| |||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 3929 | hla0803 | HVO_2695 | Hbo2416 | HVO_A0148 | rrnAC0923 | Hmu1599 |
| 1788 | hla0803 | 3611 | 1432 | 1350 | 1352 | 1415 | 1371 |
| 2616 | HVO_2695 | 1432 | 3950 | 3005 | 1738 | 1994 | 1868 |
| 2503 | Hbo2416 | 1350 | 3005 | 3909 | 1711 | 1848 | 1820 |
| 2634 | HVO_A0148 | 1352 | 1738 | 1711 | 3824 | 2576 | 2468 |
| 3110 | rrnAC0923 | 1415 | 1994 | 1848 | 2576 | 3975 | 2978 |
| 2915 | Hmu1599 | 1371 | 1868 | 1820 | 2468 | 2978 | 4014 |
591 symbols consensus ------------------------------------------------------------ #oth 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 hla0803 MTGTHSMLGAHSRSDDIGGRYGPLRGPRIARLIRFSRERVRPIMMSVSINNYIRVYFVTT HVO_2695 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hbo2416 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_A0148 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: rrnAC0923 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hmu1599 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: consensus --MMDNASDRERKRSGVSRRRFVKAAGASGVAAGLAGCASGGGGDDGG-G-GSDGG---- #oth 1223435433334242....2.2412..2.1222.1..2243.12333433123321122 hla0803 AV:V:SE::::SG:V:::::Q:LEVT::T:A:V:::::SG::::----:-:-----:::: HVO_2695 ::-:VD:DS:KG::N:::::S:::::::::::V:::::I:T::::GDNGDN::N::GDSD Hbo2416 :MDDIDTHG:S::::A:::::::::::::::::S::::I::T:::QTETEA:GSQT:::: HVO_A0148 ::-:TTNPETSKTTKS::::::IT::::T:AT:::S::::MF:N----:-::::T::::: rrnAC0923 :::S::GTSG::NST::::::::R::::A::VG::::::DFV::G:::S:D::::::::: Hmu1599 :::SN:H::DDGQ::S:::::::A:S:::::::T:::::DLV::G:::D:::::::::DG consensus ---PIGDGESSETTTVQWGGD-TAVQNNGDAIKQALHD-AGLPDDIEIEIIPGDQDTGAR #oth 1224312243422322311322233333312241112122..312.31133123321232 hla0803 :::--:::PIQI:MDAE:::I:------S::LT:S:Y:::::DES:::::L:::FES::: HVO_2695 TST::NTE:TT:DI::KIA::::RMAD:S:::V:SMR:::::::N:S:D::A:S:V:DN: Hbo2416 :::::NTEAP::DV::::AA:::R:N::RE::F:S:RE::::::N:TV:V:A:S:V:NN: HVO_A0148 ::AQV:ES::GG::V:-::F:A:VA:DHA:QLRT:::EKG::S:::RV:FQ::QP:S:K: rrnAC0923 :::ST:::S::::::::::F:PV::::::::::::::::N::S::::::FV:R::::::A Hmu1599 TGATT:E:G:DGA::I:::IGP::::TA:EEM:T:::EAG::R::::::WV:SAS:::EV consensus RSNYNRLLSAGRENPDIFMMDNGWTNIFIARGQLQNLSETLPEDLLSDIENNYFEAFTDT #oth 1231223.322235.1212..1..111..1.1112...23.12232131322.132214. hla0803 ::EFTSA:D:::AS:::::::S:::IP:::::::V:::DE:SSET:DYVQ:D:LPSAVN: HVO_2695 QAQ:QQW:GG:::E:TLL:::S:::IP::::N:::::::S::SEMI:T::DE::::SVS: Hbo2416 QNQ:QQW::S:::Q:TLL:::S:::IP::::N::::::Q:::DSMT:RV:E:::::SVG: HVO_A0148 :AT::::::SQETT::M:::::::V::::Q::::A::::V:::SA::T:::E::GG::E: rrnAC0923 :::::::::::ET:::M:L::::::::::Q::::::::::::::::::VSD:::S::::: Hmu1599 ::::::I:N:DQSD::::Q:::::V::::Q::LI:::::::::::::::NE:::SG:::: consensus ARDPNSGDLFGVPLFPDFPTMQYRKDLVENAGY-DPDFENWATEPMSWEEFSNIAADAQD #oth .32232.1.1.2.11..1.1.2.....113...2222321....1.1.311132211252 hla0803 :S::E::::::L:::::Y:V:H:::::::D:::::::G::::::::::Q::AEM:::VWE HVO_2695 :KGS:-:::Y:::::::::::::::::LR::::T:D::DT::::S:::::::KVTKE:L: Hbo2416 :KGA:-:::Y:I:::::::::::::::LR::::G:S:::T::::S:::V:::K:TKE:MN HVO_A0148 :I::A:::::::::Y::Y:::L:::::::E::::N:TE::::::::T:KRW:::::E::E rrnAC0923 ::N:SN:N:::::V:::::::::::::::E::::S:ESN:::::::T:::W::::::TY: Hmu1599 ::::S::::Y:::::::::::::::::::Q::::::ES::::::::T:::W:HVV::VK: consensus AN-----DVDYGFTTQWDIYEGLACCTFNEVMSSWGGAYFGGR-ENLFGPVGERPITVDE #oth 32211111321.1.1.212.1.11..1...211.2...1..2211.....1.1..1..12 hla0803 Q:GGPGG:F:::::::G:N:V:::::::::T:T:F::::::DH:::::::I:D:::::N: HVO_2695 :::::::::Q::Y:F:A:V::::S::D:::F:T:Y:::F:::::D::::::::::::::: Hbo2416 ::P:::::TQ::Y:F:ASV::::S::D:::F:T:Y:::F::NPA::::::::D::V:::: HVO_A0148 VS:::::G::::::::::::V:T::::::::L:::::::::::::::::::::::V:::S rrnAC0923 NA::::::::F:::::::::::TS::::::::::::::::::::D:::::I:::::::NN Hmu1599 NA::::::AE::::::::::::T::::::::::::::::::::::::::::::::::::: consensus QPVHNSINMMRKFVHDEDFEGAFDDYGGGIAPTAILGWTEEPSRAPFTGGNAIFHRNWPY #oth 42.21212.1.212211222222412312121132.212.12113..24.1.11...... hla0803 E:::DT:R:::S:MEGP:A:Y:HP:FP-Q:ST:DL:SF::::::E:::S::::::::::: HVO_2695 :S:LD::R:V:TLI:G::D:Y:L:GIT:::::E:V:Q:::::::K:::::D::M:::::: Hbo2416 :::LD::K:V:TLING::D:H:L:GIT:N:::E:V:Q:::::::K:::::D::M:::::: HVO_A0148 D::V::L::::::::::S:D:Q:S:::::FT::N::::I:DS:L:::VD:::V::::::: rrnAC0923 TE:::AL::::::::::::G:Q:EG::::FT::E::::K::DA::::VN:::V::::::: Hmu1599 PE:::AL::::::::::E:D:T:A::A:N::::D::::I:::::S::AE:D:V::::::: consensus SIALNG------ADDAF-GEDLGVMPIPYGVPASEAAYPGTGGPTAALGGWHMTVNPNSD #oth 113232111111233211111112..1..11313.13211...32111111141411125 hla0803 A:P::L::::::DSEE:SA::YD:::L:::IE:G:GE:E::::AA:-------------- HVO_2695 ::TI:::::::::::V:::::::::::::::::D::K:E:::::V:::::::::M:::AP Hbo2416 ::NI:::::::::E:V:::::::::::::::T:E::Q::M::::V:::::::V:L:::AS HVO_A0148 A:NQ--:::::::ASE:::D:::T::L:::::E:::QF:::::S:S::::::I::::::Q rrnAC0923 :L::G:RNPEETE:P:L:::N::A:::::A::E::::Q:::::S:::::::::::::::E Hmu1599 :L::T:RNPEETD:P:L::::::A:::::A:SE::::Q:::::T:S::::::L:F::::: consensus QLD--AVTQVIRAMMRPDFQLDLFEIQGWLPPRPELFNSDEAANVPVIGRYMDTLQVAGE #oth 322122442145241523131432433112112231221331432423121223131112 hla0803 ---::------------------------------------------------------- HVO_2695 :QQKQ:GA::LEV::K:Q::::N:G::::I::::::LD:E::K::D:::::LSA:K:::N Hbo2416 ::QKR:AL::MK:::TEQ:K::I:::I::I::E:D:LD::R::E:::::::LSQ:K:::: HVO_A0148 K::::::::::Q:S::EE:::F:L::E::::::AS::::ET::GLEPA:D:::::R:::: rrnAC0923 :::::::::::::A:Q:::::T:LSV:::::::::::::S::Q::::V:::::::::::N Hmu1599 N::::VIDE:VS:V:E:::A:E::RL::::::::::::::::R::APV:::::::::::: consensus NAMPRPVTVVWPQQSSKIAQQANRAVGQEKSSEDAMADLKSSLEATEQS-- #oth 1221.111411331.222133213122214323311131424123212331 hla0803 ---::RRSAAGTSR:TRTPRGSTT:FRCSRR:PTRRS------------:: HVO_2695 ::I::::::::::::G:V::EV:N:YA:::TP:Q::S::::Q:::I:::LA Hbo2416 ::I::::::::::::::::TEV:A:YAR:::P:Q::S:::NT::QI:::A: HVO_A0148 :T:A::::S::NN::::::E:::::::::VA:SE:::T:Q::::E::R:N: rrnAC0923 :T::::::G::SD::::::::::::::::A::A::::T:E:A:AE:::T:: Hmu1599 :::A::::P::S::::D:::S:::V::::T:A:::::S:T::::::::N::