5 genomes BUD1668 8 proteins a Hsa Halobacterium sp. NRC-1 b Hma Haloarcula marismortui f Hvo Haloferax volcanii g Hbo Halogeometricum borinquense h Hmu Halomicrobium mukohataei i Hut Halorhabdus utahensis j Hla Halorubrum lacusprofundi q Nph Natronomonas pharaonis x Hwa Haloquadratum walsbyi VNG1047 VNG6194 rrnAC0346 HVO_0072 HVO_1493 Hbo0054 Hbo0055 - - hla2158 - -

Pairwise sequence scores
Consensus score	364	VNG1047	HVO_0072	hla2158	HVO_1493	VNG6194	rrnAC0346	Hbo0054	Hbo0055
212	VNG1047	549	147	173	181	173	175	185	185
182	HVO_0072	147	531	136	162	146	163	151	151
268	hla2158	173	136	608	229	221	223	256	251
302	HVO_1493	181	162	229	376	224	244	270	270
266	VNG6194	173	146	221	224	367	253	230	230
291	rrnAC0346	175	163	223	244	253	343	286	286
316	Hbo0054	185	151	256	270	230	286	444	345
316	Hbo0055	185	151	251	270	230	286	345	433

108 symbols
consensus       --------------------------MPQIHLDEETVARLDALRQDDESYDEIVTELINI
#oth            1111212222122222221222222211413.231114..13.141..2..11231.322
VNG1047         MGGRSARTGKNLPAPGFMVCHSLQMR::KVI:S::::Q::E::QS:::::::L:A::LTA
HVO_0072        ::::MATANSNEVEYDYPVGYEPEVQTETVE::RR::E::::::E:::::::LI:::AS:
hla2158         :::::::::::::::::::::::::::::::::::PIG::::::I:::E:::::SG:::V
HVO_1493        :::::::::::::::::::::::::::::::::D::::::::::E:::E::DLIN::M::
VNG6194         ::::::::::::::::::::::::::::E:D:N::::N:::N::V::::::::TN:::::
rrnAC0346       ::::::::::::::::::::::::::::SVE::A:::::::D::VE::::::::::::::
Hbo0054         :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::S:::E::D:::::::::::
Hbo0055         :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::S:::E::D:::::::::::

consensus       YEAEELTLFHAGDEL---------------------------------
#oth            32.1.1112331353333233222222123132221111111111111
VNG1047         HD::::S::G:DA:-:::::::::::::::::::::::::::::::::
HVO_0072        FA:S::SAARVDSP:IE:::::::::::::::::::::::::::::::
hla2158         S::::::::R-:SD:EYTVLEYLAPRTPPSRAQLTSIASIQPRTRPYS
HVO_1493        :::S:R::::::::Y:::::::::::::::::::::::::::::::::
VNG6194         ::::::::SF:::R:E::::::::::::::::::::::::::::::::
rrnAC0346       ::::::::::S::--:::::::::::::::::::::::::::::::::
Hbo0054         ::::::::::S:XXXXXXVAPRFELFTPDTRF::::::::::::::::
Hbo0055         ::::::::::S:XXXXXKSEXR::::RPPLRTVHS:::::::::::::