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5 genomes BUD1828 5 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi
-

rrnAC2453

HVO_0032

Hbo1465

-

Hut1543

- -

HQ3724A

Pairwise sequence scores
Consensus score2651 Hut1543 rrnAC2453 HQ3724A HVO_0032 Hbo1465
602Hut1543 2368 510 467 485 455
2209rrnAC2453 510 2716 1974 2035 1956
2273HQ3724A 467 1974 2726 2095 2072
2285HVO_0032 485 2035 2095 2676 2194
2301Hbo1465 455 1956 2072 2194 2681

378 symbols
consensus       -MSSVSYSRLQKSFLRYQHIFVLIAPLAFLTAVLLAAPTPSAAG--TEYWLQYWWLFPAF
#oth            123232311311211221131.2211221234.32411113421113221221..11111
Hut1543         MDVP:QGN:-----------::AFGTV:S:SM:AITGQL::I:AFP::QF:AH::V:::S
rrnAC2453       MTT:SPS:::::G::K:::V::FL:::L:VVG:YT:::::AD:::::G::FE::::CI::
HQ3724A         ::::::::HI::::::::::::::::I::I:T:::I::::TNV:::I:::V:::::::::
HVO_0032        ::::Q:L:HV:::::K::::L:F::::L::AS:FTM:::::GV:::M:::::::::::V:
Hbo1465         ::NID:::::::::::H::L::::::VV:V:::::W:::DG:G:::LDH::E::::::V:

consensus       LTGATIVNTVGISGSALFVPFLIFIFPLF-AQPLTPETLVKVGLISEAFGLSSSAVAFIQ
#oth            2311.31111.1..112.1..111111321132.31312111..11.2..1111121111
Hut1543         IVFS:VALAA:V::ALF:S::FML-----:GVG:::AQAIGA::LT:V::MGNGLRSYVK
rrnAC2453       VI:::T::::::::::::::::::::::LAGET::::::::::::::S:::::::L::::
HQ3724A         :L:::M::::::::::V:::::::::::::::::E:::::::::::::::::::::::::
HVO_0032        :::::::::::::::::::::::::::I:::H::DSS:::::::::::::::::::::::
Hbo1465         :::::::::::::::::::::::::::Q::::::S:T:I:::::::::::::::::::V:

consensus       YGLVDRRLALTLVAGSVPFVVAGALLSFIIPEPLFHALLGIALLAAS-YLLFRADLGHEE
#oth            2.1..111123.12.11.1112....11211231113.1121.1.2211.1142112122
Hut1543         Q:V::YDT:KW:L::A::AT:V::::AHAVDPT:LKL:F:AG:I:LGAF:VYYDPPEDC:
rrnAC2453       ::::::::::S::L::::::I:::::::V:::::::::::::::::::::::K:::::::
HQ3724A         H:::::::SIA::::AI::::G::::::::::::::G::A::::::::::::QT::D::H
HVO_0032        :::::::::::::G::I::::G::::::V::DVV::::::::::::::::::N:::::D:
Hbo1465         :::::::::::::G::::::I:::::::::::MV::S:::L::::SA::::::::::::G

consensus       PGE-GDADSEA--------AADGGR--ASLPNDAGKLGPAGVRTADNGTVTRVDRDGDDY
#oth            21112242333111111112311.42233112143111111141222.21.11112.211
Hut1543         :::::EGKFLE:::::::::QNT::::--------------------::T:IEAA::ETF
rrnAC2453       :::A::S:P:V::::::::S::::D:::T::D:DN:::::::E:::D:A::::::::N::
HQ3724A         EN::TS:E:VDDDTNIDRT:S:::I::S:::::ED:::::::S:DE::Q::::::Q::::
HVO_0032        ::S:S:T:HA::::::::::T:::TVS::::::P::::::::N:::D:::::::::::::
Hbo1465         A:S:S:-::::::::::::V::::SLNTD:::::::::::::::D::::::::::E::::

consensus       TYTRGGYLRRFANYSIGGIFQGLAGFGVGELGIISML-GTKVPVRVAIGTNHIVVALTAV
#oth            2.11211121121111..411..111.21.111111111131.1...11.11111111.2
Hut1543         ::ETCWRAPGLTLSTV::FIT::ISA:LP:IVTTQLIVRCRL:P:::VA:SVFTLGIA:G
rrnAC2453       G:::::::E:::::::::V:::::::::::::::::::R:D:::::::::::::::::::
HQ3724A         Q:::A::::::G::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
HVO_0032        :::::::::::::::V::M::::::::I:::::::::::::::::::::::::::::::I
Hbo1465         :::::::::::G::::::L:::::::::::::::::::::N:::::::::::::::::::

consensus       LASLVHVFGGGLV-GGHSISLASTPWNMVVFTVPATVLGGQIAPYVSNALETDTIKNFVG
#oth            1111..111111.112112211211.11.2111.1113..1.111.1211313211311.
Hut1543         AGA:::ALSASP::-----------:YV:AWSI:GVLV::T:GSR:GKYVPG:LMEVGL:
rrnAC2453       :::::::::::::P:A:::D::::::::::W::::::T:::::::::T::D:G:::K:::
HQ3724A         :::V:::::::::::::::::::::::::I::::::::::::::::::::S:N:::T:::
HVO_0032        ::::::::::::::::::L:::T:::::::::::::::::::::::::::::SV::::::
Hbo1465         ::::::::::::::::::L:::T::::::::::::::I::::::::::::::::::::::

consensus       GLFAVIAAALFLMAAGG-
#oth            21.221221112112123
Hut1543         IV:GLVG:LVLGVELLA:
rrnAC2453       ::::::::::::::T::V
HQ3724A         ::::I::V:::M:::::I
HVO_0032        V:::::SL::::::L:I:
Hbo1465         V::T::SV::::::::IA