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5 genomes BUD1664 5 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi
-

rrnAC2962

HVO_2954

Hbo1582

Hmu3191

Hut2365

- - -

Pairwise sequence scores
Consensus score1628 HVO_2954 Hbo1582 Hmu3191 Hut2365 rrnAC2962
1132HVO_2954 1642 1190 590 681 708
1085Hbo1582 1190 1720 617 701 652
943Hmu3191 590 617 1603 705 718
1002Hut2365 681 701 705 1610 709
1017rrnAC2962 708 652 718 709 1674

227 symbols
consensus       ----------VPMAAVLFDMDGVLVDSEDYWHRFEREDILPAAIPDQDPPHEEITGMNYR
#oth            11111111122234.111.....1.3..31.33312121212121221223112..2211
HVO_2954        ::::::::::MDAN::::::::::::::Q:::A::D:WVFAD::ESG::D::::::::F:
Hbo1582         VIALVWGGMN::DE::::::::::::::T:::Q::DDWVFA:::ESG::S:::V::::::
Hmu3191         ::::::::::--:D:AC::::::::N:::::IEL:::E:::T:V:::EV:V::V::IF:E
Hut2365         ::::::::::--:T:::C:::::I:S::AH:K:H:S:::Y::TV:::EV:P::T:::Y::
rrnAC2962       ::::::::MS::P:::C::::::::Q:::H:V:AQ::::::T:A:ND:I:LSA:::R:::

consensus       EIYDYLDAEYGLAVSREEFVALYEEAAESIYGEQVELMDGARALLRDLRAAGVALAIVTS
#oth            .2.12.223.12212222.23112232332..1213232.142.1412.22.34122111
HVO_2954        :::::::::::TT:TKD::::A:H:NS::V:::H:V:::::GE:FS::::::KK::::S:
Hbo1582         ::::::SET::TT:TKA::::A:DDR:Q:L:::::R:::::N::FD:I:DD:RQ:G::S:
Hmu3191         :Q::V::ES:D:::DY:A::S:::G::DE:::D::::TP:V::::TE::E:::PV:M::A
Hut2365         :::::::DN::A:I:::::LE:F:::GRQ::::EA:IVA:VPE::::V::E:NSVSL:::
rrnAC2962       :V:PD:N:::D:EI:::V:EG:F::HG:R:::DEATFL:::HD::N:::D::::::LT::

consensus       APQDWIDIVRERFDL-DPFDLVLSAADIDGPGKPEPDIYERAAAELGVDPEDCVAVEDST
#oth            1.33.132121..1.3231.322.12.2121...1121..11.123.21.331311...3
HVO_2954        ::::::ST::::::::::L::::::D:::K::::::H:::H::::F::A::E::VI:::I
Hbo1582         ::::::G:::D::G::::L::::::D:::K::::::H:::H::EAV:L::QS::V::::V
Hmu3191         S:PE:YE::L:::::GEL::T:V:S::L::::::::T:::::::::::::ATAL:::::H
Hut2365         S:HH:::V:LD::::E:D::AIV::::VER-:::AA:V:::::ELA:E::T::I:I::::
rrnAC2962       ::WA:::VAD:::::LSK::VAI::G:::::::::::::::G::::::A::::W::::::

consensus       NGAEAAVRAGAFTVAFRGVGNADLDLSRADVVADDAAELREVLLGRL
#oth            2.33..211.12112121322123121322321122.1112312333
HVO_2954        ::I:::::S::Y:I:Y::GQ::::::::::RIV:G:::::AA:::EE
Hbo1582         H:V::::::::::::Y:STH::E::::::A::V:GP:::::::FD--
Hmu3191         H:TT::H:::MTV:S:-:::A:AGATEN::L::ETP::MA:IVRS::
Hut2365         :::S::KA:::::IG:T::H:-:I:R:IP::::E:V:::::R::E::
rrnAC2962       A::R:::A::MT::G:::D:D-ET:::MVHET:::::S::Q::::GV