|
Pairwise sequence scores | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 1760 | pNG7237 | HVO_0936 | Hbo0620 | HVO_B0246 | rrnAC1316 | hla1800 | NP4954A |
729 | pNG7237 | 1941 | 568 | 607 | 545 | 605 | 558 | 524 |
1056 | HVO_0936 | 568 | 1923 | 948 | 755 | 849 | 820 | 761 |
1098 | Hbo0620 | 607 | 948 | 1804 | 847 | 858 | 910 | 825 |
1129 | HVO_B0246 | 545 | 755 | 847 | 1540 | 859 | 849 | 841 |
1276 | rrnAC1316 | 605 | 849 | 858 | 859 | 1790 | 1026 | 947 |
1245 | hla1800 | 558 | 820 | 910 | 849 | 1026 | 1935 | 1172 |
1213 | NP4954A | 524 | 761 | 825 | 841 | 947 | 1172 | 1780 |
299 symbols consensus -------------MMDLVDALG-AADGTTCLVGAGGKKTTLYALA-----ARLD-AVVTA #oth 1111111112223243332213225444424111111123234121111165235332.2 pNG7237 :::::::::::::-:::AA:::LGSSAAVAF:::::::SAMGK:TVEGTDEGY:VGYT:T HVO_0936 MTDSSASPAPSASPPT:A::::IGP:DLV:A:::::::SL::R:::::::RD:::G:::S Hbo0620 ::::::::::::M:PS:P:G::LGDSSVLAV::::::::L::R:::::::SV:SD:I::: HVO_B0246 :::::::::::::---------:----------------------:::::----:--::: rrnAC1316 :::::::::::::-::I::::D::RH::I:F:::::::::MAT::::::::::EH::::: hla1800 :::::::::MRSD:N:V::::D:::A::::::::::::::::::::::::D:::R::L:: NP4954A ::::::::::::::T:I:A::S:::::V::::::::::::::::::::::GL::QPI::: consensus TV-----RIPIF----DGEVADVVVTDDPVAALDE------------------AQARPLG #oth .11111111.211111.32123121114.3223331111111111111111112644.21 pNG7237 :AMPPPPNL:LTLTDP::WRT:LKTR:P:I:VAR:::::::::::::::::::EV:D:AR HVO_0936 ::::::::::T::::::::::E:::::::ET:VA:::::::::::::::::::T:P:::: Hbo0620 :::::::::::::::::SH:ES::::::::S:AAD::::::::::::::::::TGT:::: HVO_B0246 :::::::::::::::::QH::::::::R:::::EK:::::::::::::::::::TDW:M: rrnAC1316 ::::::::::::::::::W:E:::::ET:RT:I:::::::::::::::::::::S:W::: hla1800 :::::::::::::::::R:::A:R::EA:::::::ITAGEGDEPTGDAESRGG:ESF::: NP4954A :::::::::::::::::R:::S:R:::::::E::A:::::::::::::::::::PPY::: consensus VVPERERDDRYRGYDPAVVDAIADAG-DDPVLVKADGARMREFKAPGDREPQLPASADTV #oth 11243213111..121421342232323332........4.21...223..12.32134. pNG7237 :------NRKV::FEAS:MEQLS:::LF:WL::::::::K::::::S:G::VV:ST:TH: HVO_0936 :::::::S:::::::::T::R::R:T:::V:::::::::S:WL::::ED:::::DT::L: Hbo0620 L::::::P::::::::::::EL:A:::ET:L::::::::N:L:::::EN:::I:DA:TV: HVO_B0246 :::D:D::::::::::D:::::GES:VA:A:::::::::::::::::::::::::T:::: rrnAC1316 :::AQ::P::::::::GT:ADL::I-::H:I:::::::::::::::S:::::::T::S:: hla1800 L::::::::::::::::::NE:GA:H::G::::::::::T:LL:::NE::::I:::::R: NP4954A L:AGHD:S::::::G:EI:::V:::H::G::::::::::T::::::NN::::::::TA:: consensus VPVASAHAVGEPLTEDAVHRPERVAAITDLAVGDEIRPEDVAAVLAHEAGGLKDVPAGAT #oth 3.111131..12.2326...112.22221433.12.2245113.13346..2223.4412 pNG7237 :::::VA::::A::T:V::::::::D::G:R:::T:TAAA:GT::T:PN:::RNA::E:S HVO_0936 C::::VRV:::::SDER:::::L:SDVSGT::::A:SEW::::::SNDC::M:G::ET:R Hbo0620 S:I:A:RV:::S:::E:::::::::EL::C:P:ET::::H::S:V:DAS::::G::QASS HVO_B0246 L:I::V::::::::::C:::::::::L:::E:::T:::SGI:T::ISGR::RA:::D::: rrnAC1316 ::I::::V::::::D:I:::VDE:T:::G::R::::::Q:::::::::Q:::::L::N:: hla1800 ::::::G:::::::AET::::::::::::A::::::T::L:GR:::::E::::GI:G::: NP4954A :::V::::::K::D:TH:::::::::LA:IDI::::T::T:GS:V:D:::::::I:D::R consensus VIPLLNKVDDAALEATAREIATAILDRA-DVSRVVLTRLAADEPVVAVV---------- #oth 11.12.21.12622341221155333232323221313244323223242211111111 pNG7237 ::::V::A:TEPQRRI:TDVL:HA:SQTERC::G:I:SF:S:-ICEE:SRSDVQEEKQR HVO_0936 :V:V::M:::ER:AE::A:::GWLGEHP:R:D:::A:S::::::::GFY:::::::::: Hbo0620 :::VV:MA:TSE:::VG:::::GV::::PS::::LV:::NR::S::E::ERD::::::: HVO_B0246 :V:V:::::::T:::V:::::SD::A:S:NIPH::::Q:T:S:::::::ER:::::::: rrnAC1316 AV::::M::::G::TS::AV:E::H:Q:::::::::AEMRS:D:L:::::::::::::: hla1800 A:::V:A::::DD::A:::::RVVHE:::::P::::A:MIEG:I:DVIE:::::::::: NP4954A A:::I:::::::D:R:::A::D::A::::::EAI::A:M:TP:V:DV:-::::::::::