| |||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 2295 | HVO_B0036 | Hbo2676 | rrnAC0030 | Hmu2044 | HVO_0532 | hla0764 |
| 1247 | HVO_B0036 | 2293 | 1131 | 1073 | 1155 | 1066 | 1063 |
| 1282 | Hbo2676 | 1131 | 2237 | 1220 | 1126 | 1162 | 1127 |
| 1413 | rrnAC0030 | 1073 | 1220 | 2295 | 1190 | 1184 | 1227 |
| 1780 | Hmu2044 | 1155 | 1126 | 1190 | 2320 | 1654 | 1684 |
| 1967 | HVO_0532 | 1066 | 1162 | 1184 | 1654 | 2338 | 2063 |
| 1993 | hla0764 | 1063 | 1127 | 1227 | 1684 | 2063 | 2326 |
336 symbols consensus MSD---RTDGG-ASATARLRRA--VEQ-TAERIGLYAVLLLAAAFYLVPIESGLMTSIKT #oth 12332222111242322432322133344431311.22234421.1.3.2.1121.21.. HVO_B0036 ::Q:::-----:S:S:GNFDV:SL::DVNLR:VAQ::LVVFFLG:F:::L:T:I::A::: Hbo2676 ---:::-----:M:LADDI:S:::---:SVS:Y:::::IAVM:::::A:L:::::::::: rrnAC0030 ::-:::IR::::--FIDE::ST::---:ENS::::::L::AGI::::F:V:TAV::MF:: Hmu2044 :::ET::::::AV::AGSDQP:GLLAEID:Y:VA::LG::TIL::F:I::::::V::F:: HVO_0532 :T:DTL:::::T:TF::::::N:::::M:I:DA:::V::::::G::::::::::V::::: hla0764 ::NAKP:::::::T:::::::T::ID:L:::D::::V::T::::::::::::::V::F:: consensus GTAIARTLPFAPPGPDGFTLEKWQTAWDAL-------LRGLGNSLLYAIPATVISALLGS #oth 43223312..1..3221...33223.4321111111132233..22211...13.213.. HVO_B0036 NESV::S::::::VGE::::GNI:F:LEQ::::::::SGSFF:::IMS::::IG:V:F:: Hbo2676 QD:FIN:T::I::FG:::::GP:NE::AQMQGPLTDFSGA:Y::AFV::::::L:G:I:: rrnAC0030 ES:F::::::::::T:::::DALT:::NT::::::::RP::V::::M:::::IV:::::: Hmu2044 S:GVSG:::::::T:EV:::A:::::F::::::::::A:::V::A:::V::::::::::: HVO_0532 ::::VE:A:::::::S::::::::A:VE::::::::::::I:::M:::V:::::::FV:: hla0764 ::::IE:A:::::::S::::::::::T:T:::::::::::M:::::::V:::::::FV:: consensus IAAYGLTIPNWRG-YQAGVLALIVAGIFIPYQAVLVPLTQFWSQWAP------LADALGF #oth 31...1.443.1421123213.111.2.1...1.....21..324521111112543332 HVO_B0036 M::::::MV:::A:-:M:M:M:F:V:V:V:::::::::AR::NNIF:::::::::RMIEP Hbo2676 :::::::NL:::::-:::::I:F:::M:V:::S::::::R::T----::::::IVGLHNH rrnAC0030 MT:::::TIS::::-:V::VV::I::::::::::::::A:::F:VL:GLLNGFVNTVF:: Hmu2044 F::::I:QS::KPK:K:PI:::F:::::::::::::::S::::-MI::::::::QE:::: HVO_0532 :T:::::::D:KQS:K:L:::::I::::::::::::::::::::::Q:::::::T:L:S: hla0764 VT:::::::T:KKS:K:V::M::::::::::::::::::::::::VQ:::::::G:::S: consensus V----WALGIRNDY-VGLVELVITHVAYGIPICTLLFRSYYKSMSDEMIEAARLDGASIR #oth 32111132135421122222.21..3...1....2...1..22323112.1111...132 HVO_B0036 MV:::ASIPFFQG:HAE::P:::::I::::::::I::::::Q:LPNSLV::GKI:::::T Hbo2676 L::::AGIPFLAQR::::I::IV::T::::::::I::::::A:FDQS:L::::I:::TFT rrnAC0030 ITGGN:QYPS::G:::Q:LQ:S:::A:::::::::::::::Q:I::::::::::::::AF Hmu2044 ::::::::::SS:::T:V:::IV::::::L::::V:::::::N::E:::::::::::::: HVO_0532 :::::::::VP::::::I::::V:::::::::::::::T:::T::E::::S::::::TL: hla0764 ::::::::::DD:::::II::::::::::L::::::::T:::T:::::::S::::::TL: consensus RIYRRIILPLSGPMFAVVLIYQFTQIWNDLLFALVLVSTESSPAAPVVLILAGLGASLEG #oth 21..1.11.1.2...1.11......11.11..1111.3323131.123.32232151221 HVO_B0036 K::::::::I:K:::G::F:::::::Y:EF:::FT::TGSDA:::::T:V:PAI:::TS: Hbo2676 :::::::F:::K:::::::::::::V:::F::::::::SPT:EV:TIA:NKLQGSMV--- rrnAC0030 S:::N::::::L:::::T:::::::VY::::::::::NEPA:QV:TQR:AALTG:VV--- Hmu2044 :V::::V:::::::::::::::::::::::::T::::Q::::T:::I::::::::Q:::: HVO_0532 :V::::VF::::::::::::::::::::::::T::::::::::::::::::::::T:::: hla0764 :V::::V:::::::::::::::::::::::::T::I:::::::::::::::::::S:::: consensus QDFALRMAGAFIAALPTLAVYILFGEEFAEGVAAE- #oth 131222.11.13..1...21.13.112..1.11212 HVO_B0036 IN:GI::SA::L::V:::IL:VA:A:Q::K:LRT:A Hbo2676 :QYNIQ::A:::::::::L::V:::DK::::::G:T rrnAC0030 :S:NTT::::IV::::::L:::M:::Q::K:::G:: Hmu2044 ::::::::::::::::::::::M::::::::::T-: HVO_0532 :::::::::::F::::::::::F::D::::::::-: hla0764 :::::::::::F::::::::::::::::::::::-: