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi
-

rrnAC3039

HVO_2244

Hbo1951

- -

hla1713

NP2562A

HQ1722A

Pairwise sequence scores
Consensus score1856 HQ1722A NP2562A HVO_2244 Hbo1951 rrnAC3039 hla1713
1369HQ1722A 1890 1052 1176 1153 1214 1270
1334NP2562A 1052 1841 1217 1268 1057 1060
1493HVO_2244 1176 1217 1871 1396 1214 1339
1499Hbo1951 1153 1268 1396 1849 1170 1262
1430rrnAC3039 1214 1057 1214 1170 1875 1408
1488hla1713 1270 1060 1339 1262 1408 1882

242 symbols
consensus       MRLARIRTDDGVVSGRYDDGTVHADDGAYEVGRDGELLAPCEPSALYCVGRNFAATLDQM
#oth            .13..13.32.222.1.31111411215.3113122.12..2.212......121121..
HQ1722A         :KH::LQ:PA:I:::::HND::N:P::T:T:::::Q:AV::I:::::::::::T::::::
NP2562A         :KF:::D:::::FE:E:::::::T:E:S::PA-EY:::::::::VF:::::::GEKV:::
HVO_2244        :::::::::G::::::::::V:T::GEE::::V:A::::::D:T::::::::Y:::V:::
Hbo1951         ::::::::A:::LT:E::::::ET:::::I::D:A::::::::::C:::::::::::E::
rrnAC3039       ::I::LL:E::P:T:E:V::V::::::Q:V:::::R::P::::T::::::::Y:::N:::
hla1713         :::::LL:P::P:::::E::VIV::::R:::::::R::P::D:G::::::::Y:E:::::

consensus       DYDRPEVPDFFIKPPVSLLAPEQPIRYPAWTDELTYAGELAAVIDERCRDVAEADVDDAV
#oth            1.13.22..1.....21123133212..51111.......1...121.4122332.2221
HQ1722A         :::::S:::::::::AA:IG:A::::::K:S:K::::::::::::T::::IEQSS:PNII
NP2562A         ::EV::::::::::::::HD::T::P::SFSE:::::::::::::TE:KN:::DE:::V:
HVO_2244        :::I:DQ::W:::::::V:D:GAD:E::D::::::::::::::::RE:S::::E:::EV:
Hbo1951         E:ET:::::W:::::::VHP:DE:VE:::::E::::::::::::::::T:L:IDE:::::
rrnAC3039       ::::::E::::::::TA:::H::N:P::PF::::::::::::::G:::H:IDP:::S:::
hla1713         E:E:::E::::::::A::::HGE:::::E:::::::::::V::::::::::EP:::PEI:

consensus       RGYTILNDLDALDQQGRTARKAFDGSGPLGPWIETDVDPTDIDMTTHINGEQRQEANTEL
#oth            .....1..3.1...31........2.1....1111121.432113.311113..221.24
HQ1722A         ::::::::I:::::E:::::::::T:A::::::::::::Y:MS:E:I:::KT::S:T:KQ
NP2562A         ::::::::::C:::ER::::::::S::::::-VVA:I::VGL:::::::::L:::D:::N
HVO_2244        ::::::::::::::P::::::::::::::::::::::E:SN::::::VG::L:::::::R
Hbo1951         ::::::::::::::A:::::::::::A:::::::::L::EG::::::VG::::::S::::
rrnAC3039       ::::::::V::::::::::::::::::::::::::A::::::::Y:D::D:R::S:::SE
hla1713         :::::M::M:::::::::::::::::::::::::::::::SL:IS:TVG:::::D:::K:

consensus       MLFGPREIVSFLSERFTFQPGDVISFGSPANPGLVEPGDDIEITYEGVGTLRNTVVEG--
#oth            .213.311111..2.1.13.1.111........121111411.2.1.1.1.4.4133321
HQ1722A         :I:D:YK::::::Q:::L:::::::::::::::TI::::N:T:::D:::::E:H:I:PAD
NP2562A         :FIK:::VI::::::::LK:D:::::::::::::L:R::E:::Y:::I:::::::GGD::
HVO_2244        :::S:A:V:::::::Y::::::::::::::::::::::::V::W:::::::T:R::D:E:
Hbo1951         :::S::::I::::::Y:::::::V::::::::::::::E:VT:W:::I:K:Q:::K--::
rrnAC3039       :::::H:V:AY::K::::R::::VA::::::::T:A:D:T:::::D:::::::S:::P::
hla1713         :::::H::::Y::K::::E:::C:A:::::::::::::ERV::::::::::S:PI:::E:

consensus       --
#oth            11
HQ1722A         VS
NP2562A         ::
HVO_2244        ::
Hbo1951         ::
rrnAC3039       ::
hla1713         ::