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5 genomes BUD1742 5 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi
-

rrnAC1114

HVO_2339

Hbo1906

-

Hut0536

-

NP1506A

-

Pairwise sequence scores
Consensus score4213 NP1506A HVO_2339 Hut0536 rrnAC1114 Hbo1906
2257NP1506A 4254 1264 1239 1325 1380
2264HVO_2339 1264 4538 1381 1264 1363
2397Hut0536 1239 1381 4220 1479 1375
2337rrnAC1114 1325 1264 1479 4263 1442
2393Hbo1906 1380 1363 1375 1442 4228

629 symbols
consensus       ----MAWLLV-YAALLLAAAAISVTLAVYAWRRRDER----GATALALLLVAASLWAVAA
#oth            111233332331443232212223213233132.332111112233332131433.3334
NP1506A         ::::------:-----M:::V::AG:T:VVFQN:HK:::::T:PQILGV:IG::F::A:D
HVO_2339        MHGAPY:QTTP:TIPIGIG:LLF:V::A:LF:::T::RLVP:::LG::::::SG::MGTY
Hut0536         :::MD:::::::QVG:VV:I:V:IVA:GL:::H:::::::::G:P:TAV:::EIG::::I
rrnAC1114       ::::::T:::A::F::::V:VVLG::S::::G:::YS:::::G::::V::AGL:I:DLC:
Hbo1906         :::::VVVTDV:P::::V::::::::C:MT:-::SVT:::::SV:FS:NML:VT::L:GH

consensus       AAELLVTDTSLALLWANVRFVGVAVLVLALFAFALAYTGRDRWLRRRWVALLAVEPVVFN
#oth            223233323323233233432134123242122112122223323223112221211134
NP1506A         :LR::SS:P::Q:F:H::::L:ST:V::SA:LH::E::N:E::::P:::SVA:FIF::T:
HVO_2339        :L::S:::F:TKV:LNQLGY::I:P:P:LW::YV:RHA:VKLNS:AA::::GS:-::AVV
Hut0536         LVTTV:PG:DI::AANKALLA::V:::P::LV:::E::::ESLVT::LL:A:S:::I::T
rrnAC1114       ::GV:TRG:E::::F:YGV::::MPAMAG:::::::::D:::Y:S::T::::T:::I::F
Hbo1906         T::VMA:SEA:IRY::::QW:AAI:VAPTW:L:VM::L:K:Q::DPKRL:V:::::::ML

consensus       ALVWTNGPHGLIWNRLGADTV------GQTVLEAEHGPAFG--GHAAYSYALLAVASALI
#oth            1113123332232443332333211112431224331131311324111.2.14222232
NP1506A         L::::TE:L:HELI:A::E::AVG:::S:::::F::::W:F::IN:::::L::VA:V:MY
HVO_2339        :::V::PW:::::TD:WV:ADH::::::YA::VN:::V::D:::FI::A:::ILLGCGVL
Hut0536         :::::::A:R:V:ET:R::GT:::::::PRG::TVN::L::::V:T::::L::S::VL::
rrnAC1114       :ALFV-::D:A:YSIS:PTDA::::::AMYGW:IIG::V:W::::LV:::::I::S::::
Hbo1906         L:LA::NQFH:L::EPHI:::TLGWLF:E::TL:AAE::V:TLA:V:F::T::F:G:LYL

consensus       VREALRSAGIYRRQVAALLLAGLVPWVANAVSLAGATSI---DLTPLAFSVTGVALSWAL
#oth            3341.32424.12.33.2221431.132222323243321111.1232121.22223232
NP1506A         AF:::QRS:T::::A:::IV:MA:::LL:L:YVL:YVVV::::::GFG:T::A:VFVAQ:
HVO_2339        G:TL::AD::::K:TL:::GG::::A:GGV:CV::LSPVPGL::PV::::::SA:VA:SV
Hut0536         :VF::::RYF:Q:::M:IVV:T::::G:::::::LGLEY:::::::I::T:::::FT::V
rrnAC1114       IHY::V:G:L::K::Y:V:::IGL::FGSVL:IF:D::::::E::::LLAG::LT::::F
Hbo1906         ::L::A::SV::W:S::V::GVS:::::S:AA:SD:::::::::::V::::::::::FG:

consensus       FRERLLDIVPVAREAVVESINDAVLVVDANGRIIDANDAARALLDLDEDDAIGQSIAEVL
#oth            324211122.1.3341123232223.2.44211212.212341332233222.2223321
NP1506A         YWFQ:::V:::::GT::NH:ESGY::::PE:::L:::E:SAE:F:VPR:AI:::T:D::F
HVO_2339        :HH::FTL::::W:SA:::MH::A::L:GD::V::V:P:GERF:S:PLS::Y:::V:R::
Hut0536         V::EF:::T:I:T:V:FDR:DT::V::::SD::V:I:ES::T::GI:-:::V:TR:QTQ:
rrnAC1114       ::G:::::S:::YRE::::L:S::F:::T:SK::E::::G:Q:--:R:ETIV:::VEDA:
Hbo1906         I:Y::::L:::::D::::NL::S:I:F:RH:::V:V::::L:FT::::P:V::A:A:::F

consensus       ETLPELVERYRGV--ADDRDEITIDREGGERAYDVDLTPLYDRRDDRVGRLVLVRDITER
#oth            22421222322221131433232344233214331231.231222341.32322222..2
NP1506A         :::::I:::FGDE::R:V::I:::F:D:DRYD::::IS:V::S::RY:::V::::NV::Q
HVO_2339        P:--:::DALG::PT:GSEA:A:LTT:D::::LL:ET:::G:-ES:MS:S::::::V:::
Hut0536         TSV:DA:PV:ES:::T:GH:TG:R:LSI:::SIRIEGS::V:::G:V::HALIMV:L::E
rrnAC1114       ::S:::L:K:::L::N::AK:TQAVI:QRD:FF::Q::::::S::TL:::VF::HE:::Q
Hbo1906         TEYTD:I::::::::::M:E::A:EH::V::H:E:::::ITG:DGS:::T:TVC::::::

consensus       RRRERE-------LERRNEQLDRFASVVSHDLRNPLQVAAGRLELAREDGDEERFERVEE
#oth            23.1121111111.1.2.22.12.1211.......13..4.3122.11211314111113
NP1506A         :::Q:KLEERTEA:::Q::K::::::I::::::::IA::N:H:QI::::::::S:::ID:
HVO_2339        VE:::R::::::::::Q::R::E:::::::::::::T::R:Y::::A:T::A:Y:::I:N
Hut0536         :A::A:::::::::T:::::::::VG::::::::::::::::::H::R:::::H::A::R
rrnAC1114       KQ::::::::::::::::Q:::Q::A:L::::::::S::S:::A::::RN:P:E:D::::
Hbo1906         ::::::::::::::::K:N::E:::::::::::::::::T:NV:::::T:SDD:LD:::D

consensus       AHDRMDRIIEDLLALARQDEDLTDRDEVALSTVANAAWANVDTGDATLDVAVDA-TIAAD
#oth            111..241.112.211.3123322343241331243..441322211.32431212141.
NP1506A         SLE:::D::::V:::::::DEI::P:::S::DLCTQ::TT:::NG:::::QT:::::N::
HVO_2339        :::::ET::::::T:::EG:T::NVTP:::R:::QE::DGTVV:::::::R::R::::::
Hut0536         :::::E:L::::::::::::::-::ERIE:G:::ES::SY:EIA:G::EL:::DF:VV::
rrnAC1114       ::E::SSL:DEV::F::-::KT:::V:LR::AL:K::::H::::E:::QIDG:R:E:TG:
Hbo1906         :L::::Q::D:M:E:T:V:G:SIETSA:NIDS:S::::R::A::::A:T:EAE::VVE::

consensus       RDRLRQLFENLFRNAVEHGSTG----PDD----------QASDDAVEHGG-GGSLTVDVG
#oth            111.3111..11..1...112121232122211122211432432113323.2221.423
NP1506A         :GQ::RAL::::::S:::V---::::---::::::::::-----------::DDV::T::
HVO_2339        :G::::::::::::::::::::SRDT:::AVEHGSTGNLT::G::::::SD::::::V:T
Hut0536         P:::S::::::::::::::::-:::S::S::::::::::::RQ:::::::E:VTV::ECL
rrnAC1114       ::Q:L:::::VV::::::::::GRPGG::STEHGHSR::PE::NS::PA:T:VTIR::A-
Hbo1906         ::::V::L::::::::::::S:::::---::::::::::ET:EP:::AD::::::R:W::

consensus       DTSDGFTVADDGPGIPEAEREKVFEAGYTTSEDGTGFGLSIVSQIADAHGWSVSATESRA
#oth            4333..313.1.1.223311231124.3.1323...1..2..342133...212432223
NP1506A         :L::::Y::::::::::D:::::L:S:F::::T::::::::::GT:::::::LDIASDDD
HVO_2339        GVDG::::E:::S::S::::AD:::R::::H:N::::::P::KT::::::::::LG::D:
Hut0536         PDRR::A:T:::::FGD:DT::::AD::::TR::::::::::AE::TQ::::::::NAEG
rrnAC1114       -::::::IG:::::V:PE:::EI:TH:V:S::S:::L::A::QHVVKS:::A:EM::::S
Hbo1906         T:EN::F:::N:::::VT::DT:::::H::GS::::L:::::::::NV:::D::VD::::

consensus       GGARFEFTGVE----TD-EPA--------
#oth            1..12122332111121321222222222
NP1506A         ::::::::D:SVVERA:ST:GAPASMWEE
HVO_2339        A::::::::::::::::P:::NAEQSTSD
Hut0536         ::::I:VV---::::::G:::::::::::
rrnAC1114       :::KLVVS:L::::::-:---::::::::
Hbo1906         ::::::L:ER-::::--:---::::::::