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5 genomes BUD1835 7 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi
-

rrnAC2536

-

Hbo3008

Hmu0837

Hmu2993

Hmu3070

Hut1388

- -

HQ1296A

Pairwise sequence scores
Consensus score1988 Hmu2993 Hmu3070 Hbo3008 Hut1388 HQ1296A rrnAC2536 Hmu0837
1057Hmu2993 1988 742 828 901 851 853 872
959Hmu3070 742 2013 732 867 724 757 757
1105Hbo3008 828 732 1942 954 859 974 924
1390Hut1388 901 867 954 1841 1097 1156 1192
1522HQ1296A 851 724 859 1097 2058 1445 1442
1556rrnAC2536 853 757 974 1156 1445 2072 1569
1608Hmu0837 872 757 924 1192 1442 1569 2017

290 symbols
consensus       MTDS----GAH-DDSG-----------RAGYYHLARAVLARELLLFVRYPVNAAGGIVVA
#oth            224411124335453333322111111613255142112612433331..1114232254
Hmu2993         VS:V::::::RSAVG::::::::::::W:S:AN:I:V:AK::::VYL::::DTG:LLLAY
Hmu3070         :::T::::IG:TRQ:DA::::::::::N::LTT:FK::A:KRIH:L:Q::::TFSQV:TL
Hbo3008         :SS:::::---:-N:::::::::::::T:::GS::Y:I:S::VINWA:::::::SVVFGQ
Hut1388         ----::::---:----:::::::::::-------MK::IH:D:VIWL:::::::T::LM:
HQ1296A         ::::QLFST::Q::TEQSDPQ::::::P:T::::T::::L::F:::I:::A::V::::::
rrnAC2536       ::A::::A:T:A:::DGASAQTISAAMQ:::LD::::::Y::Y:I:::::A::V::::IS
Hmu0837         ::GQ::::P:SETP::GETPR::::::::S:::::::::V::F:::::::A::L:::::S

consensus       LFFFGLIFYGGRALAGQ------ALDDSIEGIVVGYFLWTLAQGAYQGISNDIGSEAQWG
#oth            421.212.2..1333121111111332122121..2..11124311423433144.23..
Hmu2993         ALI::V::L:::::V:D::::::GF:K:LDS::::F:::::STI:FIDVGKA:WK:SE::
Hmu3070         YL::AVV:F:::EASSRVADGTG::SSTLD:VI::W::L:M::A::F:LASN:IR:S:::
Hbo3008         F:::A:::F::Q:VGS:::::::GFS::AA:L:::::::S:VGQS:::TIGI:TE::S::
Hut1388         :I::::::::::LV::::::::::I::T:::LI:::::::::::::F::T::VQA::G::
HQ1296A         ::::IVL::::QL:::R::::::::A:::::::::::::::SS:::AS::::::::V:::
rrnAC2536       V:::::L:::::M:::::::::::VT::::::I::::::S:SV::::S::::::::::::
Hmu0837         ::::::L:::::MI:::::::::::T::L:::::::::::::V:::SS::::::::V:::

consensus       TLERHFMTPFGFAPVALLKGVAKVVRTFLTSAVILAGMLLITGTQLQLPVVTVVVVAALS
#oth            .1.11331.2..23.325.321421223321222.24.134.123.34332113213412
Hmu2993         :M::::L::L::NV:L:T:AL:TL:FAG:V:TLM:L:::V:::Q:::VDLL:I:PIVL::
Hmu3070         :::QLH:::Y::GT:VAV:T:WN::ESAGWGLL:::L:::T::RS:VIDA:A::PISI::
Hbo3008         ::::::IS::::NR:LFI:AI:RML:ALFV:LAV::M:VIL::::::MH:I::LSILL:T
Hut1388         ::::::::::::G::I:A:SI:V:L::::::::V::A::VM::RS:E::L:::::::::A
HQ1296A         :::::VT::::::::::::::::L:::::::::::V::::V:::K:AF:P:::I:::GA:
rrnAC2536       :::::V::::::::::FC::::::::::I::T:V::V::A::::T:::N:L::::::S:T
Hmu0837         :::::I::::::::::::::::::::::::::::::V:::L:D:T:::::::IT:::::A

consensus       VASVLGLGFAAGGVAVLYKRIGNWLNLLQFAFIGLISAPVFEIPWTRLLPLAQGSALLQR
#oth            22.23.2.113112211..1143234.2212232.121.233222114..111..11..3
Hmu2993         :S::F:I:::V::IS::::KVDS::A:CN::LA::VAV:TTGVDLL::::::::::M::A
Hmu3070         IL:II:V::VFA:L:LV::::EKVTS:::::L::::A:::V:::A::::::V:::SM::A
Hbo3008         TL::V:::::M::::::::::SSFSQ:FSLVIL::VG:::LD:::L:V::VV::::M::Q
Hut1388         :::AF:::L:M::LS::::::N:VA::::::::::::::::::::::I:::V:::::::V
HQ1296A         ::::::::::::RIT:::::V:T::G::::G:VI:V:::::S:::L:A::::H:::::::
rrnAC2536       I:::::::::::::::::::::::::::::G::I::::::::LG:::V::::H:::::::
Hmu0837         ::::::::::::::::::::::::::::::G::L:::::A:DLG::KF::::::::::::

consensus       AMRDGTRLWEFDPVDLALLVGTALGYLLAGYAVFHLATRRARRLGVLGDY
#oth            2.32.3111212333232.312342.223.121.4422.1.1221.1.1.
Hmu2993         ::T::Y:::D::::S:L::L::G:F::V::::::VWCQ::::::A:::::
Hmu3070         T::Q:VE:T::P::AF:::::::F:::::::V::LVCM:V:K:R::M:H:
Hbo3008         T::S:V:::Q::GI:IGI:::VT:V:FGI:F:::::TQ::::NV::::::
Hut1388         V::::D::::L::LA::I:::::GF::G:::LA:V:::::::::::::::
HQ1296A         V:V::::::::SITEIS::FAI:VV:::G::V:::Y::::::::::::::
rrnAC2536       ::V::::I:Q:SAT::G::I:VPA::V:L::V::QYT:::::Q:::::::
Hmu0837         ::I::::::::PA:::LV:::V:V::VVL:::A:EA::::::::::::::