| |||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 3070 | Hbo0524 | Hmu2247 | Hut0911 | Hmu2954 | HVO_1686 | hla1466 |
| 1264 | Hbo0524 | 3157 | 2258 | 670 | 687 | 623 | 636 |
| 1273 | Hmu2247 | 2258 | 3150 | 632 | 809 | 707 | 693 |
| 1936 | Hut0911 | 670 | 632 | 3021 | 1609 | 1653 | 1519 |
| 2117 | Hmu2954 | 687 | 809 | 1609 | 3076 | 1876 | 1650 |
| 2146 | HVO_1686 | 623 | 707 | 1653 | 1876 | 3217 | 2076 |
| 2035 | hla1466 | 636 | 693 | 1519 | 1650 | 2076 | 3168 |
465 symbols consensus ------GSLG-LRRRQFAALYGTRFAGSFGFITLLTLLPLYINALG-------------- #oth 1233223343143332132.2311..22112312211.2311251112122121111111 Hbo0524 MARSVG::::L:KD:E::::A::A::R:QAYS:I:IA:A::ADQF::::::::::::::: Hmu2247 :VVDVG::I:L::D:E::::A::A::R:QAYS:IIIA:A::ADLF::::::::::::::: Hut0911 ::::::MA:S:NDEL::SS::VM::::::::MSV:::::DF:E::::::::::::::::: Hmu2954 ::::::--VT:E:QK:LR::FF:::::A::LV:::::::T::EV:::::::::::::::: HVO_1686 ::::::--MD:RT:LR:WT::L:::::G::::::V::::K:::E:DPGAVAVPELALGGL hla1466 :VSNADAGN::AK:S::W:::L::::EG::::::I:::GT:::T:DPQATTVL::::::: consensus -------ATGFVIGMFGTGFTLAQTVAVVPLAWAGDRYDKRTVLLGGLALNAAVYAAFPL #oth 111121223.222.212.11221121312.22232.2222132.1322323231133.33 Hbo0524 :::::::T::::E:L:::A:AVV:LLI:L::GRKV:TGNAKHY::A::VV:V::FIG:TQ Hmu2247 :::::::T::T:E:L:::::A:V:LLV:L::GRRI:LG:SKRY::V:FL::LV:F:G:VF Hut0911 ::::::::::LT::V:V:ALE::R::GI::I:::::::S:K::::I::::SVLA:LT:AV Hmu2954 ::::::::E:::V:::V::L:F::A:::I:VSYL::::::::I::V::G:A::::G::TF HVO_1686 ALGGFSLSR:::::::T::::::::::::::S:::::::::L::A:TVG:G:V::::::: hla1466 :::GVSISA:LI:::YT::::::::::::::::::::F::::::::V::IG:G:::L::: consensus VDSSAGFVLARAVQGLGATGAGLLGLALVGEIAPDGSRANWIGKYNAARFAASIAGDLSA #oth 1322522213.32..22212211221221.211232311341.12.23332121313231 Hbo0524 :QN:THV::M:M::::::SLLWIT:STV::::S::D:SGR:L:A::QVAAFS:L:::VIG Hmu2247 :ENAIHI::I:M::::::SLLWIT:STI::::S:::E:GQ:L:A::QFGSIS:L::::VG Hut0911 IS:IE::LG::FL::::M::V:::::::I:DL::AD::::Y::::::F:M::G:VAPIGG Hmu2954 :ET:W::::V:G:::IA::T::::::::::QL:R:SK:G:T:::S:SW::::D:G:T::: HVO_1686 ::::LS:I::::A::VAV:::::MS::::::L:RE:T:::H:::A:::::::::L:SV:: hla1466 :::::S:I:V::L:::VV:::::MT:S:::Q::DV:T::DK:::A:::S:::::V:S::: consensus GILYDAFGFDPIFMLLAALTAAAFVAVWRFL--------DPDETTVEGFAFFDLALNRRI #oth .311333113331432351253.3232233112111111221112221221312122111 Hbo0524 :Y:LY:YQTYVVY:A:S:V:I:::LL:::Y:RENPGGRK::E:A:--:TETLRAL:D:PM Hmu2247 :Y:LF:Y::TLTYAV::GV:LV::AL:FLY:RDNPGGRK::::AG--:IET:RQL:G::M Hut0911 ::::EVT:::VL:L:V:T:L:V:A:GI:::V:::::::::A::::::::::T:::I:::: Hmu2954 :V:::N:::STV:G::MVV:GL::L::LAWV::::::::E:::::::E:::::::V:::: HVO_1686 :::::L:::T:::IVITI:LTI:V::I:V::::::::::P::::RIR::P:T:::::E:: hla1466 :AI:::V:::::::II:L:MV::W:IT:LV::::::::::D:D:R::::P:S:::V:::: consensus L-TMVSFRAQYAVAVTLVRIWVPIFAGV-AAQGGLGI-----GAIAIGWTVAAEKFTNML #oth 212223..321111112.1311..122342.42211311111313122323222121122 Hbo0524 IRSL:F::LAFS:GKMA:I:FL:::---:-:HKQF:::::::N:F::::IL:GG:L:KTV Hmu2247 :RAL:V::FTFS:GKMA:I:FL::Y---:-:RTSF:::::::S:F::::IM:GG:L:KAI Hut0911 :::::T:::::::::::::K:::::V:LN::::::AY:::::::GVT:VV:::::::::: Hmu2954 A::IT::::::::::::::N::::::::A:::::::FNAAVN::T:VSL:IVSAR:M::: HVO_1686 ::::AT::V::::::::::T::::Y:::S::S:::AY::::::G::VAA::V:::::::: hla1466 ::::T:::::::F:::M::T::::YVSTEM:A::::V:::::TG::::V::T:::A:::V consensus SQPYTGRLSDRLGRAR-FVFVGGGAYGLGAAAIPFAAAIGEALALPAEFPAFG---ALGG #oth 4.212.111.23.1432.121.131..232312.133331212332232232.2113132 Hbo0524 A:G:M:D:T::::SKHW::A::AAL::I:T:L::L:LYF-:GVVT:I::S:::KTQ:::: Hmu2247 T:G:V:D:T:::::HHY::A::A:L::V:T:L::L::YF-:GTVT:I::T:::GTQ:::: Hut0911 :::::::::::W::EP::IIA::S::::FGI:F::ITGA-:G:-FRVSV:IA::::TVT: Hmu2954 :::F:::::::F:::::::::::L:::IA:LLV::TP:::S::::::T::Y:::::E:SA HVO_1686 C::::::I::GY::::::::::::L:::I:L:V::SP:V::::::::A::VL::::P:SP hla1466 G:LF::::::DY::SL::::A:::::::I:M::::S:V::T::GAGVTL:IL::::E:PA consensus AFLALFAASGLLGIADSIREPASMALFADEGEGEDGVASSFGIRSIVWRPGSVAAPLLGG #oth .21113234221.2..12.1.......11.1334321.1.111.212.12.2.31.223. Hbo0524 ::F:::::Y:V::V:::::L:::::::VE:::RF:S::::MSL:::S:KI:Q::G:A:V: Hmu2247 ::F:::G:FSI::L:::L:L:::::::VE:A:AY:A:::::SL:::S:KV:Q:TG:V:I: Hut0911 :V::AIVLN::I::::GF:::::::::::::K::-:I::::::::L::K::::L:::V:: Hmu2954 :::P:L:V:A:::::::::::::::::::::T::-:::A:::::D::::::A:V:::V:: HVO_1686 :::P:VGLA::::V:::L:::::::::::::S:GA:::::::::ELL::::::V:::::: hla1466 :Y:P:V:F:::::::::F:::::::::::::TDDG:::::::::EL::::::::G::IA: consensus WLMDEVGIEWVFFLGAAFAISGVLAFLAILARDHGREALRAW--- #oth 31144123321.2311122331143.2332454213331323221 Hbo0524 TIK:V:STTAA:LTA:::I:VATGI::VTYYLTSRV:SP:PVTSD Hmu2247 AIK:L:SP:AA:LAA:G:LGFATVV:VGMSV:ARRAQTPV:TPGD Hut0911 :::GAA:::::::::G:A:L:::AT:TS:::SR:::::::PA::: Hmu2954 :::SS:::D:::::::GA:F:::I::VG::SY:::::G:AK:::: HVO_1686 Y::A:::M:::::V:G:T::T:::::::A:TWS::TD::T::::: hla1466 :::I::NMAS::YV:G::::T::::::::::H::::A::T:::::