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4 genomes BUD1935 4 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi
-

rrnAC2685

HVO_1944

Hbo2542

Hmu3095

- - - -

Pairwise sequence scores
Consensus score2818 HVO_1944 Hbo2542 rrnAC2685 Hmu3095
1721HVO_1944 3122 1147 1115 1090
1754Hbo2542 1147 3175 1117 1243
1757rrnAC2685 1115 1117 2717 1344
1883Hmu3095 1090 1243 1344 3264

510 symbols
consensus       -------MARLCAALVVLAVVVALAAA---PATGAGLGALAQQQVDPDDVVLRVDVQEDG
#oth            11222223332233221212212211311111213232312122121.31223212222.
HVO_1944        MAIRDAVF:L:::::C:::::APT:::QEST:S:P:VEP:V::G:E::STRIV:E:S:R:
Hbo2542         ::MSRLEPRT::VIT:IIFAT:LG::T::::::AQSTQ:V:GT:LA::::S::I:I::N:
rrnAC2685       ::::::::G:SAGT:::VF:A:::LVP:::T:::::F:S:G::S::A:V::MTA::GP::
Hmu3095         :::::::---------:::L::::L:V::::IA:GQ::G:::E:::::T:::Q:EL:A::

consensus       DARWEVAYRTRLD-DDNATAAFESLRDDIRANPAAYTAAFADRMARTAGAAENATGREMA
#oth            2.3.213.122..1.1.1.2..11112.13211321.23.32.132.221.........1
HVO_1944        :::::IQ:W:W::::E:T:E::R::Q::V::::DD::::::E:I:S:V::::::::::::
Hbo2542         S:I:::E::VL::G:E::::::::V:Q::EN:ESQF:GE:H:::DA::QT:::::::::D
rrnAC2685       A:D:T::::I:::::::::Q:::D::A::Q:::::::DR:ES::Q:::::::::::::::
Hmu3095         ::S:A:H::::::::::T::::::::::VSDD:T::::D:G:::N::IAT::::::::::

consensus       ARNVSVAAETRALPQEYGVVTYRFEWTNFAAVDGDRLRAGDALSGLFLDEESSLRIRWPA
#oth            32.11.12223311121..11.1.2.1...212..2122...12.11..1112.333..2
HVO_1944        :T:::::::::S::DSF:::S:S:::S::::::::::VV:::IE:F:::SS:R:ILS::D
Hbo2542         V:::::SVSRQG::::::::::::V:::::EI:::SI::::::A:::::::T::LMT::E
rrnAC2685       IE::T:S:REDTFG:T:::I::::Q:::::G:S::::EI::::::::::S:T::TV::::
Hmu3095         L::LT::T::E:::::::::::::::::::::E::Q::::::::::Y:::::T:::D:::

consensus       GYAATSVAPSPDERRERTVAWRG-QQDFGSGEPRVVLTRGAG----------T--AGDDT
#oth            1.322213.221232232.3.2.1232.222..22112322211222222221222.232
HVO_1944        D:GV:T:E:AG::T::NA:I:::T:TE:V::::N:::E::::GSEPSATPTP:PTP::SE
Hbo2542         ::::QDAT::::DE:S:::V:N::PL:::P:::SII:SPQT:::TETGDSSN:GGV::G:
rrnAC2685       ::Q:D::::QV:::KNDS:T::::::T::ES:::::V:S:DS::::::::::-::::G:S
Hmu3095         ::ER:::D:::TRSD:Q::::D::RI::E:D:::L:V:ES:A::::::::::-::::ET:

consensus       TAAGDADNDATLLVVAGLLAVVGVVAGAWALRRRGALGG-----GASDAGRDDA------
#oth            1321332333232222211121222112222111.32..111111322312221111111
HVO_1944        :P:ASD:SFP:TTA:IA:AL::L:G:::VY::S::::::::::::DGG::AV::::::::
Hbo2542         ::S::S::SS:WF:G::::L::VA:G:G:VFY:::--::TAIKT:P::D:::G:GAAASS
rrnAC2685       GSN:--------:L:G::::L::IA:::Y::::Y:V:::::::::--ELAEPP:::::::
Hmu3095         :G::E:AG::W:::A:TV::AG::::LL::N::Y:IA:::::::A:::S::::G::::::

consensus       -------------AD--------TSDEDADTGGTDATAASDADAGGAPA---PP--PELL
#oth            1111222222222112222222212223222222222222.22122311111..112...
HVO_1944        ::::TGGTDADAP::STAATSRA:A:AG:::AAA:D:DQ:::SDD:E:S:::::::::::
Hbo2542         PQSSDARSESAEM::TSESDETK:T:::GS:::::G:::D:TE:TP:::DDT::WED:::
rrnAC2685       :::::::::::::--::::::::-:MVES:DSN:E:P:GT:::::---::::::::A:::
Hmu3095         :::::::::::::--::::::::-:E:P:ES::ES:GE:::E::::D:S:::::::::::

consensus       SNEERVLQLIDSRGGRLKQQEVAGALDWTDAKTSQVIRGLRDEDDLETFRIGRENVLTLP
#oth            ....1..2.1123...1...21.13....1....1.1121.1.13212..1.....12..
HVO_1944        :::::::R::E:::::I:::::::::::::::::K:V::M:::GTI:G::L::::::R::
Hbo2542         :::::::A::EHE:::::::::::T:::::::::::V:KM:::G::DA::L::::::V::
rrnAC2685       ::::Q::::L::N:::::::Q:::E::::::::::::G::::::KV::::::::::V:::
Hmu3095         :::::::::L:DS:::::::AI:ER::::A:::::::GD::E::E:::::::::::V:::

consensus       DDD---------------------------------------------------------
#oth            231221111111111111111111111111111111111111111111111111111111
HVO_1944        E:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
Hbo2542         :EN:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
rrnAC2685       :T:VT:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
Hmu3095         GV:LASDVGEGEGEGEGEGEGEGEGEGEGEGEGEGEGEGEGEGEGEGEGEGEGEGEGEGE

consensus       ------------G--DGEGDGE-DGEGDEV
#oth            111111111111122312222311221232
HVO_1944        ::::::::::::-::::GA:AP:::GSNG:
Hbo2542         ::::::::::::-::-------::D:::L:
rrnAC2685       :::::::::::::GNG:::::T::SD:ETQ
Hmu3095         GEGEGEGEGEGE:EGE:::E::GE:::::P