|
Pairwise sequence scores | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 2108 | HVO_A0205 | hla0523 | pNG4046 | Hmu1030 | Hut2156 |
1002 | HVO_A0205 | 2134 | 824 | 859 | 849 | 887 |
1506 | hla0523 | 824 | 2084 | 1353 | 1388 | 1395 |
1781 | pNG4046 | 859 | 1353 | 2145 | 1520 | 1673 |
1793 | Hmu1030 | 849 | 1388 | 1520 | 2117 | 1653 |
1871 | Hut2156 | 887 | 1395 | 1673 | 1653 | 2139 |
283 symbols consensus MRILARLSARADAAYDNTYHHKLRGRLWRALDGTE-YEALHDENRPKGFTYSNPFPPGDM #oth 212312.3.11.1..133.11.11..1.41.122311323..213122.3...1..1221 HVO_A0205 V::ELA:D:V::::::RS:F::A:::I::G:ENDDTFSET::S:HGV::S:::I::W:QI hla0523 ---M:H::::::T::QDD::::::::::N::::::::GER::SGE:P::A:::::::H:: pNG4046 ::::::::::T:::::::::N::Q::I:Q::EDSK::D::::K:Q::P:V:::::::Q:: Hmu1030 ::VI:H:Q::::T:::A:::::::::::D:::::A:::S:::::::::::::::::::N: Hut2156 ::V::::R:::::::::A::::::::::K::::::::::S:::::::A:::::::::::: consensus DEGDERTLLVASPEEGLLAHVAADLKRDRELNIGEMPFHVDDVTGLAPDVGEPGTSGTIE #oth 3...1121211.1323..11211113411111..1.1.1113122211....1.12.211 HVO_A0205 E:::R:YFRI:::RR:::DTLI:HFG:E:AFE::Q:R:TI::I::H::::::A:ST:VL: hla0523 Q:::::K:I:S:V:D::::::::::LEEP:F:::::::::::::SFT::::::::Q:I:: pNG4046 :::::::::::::::S::::I:E::TH::::::::::::::K:SP::::::::::::::: Hmu1030 R::::K:::::::H:E::::::::::L::::::::::::::A:N:::T:::::::::::: Hut2156 :::::::::::::Y:D::::::::::D:P:::::::::T:EEI:P::::::::::::::S consensus TGTGVLVRIPPWRFEEYGID-TNHDEAE-----FWRPEHTMEPFRNQIEANLDKKHGLFC #oth 1...112111111211.1212342.31111111..1.1.12..12211121.111.3.12 HVO_A0205 :::::HCALGRQLA:::NL:TSKI:AG:SETEL::::K:G:::LQDA:RRS:QQT:E:YG hla0523 S:::L:I::::::C::::::HPGG:T:V:::::::Q::::T::LIT:LR::::::::::: pNG4046 ::::L:::::::::DD::M::V:::Q::::::::::::::L::::T:L::::::::R:YM Hmu1030 ::::::::::::::::::::::D::::::::::::::::::::::::::N:::::::::: Hut2156 :::::::::::::::::::E::E:::::::::::::::::::::::::::::::::D::: consensus PDYLPGPSEVDGDLFDGYELIK---TFAIPVTPTTGRTETWVLSKWRFDYTVRDDDHRRH #oth 21.22..112.22..122111.11111211111121432121......2.1.1112..1. HVO_A0205 D::YD::G:::EP:::RI:P::DDVVYPVRFQ:A:AVDR:VL::::::G:R:::ET::Y: hla0523 :::::::::R:TE:::S::::::::::S::::V:E:TQM:Y:::::::G:::Q::H:::: pNG4046 ::::A:::D:::::::S::::::::::::::::::::::E:::::::::::::::::::: Hmu1030 QE:Q:::::T:::::E:AD::::::::S::::V:Q:QR:::::::::::::::::H:::: Hut2156 :E::::::::::E:::::::L:::::::::::::::E:::::::::::E::::N:::::: consensus LNLALDTGLGERNSLGFGFINITDKTG--PGESDIEG------ #oth ...1..2.1.1.111.1..2.11111311.3233422211121 HVO_A0205 ::::::S:I:Q:REH::::L:L::::L:::RA::---:::::: hla0523 ::::::::::::::::L:::::::::A:::W:VSS--:::::: pNG4046 ::::::V:::::::::::::::::Q:R:::D:TEL::ENAFP: Hmu1030 :::::::::::::::::::V:::E:D:RQ::TE::DA:::::: Hut2156 :::L::V:I::::::::::V::V::::::::::AM::KNAFAR