| |||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | ||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 3208 | Hmu1804 | HQ2535A | Hbo0024 | Hmu0235 | HQ3226A | HVO_0336 | Hbo1143 | HQ3085A | Hmu0251 | pNG6077 | Hbo1868 |
| 1246 | Hmu1804 | 4214 | 1141 | 1139 | 864 | 863 | 893 | 899 | 626 | 615 | 710 | 666 |
| 1106 | HQ2535A | 1141 | 3428 | 1269 | 713 | 681 | 811 | 714 | 661 | 638 | 658 | 704 |
| 1025 | Hbo0024 | 1139 | 1269 | 3067 | 720 | 714 | 771 | 754 | 642 | 700 | 688 | 678 |
| 1903 | Hmu0235 | 864 | 713 | 720 | 3801 | 2018 | 2038 | 2245 | 811 | 761 | 754 | 824 |
| 1867 | HQ3226A | 863 | 681 | 714 | 2018 | 3765 | 2251 | 2413 | 765 | 793 | 716 | 807 |
| 1919 | HVO_0336 | 893 | 811 | 771 | 2038 | 2251 | 3242 | 2451 | 818 | 803 | 801 | 821 |
| 1958 | Hbo1143 | 899 | 714 | 754 | 2245 | 2413 | 2451 | 3647 | 800 | 801 | 788 | 820 |
| 1597 | HQ3085A | 626 | 661 | 642 | 811 | 765 | 818 | 800 | 3381 | 1708 | 1758 | 1966 |
| 1631 | Hmu0251 | 615 | 638 | 700 | 761 | 793 | 803 | 801 | 1708 | 3503 | 2039 | 1797 |
| 1644 | pNG6077 | 710 | 658 | 688 | 754 | 716 | 801 | 788 | 1758 | 2039 | 3409 | 2031 |
| 1606 | Hbo1868 | 666 | 704 | 678 | 824 | 807 | 821 | 820 | 1966 | 1797 | 2031 | 3113 |
637 symbols consensus ------------------------------R--IRLILLGVVIL----VLTLVVAAAAAP #oth 111112323333233323444444336565254443665445451111345545744634 Hmu1804 :::::::::::::::::::::::::MRART:SAL:VLF:T:M::SAAA:GQSFLQST:GA HQ2535A ::::::::::::::::::::::::::MALE:YL:YFCVCTI::S::::TGVIFIDF:GGS Hbo0024 ::::::::::::::::::::::::::::::-::-----------::::------------ Hmu0235 VFSDGLLASCRRIGTGLTDCVARARANATAADW::FA::ATIC:::::L:AV:A:NV:TS HQ3226A ::::::MSVSQKIQERVHSPRDVLTAFRSRAYL::::TVVLI:I::::L::PSITS:ITY HVO_0336 ::::::::::::::::::::::::::::::-::-----------::::------------ Hbo1143 ::::::::::::::::::::::::::::::-::M:VVAFAL::A::::L::PS:VS:ITY HQ3085A :::::MPSGYSHSYSFLSRLISGIRRISGR:GG:AVM:A:IS:F:::::FSV:L:::V:: Hmu0251 ::::::::::::::::::::::::::MDRRARGLA:VG:::LVI:::::G::A:G:VT:: pNG6077 ::::::::::::::::::MNPVPNVAVPDL:RGSY:::F:::LF:::::::::SS:ML:: Hbo1868 ::::::::::::::::::::::::::::::-::-M::VF:::L::::::SS:::S::L:: consensus DPGAATADER---------TTIV------------------------------------- #oth 674556747544424233462441111111111111111111111111111111111111 Hmu1804 ET:TE::TATPAATTPDDA::VAEENRSAGGDATATAAPPSSGLTEVDVESRFQRAKSET HQ2535A SNEQTADATLEQQSQLPFSERKQ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hbo0024 ----------:::::::::----::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hmu0235 T:ADN:TLQ:GTVTQPADN::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HQ3226A :AS:QP:L:KGTITKPANGS:VI::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_0336 ----------:::::::::---:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hbo1143 ::ADE:SLT:GTVTSPANG::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HQ3085A NV:V:AD:R::::::::::V:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hmu0251 :RSVTDG::::::::::::Q:L:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: pNG6077 AI:T:SETDQTS:::::::R:L:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hbo1868 SV:::GN:GTP::::::::Q:L:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: consensus ---------------GSQG-T--GGTGDH---KPARLYALDERGSTKWRHDDADS----Y #oth 111111111111111342232353553731115733234344337471555383433111 Hmu1804 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Y:W:PPRRIGRTETVQW:::::VN:THY::::I:::::::::AR:NVHLL:IE::T:V:K Hmu0235 ::FE::::::::----:::A:M:S::::VIGH:RAWNETSEV:N:EVV:Y:L::D::::R HQ3226A :EME::::::::----:::I:Y:::NRFVI:N:REWNESADA:D::VVIY:RS:DA:::Q HVO_0336 :DME::::::::----:::::AF::::::I:N:REWNDSAGV:E:::V:Y:R::D::::: Hbo1143 :DIE::::::::----:::::V:S::::VI:N:REWNDSAGV:D:::::Y:R:S::V::: HQ3085A :::::::::TRV::::::::E:::PN:YVFT:::::::::::D:E::AI:D:-N:T:::: Hmu0251 V::::::::SQG::::::::E::PSG:Y:MT:::::::::::D:E:LVA:R:-N::V::: pNG6077 :::::::::TNK::::::::E::ESG:Y::T:::::::::::EYE:::T:K:-N::V::Q Hbo1868 :::::::::TRS::::::::EL:DSG:F::S:::::::::::EYE:::T:K:-N::V::Q consensus WRASEHYDAPTDGG-NTDWLHVNDVDVIGDGRLLLSPRNADQVIVVDRGEG----VVE-- #oth .4264613345114357..2.2..11524232323.2..321222233451122524342 Hmu1804 ::FD:::SREAG:Q:GG::T:::::E:LS:::IM:::::M:E::FL::TD:GGYA:D:NW HQ2535A :H:QDN:PLSGG:SWPS::T:L:::EALA:::IMI:L::Q::::FIQP:::::::LI:DW Hbo0024 :::EQSFPRNGG:AYPY::T:I:::ELLD:::IMA:L::Q:::VFLN:-S:::::LE:SW Hmu0235 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Hmu1804 T::E:G::::::::::::::::::::::::::NHSI:Y::::A:YIPRAY:G:::V:::: HQ2535A T::AES::::::::::::::::::::::::::EYST:Y::::::YIPK:R:G:::I:::: Hbo0024 T::GE:::::::::::::::::::::::::::EFETIY::::::YIPTKM:G:::I:::: Hmu0235 :::::::::::::::::::::::::::::::::YS::T::::::Y:VG:N:::TM::::: HQ3226A :::::G::::::::::::::::::::::::::AHEI:Q::::::::MSDT:::TI::::: HVO_0336 :::T:::::::::::::::::::::::::::::Y::::::::::::VS:N:::TM::::: Hbo1143 :::S::::::::::::::::::::::::::::NY:::::::::::MVS:N:::TL::::: HQ3085A VINK:E:::::::::::::::::SGNG:::KG::S::RQ::::Q::::-::NGT:::::: Hmu0251 :G:S::::::::SCLVRGEQLVPDADGDVRCG::::::H::::Q::::-::DG::::::: pNG6077 VINE:TTDSNDANCRKSGQLNDYDNDGDIRCG::::::H::::Q::::-::DG::::::: Hbo1868 VINK:E:::::::::::::::::NGDG:::TG::E::LQ::::Q::::-:NNGS:::::: consensus ENDRVVEYART--------DGEWERTWTVGDAE---LKWPRDADRLPNGNTLITDTLNHR #oth 4.3.1..222632111111522.342.43654512325........2..1..22.1236. Hmu1804 ::A:::::Q:V::::::::::::VQS:SWQ:VR:::::::::::::::::::LV:SNGN: HQ2535A Q:N:::::Q:::::::::::NS:Q:S:QWS::::::MQ:::::::::::H:::S:SNSG: Hbo0024 ::N:I::FQ:S::::::::E:::VES::WQ:RT:::MS::::::::::::::V:::AAG: Hmu0235 G:::::::::L::::::::N:S:::::E::TGS::::::::::::::::::::V:S:::: HQ3226A :::::::::KL:::::::::N::T::::::TNT::::T:::::::::::::::V:::::: HVO_0336 G:N::::::KE::::::::::::V:::S::KNT::::N:::::::::::::::V:::::: Hbo1143 G:N:I::::YENRSETSHT::::V::::::TGS::::::::::::::::::::V:::::: HQ3085A H:::I::LH:GA::::::::DS::V::SIAA::GVPFS::::::::S::::::::S::K: Hmu0251 D:H::::LH::E:::::::S::::PA::LER:GGIR:D::::::::S:::::V:::::T: pNG6077 :::::::LH::E:::::::G:K::PA:ALDR:AGVE:D::::::::::::::::::::R: Hbo1868 H:::I::LH:NNT::::::TD:::VA:A:YE::GVPFS::::::::A::::::::S::Q: consensus VIEVNPSGEVVWSYYAT---WGPYEAERLGTGDESVGGPTYRDLNAAG-YPGTGSANLTA #oth 2312344143..24545111542.111.234.1.24215433773644633445446676 Hmu1804 LV:::ADD:I:::ATVG:::-M::DV::I::::::E:::AA:LRGR:PVE:R:QPEDGAN HQ2535A IL:I:E::DI::KITGV:::-SN::::::::::::S::SSAAT:DL:S:-Q::RD:ETSQ Hbo0024 ::DL:TD::I::::EIQ:::-MA::::::::::::A::ESAAA:GLPSRE::DVVDTEQ: Hmu0235 ::::T:T::I::E:::::::::::D::::::::::N-:::I:QQ::T:S:DLS:::G:RP HQ3226A ::::T:M:::::E:::::::::::D:::VVH::::N-:::M::I::S:N::I:::::::T HVO_0336 ::::T:T:::::E:::::::::::D:::VAH::::S-:::I:::::S:S::I:::::I:: Hbo1143 ::::T:T:::::E:::::::::::D:::IVH::::AN:::I::M:QS:T:DI:::::::: HQ3085A IV:I:N::VA::::QTQ:::KV::::D::PA:-:R:::VA:TNA:NI-:-----DTAAST Hmu0251 IF:IS:N:T::::RETPDTSPI:::::::PE:-:R:::QR:PGGE:::ETD:RTPTATPD pNG6077 LV::DE::T::::VRTE:::RI::::D::PY:-::::A:K:TTNGSS-:---------VD Hbo1868 :V:::E::MT::::KTP:::YV:::::::PE:-:T::AT::AVNED:TV:---------- consensus GPGGNVPVLSLLRSTFAGTPLSEPF----------------W-RPVWMTEWDLGFALLAL #oth 6547655355555444544456534443111133335234245414.3457444655554 Hmu1804 :TATPPS:GAS:ET:GDR::ADRFWLTLKDVTPSLVTNGILYTA:P:VLFT::A::A:FV HQ2535A FKSIVGLIKNF:::ILPAKVINAAL::::::::::::::::IVI:S::SPQSI:---AVV Hbo0024 K:SLVSRIPGMIT:L:PNKLVHGVM::::::::::::::::FLL:G:VGVYE:LG:M:CV Hmu0235 :T:D:LDFP:R:QA::S::L::G:ANAL::::AQLWGHYMP:F::::LSS::AA:LIG:G HQ3226A VSNNG:G:ADWA:T:S:::::A::ASAI::::ATQWAHVTP:I::::::G:::L:::GS: HVO_0336 :GD:S:GFV:RVQ::::::::E::MSGL::::STRLSHVLP:L::::::P:::FW:AC:V Hbo1143 :T:DEIGFAERM:A::S::F:E::MDDF::::ATRWEHVTP:L:::::SG::FVW:IT:I HQ3085A AA:R:I:I::::LIGIQTGI-QT::::::::::::::::::-:---:F::IHVATGV::: Hmu0251 A:::D::G:::GMTVLRAAVP:T::::::::::::::::::-:---:FG:AH:::S:VG: pNG6077 S:DAG:::::::LVGLRAVVP:T::::::::::::::::::-:---:FR:PQ::LT:VST Hbo1868 -GN:D:::::::LIL:QTGI-QV::::::::::::::::::-:---:F::LHV:VT:VS: consensus LLGITGGG-E-IRARNRL------I------------ #oth 5454624542536727546556553764432111111 Hmu1804 :V:LCWATS:FYW:GHT:RGVAAG:GRRVRAGVENVR HQ2535A SIIL:::FLSSLLLKRSRYEFQTP:IRQDE::::::: Hbo0024 GSLF:W:IL::::W:SVEIQFRNP:QFNR:::::::: Hmu0235 :::VSWA:G:A:VR:K::VGGLRRRLPF::::::::: HQ3226A IIVTMWLIG:V:T::Q::LATFRDLWNNMGI:::::: HVO_0336 GV:::ATAG:LYLM:Q::LDAVRGLFGR::::::::: Hbo1143 ::SLVW::A:L:AG:H:IGAAVQH:RQR::::::::: HQ3085A ISI:C:S::-:LILK::-::::::-:::::::::::: Hmu0251 V:VVG::I:-:D:W:AL-::::::-:::::::::::: pNG6077 ::IVV::V:-:D:I::--::::::-:::::::::::: Hbo1868 TMT:A:TV:-:LIV:D:-::::::-::::::::::::