| |||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 2180 | hla2538 | Hbo2541 | HVO_1945 | Hbo1293 | rrnAC2684 | Hmu3094 |
| 912 | hla2538 | 2729 | 541 | 505 | 535 | 473 | 456 |
| 1077 | Hbo2541 | 541 | 2773 | 569 | 562 | 602 | 680 |
| 1129 | HVO_1945 | 505 | 569 | 2620 | 598 | 649 | 745 |
| 1109 | Hbo1293 | 535 | 562 | 598 | 2204 | 716 | 794 |
| 1159 | rrnAC2684 | 473 | 602 | 649 | 716 | 1878 | 940 |
| 1332 | Hmu3094 | 456 | 680 | 745 | 794 | 940 | 2115 |
422 symbols consensus -MRRAATVLLALVLVVAALAAV--PMATAAAQTDGP-------AAANASATGTAAGTDAA #oth 221242322223312242221311131321243323222221232325352344334432 hla2538 MN::I:LIAV:V:::GV:GI:AAG:VG::V::-::::::::::V:::ETSE:NGM:ASNG Hbo2541 ::::VV:LSMV::::::SAS:G::-::A::SPPT::SGESPAV::Q::TE::::TNET:G HVO_1945 VLAV::A::::T:GAPL::::SAG:TG::::A:::SVAAPVAQTT::D:::TDT::N:S: Hbo1293 ::::N::I:MTAM:L:::::T::::::SV:QSEG:T:::::::----TATETPM::S:ST rrnAC2684 :::::TP:::::L:::ST:::::::A::M:QE:EAV:::::::-------------:EQ: Hmu3094 :::DTT:::V:VA:::GS:::::::::GV::::TET::::::::TDTN:P:A::TD:N:T consensus AANETA---------------PGEQLAGVIAVQRAEIDGEVETRAFGIRVAQANSNESKA #oth 3434131111111111111111.22.11.22..32.321.232.212323132411221. hla2538 T:DIS-::::::::::::::::::R:S:::G:::::VA:::DS:::EVGLNRTGTD:ER: Hbo2541 TD::::KAEDADSNESSGGIS::A:::::L::::T:::::IA::S:EKQ::S:R:::::: HVO_1945 :SS::L:::::::::::::::::QR:SA::G::GS:TN::L:R:S:DA:F:N::::A::: Hbo1293 SNES:Q:::::::::::::::S::L:S::L:::D:::AR:::::T::::::::ATD:A:: rrnAC2684 NE:P:::::::::::::::::::A:::::VS::E::L::::QS:T::V:I::::TDAA:: Hmu3094 :::A:::::::::::::::::::::::::VS::G:::::::::::Y::::::SE::D::: consensus AVVAEQVNDIEERLEELEQRRERLEAARENGSLSEGEYRARMARLAAETRTVQRLANRSA #oth 31.221234422..421121344.323.22.3212.2122221223.2214332222313 hla2538 :L:::RLDR:::::S:I:R:QRE:RER:DA:E:TQ::FA::::ETG:RAEA:K:E::::: Hbo2541 K::SQ:::QTQ::::S:QTQL:V:K:E:RE:N::Q:R::SQA::::::I:SL:::LDK:Q HVO_1945 ::::T::ETVR:::T::::::D::::Q::::T::::Q::::LT:TV:DIERTRSML:QTT Hbo1293 D::::RL:SN:A::A:::::KA::::::::::I:K:::NT::::V::::E::KE:T:::: rrnAC2684 S::::::::S:A:::::Q::KQA::Q::::::M:::::::KA:Q:H::::N:::::TETN Hmu3094 :::GQ:MA:::Q::DD::::::T:T:::::::M:::Q::::::::::::::AE::::Q:N consensus EAASTLPAEVLEARGVNATAIDTLRTRANELSGPEVAAIARGIAGANVGNGFA------- #oth 321441.4241324.2233232212421231211..111.1311.522132421111111 hla2538 AV:RD::EP:RA:Q:LDSERM:AV:E:::GV:::::S:::::V::DG::QPL:::::::: Hbo2541 :::DG::P:ARQ:T:LDEKRF:R::NDTEN::RS::SEV::EV::E:::::::R:::::: HVO_1945 D::::V::QE:S::::ETAEL:R:::N:S::T:::::E:::::::-:P:K:IGRERAANE Hbo1293 T:SER::N:L::Q::::T:::R::A:::ED:T::::SE:::Q:::SATTR:N:::::::: rrnAC2684 :T::Q::T::::KK:I:::::K::SQ::S:::::::::::Q::::P:::QQAR::::::: Hmu3094 :T:Q:::::T:::N:::::::R::SD:::::R:::::::::S:G::GT::::G::::::: consensus --------PARAG--ERGPPAGNRTENGD--------RAADA-G------------G--- #oth 111111222242.12332233323124431111111115441424223232233321333 hla2538 ::::::::SE:R:PPAGV:G::AG:::AT::::::::GNTTGA:ASSPPAPGKPGD:GPS Hbo2541 :::::GPPTD:P::::::::DR:ESDSNSPGNSADAPGRDRGQ:NSGAPGNAANET:RND HVO_1945 TETDAGGR:DDP:::RSDA:GNSHS:AS::::::::::::::RADTGNATNGTETD:HAT Hbo1293 ::::::::T:HR:PF:EV::R::H::::N::::::::GQ:N:H:Q:::::::::::-::: rrnAC2684 :::::::::EV::::D::SD:A::::V:::::::::::PGAG:-::::::::::::-::: Hmu3094 ::::::::::A:::::::AE:::::AGQ::::::::::GS:::-::::::::::::-::: consensus ------------REAADGAERTDASSAP--PANDG--TATDPGDSGSDPGDARAD----- #oth 323332332333544532342323443421153234333323344245334533311111 hla2538 VGAGSGSGSAGNGD:PP:NATPGSETG:NGAMG::PE:N:S:::N:A:G:NG::G::::: Hbo2541 GQNEAGEPGNSGNAHGH:S::::DN::KTG:NRSNGNS:S:::N::NG::H:D:NSGRDV HVO_1945 NGTVTDVAGGESDG:::::D:GN:PET::::G::KRAKDA:GS:VAVP:A:E:S:::::: Hbo1293 ::::::::::::::TLEN:TTEN:::TI:::D:E-::::::TPL:::EQ:ASER:::::: rrnAC2684 ::::::::::::P:RTPAG::::VAD:T:::::E-::------------------::::: Hmu3094 ::::::::::::---R::GNE::::NER:::TA::D:-----:AT::Q:E:D---::::: consensus -SDRTANDSATTATAGEGTDARGEGSATVNSGA--------------------------- #oth 122544334532423334425322224233434222222111111111111111111111 hla2538 ::NG:PSG:GPGPRD:A:DRPTES::::::TV:EIETLMGRLTGSWADSTDILRRVVTGI Hbo2541 P:N:N::G::D:E::S:DRETT::TATDG::TS::::::::::::::::::::::::::: HVO_1945 :D:T::T:DD::::DDDT::DES:T:S:DD:::::::::::::::::::::::::::::: Hbo1293 :::DST:AGK:DSSSKS:A::::SDALS:SRSGLLVRIE::::::::::::::::::::: rrnAC2684 :----------:::N::E:ESP:G::D::DA:Q::::::::::::::::::::::::::: Hmu3094 :-:QQST:TE:DDS:S:AE:Q::G:N:SEGQ:R::::::::::::::::::::::::::: consensus -- #oth 11 hla2538 DG Hbo2541 :: HVO_1945 :: Hbo1293 :: rrnAC2684 :: Hmu3094 ::