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5 genomes BUD1734 8 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi
-

rrnAC0564

rrnAC0640

HVO_2525

Hbo0911

Hbo3105

Hmu1335

- -

NP0162A

NP6030A

-

Pairwise sequence scores
Consensus score1785 HVO_2525 NP0162A NP6030A Hbo3105 rrnAC0564 Hmu1335 Hbo0911 rrnAC0640
517HVO_2525 1652 378 334 393 410 413 344 372
1097NP0162A 378 1762 712 859 895 943 900 886
970NP6030A 334 712 1873 750 838 815 819 945
1238Hbo3105 393 859 750 1767 1096 1132 848 897
1389rrnAC0564 410 895 838 1096 1776 1297 871 994
1390Hmu1335 413 943 815 1132 1297 1719 861 961
1036Hbo0911 344 900 819 848 871 861 2013 1038
1177rrnAC0640 372 886 945 897 994 961 1038 1771

268 symbols
consensus       MIDLTLDMEQYDCPFIDTTADHDVSFSAVHWDFDPAARELETRMVVEGADREELDRGLEA
#oth            143453.2311...2222133231215142.3233453421113425222225.451153
HVO_2525        :YRV:::-TRL:::LGRV::A:::TLTTPY:NLS:ETGRCDLWVEASSPG:SQ:ES:IR:
NP0162A         ::::DI::R::::::::::DEVP:::::MQ:HL:TSYGQ:::::I:K:ES::T:T:::QT
NP6030A         :KS:K:::V:::::Y:R:SKS:::A:RTQ::E:NQ:N:T::::LLTI:E:S:::HSA:::
Hbo3105         :::::V:V:::::::VAA:D::P:A::::::EY:T::DRT:::::::A::::S::A::SV
rrnAC0564       :::IA:::::::::::::::::::A:A:::::::QR:::::::::::AE:AGV::T::DS
Hmu1335         -----M:V::::::::::::::AL::::::::::RRT:::::::::::::::::SV:::T
Hbo0911         :LSM:M::V:::::Y:AV:D:V::::HTM:::::::REA::::IL:T::S:GA:TE::SS
rrnAC0640       ::S:EM::V:::::Y::::R:YE:::L:KQ:::H:VE::::::IM:N:::::::::::N:

consensus       LRDHENMNDCDLLRRRGNTAHIRTVIEETDAMRTIRDNDGYITGPFRIRDGSEIWHVGFD
#oth            .443334632412313335142223141.3.14212522.211..26112.2.4.22..1
HVO_2525        :::ADGVSYFE:K:K::SHSTAHV:L:::V:IE:VLA:G:AVI::L:D:N:W:R::L::A
NP0162A         ::::G:ITS:VS:KKK:D::T:::::::::::SVVQNH::::::::N:E::T::::::::
NP6030A         :NSC:MLQ:Y:::S:KR:::LL:SR:D:::::::::K:G::V::::V::N:::::N::::
Hbo3105         ::G::GTA:YQ::S::NDV:::::::GQ:::::I::EE::F::::SF:E::::L:RI:::
rrnAC0564       :QT:::::::V::::EN:A:::::T::::A::Q:::::G:::::::H:EA:::T::::::
Hmu1335         ::::G:::::S:VA::D:V:Q:::::A:::::A:::S::::V::::Y:E::::V::::::
Hbo0911         :KEQPG:RGF:::S:Q:ES:V:KSF:H::N:::V::EH::::::::Q::::::L:N::::
rrnAC0640       :ET:DH:ESYQ::::K:DL:L::SR:D::N::SV:::HS:::::::::::::::::::::

consensus       DERAADEALSELDRNNEYAVVERTSVDLPDLFDLVQNAGAAMTLLDGCRDLSDTERETLE
#oth            34541362.13.114213423323464343461432134325433332251233123113
HVO_2525        :AD::AAT:DS:::RY:L:A::Q:------------------------------------
NP0162A         ::AT::R:::D::DE:DV::ES::ELTVAE:::VIE::N::HSF::S::A:T:::::::V
NP6030A         RGQ::GD:::::::S::FSIKSDD::HID:F::IL::VESLGS::RTLQS:T:R::::::
Hbo3105         :RETEE:V::R::::H:FD::K:NAP:::E:T:F:::V::::::IE:::::::V::K:::
rrnAC0564       RG:D::TT::::::D:::D::::::AT::Q:Q::::::::::::V:::::::::::::::
Hmu1335         ASSE::S:::::::::::E:::::DTS::EMG::::::::::::IE::Q:::::::::::
Hbo0911         TSQD::::::D:E:E:D:S:EA:N:IS:E:YL:V:::IDV:TDY::T::N::RV:Q:::S
rrnAC0640       T::V:EGT::::E:D:D:TIRS:E::::E:YY::L::IDS:KR:V::::E::EV::N:::

consensus       AAVEAGYFETPRDATLGSLAEEFDVSKPAVSKNLRRGQRKMLERVVEALDDIEG------
#oth            4134511142..221.431112111.2322.11...211.32432243144234443333
HVO_2525        ----------::SES:A::GDRCG::DV:I::T:::AE::L:GAA:S::AGLD:FDSDPD
NP0162A         ::A:::::::::G:S:DD:::::::::T:A:M::::AE::LV:ATI:SMSSLR:VE::::
NP6030A         T:::D:::A:::GT::DGIG::::I:RMGA::::::S:::V:RK:IHV:N:V:AQMELQE
Hbo3105         S:IDG:::QS::S:::::::D::::::::::::::::::::I::::N:::EL::::::::
rrnAC0564       T::SE::::S:::::::::::D:G:::::::::::::E:::I:::::::::::D::::::
Hmu1335         :::SS:::::::::::::::D::G:::::::::::::::::IH:::T::::::-::::::
Hbo0911         K::K::::::::::S:TT:::::::::TS::::::::EK:V:GS:::T:ET:DETALTTG
rrnAC0640       K:::G:::D:::::::S::::::::::M:I::::::S:::I:D::TT:MN:VTE::::::

consensus       ----------------------------
#oth            3333333333222222222222221111
HVO_2525        SDSNSDPDSNSDPNSTNARPDGGG::::
NP0162A         ::::::::::::::::::::::::::::
NP6030A         EGPETQELDE::::::::::::::::::
Hbo3105         ::::::::::::::::::::::::::::
rrnAC0564       ::::::::::::::::::::::::::::
Hmu1335         ::::::::::::::::::::::::::::
Hbo0911         REKPHEHTQHEREQRQRENQKRVNLQQS
rrnAC0640       ::::::::::::::::::::::::::::