5 genomes BUD1817 5 proteins a Hsa Halobacterium sp. NRC-1 b Hma Haloarcula marismortui f Hvo Haloferax volcanii g Hbo Halogeometricum borinquense h Hmu Halomicrobium mukohataei i Hut Halorhabdus utahensis j Hla Halorubrum lacusprofundi q Nph Natronomonas pharaonis x Hwa Haloquadratum walsbyi - pNG7301 HVO_2599 Hbo2245 Hmu2068 - - - HQ3209A

Pairwise sequence scores
Consensus score	1836	pNG7301	Hmu2068	HVO_2599	Hbo2245	HQ3209A
1293	pNG7301	1871	1165	1037	946	934
1293	Hmu2068	1165	1807	972	912	866
1371	HVO_2599	1037	972	1822	1100	950
1315	Hbo2245	946	912	1100	1797	1150
1182	HQ3209A	934	866	950	1150	1833

236 symbols
consensus       -MSQPSFHPDVA-QHRRIDVDRWDDVYVVGDVHGCRPELERLLDRLDPTEDDLVVFVGDL
#oth            132413.3211232.3121232.121.11......332.11.112.222322.1......
pNG7301         MA:P:T::::LGAP:Q::RGH::EEI:::::::::::T:::::S:::::P:E::::::::
Hmu2068         MTATL::E:T::K:::Q:::S:::E::::::::::AET:::::::::-NGRS:F::::::
HVO_2599        :::V::::::::E::L:V:I:D:::::::::::::L:A::::V:::E:S:::::::::::
Hbo2245         :::::R:DA::-:P:::::::D::G:::::::::::A:::Q:::E:GV::::::::::::
HQ3209A         :--M:Q:ADT:-:E:K:L::TA:::I:II::::::HD::NQ::ST::V:DT:::::::::

consensus       VRKGPDSKGVVDLVREADNMLTVRGNNEEKLIRGRKSLDALSDDDLAWIASLPVAISWDD
#oth            .......311123..222.2111.....1..11.211112.2211.212412.1211.21
pNG7301         :::::::D::::M::HTP:F::::::::Q:::D::::IPS:T::::S:M:::::::::::
Hmu2068         :::::::RRALS::::R::L:S::::::Q::LD::A:::::D:::::FVE:M:LVV:::G
HVO_2599        ::::::::::::Y:::R::F::::::::::::::T:E::::T::::E::SN:::::T:E:
Hbo2245         :::::::A:::S:::N::::F:::::::::::::T:E:::::GEQ::::RN:::::::E:
HQ3209A         ::::::::::LEH::H:E::F:I::::::::L::E:::PV::S:::S::K:R::G:::Q:

consensus       ALVVHGGVDPRKPLAEHSADELENNRSLSPDDGYDRPYWFETYDGPRRVFFGHTVLAAPF
#oth            21.....1111.2111.243..214.1122321112.1.1.31313411.....1113.2
pNG7301         S::::::::H::SI:::ELT::L:M:::V::GS:::::::::RRADP:I:::::::SE::
Hmu2068         :::::::I:H:::::::::E::L:::::V::G::::::::::R::G:T:::::::::Q::
HVO_2599        :I::::::H:E:::S:::V:::::T:AMN:G:S::G:F:::Y:E::E::::::::M:H:A
Hbo2245         S::::::::::::::D:TI:::::V:A::DA::--E:::W:V:Q::S:::::::P:S::V
HQ3209A         T:::::::::::E:S::TTY::QTF::::S--:::::F:W:R:::SD:I:::::P::::V

consensus       ARECAVGLDTGCVYGGQLTAYDCRTDEFVSVDPEKTHQERSESKIVDPRQAPMV--
#oth            3224.2.....1...12....222321112.3223.223.3311113.33412333
pNG7301         ETPT:::::::::::::::::Q:S:Q:::T::::T::EA::SDS::::ER::PTST
Hmu2068         :TPW:::::::::::::::::R:S:G:::::E:PE:YV:::ADS:::::--:::EE
HVO_2599        VF:Y:M:::::A::::A:::::LHA::L:A::S:V::ES:KD:::LE:::PAL:::
Hbo2245         ::RH:::::::::::NE:::::W:E::::T:A:D::V:::A:::W:K:VVV::Q::
HQ3209A         Y::::I:::::::::N::::::W:R:C:H::TA:::V:H:N:::W:H:D:S:PAAD