5 genomes BUD1646 5 proteins a Hsa Halobacterium sp. NRC-1 b Hma Haloarcula marismortui f Hvo Haloferax volcanii g Hbo Halogeometricum borinquense h Hmu Halomicrobium mukohataei i Hut Halorhabdus utahensis j Hla Halorubrum lacusprofundi q Nph Natronomonas pharaonis x Hwa Haloquadratum walsbyi VNG1655 rrnAC0851 HVO_2532 Hbo2328 Hmu1543 - - - -

Pairwise sequence scores
Consensus score	789	HVO_2532	Hbo2328	VNG1655	rrnAC0851	Hmu1543
483	HVO_2532	853	347	254	264	275
436	Hbo2328	347	852	181	192	247
391	VNG1655	254	181	873	266	225
383	rrnAC0851	264	192	266	733	347
465	Hmu1543	275	247	225	347	817

128 symbols
consensus       MSDTDDATAAE-A-----RPTDTRARATDRTTDDADDE---TAARDTGSRVRRALQWAAL
#oth            .11324432223221111431134444333332223121112433333323334232121
HVO_2532        ::ER::S:T:DE:DIETMVS::STPES:ES:E:TI::::::EKN:EFAE:M::F:DY:V:
Hbo2328         :T:ETEP::::T:N::::::::D:T::D:::RASEP:D:::-SGDS:V::LVTV:NY:I:
VNG1655         :::::H:Q---:-:::::Q::::DRNT:TTN:S::TGSGRH:R:::DT:D:::LILRG::
rrnAC0851       ::::-------:-:::::SN:::V:QDI:AD::::VG::::-TDE:S:PAIALYA:::VF
Hmu1543         :::D:TGG:T:AQ:::::HDDEPFESPAQ:RN::E:::::::::SN::Q::ID::::::F

consensus       AGLLLVALIAALQFYLSASAAITTFVTPEYRALFQAAFNLVILLAAALGISVQVRRLT-D
#oth            13.311.21.22.1.2221421321.332..111311...122.2311.2.121.11132
HVO_2532        :::::L::::::::::N::QT:::W:N:::::P::M:::::L::G::::V:::L:::AS:
Hbo2328         G::::L:V:::V:L:::V:RTV::::VY::::PVL::::::VF:I:::::::::::::AS
VNG1655         :V:GF::IV:LF:::T:TT:V:NEW:GR::::::R::::::::::TGI:::LV::K::G:
rrnAC0851       :I:T::::::T::::F:::S::D::::DR::P::N:::::AVV:GCG::L::L::::A:-
Hmu1543         :M:I::::::T::::FA::N::RN::::D::P::::I::::::::S:::L::L:::I::-

consensus       --------
#oth            22122221
HVO_2532        ::::::::
Hbo2328         EADDADT:
VNG1655         GNDSREHR
rrnAC0851       ::::::::
Hmu1543         ::::::::