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| Pairwise sequence scores | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 2942 | Hbo3256 | hla1406 | HQ3189A | pNG7316 | HVO_B0243 |
| 1884 | Hbo3256 | 3125 | 1492 | 1491 | 1584 | 1642 |
| 1989 | hla1406 | 1492 | 2847 | 1667 | 1669 | 1685 |
| 2335 | HQ3189A | 1491 | 1667 | 3417 | 2009 | 2052 |
| 2333 | pNG7316 | 1584 | 1669 | 2009 | 2872 | 2148 |
| 2461 | HVO_B0243 | 1642 | 1685 | 2052 | 2148 | 3190 |
449 symbols consensus ----------------G-FCL---S--------------------FI---R--S-MTDMS #oth 111111212223333323222333233332221222222222212213332332323331 Hbo3256 :::::::::::VRRSRVPW:ITLSVESALGSKSSVSVLRIRRLRNV:SLL:QRLV::AG: hla1406 ::::::::::::::::-:---:::-::::::::::::::::::::--:::-::-:---:: HQ3189A MLRRQMFCIYTYNVQS:E:S:RRP:CHVSSIASEYILCFDLLNRT::CEHTII:I:::TD pNG7316 ::::::::::::::::-:---:::-::::::::::::::::::::--:::-::-::ATD: HVO_B0243 ::::::LCFHGGSPEH:G:::PCG:TDPV::::::::::::::::::TTT:EA:HSI::: consensus DDEIPMTVISGPLGAGKTTLVNRLLNNPGGRRIAVIVNDMGEINVDAELVARETD---EG #oth 3132.2.12..2.......1..11.32112131..21.....2.1..1.11413111111 Hbo3256 ::TR:V:LV::T:::::::::::I:Q:QA:YDV::L:::::::::::::::GS::::::D hla1406 ::R::V::L::Y:::::::M::H::A:::D::::::L:::::V::::::::::N:::E:: HQ3189A VT:::::::::::::::::::::::::::E:Q::::::::::::I::A:LQE:::::::: pNG7316 S:SV:::::::::::::::::::::SE::::::::V:::::::::::::L:D:AESGE:: HVO_B0243 TT:::I::V:::::::::::::::::D::::E:::V::::::L::::::::S:S::::D: consensus VVDLSNGCICCRLQDDLVTEVTRLAEERSFDYLLVEASGISEPIPIARTLTEGTENGDLD #oth 11..1........1...22.121..12.3..1.21.1..1...2...1112313242332 Hbo3256 :I::T::::::::R:::TD::V:::D::A::C:::::::V:::F:::K:FL:ED:VT--- hla1406 I::::::::::::::::LS:AAT:::S:E:::::::S:::::::::::AF:::::DS:I: HQ3189A I:::::::::::::::::::A::::D:::::::VI::::::::::::K:::T:::::S:: pNG7316 ::::::::::::::::::::::::::::T::::I:::::::::::::::::V:PDG::PP HVO_B0243 :I::::::::::::::::::::::::N:::::::I::::::::L::::::ASESNE:G:P consensus --DRLRLDTTVSVIDTYGFWKAFDPEESLP-DAAPNPERPLAEVLVDQIEFCDVLLLNKC #oth 1112221..1.1.2.1.....1..12122.11122423.1.22..1111......11.11 Hbo3256 ::::Y::::M:::L:A:::::E::::TTR:::GRHPGG:E::N:::::V::::::::::: hla1406 PTE:F::::M:T:L:::::::E::AG:N::G:GESTED::::D:::EG:::::::VM::T HQ3189A ::::FCV:::::::::::::::::A:::I::::::::N:::S:::I:::::::::::::: pNG7316 :::G:H:::::::V:A:::::::::::::::E:::G:::::T:::I:::::::::::::: HVO_B0243 :::H:::::::::::::::::::::A:::::::::D:::::T::::E:V:::::::::R: consensus DMVPDDALDAVEAVARELQPRAAIHRTTYSEVDPERVLDTGRFDFEAARRSQGWKQAL-- #oth .1..1121.21.23222.1...223..1.1112.34..1..1...2312.32...12111 Hbo3256 :L:::::I:E::::::::::::SLY::::AD:S::T:::::L:::D:V:::A:::RQ::: hla1406 ::::::V::EI:S::ER:G:::KRI::S::::N:DE::::::::::T:T::P:::REI:: HQ3189A :::::TE::MI:DSI::::::::::::::::IS::M:::::::::NE:::Q:::::::ST pNG7316 ::::A::::::::AVKA:::::::::::::::::SD::G:::::::D:K:R::::::::: HVO_B0243 :::::::::::::EI:::::::S:R:::::D:::T:::::::::::::K:H::::::::: consensus --A--GAEADHNHD--------HEHDHAESAAAAHGVESFVYRRDRPFHPERFNAWLDDW #oth 11.221424232123311211114..32311121.1.2.12.1233112.22124.121. Hbo3256 ::::::EHE:----::::::::-S::R:DGEG-D:::S::C:EST:::::::::T:I:E: hla1406 :::::ES:GE:G:EPAAGQ::::::::::G:::::::D:::::SADALD::S:AN::H:: HQ3189A HT:ES:DSQ:S:::ASAGDNYG:T:::G:::::::N:::::::QQK::N::Q:DS::SE: pNG7316 ::::::::DHA::E::::::::--::DEM::::::::::LI::::T::::V:::D::::: HVO_B0243 :::SD:V::::G::HD:::::::I::EGV:::R:::::::::::::::::Q:LD:::::: consensus DGAIVRAKGFAWVASRPETVLGVSQAGPSVQAGPIGEWG-DDDPATRLVFIGQDLDEAAI #oth 31312.1..11222212.1.2.111..11.1.....1.122.213....1..322.2222 Hbo3256 PSGVY:::::FLLPT:S:::M:LNR:::::T:::::::RA::E:::::::::T:V::::: hla1406 :::::::::V:N::GTD:-:I::::::::::::::::::P:::RR:::::::SEM:::R: HQ3189A N:D:I:M:::::IST::::::::::::SA:::::::::::Q::::::::I:::H::ITQ: pNG7316 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::N:::S::::::::EM:GD:L HVO_B0243 R:NV::::::::::::::::::::::::::::::::R:::::T:Q:::::::R::::D:V consensus RGELDDCLATDPER-EAAAADDPFPRES- #oth 232.11121223133333442.1..2221 Hbo3256 :EQ:A:::L::E:MAD:D:FS::::TA-: hla1406 :::::ELA:SN::SV:N:---:A::L--: HQ3189A TAD::::V:D::NKHSQKSQ::::::::: pNG7316 I::::::::::K:::TETF:S::::::G: HVO_B0243 TR:::E::::TD::::::YP::::::::A