|
Pairwise sequence scores | |||||||
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Consensus score | 2848 | HVO_B0038 | rrnAC0031 | Hbo2675 | Hmu2045 | HVO_0534 | hla0763 |
2025 | HVO_B0038 | 2874 | 1811 | 1817 | 1856 | 1814 | 1768 |
2031 | rrnAC0031 | 1811 | 2865 | 1894 | 1858 | 1748 | 1749 |
2208 | Hbo2675 | 1817 | 1894 | 2830 | 1891 | 1941 | 1890 |
2225 | Hmu2045 | 1856 | 1858 | 1891 | 2869 | 1978 | 1938 |
2419 | HVO_0534 | 1814 | 1748 | 1941 | 1978 | 2871 | 2433 |
2390 | hla0763 | 1768 | 1749 | 1890 | 1938 | 2433 | 2857 |
386 symbols consensus MATLELDSVTKTFQDGDE-EIVAVDDVSMDIDDGEFLVVVGPSGCGKSTTLRMIAGLETI #oth .13.1.142..113.32311.1..13113211....111..............2....11 HVO_B0038 ::R:T::D:::VYT:EGGGD::::EEI:L:::::::::L::::::::::::::M:::::V rrnAC0031 ::Q:T::E:::::::D:G:::I:::E::V::E:::::C::::::::::::::::::::D: Hbo2675 ::E:T::N:::V:D:NGT:D:::::G::V:::::::::L::::::::::::::::::::V Hmu2045 :G:::::RL::V:H::E:G::::::N:DIQM:::::I::::::::::::::::V:::::V HVO_0534 ::::::::I::::::::D::::::::I::S:::::::::::::::::::::::::::::: hla0763 ::::::N:I::::::::::::::::::::S:::::::::::::::::::::::::::::: consensus TSGEIRLDDRVVNDVKPQDRDIAMVFQSYALYPHMTVRENMSFGLEESTDLPDDEINRRV #oth 12.211121212.223223.11............11.22..1.......211.1..432. HVO_B0038 :E::L::E:::L:G:SA:::::::::::::::::KS::G::::::::::G::::::RQ:: rrnAC0031 :R::::::GQII::QP:AR:NV:::::::::::::::::::A::::::::M::::::E:: Hbo2675 S:::::::GE:::AQP:RE::::::::::::::::::K::::::::::::M::S::SSL: Hmu2045 :::N::::G:::::E:::N::::::::::::::::::A:::A:::::::T::::::EE:: HVO_0534 :::T:S:G:::I:::AS:::::::::::::::::::::Q:::::::::::::::::G:M: hla0763 :::TLSI:::::::::S::::::::::::::::::S::Q::::::::::::L::::::M: consensus EETAEMLGISDLLDRKPGELSGGQQQRVALGRAIVRDPEVFLMDEPLSNLDAKLRAQMRT #oth 22132311.43.11...12...................1........1....1.111... HVO_B0038 :::TD:::::::::::::Q:::::::::::::::::::::::::::::::::::::E::: rrnAC0031 :KACKDM::FE:I::::::::::::::::::::::::::::::::::A::::::K:E::: Hbo2675 :::::::::G:::G::::::::::::::::::::::::K:::::::::::::Q::S:::: Hmu2045 HDA::TM::AE::::::S:::::::::::::::::::::::::::::::::::::S:::: HVO_0534 S:::DL:D:PS::::::SD::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: hla0763 S::G::::::P::::::SD:::::::::::::::::::::::::::::::::::::E::: consensus ELQRLQADLGVTTVYVTHDQTEAMTMGDRIAILNDGELQQVATPLECYHEPANQFVAGFI #oth ...11.52.1.1.1............1..1.1.11.2...211..21..1.2.1...2.1 HVO_B0038 ::::::GE:::::::::::::::::::::V:V:D:::::::G:::D:::R:N:L:::::: rrnAC0031 :::E::Q::D::::::::::::::::S:::::::::V:::C::::::::::N:L:::::: Hbo2675 ::::I:EN:::S::::::::::::::::::::::::::::::::::A::::T:::::K:: Hmu2045 :::::::E:D:::M::::::::::::::::::::::K::::::::::::::::::::::: HVO_0534 ::::::D::::::::::::::::::::::::::DG:::::I::::::::::::::::S:L hla0763 ::::::N::::::::::::::::::::::::::DG:K:::I:S::K:::::::::::S:L consensus GEPSMNFFDMTLDGDRLVGDRFEYPLSDETRDDLGDTSDLTLGIRPEDIEVVESASGDHD #oth .1....1.23223.1113125.1.121432232212233212.1...2122144421423 HVO_B0038 ::::::L::GS:S::TFR::G:D::::GA:::Q::GA:G:::::::::VT:G:RR::QRT rrnAC0031 ::::::::PT::E:ST:K:EW:::E:::::VAAVEG:::I::::::::::F:Q:DV:PNV Hbo2675 ::::::::E:EMQ::::TS:L:D::::E:::EA::::THV:F::::::::::SE:AD::: Hmu2045 :D::::::::ER:::T:::S:::::::QS:L::V:E:RNV:::V::::V::GTDE::S:T HVO_0534 :::::::::V:RE:::::::S::::VGA:I:::I::VT::V::::::SV:L::A:::::: hla0763 :::::::::V::::::::::V::::IG:DV:V:::E:A::VM:::::A:KL:A:K:DA:E consensus FEMTVDVVEPMGNENTVYLRFEPDAD---AATLVATIDGLTQLSAGDRVVARIPEDAIHL #oth 122313....2.1..221.4.2434111223212..22.342343.2412222..31..2 HVO_B0038 :DAE:V::::Q::::A:H:::VDGDE:::GTQFT::TT:QSRVE::::TTVSF::::::: rrnAC0031 :DS::H::::R:::::AH:Q:DESM::::-DQFI::VG:MK::K::QH:KI:F::N:::: Hbo2675 :::VI::::::::::N:::S::TGG::::-:D::::V::MRS:D::QP::::L::P:::: Hmu2045 YSAI:E::::::D:::::::::SAPE:::GE:FI::::::Q:AAV::::TVS:::ET::: HVO_0534 ::::::::::::D:::L::Y::::::PET:E:::::T::::RI:P:ET:::Q:::E:::F hla0763 ::::::::::::D::::::H:D::::PES::::::::::F::V:E::S:::Q:::::::I consensus FDGRSGEALHNRSLDEAAEQESLV-- #oth ..241.2.22..31334343444421 HVO_B0038 :::ET:D::K::E:PSNRAIDAF:SN rrnAC0031 ::TS::S:IR::T:::IETV::V::: Hbo2675 ::TQ::S::K::::::LE:T:PRL:: Hmu2045 ::::::::V:::R::MSG:IS:PPT: HVO_0534 ::::T::::::::ME:::Q:ID:G:: hla0763 ::RVT::::::::MKD::D:VN:A::