|
Pairwise sequence scores | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 2645 | HVO_1237 | Hut1037 | Hmu2725 | hla2739 | rrnAC0202 |
1284 | HVO_1237 | 2316 | 739 | 876 | 819 | 893 |
1405 | Hut1037 | 739 | 2483 | 989 | 936 | 1029 |
1660 | Hmu2725 | 876 | 989 | 2617 | 1140 | 1147 |
1750 | hla2739 | 819 | 936 | 1140 | 2647 | 1324 |
1775 | rrnAC0202 | 893 | 1029 | 1147 | 1324 | 2668 |
378 symbols consensus --MS-SLSRARRRTLTALLVSLLLLGALA-GTAAAQSRQGASGTVVVGEGETVDGDLEAV #oth 112233324443132321112321122221.212.2232112.2111121..21311121 HVO_1237 ::--:VIPMFTTKQ:V:::::::VV:S::::V::::QGPS:G:A:::D:::::::::D:: Hut1037 MVSKR::::TNV::I:::V:VF:::ASIP::::F:ET:T:--:S::::AD:::A:::DVF Hmu2725 ::--:-----M::::C::::VI:VV:::P::::::A::T:--:::T::P:::I:D::::: hla2739 ::::L:S:T::::R:AVA:ALVA::SP::A:L:T:::V::::::I::D::::::R-V:G: rrnAC0202 ::::SR::SGGI:VA:LAV:::V::S:VT:::V::::Y::::::I:I:PD::Y:S-V:G: consensus AGTVVVHGTVTGDLSAAAGTVRITETGRVEGNVEAAAGTVRIDGTVGGNVEAAAGSVEID #oth 1.11213..1211333221224221214.3.123111.12322.2.1.222431112222 HVO_1237 G:::::A::::::V::T::::LV::::V:N::LD:V::SATLE:S:::SLAYD:ATATV: Hut1037 ::S:AI:::-------------------:::::R:VG:::::::::T:::S:T::::V:G Hmu2725 G:::::E:::::::E:TG:::I:--D:T:::D:::::::LD:G:::::D::G:G:::TV: hla2739 :::I::::::E::::G:::LI::A:::::D:::QV:::::VV::A::::A:LG:::F:LT rrnAC0202 ::::I:R::::::IAT:::::HV::::E:G::I:::::::::::::::D:SV:G:T:::G consensus ETARIDGNLDAGAGSATVDGAVDGDVQAGAEEVVLGPTADIGGDLRYD-GTLTRADDAAV #oth 231312.21232223433314231313321233332221323133312122231222121 HVO_1237 AA:VV::GV---------------------------------------:---RQV::L:: Hut1037 PD:T:E:S:TGAS:DV:IA:S:Q::::V:::I:RVTE::E:A:N:E:G::::E::SG:SI Hmu2725 :G:::G:::T::::::::::RI::N:EI::::IT:::::::R:::T::::N:N:::G:T: hla2739 ::G::::S:::::::IS:::::G:::R:A:DS::I::N::V::EF:::A::F:QSP::T: rrnAC0202 :::Q::::::V::SYLALR:T:::T:::::::F::::::SV:::V:::AA:F:::PE::: consensus AGTVVADTSLGFD-SGPGFGG-AIPSWFGSAYGFLVNLVLGAILLLAFPRFSARVADAVT #oth 113122233333213233.22332.313233.2231111311111331.3.142.12412 HVO_1237 :AP:::G:PFQ:G:---Q:E:PV::G:VV:G:W::A:F:V:::IV:VA:G:AG::TGLG: Hut1037 :::IS::SD::::::PL::--:S::::IVGI:A:M:G:LGAV:::GL::D::RS::T:G: Hmu2725 G:::ERTDNVTVSP:::S:--::L:TGTFT:::V:A:::A::V:VV::::::TS:::D:: hla2739 ::G::E::::RG::T:V::::DLV:L:::::::VA:::::::V:::::::::DD:::R:S rrnAC0202 G:S::R:E:I:AS:A::E::EF:L:::::VV::LF:::L::::::AI::S::::::GH:A consensus EQPLRSGGVGLLALVAIPIVLVLLLLTIVGIPLSLAGAVAYLLALWVGSVYGRFALGSWL #oth 331221.12.11.1113.22121133.1.....112.41212232.2131..2212.212 HVO_1237 K:AV:::::::::I:::::::L:::::::::::::::G:GF::V:::AG:::ALV::T:: Hut1037 A::::::AI:IV:::G::VG::V:V::::::::A:I:LFI:::G:::::L:::Y:V:TFV Hmu2725 DD:::M:AF::::::GG:M:C:::FV:L::::::I::M:::VFLV:A:AL:::::::R:: hla2739 :G::A:::::::::I:T::F:A:VAI:::::::A:V:I:::VV:::I::::::Y:::::V rrnAC0202 :R:AK:::::::::::V:V:::V::F:::::::::V::::FGV:A::AV:::Q::I:::A consensus LSRADRDNRWLALLVGLLGVAALGFVPVLGGLLELVVLLVGLGALALALRERYR-DGDEP #oth .3221321..1..23.2222.22232.33.22222112.1...11112132212322332 HVO_1237 ::L::Y::::V::FA::FVL:V:D:::L-::I::F:::::::::F:::::GESAD::::S Hut1037 :TQL:TE:::::::T:F:A:::::RL::A:::IQ:::::::::G::AT:L:::::-:QRS Hmu2725 :Q:IG::S::::::::V:::::VK:::I::DFV:A::V:::::::V:GMYD::QS:E:D: hla2739 :D:L:SP:::V:::L:VV:::LI:L::WI:E:VD:L:::L:::::::::WG::::----- rrnAC0202 ::L:::E::::::V:::V:F:L::AI::::::::::AF:L:::::::T:::S::NR:A:: consensus -GGRDTAADGDAEPSAMA #oth 213343243232232332 HVO_1237 :--VSAPDE:PR:G:P:: Hut1037 N:EGE::T::RS:RVVP- Hmu2725 ::PTPEP:A:::::::-- hla2739 :-:::D:IVS:SD:VE:D rrnAC0202 S:::Q:TL:ES:GDT:A: