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5 genomes BUD1810 6 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi
-

pNG7264

rrnAC3432

HVO_2613

Hbo2234

Hmu3040

- - -

HQ1825A

Pairwise sequence scores
Consensus score1168 HQ1825A pNG7264 Hmu3040 rrnAC3432 HVO_2613 Hbo2234
668HQ1825A 1133 647 541 224 195 230
675pNG7264 647 1142 589 136 302 236
616Hmu3040 541 589 1145 236 264 246
439rrnAC3432 224 136 236 1266 287 383
625HVO_2613 195 302 264 287 1293 667
575Hbo2234 230 236 246 383 667 1236

182 symbols
consensus       -MNTLPAAVSL------L--TVALRFLLGAVAGAAATLVMNIPMARQPEGETPAYVAAGV
#oth            1353223542411222213142343433222213312321331.32121.31.121.122
HQ1825A         ::::IL:ISE:::::::-::::S::::::II:A:I::M:::YV::EL:::N::PR:::::
pNG7264         ::ESV:LVTA:::::::-::::SF::VI:V::AV:::V::DLV:::L::::::PFI:S::
Hmu3040         :-M:ILSS::P::::::-::G:::LITF:I:::ML::RG:DVV:::L::::::PF::S::
rrnAC3432       :--M:IGTA:K::GRHV:DYPLTQWAFVCV::::VVG:LL::::VT:D::YL::::::AG
HVO_2613        MFDH:::::AALDAASS:G:A::G:L:::::V:V::AV::A:::W::DD:F:::::::A:
Hbo2234         MSF:::GPF:G:::::S:E:SMLVFVV:S:FS:FV:A:::GV::S::ED:F::::I::SI

consensus       LTRTTPDDAPRRLANVVHHAAGLLAGPLYVWLLLALEALLPGDGSLG-----P-HAVAAV
#oth            11434.3311421.4.2.131131112.12333353431124343243333211332312
HQ1825A         ::MLR:E:::::::W:::YV:A::T:::F:::IFSV::::-S:TA:S:::::-:V::S:I
pNG7264         ::NSV:A:::G:::::::YI::W:T:::F::M::TS:G::G:QSI:A:::::-:TV:::A
Hmu3040         ::EQN::S::K:::A:::::::W:T:::::T:::LVGNV:-:::VVT:::::-:YLLT::
rrnAC3432       ::::D:SAVS:P::V::::GTA:V:A:::SAVVAG:SFV::TAI::NGVPLI:::TIG::
HVO_2613        VR:::::EVSFGD:::A:::::A:::V::AVVY:VTD:VA:DL:VA:IGIDL:S:L::TA
Hbo2234         :RG::::EVSEGD:Y:T:YG::V:::I::AVAYT::A::::PLV:V:SMLVL::::::T:

consensus       VLYALMYGFFARIVLPRAG-RLYRERATAIRRDWARSA--FGAYLLVLVPLIAGGL----
#oth            223312231.24322.13121344413431221.1311221122.3123.2244334321
HQ1825A         I:::::I:::MI::::QS-::VSAS:VNT::::::LT:::-:G::G::::::G:VSLLLS
pNG7264         :::S::V:::VFV::::S-:::PSA:MAD::::::I::::-A:::::::::V:L:SRIV:
Hmu3040         ::LV::V::::VV::::P-:G:A:Q:VRT:T::::V::::-A:::::::::V::AAGVLS
rrnAC3432       GIS:FI:Y:::::AM::F::GSL:DD:DE:IQQ::LT:FI:::A:ALFI:VLVTW:::::
HVO_2613        :VV:FI:VA:::FIF::::R:I:G:::::V:GQ:L::SLV:::T::::A:A:FP:FA:::
Hbo2234         :VVGFV:S:::HL::::::K:V:E::S::V:GQ:L::SFV::LT:V:VL::LTA::::::

consensus       --
#oth            11
HQ1825A         ::
pNG7264         ::
Hmu3040         GL
rrnAC3432       ::
HVO_2613        ::
Hbo2234         ::