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5 genomes BUD1827 5 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi
-

rrnAC1769

HVO_B0379

Hbo2867

-

Hut1376

- -

HQ2370A

Pairwise sequence scores
Consensus score3677 rrnAC1769 Hbo2867 HQ2370A HVO_B0379 Hut1376
2371rrnAC1769 3616 2012 1839 1988 2018
2909Hbo2867 2012 3800 2300 2504 2555
2811HQ2370A 1839 2300 3825 2595 2524
3069HVO_B0379 1988 2504 2595 3642 2728
3079Hut1376 2018 2555 2524 2728 3691

529 symbols
consensus       MVSSTIALGLTVATLVAFTGIGLWFSRGRVGSVEDLISARDSAGEGRMTATLVASVMGVW
#oth            1..1221.1..12.123.113.22311.113.1.11.1..122.23232..11..1....
rrnAC1769       ::::A:V::::A::VLV::::::FAA:::ID:::TY::::::::S:TLA::VI::M::::
Hbo2867         ::::::::A:::::::I:::::V:::::K:E::::::T::NAT:::Q:S:::I:::::::
HQ2370A         :::T:LV:::::M::IG::IT:M:Y:Q:::T:I:::::::NQ::AN:I::::::::::::
HVO_B0379       -::::V::::::::::::::V:V:::::::::::::::::::::SR:T::::::::::::
Hut1376         :::TGV::::::L:::::S:L::LH::::::::::::T::::V::K::::::::::::::

consensus       ILLSAPEAGASF-GIAAVIGYAIGEAVPMLAYARLGPRIRELIPEGHSLTEYAHARYGTA
#oth            1.1111....311.21..2..11.1.2.1121222.1.1.111.3......1.2..1.32
rrnAC1769       ::::PA::::A:G:LP::L:::::S:I:L:LFIPV:A::::VM:A::::::F:Y::F:SG
Hbo2867         ::::::::::LY:::::::::G::::::::::S::::::::::::::::::::Y::::G:
HQ2370A         ::FA::::::G:::V:::::::V::::::YV:S:V:::::::::S::::::::R::::::
HVO_B0379       V:F:::::::::::::::V:::V:::::::V:::::::::::::::::::::::::::::
Hut1376         ::::::::::::::::::V:::::::L::::::KI:::V:AV::D:::::::::::::AS

consensus       MYAFVLLVSGLYMFVFLAAELTGIAGALALVADVPQWQTALLVGGFVLLYTGYGGLRASI
#oth            ..11.23..21...1.1...1...12..23..11.1...12.1.....1..2....1...
rrnAC1769       ::LL:::::VF:::I:::::M::::::::::::::L:::S::I:::::V::A::::L:::
Hbo2867         :::::IV::V::::::::::::::SL::NH::GI::::::V:::::::::::::::::::
HQ2370A         :::::VG:::::::::V::::::::::::F::::::::::T:::::::::::::::::::
HVO_B0379       :::::::::A::::I:::::::::::::S:::G::::::::::::::::::S::::::::
Hut1376         ::::::A:::::::::::::::::SR:::M::::::::::V:::::::::::::::::::

consensus       FTDTVQAVVVIPLLALAFAGALLALGGPGAVHDGIVAADPTLLDPGFVPGLQFGLALAFA
#oth            2..12.13112...2222212222...12233321121112...11131.12..1112..
rrnAC1769       V:::::TL:IL::::VG:G::::S:::TSEF:ATV:S::::::::::G:::E:::YV:::
Hbo2867         ::::I:TM:IL:::V:SV:AVI:T::::::I:Q:V:E:NA:::::::::::R::I::V::
HQ2370A         :::::::::::::::V::IATVF:::::SS:LGN:T::::G::::TAAA:F:::::::::
HVO_B0379       A::A::::::::::L:::::::V:::::A:AI:::T:TN:A:::L:A:A:::::::::::
Hut1376         ::::L::II:M:::VI:A:::VF::::::::Y:::::T:::::::::W:::::::::S::

consensus       ILGAELINQTWWQRIYAADDSETLERGFRRAAVANGLIVLLAAFFGVVAAGNADVVT-PA
#oth            2...112..11...1..1221132312122.21211211222211.12.1.223211323
rrnAC1769       L:::NML::GV:::V::::GDGA:R::MGI:::VVVPML::SGL::IA:::LG----:-L
Hbo2867         V:::::V:::::::::::T::GV::::::T:T::::::LV::TLL::::V:::::::QLG
HQ2370A         ::::::L::::::::::GT:::SIAVA::::T:L:::::FI:::L::::::HT:I::N:T
HVO_B0379       :::::::::::::::::::S:::VG:S::T::L:::A::FVT:::::::V:::A:::D::
Hut1376         :::::::::::::::::GS::::V::::L::SL:::::::V::::::I:::H:N::::-:

consensus       SEGYNADIAFFVLLEEAFPEWLVLAVVLLALLLVMSSADTLFNALSSLVTADLARLLDDP
#oth            11311.231..111322111.12.2111..12....12..1...11.11.1..1.12321
rrnAC1769       T:SGS:S::::LVVA::::T:VT::::V::V:::::::::M:::IA:V::::::::::::
Hbo2867         ::N:::G::::::::GV:G:::::G:L::::T::::T::::::::::::::::P:::N::
HQ2370A         :AA::::V:::::::T:V:::VI:V::::::S:::::V::::::::::I:V::::IYPGS
HVO_B0379       :A:::::A::::::G::::::::::A:::::::::::I:::::::::::::::::::AE:
Hut1376         :::::::LS::L::N:S::::::::::::::::::::V:::::::::::::::P::I:::

consensus       DDRTLALGARALTVVVAVAAIYVSLRARSVLRLFFLADLLGAAVAFPLVYGLYSERLTGA
#oth            21.2.2112.12.121.3..12112112..11..13....111121.111..113.11.4
rrnAC1769       :Q:::W::G:G:::A::L::MFIGAQGY:::Q::LT::::A:G:FV:FLA:::T:::::P
Hbo2867         :::::R:::::V:::::::::A:::::::::::::V::::::::G:::::::FTG::S::
HQ2370A         T::Q:RWI::GF:LCI:F::::::V::Q:::::::::::::T:L:::::::::::::::F
HVO_B0379       S::H::::S::::::::A:::::::::Q:::::::F::::::::::::::::::T:I::L
Hut1376         :::::::::::F:::I::::::::::::::I:::::::::::::::::L:::::R::::T

consensus       GALASSLAGLAVGLAYFP---DLRGLITAIPGVGGALPAPDPLYLTAFAGAFLVSTALAL
#oth            ...21112..11.211..1112.1232221141.23..111321.22.111122.23222
rrnAC1769       :::V:GI:::L::FT::::::S::::MA::::::SM::::S--F:I:::::T:::A::TA
Hbo2867         ::::::IT:::::S:F::FPFG:H::VDGL--L::::::::AT::LP::S::::::V:::
HQ2370A         ::::G::S::::::::::::::::SF:::::L::P:::NA::::::::G:S::T:IGVTI
HVO_B0379       :::::::T:::::::F:::::::::V::S::V:::L:::A::::::S:G:::V::::AS:
Hut1376         :::L:::::::F::::::::::::EY:::::I:::H:::::G::::S:::::IL::L:::

consensus       VAARLSTARFDLDRLSREIRRLDDPVADGG--------------SD--D
#oth            1122.32342.123.1211111.22321212222222212222222112
rrnAC1769       ::TL:GG:DA:::S:G::V:A::::::::::::::::::::::::E::Q
Hbo2867         A::::::DE:::S::::::::::E::P:::TASETGRQLQTEDTTEVSE
HQ2370A         :IS::T:T:::::T::A::T:::E:I::::RTYSAESSLCPDGN:::::
HVO_B0379       :::::AD:G:::G::::::::F::GQT:AP:::::::::::::::S:::
Hut1376         :::Q:::PTV:H:A::HR:::::GSG:ESP::::::::::::::A::::