Home |  Text search
5 genomes BUD1768 7 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi
-

pNG7237

rrnAC1316

HVO_0936

HVO_B0246

Hbo0620

- -

hla1800

NP4954A

-

Pairwise sequence scores
Consensus score1760 pNG7237 HVO_0936 Hbo0620 HVO_B0246 rrnAC1316 hla1800 NP4954A
729pNG7237 1941 568 607 545 605 558 524
1056HVO_0936 568 1923 948 755 849 820 761
1098Hbo0620 607 948 1804 847 858 910 825
1129HVO_B0246 545 755 847 1540 859 849 841
1276rrnAC1316 605 849 858 859 1790 1026 947
1245hla1800 558 820 910 849 1026 1935 1172
1213NP4954A 524 761 825 841 947 1172 1780

299 symbols
consensus       -------------MMDLVDALG-AADGTTCLVGAGGKKTTLYALA-----ARLD-AVVTA
#oth            1111111112223243332213225444424111111123234121111165235332.2
pNG7237         :::::::::::::-:::AA:::LGSSAAVAF:::::::SAMGK:TVEGTDEGY:VGYT:T
HVO_0936        MTDSSASPAPSASPPT:A::::IGP:DLV:A:::::::SL::R:::::::RD:::G:::S
Hbo0620         ::::::::::::M:PS:P:G::LGDSSVLAV::::::::L::R:::::::SV:SD:I:::
HVO_B0246       :::::::::::::---------:----------------------:::::----:--:::
rrnAC1316       :::::::::::::-::I::::D::RH::I:F:::::::::MAT::::::::::EH:::::
hla1800         :::::::::MRSD:N:V::::D:::A::::::::::::::::::::::::D:::R::L::
NP4954A         ::::::::::::::T:I:A::S:::::V::::::::::::::::::::::GL::QPI:::

consensus       TV-----RIPIF----DGEVADVVVTDDPVAALDE------------------AQARPLG
#oth            .11111111.211111.32123121114.3223331111111111111111112644.21
pNG7237         :AMPPPPNL:LTLTDP::WRT:LKTR:P:I:VAR:::::::::::::::::::EV:D:AR
HVO_0936        ::::::::::T::::::::::E:::::::ET:VA:::::::::::::::::::T:P::::
Hbo0620         :::::::::::::::::SH:ES::::::::S:AAD::::::::::::::::::TGT::::
HVO_B0246       :::::::::::::::::QH::::::::R:::::EK:::::::::::::::::::TDW:M:
rrnAC1316       ::::::::::::::::::W:E:::::ET:RT:I:::::::::::::::::::::S:W:::
hla1800         :::::::::::::::::R:::A:R::EA:::::::ITAGEGDEPTGDAESRGG:ESF:::
NP4954A         :::::::::::::::::R:::S:R:::::::E::A:::::::::::::::::::PPY:::

consensus       VVPERERDDRYRGYDPAVVDAIADAG-DDPVLVKADGARMREFKAPGDREPQLPASADTV
#oth            11243213111..121421342232323332........4.21...223..12.32134.
pNG7237         :------NRKV::FEAS:MEQLS:::LF:WL::::::::K::::::S:G::VV:ST:TH:
HVO_0936        :::::::S:::::::::T::R::R:T:::V:::::::::S:WL::::ED:::::DT::L:
Hbo0620         L::::::P::::::::::::EL:A:::ET:L::::::::N:L:::::EN:::I:DA:TV:
HVO_B0246       :::D:D::::::::::D:::::GES:VA:A:::::::::::::::::::::::::T::::
rrnAC1316       :::AQ::P::::::::GT:ADL::I-::H:I:::::::::::::::S:::::::T::S::
hla1800         L::::::::::::::::::NE:GA:H::G::::::::::T:LL:::NE::::I:::::R:
NP4954A         L:AGHD:S::::::G:EI:::V:::H::G::::::::::T::::::NN::::::::TA::

consensus       VPVASAHAVGEPLTEDAVHRPERVAAITDLAVGDEIRPEDVAAVLAHEAGGLKDVPAGAT
#oth            3.111131..12.2326...112.22221433.12.2245113.13346..2223.4412
pNG7237         :::::VA::::A::T:V::::::::D::G:R:::T:TAAA:GT::T:PN:::RNA::E:S
HVO_0936        C::::VRV:::::SDER:::::L:SDVSGT::::A:SEW::::::SNDC::M:G::ET:R
Hbo0620         S:I:A:RV:::S:::E:::::::::EL::C:P:ET::::H::S:V:DAS::::G::QASS
HVO_B0246       L:I::V::::::::::C:::::::::L:::E:::T:::SGI:T::ISGR::RA:::D:::
rrnAC1316       ::I::::V::::::D:I:::VDE:T:::G::R::::::Q:::::::::Q:::::L::N::
hla1800         ::::::G:::::::AET::::::::::::A::::::T::L:GR:::::E::::GI:G:::
NP4954A         :::V::::::K::D:TH:::::::::LA:IDI::::T::T:GS:V:D:::::::I:D::R

consensus       VIPLLNKVDDAALEATAREIATAILDRA-DVSRVVLTRLAADEPVVAVV----------
#oth            11.12.21.12622341221155333232323221313244323223242211111111
pNG7237         ::::V::A:TEPQRRI:TDVL:HA:SQTERC::G:I:SF:S:-ICEE:SRSDVQEEKQR
HVO_0936        :V:V::M:::ER:AE::A:::GWLGEHP:R:D:::A:S::::::::GFY::::::::::
Hbo0620         :::VV:MA:TSE:::VG:::::GV::::PS::::LV:::NR::S::E::ERD:::::::
HVO_B0246       :V:V:::::::T:::V:::::SD::A:S:NIPH::::Q:T:S:::::::ER::::::::
rrnAC1316       AV::::M::::G::TS::AV:E::H:Q:::::::::AEMRS:D:L::::::::::::::
hla1800         A:::V:A::::DD::A:::::RVVHE:::::P::::A:MIEG:I:DVIE::::::::::
NP4954A         A:::I:::::::D:R:::A::D::A::::::EAI::A:M:TP:V:DV:-::::::::::