| |||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | ||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 3362 | HQ1958A | Hmu3271 | pNG7016 | HVO_B0324 | HQ3213A | rrnAC1968 | hla0706 |
| 2663 | HQ1958A | 3358 | 2444 | 2524 | 2582 | 1203 | 1209 | 1120 |
| 2768 | Hmu3271 | 2444 | 3302 | 2527 | 2564 | 1256 | 1278 | 1267 |
| 2815 | pNG7016 | 2524 | 2527 | 3396 | 2817 | 1197 | 1231 | 1206 |
| 2882 | HVO_B0324 | 2582 | 2564 | 2817 | 3446 | 1190 | 1249 | 1174 |
| 1409 | HQ3213A | 1203 | 1256 | 1197 | 1190 | 3359 | 1539 | 1533 |
| 1497 | rrnAC1968 | 1209 | 1278 | 1231 | 1249 | 1539 | 3209 | 2332 |
| 1501 | hla0706 | 1120 | 1267 | 1206 | 1174 | 1533 | 2332 | 3689 |
500 symbols consensus --------------------------M--DDRQQAADW---------------LSVPEAT #oth 11111111111111111222222343355454554435211111111111111121.135 HQ1958A :::::::::::::::::::::::::::GQ:QASEV::Q:::::::::::::::::::::M Hmu3271 ::::::::::::::::::::::::::-::ME:N:S:SE:::::::::::::::::::::: pNG7016 :::::::::::::::::::::::MPR:NAS:Q:I:::A::::::::::::::::::::E: HVO_B0324 :::::::::::::::::MSNSAVEFR:HT:GDENPV::::::::::::::::::::::DV HQ3213A :::::::::::::::::::::::MDTESDT:QT:PQ:IT::::::::::::::::F:D:E rrnAC1968 ::::::::::::::::::::::::::-::---------:::::::::::::::MNF:DRG hla0706 MTRLRLFPCVQRRHTGTSRPLYRQASHRLSS::H:YN:QSHPQLLYWRREGPHMEF:DRR consensus IVDACDDP-PLPEFGIVEQVWETDPIPAADIAAAAAKAVDAL--DLDAVPAGGEVALGVG #oth 22212322241.31131212221323452335312351233.113134113.111.111. HQ1958A :KK::::::A:::L::I::::N::S::SSET:E:::::::S:::P:ET::::::I::::: Hmu3271 :::::G:L:D::KL:V:::::::::::::A:D:HVES:::::::E::D::::::I::::: pNG7016 ::::::::::::::::I::N::::::TP:HV:TH::R:AES:::SFAD::D::::::::: HVO_B0324 :LE::GN::S:::L::I::::::N::::::VPE::::::A::::SFA:::E::::::::: HQ3213A T:E:ALPTREI:S:AA::--SHPETPVES::IK:TQY::NN:SGP:SS:::::TI:V:L: rrnAC1968 D:::LI::Q:::D:AR:Q--Y:PETAAVD:PS:::RTEL:R::::F:GLEP:AT::VA:: hla0706 D::HLI::Q:::::AR:R--Y:PRTERLD:PV::TRDEL:::::::::L:E:AT::V::: consensus SRGIANIDDIVAGVVDALSDRGYEPFVFPAMGSHGGATGEGQREMLAELGITEETIGCEI #oth ....22243213321352521.12.112..........22..133.221121.222112. HQ1958A ::::::LASL:S:::TH:Q:::::::I:::::::::::DD:::KK::::D:::A:::::: Hmu3271 ::::D:VSE:::AA:ST:E::::D::::::::::::::::::A:::::::V::SS::::: pNG7016 ::::::LPT::::::::V::A::::::::::::::::::::::A::N:::V::S:::::: HVO_B0324 :::::::P:::::::::V:EA::::::::::::::::::D::::::N:::::::R::::: HQ3213A ::::HD:QTVAQVTI:E:IS:::N:V:I::::::::::PA:::QT:E:I:LN:::L::S: rrnAC1968 ::::HR:::::ET::ADIR:::F::V:V::::::::::P:::::V:ES:::::SRLDAP: hla0706 ::::DR::EVA:A::AR:AE::FD:V:V::::::::::P:::::V::A::V::::V:AP: consensus RSSMDVVEVGRTP--DRDVPVVADANAAEADAIIPINRVKPHTDFDGPVESGLSKMLVIG #oth 112.3233223121122241132243.34..21211..1.1..112.51....2..111. HQ1958A ::::N:::I:Q:T::::EI:::::::::S::::::::::::::::::T:::::::::::: Hmu3271 :::::::::::::::E:::::::::H::G::::V:::::::::::::A:::::::::::: pNG7016 ::::::::::::::::::::::::D::VA::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_B0324 ::::E:::::::::::::::::::::::G::::::::::::::::::E:::::::::::: HQ3213A DAG:ETTVL:E:T::-:GHNISFAQS:VD::G::V:::I::::N:T:YI::::::::TV: rrnAC1968 DAR::TAQ:DTVTVG:TEF::HVSTA:Q::::VVVV:::::::NYS:RI::::M::T:V: hla0706 DAR:TARALATVSVG:AET::YFSEA:L:::TVLV:::::A::N:T::I::::A::T:V: consensus MGKQRGAQIAHEWAVDWSFRNMIPEILEQLLDALPVVGGIAIVEDQHDETTLIEGVPPGG #oth 1...2..231.31.23212141122123323442121..1111.111121312111.123 HQ1958A :::::::::::Q::::::L:::::::T::::AK:::::::::::::::D:M:V:::::SD Hmu3271 :::::::K::::::::::::::::::AG:::::::::::::LL::::::::::::::::: pNG7016 :::::::::::K::::::::Q:::::TGR::KE::I:::V::::::::::::::::::S: HVO_B0324 :::::::::::K::::::::R:::::T:::::S::I:::V::::::::D:::::::::S: HQ3213A L:::A::RTF::T:LTNGYVDT:ERA::IIC:TVR:I:::G:::NF:EQ:AH:D:I:ADK rrnAC1968 L:::H::KAF:ST:IKEGYVETLEAA:PVVGS:::L:::V:L::NF:E::AHV:AI:A:S hla0706 L::::::KSF:ST:IAEGYVETLTAA:DVIERET:LI::::L::NFEE:IGHL:A::A:S consensus FLDRERELLERAYDEMPTLPFDDLDLVVFDRQGKEISGQGMDTNVIGRRRF-INEPAPDT #oth 1211.42..13.123111..1311.1113122..11..1.1....1..12121.113.13 HQ1958A :::::A::::L:::V::K:::N:::V::L:K:::::::::L::::::::P:A::::E::Q Hmu3271 ::::::::::::::V::::::SE::V::::::::D:::::L::::::::A:A:::::::E pNG7016 :::::E::::T::EL::::::EE:::::::::::::::::L::::::::P:S::::::E: HVO_B0324 ::::::::::T::EL::K:::EE::::::::::::::::::::::::::P:S::::::EK HQ3213A LPEA:TS::T::ESYL:::::::::VLIIEKI::D:::A::::::V::Y:V:L:ADN::: rrnAC1968 :T:::PA:::Q:::::A:::V::I::L:V:EL::DV::A:::::::::Y:V:L:A:D::E hla0706 :::::P:::::::E::::::V::I::L:I:EI::::::A:::::::::Y:V:L:A:D:E: consensus PAIKRIYTRGLTEATHGNAMGIGSADIIHEDVVAELDAETTLINALTASTIRGVKLPPVV #oth .4.211222...22.1..12.2.1..222222322.1332112....12132122..2.2 HQ1958A :D:::::V::::QK:::::::M:::::V::N:P:D:E:T::::::::::::::::::::: Hmu3271 :T::::::::::A::::::::V::::L:::::::::::::::::::::::V:::R::::: pNG7016 :D::::F::::::K:::::::::::::::A:II:::::::S::::::::::::::::::: HVO_B0324 :N::::::H::::K:::::::V::::V::::I::::::Q::::::::::::::::::::: HQ3213A :::S::VVL::::T::::GQ:::L:::TTAN::S:::F:Q:YT::::SASVSKAH::L:M rrnAC1968 :S::LL:A:::::::K::GN:::L:::TRQAALDQ::LQK:YA::::SGSTAKA:::L:A hla0706 :::DL::V:::::::K::GN:::L::LTRQAA:DQ::MKK:YA::::SGSLSKS:::V:A consensus ETDRAGIVAALSTIGVVDPDTVRIVRAADTMHLHRLYASPALVEEARARDDLRVVEDAEP #oth 12112123112211.21123.1.221142.32.33132.321233223233112133333 HQ1958A :::::::I::F::::::::N:::ML::T::::::::::::::IA:::D:T::::::E:S: Hmu3271 :S::::L::::::::::::E:::V:::R:::::A:FF::E::I:D::Q:E::::::E:T: pNG7016 ::::::::::::::::::T::::VL:::::::::Q:::::::::A::D:::::::::PS: HVO_B0324 ::::::V::::::::::E:::::V:::::::::::::::::::::::E:::::::::PT: HQ3213A PSE:HA:Q:::G:::QY::Q:A::AWIS::SQ:SQFHL:TG:LPGIE:T:S:-TIKQRME rrnAC1968 PD:EFA:RT:::AL:GY::::::::WIQT:QD:ST:HV:EP::D:LP:AAE---:T:L:S hla0706 PD:EFALRTGAAAL:GY:SE:::::WIRN:ED:GE:RV:D:V:DDLPEAAR---:VGR:T consensus IAFDDGQARAPSLRD----- #oth 23.31132413322221111 HQ1958A :M:::::FT:::::H::::: Hmu3271 :E::::AFS:-::A:::::: pNG7016 :E::N::LV:::::E::::: HVO_B0324 :::E:::FA::::::::::: HQ3213A LC:T:DI::FDP:T:S:::: rrnAC1968 L::S::T:SF--T:E::::: hla0706 V:::::T::FEAAT:DDPDA