Home |  Text search
5 genomes BUD1714 5 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi
-

rrnAC0202

HVO_1237

-

Hmu2725

Hut1037

hla2739

- -

Pairwise sequence scores
Consensus score2645 HVO_1237 Hut1037 Hmu2725 hla2739 rrnAC0202
1284HVO_1237 2316 739 876 819 893
1405Hut1037 739 2483 989 936 1029
1660Hmu2725 876 989 2617 1140 1147
1750hla2739 819 936 1140 2647 1324
1775rrnAC0202 893 1029 1147 1324 2668

378 symbols
consensus       --MS-SLSRARRRTLTALLVSLLLLGALA-GTAAAQSRQGASGTVVVGEGETVDGDLEAV
#oth            112233324443132321112321122221.212.2232112.2111121..21311121
HVO_1237        ::--:VIPMFTTKQ:V:::::::VV:S::::V::::QGPS:G:A:::D:::::::::D::
Hut1037         MVSKR::::TNV::I:::V:VF:::ASIP::::F:ET:T:--:S::::AD:::A:::DVF
Hmu2725         ::--:-----M::::C::::VI:VV:::P::::::A::T:--:::T::P:::I:D:::::
hla2739         ::::L:S:T::::R:AVA:ALVA::SP::A:L:T:::V::::::I::D::::::R-V:G:
rrnAC0202       ::::SR::SGGI:VA:LAV:::V::S:VT:::V::::Y::::::I:I:PD::Y:S-V:G:

consensus       AGTVVVHGTVTGDLSAAAGTVRITETGRVEGNVEAAAGTVRIDGTVGGNVEAAAGSVEID
#oth            1.11213..1211333221224221214.3.123111.12322.2.1.222431112222
HVO_1237        G:::::A::::::V::T::::LV::::V:N::LD:V::SATLE:S:::SLAYD:ATATV:
Hut1037         ::S:AI:::-------------------:::::R:VG:::::::::T:::S:T::::V:G
Hmu2725         G:::::E:::::::E:TG:::I:--D:T:::D:::::::LD:G:::::D::G:G:::TV:
hla2739         :::I::::::E::::G:::LI::A:::::D:::QV:::::VV::A::::A:LG:::F:LT
rrnAC0202       ::::I:R::::::IAT:::::HV::::E:G::I:::::::::::::::D:SV:G:T:::G

consensus       ETARIDGNLDAGAGSATVDGAVDGDVQAGAEEVVLGPTADIGGDLRYD-GTLTRADDAAV
#oth            231312.21232223433314231313321233332221323133312122231222121
HVO_1237        AA:VV::GV---------------------------------------:---RQV::L::
Hut1037         PD:T:E:S:TGAS:DV:IA:S:Q::::V:::I:RVTE::E:A:N:E:G::::E::SG:SI
Hmu2725         :G:::G:::T::::::::::RI::N:EI::::IT:::::::R:::T::::N:N:::G:T:
hla2739         ::G::::S:::::::IS:::::G:::R:A:DS::I::N::V::EF:::A::F:QSP::T:
rrnAC0202       :::Q::::::V::SYLALR:T:::T:::::::F::::::SV:::V:::AA:F:::PE:::

consensus       AGTVVADTSLGFD-SGPGFGG-AIPSWFGSAYGFLVNLVLGAILLLAFPRFSARVADAVT
#oth            113122233333213233.22332.313233.2231111311111331.3.142.12412
HVO_1237        :AP:::G:PFQ:G:---Q:E:PV::G:VV:G:W::A:F:V:::IV:VA:G:AG::TGLG:
Hut1037         :::IS::SD::::::PL::--:S::::IVGI:A:M:G:LGAV:::GL::D::RS::T:G:
Hmu2725         G:::ERTDNVTVSP:::S:--::L:TGTFT:::V:A:::A::V:VV::::::TS:::D::
hla2739         ::G::E::::RG::T:V::::DLV:L:::::::VA:::::::V:::::::::DD:::R:S
rrnAC0202       G:S::R:E:I:AS:A::E::EF:L:::::VV::LF:::L::::::AI::S::::::GH:A

consensus       EQPLRSGGVGLLALVAIPIVLVLLLLTIVGIPLSLAGAVAYLLALWVGSVYGRFALGSWL
#oth            331221.12.11.1113.22121133.1.....112.41212232.2131..2212.212
HVO_1237        K:AV:::::::::I:::::::L:::::::::::::::G:GF::V:::AG:::ALV::T::
Hut1037         A::::::AI:IV:::G::VG::V:V::::::::A:I:LFI:::G:::::L:::Y:V:TFV
Hmu2725         DD:::M:AF::::::GG:M:C:::FV:L::::::I::M:::VFLV:A:AL:::::::R::
hla2739         :G::A:::::::::I:T::F:A:VAI:::::::A:V:I:::VV:::I::::::Y:::::V
rrnAC0202       :R:AK:::::::::::V:V:::V::F:::::::::V::::FGV:A::AV:::Q::I:::A

consensus       LSRADRDNRWLALLVGLLGVAALGFVPVLGGLLELVVLLVGLGALALALRERYR-DGDEP
#oth            .3221321..1..23.2222.22232.33.22222112.1...11112132212322332
HVO_1237        ::L::Y::::V::FA::FVL:V:D:::L-::I::F:::::::::F:::::GESAD::::S
Hut1037         :TQL:TE:::::::T:F:A:::::RL::A:::IQ:::::::::G::AT:L:::::-:QRS
Hmu2725         :Q:IG::S::::::::V:::::VK:::I::DFV:A::V:::::::V:GMYD::QS:E:D:
hla2739         :D:L:SP:::V:::L:VV:::LI:L::WI:E:VD:L:::L:::::::::WG::::-----
rrnAC0202       ::L:::E::::::V:::V:F:L::AI::::::::::AF:L:::::::T:::S::NR:A::

consensus       -GGRDTAADGDAEPSAMA
#oth            213343243232232332
HVO_1237        :--VSAPDE:PR:G:P::
Hut1037         N:EGE::T::RS:RVVP-
Hmu2725         ::PTPEP:A:::::::--
hla2739         :-:::D:IVS:SD:VE:D
rrnAC0202       S:::Q:TL:ES:GDT:A: