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5 genomes BUD1839 6 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1		 b Hma
Haloarcula
marismortui		 f Hvo
Haloferax
volcanii		 g Hbo
Halogeometricum
borinquense		 h Hmu
Halomicrobium
mukohataei		 i Hut
Halorhabdus
utahensis		 j Hla
Halorubrum
lacusprofundi		 q Nph
Natronomonas
pharaonis		 x Hwa
Haloquadratum
walsbyi
- -

HVO_0810

HVO_A0046

Hbo0723

Hmu0869

Hut0400

 - -

HQ1571A

Pairwise sequence scores
Consensus score1399 HVO_A0046 HQ1571A Hbo0723 HVO_0810 Hmu0869 Hut0400
917HVO_A0046 1420 769 814 695 749 756
1045HQ1571A 769 1408 913 882 709 721
1045Hbo0723 814 913 1513 914 682 705
1035HVO_0810 695 882 914 1378 706 677
873Hmu0869 749 709 682 706 1388 847
895Hut0400 756 721 705 677 847 1480 

210 symbols
consensus       ------------VPLGLLAPLAEFG------SIWPDFGWLE---AAVETATGWVGLVIIF
#oth            122222222223344333341322321111133434223.111142.33...14..41.1
HVO_A0046       ::::::::::::M::SVNSRVF::V:::::::SDLTT:L::YGHT::DG::::P::G:::
HQ1571A         :::MI::::::SSDG:::L:VSL::::::::D:::E::::S:::::::R::::G::I:::
Hbo0723         VSPAIDVLSSVTT:AL::EGV::LLVNGGVA::::::S::S:::::::::::::::A:::
HVO_0810        :::::::::::::S:TAF:S::DLTL::::::LY:::S::S:::SL::::::::::::::
Hmu0869         :::::::::::::FD:FVLF:S:C:::::::TATDPT:-:::::E::C::::PF::L::A
Hut0400         VTAALPLVVTGD:IV::::::WD:L::::::ASSGGLAV:::::DM:RS:::PI:::V:A

consensus       VYSFLIAFALPGPSEIVLAAP--LDLGLSDNAHLAVIILVSGAGKAAGSVFAFHIGQEAK
#oth            2.......3..21..1..3122221..215533112.121.12...2..21...1.112.
HVO_A0046       ::::::::V::::::V:::::::::::VPLWG::GL:MG::AT:::V::LV:::L:::::
HQ1571A         I:::::::::::V:::::L::::I:::::QTGR:GI:M::::::::::::::::L:::V:
Hbo0723         ::::::::I:::V::V::F::::::::FP:YV::GL:MVI::::::::::::::::::::
HVO_0810        A:::::::::::V::::::::::::::::HG:K:::::::::::::::::::::::RQT:
Hmu0869         ::::::::L::F:::V:::PSGT:R::::EP:TI::::V:::::::L::I::::::::T:
Hut0400         I:::::::V::L::::::VPASHMR::::S:WT:::::::::L:::::::::::::::::

consensus       ESGPIERLLRRSRFDVIEWSERKTVQIAQKWGYAGLAAALCVPGFPDTISIYAFSILEDD
#oth            12.22233223121.222.1..11131.242.13...1..1..1....1.....21..3.
HVO_A0046       QA:::V:W::::::::::::::R::SL:RRY::S:::L:::::F::::L:::::A:::E:
HQ1571A         Q:::VLQ:FQN:W::L:S::::R::AL::Q::::::::::S::::::::::::::V::E:
Hbo0723         :::F::KR::Q::::IM::T::::LE:::::::L::::::::::::::L:::::::::K:
HVO_0810        :::YV::A:E:LPV::MG:T:::A:::::N::F:::::::::::::::L::::::V::::
Hmu0869         :Y::LLS::E:::::ILG:::::::S::K:Y::::::L:::::F::::::::::::::::
Hut0400         :Y::LVKWIQE:::::::::::::::L:REF::V:::L::S:::::::::::::T:::R:

consensus       YLKFALATFVGSIGRLVVTVGGFGGVFAFL
#oth            .11..3...4..4...1..33343124443
HVO_A0046       ::::::::::::L::::::LSL::::ISV:
HQ1571A         :::::::::I::::::I:::I:V:A:S::I
Hbo0723         :::::V:::T:::::::::TVTLS::GITV
HVO_0810        :::::A::::::C:::::::I:IEAAL:::
Hmu0869         :::::T:::F::A::::::I:LAA:F:TIF
Hut0400         :GR::::::A::V::::::::F:::A:YLF