|
Pairwise sequence scores | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 2237 | rrnB0062 | HVO_A0003 | Hbo3512 | VNG5089 | VNG5208 | VNG6086 | VNG6153 | HVO_B0018 |
976 | rrnB0062 | 2182 | 810 | 748 | 856 | 856 | 856 | 754 | 890 |
1018 | HVO_A0003 | 810 | 2086 | 1706 | 800 | 800 | 800 | 691 | 825 |
1016 | Hbo3512 | 748 | 1706 | 2043 | 795 | 795 | 795 | 707 | 824 |
2008 | VNG5089 | 856 | 800 | 795 | 2365 | 2365 | 2365 | 1016 | 1106 |
2008 | VNG5208 | 856 | 800 | 795 | 2365 | 2365 | 2365 | 1016 | 1106 |
2008 | VNG6086 | 856 | 800 | 795 | 2365 | 2365 | 2365 | 1016 | 1106 |
1172 | VNG6153 | 754 | 691 | 707 | 1016 | 1016 | 1016 | 2642 | 1213 |
1287 | HVO_B0018 | 890 | 825 | 824 | 1106 | 1106 | 1106 | 1213 | 2179 |
362 symbols consensus -------MAG--S--S--ST-S--S----V-----------------------------D #oth 111111123322122122112122122221111111111111111111111111111112 rrnB0062 ::::::::SA::-::-::--:-::-::::-:::::::::::::::::::::::::::::: HVO_A0003 :::::::---::-::-::--:-::-::::-:::::::::::::::::::::::::::::- Hbo3512 :::::::---::-::-::--:-::-::::-:::::::::::::::::::::::::::::- VNG5089 ::::::::::TN:GN:ID::N:PN:PYDS::::::::::::::::::::::::::::::: VNG5208 ::::::::::TN:GN:ID::N:PN:PYDS::::::::::::::::::::::::::::::: VNG6086 ::::::::::TN:GN:ID::N:PN:PYDS::::::::::::::::::::::::::::::: VNG6153 MATVLYQTLKNQ:TT:TS::V:TV:VLST:AFLSVVSTLEKLKELSTVVSGEATDMAQSN HVO_B0018 :::::::---::-::-::--:-::-::::-:::::::::::::::::::::::::::::- consensus TAGNSRAVSVCLLKGGVGKSTIAINLARQLAARGHDVLLIDLDPNGHATVGLGFDDHYHN #oth 233431112.221...2..1.212.1.13..2123221.1...32.131321.4314143 rrnB0062 EFEGLPGAA:S::::::::::::L:I:DR::::::ETV:::::KD::M:TQ::Y::A:D- HVO_A0003 ---V::::::S:Q::::::T:::::::DA:::::N::::V:::QQ:N::E:V:LK:D:ES Hbo3512 ---MA:::::S:Q::::::T:V:::::DA:::::N::::V:::QQ:N::E:V:RK:L:ET VNG5089 :::::::::::M:::::::::::V:::::::THD::::::::::::::S::::::::::: VNG5208 :::::::::::M:::::::::::V:::::::THD::::::::::::::S::::::::::: VNG6086 :::::::::::M:::::::::::V:::::::THD::::::::::::::S::::::::::: VNG6153 :SKTP:::C:GI::::F::T:T:L::::E::H:NEKA::V:::D:::L:LN::HR:A:Q: HVO_B0018 ---M::::::::::::I::::TS:::::E::H::S::::V:::::::T:T::::GEEFY- consensus -----TDEGIGDVLFDEAD--PREVIYDTEYEFDLLPSSEDLEQVERRI--GDVFQGSAL #oth 111115142312214122232122325223313122.12411131.33211223422323 rrnB0062 :::::R:INL::A:INGE::::EDLLIE:DFGVH:::::N:::N::T:L::K:ERFADVK HVO_A0003 :::::LEPN:::::T:DDPIDV::::R:R:-G::V:::HV::DDI:D:V::RNSTF:MLW Hbo3512 :::::EEPHV::L:T:DDPVDV::I:H:RG-::::I:AHV::DDI:D::::RNSTF:VLW VNG5089 :::::::::::E:F::::::::TS:V::::::::I::::::::::::E:VV:::::P::: VNG5208 :::::::::::E:F::::::::TS:V::::::::I::::::::::::E:VV:::::P::: VNG6086 :::::::::::E:F::::::::TS:V::::::::I::::::::::::E:VV:::::P::: VNG6153 GSGGDNENHAEA::VN:::::::DY:VNVAGGL::F::HA:::G::STL::K:AV::::R HVO_B0018 :::::SEAHL::::L:D:ELE:::L:LE:GF:I:::::NDRI::::SDL:::G:MM:::R consensus LKRRVVEPLLGDEYDYIVIDSPAYRGRLSDNALIATGNLVLPLAPGNEAMSGLERTIERQ #oth 1113211..1122..1112.2124112.2.11131221112.131342242.12212211 rrnB0062 :R:N::D::IQNG:::VI::AAGG::K::::::::VQRVIV::I:RAGSIN::NKM:::: HVO_A0003 VR::I:D:::::D:::::::::PSL:P:::A:::G:::V:V::LMSEPSV::F::MF:Q: Hbo3512 VR::II:::::E::::::::::PSL:P:::AS::GA::VIV::LMSEPSV::F::MV:Q: VNG5089 :::E:::::::::::F::T::::::S::T::::V::S::::::::::::::::::::::: VNG5208 :::E:::::::::::F::T::::::S::T::::V::S::::::::::::::::::::::: VNG6086 :::E:::::::::::F::T::::::S::T::::V::S::::::::::::::::::::::: VNG6153 ::QHL::::::ED:::V:::C::N::K:N:::MF:::::II::R:ELGYET::DN:VN:L HVO_B0018 ::Q::ID:::::D:::V:V:C::A::K:N::::Y::Q:::::MR:ESG:L::::K:VK:L consensus IAPIRKHMDLDILALVPNDLDGRIDQQTQDRRLLERLNSHNSLQDRIPNFARID--DWEA #oth 15.2.3331121..21.221432222423323123413343333332.31.123124223 rrnB0062 :S:::QNIG:::::VT::IIRETMG:HNEH:T:V:N::RE--FGAFV:EY::::PEIFDT HVO_A0003 :G:::REV::::::I:::::T:----NNEEK:IIRD:EDSP-FEQF::P:::S:::LFDD Hbo3512 :R::::EV::G:::I:::::S:----NNEEK:IIDD:E:SP-FEQYL:S:::SE::---R VNG5089 :::L:::::V:V::::::M::::::::::::Q:::::::::::::::::::::T:::::: VNG5208 :::L:::::V:V::::::M::::::::::::Q:::::::::::::::::::::T:::::: VNG6086 :::L:::::V:V::::::M::::::::::::Q:::::::::::::::::::::T:::::: VNG6153 VK:A:RYF::::::V::S::QR::::A:L:QE::KEITTRDGVASKV::::Y:SPE:::: HVO_B0018 :T:A:E:F::E:::V::T::RD:::HDRPT:::V:A:V:KPNIASKL::::YT:PDVF:: consensus VGSGDIS----PTPGIRHRTAISRAYRE-RKPLRDYDANCDQLKNFDELAQIVEAGEVVR #oth 52322431332131.1.2.31133142213211211.442.11332.3..32..412233 rrnB0062 LDDS:QTVESI:K::::E:::::::FKQ:GM:VSEF:ED:::IP:::H::DL::EHSHA- HVO_A0003 PD:----::::KG::::::I:F:::W:D:G:T::E::PSN:M:DRL:R::E:::H:GTDD Hbo3512 F:ES---:::::G::L:::I:F:::W:D:GET::E::P:S:M:DRL:K:::V::N:GTDA VNG5089 :::::::::::::::::D::S:TK::G::::::L::::::::::::::::H::::::::: VNG5208 :::::::::::::::::D::S:TK::G::::::L::::::::::::::::H::::::::: VNG6086 :::::::::::::::::D::S:TK::G::::::L::::::::::::::::H::::::::: VNG6153 TEA:EYD:DGL:--:::::D::NNSL:DANE::::F:RE::::AAY::::::::Q:::I: HVO_B0018 IDD:EWD:GDL:K::::::S::DASI:::HM::::::ST::::ACY::::::::E:::A: consensus H- #oth 32 rrnB0062 -: HVO_A0003 A: Hbo3512 -: VNG5089 :G VNG5208 :G VNG6086 :G VNG6153 DE HVO_B0018 -: