| |||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 6539 | HVO_A0209 | hla0519 | Hmu1026 | pNG4051 | Hut2152 |
| 3519 | HVO_A0209 | 7081 | 4141 | 1921 | 1838 | 1937 |
| 3612 | hla0519 | 4141 | 7182 | 1966 | 1909 | 1939 |
| 3643 | Hmu1026 | 1921 | 1966 | 6436 | 2790 | 2893 |
| 4066 | pNG4051 | 1838 | 1909 | 2790 | 6773 | 4008 |
| 4222 | Hut2152 | 1937 | 1939 | 2893 | 4008 | 6517 |
999 symbols consensus MQAP-----------------------LISHPPENGRERTALDDHLTD----VATRHETV #oth 14411111111111111111111111131...3231412241321131212121312331 HVO_A0209 :TY:::::::::::::::::::::::::::::EA:DG:::YP:EQ:::DGSLRL:A:N:: hla0519 :EL:::::::::::::::::::::::::::::R:TDKN:QHPA:QT:EEGHLLL:A:S:S Hmu1026 :GTE:::::::::::::::::::::::P::::ATD:D:A:R:L:::D:::::::G:A:S: pNG4051 ::N:SGCEICNRPESTDGLWCSSEMTTIY:::::::S:GVV:::::N:::::::A:V:Y: Hut2152 -M:E:::::::::::::::::::::::RY:::::G:::GV::EV::A:::::::D:VAH: consensus VPEDATTLFGGP--LRRVLAVAARLHDFGKATTQFQAYVR-DREYDGPDL-RNHARLGAL #oth .133.11233212222432412142..1....13..21123141313233121.121.12 HVO_A0209 :S:Y::R::R::ETQ::F:C:::S::::::::P::::::::-D::E::EKEK:::::::: hla0519 :::R:::::A::TERELW:W:::T::::::::P:::EH::P:E::E:::AEK:::::::: Hmu1026 :SA::::IG:D::::PEMT::V::C::::::::W:::::V:-G:R:AS:R:T::SL:::Y pNG4051 ::PG:R:PA:E:::::P:VKTLGYV::L:::::F::D:LLD::QP:NEL:::H::P:::F Hut2152 ::D::::PTD:S::::S:VETL:WV::::::::Y::E:LLE:S:A:P:M:::H::PI:SF consensus AAYFVLDRRGADTEDCLAAFVAVAKHHGALPDAAEYTADRLHRREG-----ANAFEERQA #oth 12121.1332223111..121.1.1..13..1222.233332122211223421323224 HVO_A0209 :TW::::Q:D:PAR:K:::TL:::R::Q::::::Q:::ES:-----::::::D:::TSNS hla0519 :TW:::N:AS:SDR:::::TL:::R::Q:::N::::::NT:-----:::::IE::D:--: Hmu1026 LG:Y::::L:Y:S::::::L::L:::::Q:::VE::V-:GVS:F:N::::TSE:SN:::R pNG4051 ::::A::A::F:::T:::G:::::::::S:::ITD:IHT:A:::::VEPRER:SA:R::N Hut2152 :::HA::TQ:F:::T:::G:::::::::R::NV:::VV::T:::D:::DSRQ:SV:K::T consensus VLAAQIGNIDDTWPQLADEFFAAATAGAGT-----WEEFRRSAQSGELLDEIHE-SVAAE #oth 2242.233121331231422224114243311111.22.342433122333232223433 HVO_A0209 ::T::LEA:SER:::K:T:LLQRSGETDS:::::::D:::TWV:::TVVG:L::V:ARR: hla0519 :IQ::LDR::::::EA::::::M:GQQFD:VDTVS::A:YKW:SN::IIPGLQAL:TE:: Hmu1026 I:IE:V::V::HRR:F:QS:V:D::D:N:S:::::::::AQ:IEDES:F:TV:::--HVS pNG4051 AV:K::K::::NARE:VSTV:E::::::EE::::::AS::DGF--:::::D:AD:T:::T Hut2152 :VLK:::D:H::V:D::ETV:EN::G:S:G:::::::S:V::Y:::S::S::E::T:GTQ consensus LTGRGADRDALSESCYGLTLQCWAALVLADKTHAAGAAN-SETFDEDQPDLETLEDYIAD #oth 221324332211232.112112.22111...12.12242232323422123321221.21 HVO_A0209 :::PK:TS:K:PRKL:DR::HY:::IT::::S::MAVPE::HV::VETL:R::::E::SG hla0519 ::::RKSNKN:P:AL:DR:IHY::S:T::::S::MTISD:N:L:GF:TL::S:::Q:::G Hmu1026 :F:F:S::S:P::EF:::L::L:SG::F::::V:::IE::-GDL:GSE::ARL:SE:::: pNG4051 G:TT:IN:::::S:::::VI:::GS:::::::S::::R:VA::YT::::S:DR:N:H::: Hut2152 TA:::V:P::::S:::::V::::S::::::::S::::::E:::YAPS::GF::IS:::E: consensus LRAD---DPDDEQEAALNDERERARRDVLDGVAEF---AASEGGIATLTLPTGMGKTLTG #oth 1214121222133321.132.23..32122112321112432331........1...1.. HVO_A0209 :::E:::P::::L:R:::::::::::QAI:::H:WLGGD:QTPP:::::::::L:::F:: hla0519 :::T:::P::::H:::::::::::::QAVC::H:WL::DND:SA:::::::::L:::F:: Hmu1026 :GG::::TDE:G:A:::DTL:GE::D:::G::ER::::RD::VS:::::::::::::::: pNG4051 IE:SVSA:::GS:SER::HL:SM::E::::NA:DL::::KAG::V::::::::::::::: Hut2152 :E:GVDA:KAGTKTER::YH:SD::KN:::N::S:::::E:G::V::::::::::::::: consensus LSAAFALRDILEG-------RRVVYALPFTSIIDQVRD--ERPEIWDTDPTRSLLTAHHH #oth ...1123.1312111122223121.1..1..1.1.1222114322222.33431..2..1 HVO_A0209 :::::EA:G:::S::DGGPT:PI:::::Y::::E:T:SIF::::L:GA:::K:A::V::Y hla0519 :::G:ET::::D:RNDRDHP:PL:::::Y::::E:T:ELF:N::L:GV:::::A::V::Y Hmu1026 ::::L::::--:::::::::E::::::::::V::::A::::LADVF:::ARDD:::I::: pNG4051 ::::LDI::N:G::::::::K::I:::::::V::::V:::DVSG:Y:::DHPH::::::: Hut2152 :::::::::A:G::::::::N::::G::::::::::V::::IQ::YE::TAGR::::::: consensus LSETVIRDNDD-SADVDADRADDVAGMLGESWRAGTTLTTFVQLFESLAGPSNRQSMKLP #oth .1112243223323.223124233.2211.1..2.321..........2..2.1.11..1 HVO_A0209 :::::VYR:ERE:E::ASTDQEEH:SF:::A::D::V:::::::::::V::::::GL::S hla0519 :::::VIHG:HDDS:::ITD::Q-::L::::::D::I:::::::::::T::::::GL::: Hmu1026 :A:::TKLG:-:-P:E:P:EYARL:E:VA::::S:M::::::::::::V::::T:::::: pNG4051 :ADAS:E::A::-::-E:::S::::::::::::::L:V:::::::::::::G:::::::: Hut2152 ::::T:::T::Q:::-::::N::::::::::::::V:V:::::::::::::Q:::::::: consensus ALRDGVVVLDEPQALPLDWWKLVPRLVDILTEEYDATVIAMTATQPRLLREV-T-SLL-- #oth ..222211.....1..22..1312.1344..211312111......32222232322122 HVO_A0209 ::D::L:I::::::::KE::DGIT::IEL::T::QTR:::::::::T:::D:E:T:::DV hla0519 ::DS:I:I::::::::K:::DAI:::LST::D:F:THI:S::::::SV::::N:V:::ED Hmu1026 ::Y:S:I:::::::::MQ:::::R:IAT:::::::::IV::::::::ATD:ETASQA::: pNG4051 :::NS::::::::S:::::::I:::::KM:::QFG:::::::::::K:----:-:---:: Hut2152 ::::A::::::::S::::::::::::::V:::Q:N:::::::::::::----:-:---:: consensus -----------------FEDALELVDDPERYFENAERVSYRLDDSALRFIESADEG-PKS #oth 122122121221222121234211133212..2422..3.42131223233343221332 HVO_A0209 GREHDKTGCLRCEVGPDYPVR::PARK-:T::::::::R::I:E:::S:HL::::R:YL: hla0519 GQTHNVTACEACSQRPAY:TD:PPANE-::::DQ::::Q:T::KT::THQINS:N::FIG Hmu1026 ::::::::::::::::::D::F:::::VD:::GHF:::E:DVH::V:A:DDTDA--:IVD pNG4051 ::::::::::::::::::PESP:::EG::Q:::EVS::::H::A:TD:Y::ARN::D::: Hut2152 ::::::::::::::::::::EF::::::D::::VVR::::E::::TE:Y:::QS:-:::: consensus YETAATRIRAATEAGE--STLAVCNTIDSAAELTDAICENE-AVVDVGRAYDDELRANNI #oth 123.1332423233121111.11....2.123..24232331422111233232.44344 HVO_A0209 H::::A:VV:::A:::GG::::I::::N:S:T::QEL:GHD:G:THL:E:I:SV:G::DV hla0519 ::E:::::IDR::T:::::::T:::::A:S:::::I::::::T:AHL:V:VREY:TS::: Hmu1026 ::::GRT:LDE:GRS:::::::I:::::::TA:::::E:R:::::::::CLEL::D---- pNG4051 :QD:::NLSEQLT::T:::A::::::::::RH::ERLV::APDA:::AEQ:::V::KKEL Hut2152 :AA::NEL:::V:S:Q::T:::::::::::R:::EQVGDG-:SF:::::L:::::QEAGS consensus -DAADPEALVKRVA-------------------STPASNDRALLHLSTRLRPADRLTLIE #oth 222412343233132221222211221111122122334232221111.1..2..13.12 HVO_A0209 :::TKQ:NN:SAIVDAILRRSGL:RGVD::GEL:V::GT:IVVAT:NS:Y::F::RL::: hla0519 :S:I:::QSP:EI:YEVLASHRLIPPVDKTGSW:::E:SSLFV:TFNS:Y::F::RI::H Hmu1026 ::G::VD:::E::E:::::::::::::::::::::LS::E:::V::::::::R:::A:V: pNG4051 TTGE:VAKR:QS:G:::::::::::::::::::------:::I:::::::::::::::VD Hut2152 A:DV::VE:A:::::::::::::::::::::::---:TD:N::::::::::::::::::: consensus AAKALTEAGHPFLAVSTQLIEAGVDISFDRVFRDIAPIDSIVQAAGRCNRSFE--RNGGR #oth 3224.1223212231...11.....2..11.1..1..1..1...1......1.11223.4 HVO_A0209 I:DT:SGSEI::VLI:::A::::::L::K::::::::L::::::G::::::Y:WG::::Q hla0519 LLTM:ST:PVR:VC::::A::::::V::KT:::::::::::::::::::::Y:WGK:::: Hmu1026 :T:R:::RDV:V:::::::::::::::::::Y::::::::V::::::::::::::SDL:T pNG4051 :::E:::::::VAV:::::::::::::::::Y::L:::::V:::::::::::::::DR:H Hut2152 T::::::R:::T::I::::V::::::::::::::L:::::::::::::::::::::EQ:V consensus VTVWWLADPDE------TEKTPAEAVYNR-GSS------HLPLIADTLAQIRDDDGQLPE #oth .2..1113.221212212321..32..211.2221122221323122.232232214231 HVO_A0209 :V::T::::::ENPGDP:KSP::HW::E:::::DAGIQT::Q::SSI:::FE:EE--V:D hla0519 :I::TI:::::ETPAEP:::P::GY::E::::NEAGVRG::R::S:V::D:GETE-:I:D Hmu1026 :::::::P:AG:::::::TT:::Q:::DSE:V:::::::TIS:T:R::DA:GA:::TVA: pNG4051 :::::::A:PD::::::V:::::::::::::T:::::::L::VA:::::SV:S:::E:T: Hut2152 ::::::DV:::::::::QS::::::::::::TT::::::L::TV::::R::::ES:S:S: consensus AAIARDAVEAYFDRLR-DKSVGKQAYADWVDNAKADKLARLSLIGQRESVDVVVARTDAD #oth 4422221.14.123223213223241223112.3.33.233...122311111122.311 HVO_A0209 :E:SHH::NE:::A:::E::LSSTKIRTLI:D:::G::::E::::GYQT:::L::T:Q:E hla0519 VS:SLH::::::EQIHTT:::ANTDIR:HIE::E:RW:::Q::::GY:T:::L::V:E:: Hmu1026 QTMT:::::H:YGLVA::RNP:DPE:VK:::E:N::A:GG::::::::::::::C:::G: pNG4051 R:V::::::R:Y:::HD::C::::::::Y::::R::::SD::::D::P:::::IC::::: Hut2152 TDV::RG::W::E:::E::D::::T::::::D:::KE:GTI:::DEQL:AEI::T::P:E consensus RERAEAIRNAFRAFDFD--AFG-DKLDEAKDLRVSLPVYS-DSETAEALPDLQPLDDAER #oth 2132233221343313311221223312124111.1.31231232313333241224411 HVO_A0209 :K:LNELTEL:TSD:PTDRST:YK::EQ:AGI:::::L--:--NSI:Q:::VSRV:GK:: hla0519 KKTL:K:TE::C:N:--::S::FK:::::SQ:::::::--:--R:M:DA:KI:RI:HRD: Hmu1026 ::L:D:MVA:LDE::Y::::::::YREA:::IT::::I::R::TE::TVRN:E::G::D- pNG4051 H:IV:SV:::AN:Y:::::::S::AI::T:S::I:V:::PG:D::K:::NS:V::VKN:: Hut2152 ::::::::::Q:N:E:E::TL::QLV::T:P::I:V:Y::E:::::D:IT::P::VED:- consensus ---G-QVRELRGARGLEYFDQTGGLAVPEDTVAGRFL-- #oth 33323222212243332122322.14131321221.321 HVO_A0209 NED:V::FRYT:TES:::DL:::::RGK::::::::TTF hla0519 GDE:A::F:Y::GS::::GFDS:::QGV:::IL:::SV: Hmu1026 :::-:-L:V::R:::TS:::E:K::::D:PC:DD::::: pNG4051 FNRATG::V:DVR:FENH:::RT:FI::DS:::HQ:I:: Hut2152 :::-:GIY::DVQQNPSH::R:T:FV:::AS:DHQ::::