Home |  Text search
5 genomes BUD1823 8 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi
-

pNG6142

HVO_2833

HVO_A0011

HVO_A0436

Hbo3577

-

Hut2745

- -

HQ2167A

HQ3573A

Pairwise sequence scores
Consensus score2324 HVO_2833 pNG6142 HQ3573A HQ2167A HVO_A0011 HVO_A0436 Hbo3577 Hut2745
1071HVO_2833 2413 1569 1611 666 650 647 686 624
1138pNG6142 1569 2422 1777 664 652 659 719 728
1032HQ3573A 1611 1777 2394 607 607 629 644 641
1781HQ2167A 666 664 607 2354 2145 2148 1107 1069
1795HVO_A0011 650 652 607 2145 2329 2295 1107 1081
1795HVO_A0436 647 659 629 2148 2295 2322 1105 1073
1449Hbo3577 686 719 644 1107 1107 1105 2346 2078
1416Hut2745 624 728 641 1069 1081 1073 2078 2366

323 symbols
consensus       MLSEAELAVLDALH--REATVSELATNLDRSLSYLSELVERLETAGLV-ETRRQGNQKRV
#oth            1122312211212211112.333..14113.33231221421443..1311114322121
HVO_2833        :::KTGI::::::STG::::AQ:::ADTGN:RKQVYRV:DEMIE::::R:::GHH::RV:
pNG6142         :I:K:G:::::::STG::::PA:::AETGY:RDH:YDVLNE:LA:::LT:::GSS::R::
HQ3573A         :I:K:G:::I:::STG::::PVA:::ETGY:QAHIY:VLDD:LD:::LV:R:GPN::RQ:
HQ2167A         ::T:::VRA:T:::::G:Q:::D:::::::::::T::::::::::::::::::::KT::I
HVO_A0011       ::T:G:VRA:T:F:::G:Q:::::::::::::::T:::::::::T::::::::::KT::I
HVO_A0436       ::T:G:VRA:T:::::G:Q:::A:::S:::::::T::::::::::::::::::::KT::I
Hbo3577         V:RRI::E::ATVD:::GD:I:::::K::H:E::::RA:AD:VEK::::Y:E:D:RR:::
Hut2745         V:RRI:::::ATVD:::GD:I:Q:::K::H:E::::RA:GD:AQN::::Y:E:D:RR:::

consensus       RLSDAKALELYRDLTQQYSHIDWPELLSGAALRVCYYLDTPRTVTEIADRADIHRQTVHR
#oth            14212213.4123.32231.11131..111112.1111.3..23231.2.2122.22.12
HVO_2833        :AT:DPVV:A::R:ASKLG:VE::::::P:TI:::WF::E::R::A::::LG:T::A::K
pNG6142         :IAEHPVT:A::T:QSEF::V::T::::P:T::::W:::R::HIAD::::LG:T::G::S
HQ3573A         :VA:HPVI:G::T:QSEL::VE:AD:::P:T:Q::WF::E::R:S:::E:LG:T::G::K
HQ2167A         ::::::::::LTK::::::::::::::::::::::::::::::P:KL:R:::V::S::::
HVO_A0011       ::::::::::LT:::::::::::::::::::I:::::::::::A::L:R:::V::S::::
HVO_A0436       ::::::::::LT:::::::::::::::::::::::::::::::A::L:R:::V::S::::
Hbo3577         VP:::R:V:R:Q::VR:H::::F::::T:K::E:L::::Q::::S:::::S:NY:N::N:
Hut2745         VP:::R:V:I:Q::VR:H::::FS:::T:K:IE:L::I:Q::::SD::::S:NY:N::N:

consensus       ALAPLQHRGIV-QTDDGAYALNDDFEPLLEFARELAHHEHRQRVEEQAPSATILWEDLDE
#oth            1.21122.1211332125.22322242.32..11313.2..3121231132112.11221
HVO_2833        ::S::KN:AML:DPAGPE:::A::LR:::::::AVVA::::V::RAL:::::VE:C:PKR
pNG6142         ::S::K::ALL:SRS:SK:::H:EVS:::A:::ATVE::::A::R:I::::::A:C:PKR
HQ3573A         ::S::KN:AML:SPSGPE::VSE:LA:::A::QAIVI::::S:AR:L:::::VE:C:PKR
HQ2167A         :::::::::::Y:::::T:::::G::::SV::::::::V:::T::A:TDTYS::::S:::
HVO_A0011       :::::::::::Y:::::::::::G::Q:SV::::::::V:::T::::TDTY:::::S:G:
HVO_A0436       :::::::::::Y:::::::::::G::Q:SV::::::::V:::T::::TDTY:::::S:G:
Hbo3577         V:KRFRD::L::GSA::H:EF:A::DR:H:::::::::L::::L:AV::KG::::::Y::
Hut2745         V:KRFRD::L::G::::R:DF:A::DR:Q::::::V::L::::L:SV::QG::::::Y::

consensus       FLVQTQTEIDTEHFQP------TGLARFQAYGLQFLLADRRYYLYSEDTDELSPAELCCH
#oth            1.11342311313134121123..121.4211.21112121213122224311.1311..
HVO_2833        A::RVHDPE::DTL:SAEDWEL::::::R::::R:F::GEPAFW:AP:-VP:T::DVV::
pNG6142         A::RL::DE::DAL:AAPDWEM:::G::T::::::F::GEPPFW:AP:-ED:T:::VV::
HQ3573A         A::RV::TE::DALLDAPDWQV:::G::EE:::::F::GEPAFW:TP:-E::T::DVV::
HQ2167A         :::::P::::N:::I:::::::::PDQ::R:::PL:AR:::::::::A:C::::EM::::
HVO_A0011       :::::TI::AD:::I:::::::::PDQ::R:::PL:AR:::::::::A:S::::EI::::
HVO_A0436       :::::TI::AD:::I:::::::::PDQ::R:::PL:AR:::::::::A:S::::EI::::
Hbo3577         ::A:AE::::A:G:HE::::::::::::A:FD:::::TGH:::V::::L:AV::::::::
Hut2745         ::A:AE::::A:G::E::::::::::::A:FD:::::T:H:::RF:TEL::V::::::::

consensus       TLVIDSGSRRQSYCLLLLSH--VDIDREELRAQATKYGLEDTVDALYRYLDTSGAQRDD-
#oth            1.13.211.23..21..11311211.233.221131.11233133123312243444132
HVO_2833        :::L:AD:::T::A:::IEQ::EE::::A:TET::W::V:Q:ISQM:AFI:EDIEAG:EG
pNG6142         ::LL::::::V::SM::IEA::E:::Q:T:VET:QW:D::P::K::::P:QGDFDRT::L
HQ3573A         :::S::::::V::AM::IEK::L:::Q:T:TDTT:W:D::S::A:M:QA:QGKVKDS:GL
HQ2167A         M::::::A:T:::::::::::::::::N::::::I:::VD:V::D:CT:::::::::TS:
HVO_A0011       M::V:::A:T:::::::::::::::::D::::::::::VD:V::N::T:::::::::TS:
HVO_A0436       M::V:::A:T:::::::::::::::::D::::::::::VD:V::N::T:::::::::TS:
Hbo3577         ::L::D:::HR:::::::::::::V:EAD:::::A::::::EI:::L:::E:H:EVD:::
Hut2745         ::L::D:::HR:::::::::VD::V:E:D::D::A::D:A:KI:::L:::E:N:VVD:::

consensus       --RLPEWEEFQELAEQYEVAL--
#oth            212..2341132.122.1.3211
HVO_2833        GV:::SPG:YAA:KD::G::-::
pNG6142         PVI::KKN:YMA:KD::G::-::
HQ3573A         PVV::SES::IA:K:::G::-::
HQ2167A         ::::::::D::::::E:::TP::
HVO_A0011       ::::::::D::::::E:::T:::
HVO_A0436       ::::::::D::::::E:::T:::
Hbo3577         :::::::D::::::AD:::P:P:
Hut2745         :::::::D:::G::AD:::D:PQ