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5 genomes BUD1682 6 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi
-

rrnAC0031

HVO_0534

HVO_B0038

Hbo2675

Hmu2045

-

hla0763

- -

Pairwise sequence scores
Consensus score2848 HVO_B0038 rrnAC0031 Hbo2675 Hmu2045 HVO_0534 hla0763
2025HVO_B0038 2874 1811 1817 1856 1814 1768
2031rrnAC0031 1811 2865 1894 1858 1748 1749
2208Hbo2675 1817 1894 2830 1891 1941 1890
2225Hmu2045 1856 1858 1891 2869 1978 1938
2419HVO_0534 1814 1748 1941 1978 2871 2433
2390hla0763 1768 1749 1890 1938 2433 2857

386 symbols
consensus       MATLELDSVTKTFQDGDE-EIVAVDDVSMDIDDGEFLVVVGPSGCGKSTTLRMIAGLETI
#oth            .13.1.142..113.32311.1..13113211....111..............2....11
HVO_B0038       ::R:T::D:::VYT:EGGGD::::EEI:L:::::::::L::::::::::::::M:::::V
rrnAC0031       ::Q:T::E:::::::D:G:::I:::E::V::E:::::C::::::::::::::::::::D:
Hbo2675         ::E:T::N:::V:D:NGT:D:::::G::V:::::::::L::::::::::::::::::::V
Hmu2045         :G:::::RL::V:H::E:G::::::N:DIQM:::::I::::::::::::::::V:::::V
HVO_0534        ::::::::I::::::::D::::::::I::S::::::::::::::::::::::::::::::
hla0763         ::::::N:I::::::::::::::::::::S::::::::::::::::::::::::::::::

consensus       TSGEIRLDDRVVNDVKPQDRDIAMVFQSYALYPHMTVRENMSFGLEESTDLPDDEINRRV
#oth            12.211121212.223223.11............11.22..1.......211.1..432.
HVO_B0038       :E::L::E:::L:G:SA:::::::::::::::::KS::G::::::::::G::::::RQ::
rrnAC0031       :R::::::GQII::QP:AR:NV:::::::::::::::::::A::::::::M::::::E::
Hbo2675         S:::::::GE:::AQP:RE::::::::::::::::::K::::::::::::M::S::SSL:
Hmu2045         :::N::::G:::::E:::N::::::::::::::::::A:::A:::::::T::::::EE::
HVO_0534        :::T:S:G:::I:::AS:::::::::::::::::::::Q:::::::::::::::::G:M:
hla0763         :::TLSI:::::::::S::::::::::::::::::S::Q::::::::::::L::::::M:

consensus       EETAEMLGISDLLDRKPGELSGGQQQRVALGRAIVRDPEVFLMDEPLSNLDAKLRAQMRT
#oth            22132311.43.11...12...................1........1....1.111...
HVO_B0038       :::TD:::::::::::::Q:::::::::::::::::::::::::::::::::::::E:::
rrnAC0031       :KACKDM::FE:I::::::::::::::::::::::::::::::::::A::::::K:E:::
Hbo2675         :::::::::G:::G::::::::::::::::::::::::K:::::::::::::Q::S::::
Hmu2045         HDA::TM::AE::::::S:::::::::::::::::::::::::::::::::::::S::::
HVO_0534        S:::DL:D:PS::::::SD:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
hla0763         S::G::::::P::::::SD:::::::::::::::::::::::::::::::::::::E:::

consensus       ELQRLQADLGVTTVYVTHDQTEAMTMGDRIAILNDGELQQVATPLECYHEPANQFVAGFI
#oth            ...11.52.1.1.1............1..1.1.11.2...211..21..1.2.1...2.1
HVO_B0038       ::::::GE:::::::::::::::::::::V:V:D:::::::G:::D:::R:N:L::::::
rrnAC0031       :::E::Q::D::::::::::::::::S:::::::::V:::C::::::::::N:L::::::
Hbo2675         ::::I:EN:::S::::::::::::::::::::::::::::::::::A::::T:::::K::
Hmu2045         :::::::E:D:::M::::::::::::::::::::::K:::::::::::::::::::::::
HVO_0534        ::::::D::::::::::::::::::::::::::DG:::::I::::::::::::::::S:L
hla0763         ::::::N::::::::::::::::::::::::::DG:K:::I:S::K:::::::::::S:L

consensus       GEPSMNFFDMTLDGDRLVGDRFEYPLSDETRDDLGDTSDLTLGIRPEDIEVVESASGDHD
#oth            .1....1.23223.1113125.1.121432232212233212.1...2122144421423
HVO_B0038       ::::::L::GS:S::TFR::G:D::::GA:::Q::GA:G:::::::::VT:G:RR::QRT
rrnAC0031       ::::::::PT::E:ST:K:EW:::E:::::VAAVEG:::I::::::::::F:Q:DV:PNV
Hbo2675         ::::::::E:EMQ::::TS:L:D::::E:::EA::::THV:F::::::::::SE:AD:::
Hmu2045         :D::::::::ER:::T:::S:::::::QS:L::V:E:RNV:::V::::V::GTDE::S:T
HVO_0534        :::::::::V:RE:::::::S::::VGA:I:::I::VT::V::::::SV:L::A::::::
hla0763         :::::::::V::::::::::V::::IG:DV:V:::E:A::VM:::::A:KL:A:K:DA:E

consensus       FEMTVDVVEPMGNENTVYLRFEPDAD---AATLVATIDGLTQLSAGDRVVARIPEDAIHL
#oth            122313....2.1..221.4.2434111223212..22.342343.2412222..31..2
HVO_B0038       :DAE:V::::Q::::A:H:::VDGDE:::GTQFT::TT:QSRVE::::TTVSF:::::::
rrnAC0031       :DS::H::::R:::::AH:Q:DESM::::-DQFI::VG:MK::K::QH:KI:F::N::::
Hbo2675         :::VI::::::::::N:::S::TGG::::-:D::::V::MRS:D::QP::::L::P::::
Hmu2045         YSAI:E::::::D:::::::::SAPE:::GE:FI::::::Q:AAV::::TVS:::ET:::
HVO_0534        ::::::::::::D:::L::Y::::::PET:E:::::T::::RI:P:ET:::Q:::E:::F
hla0763         ::::::::::::D::::::H:D::::PES::::::::::F::V:E::S:::Q:::::::I

consensus       FDGRSGEALHNRSLDEAAEQESLV--
#oth            ..241.2.22..31334343444421
HVO_B0038       :::ET:D::K::E:PSNRAIDAF:SN
rrnAC0031       ::TS::S:IR::T:::IETV::V:::
Hbo2675         ::TQ::S::K::::::LE:T:PRL::
Hmu2045         ::::::::V:::R::MSG:IS:PPT:
HVO_0534        ::::T::::::::ME:::Q:ID:G::
hla0763         ::RVT::::::::MKD::D:VN:A::