|
Pairwise sequence scores | |||||
---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 2818 | HVO_1944 | Hbo2542 | rrnAC2685 | Hmu3095 |
1721 | HVO_1944 | 3122 | 1147 | 1115 | 1090 |
1754 | Hbo2542 | 1147 | 3175 | 1117 | 1243 |
1757 | rrnAC2685 | 1115 | 1117 | 2717 | 1344 |
1883 | Hmu3095 | 1090 | 1243 | 1344 | 3264 |
510 symbols consensus -------MARLCAALVVLAVVVALAAA---PATGAGLGALAQQQVDPDDVVLRVDVQEDG #oth 11222223332233221212212211311111213232312122121.31223212222. HVO_1944 MAIRDAVF:L:::::C:::::APT:::QEST:S:P:VEP:V::G:E::STRIV:E:S:R: Hbo2542 ::MSRLEPRT::VIT:IIFAT:LG::T::::::AQSTQ:V:GT:LA::::S::I:I::N: rrnAC2685 ::::::::G:SAGT:::VF:A:::LVP:::T:::::F:S:G::S::A:V::MTA::GP:: Hmu3095 :::::::---------:::L::::L:V::::IA:GQ::G:::E:::::T:::Q:EL:A:: consensus DARWEVAYRTRLD-DDNATAAFESLRDDIRANPAAYTAAFADRMARTAGAAENATGREMA #oth 2.3.213.122..1.1.1.2..11112.13211321.23.32.132.221.........1 HVO_1944 :::::IQ:W:W::::E:T:E::R::Q::V::::DD::::::E:I:S:V:::::::::::: Hbo2542 S:I:::E::VL::G:E::::::::V:Q::EN:ESQF:GE:H:::DA::QT:::::::::D rrnAC2685 A:D:T::::I:::::::::Q:::D::A::Q:::::::DR:ES::Q::::::::::::::: Hmu3095 ::S:A:H::::::::::T::::::::::VSDD:T::::D:G:::N::IAT:::::::::: consensus ARNVSVAAETRALPQEYGVVTYRFEWTNFAAVDGDRLRAGDALSGLFLDEESSLRIRWPA #oth 32.11.12223311121..11.1.2.1...212..2122...12.11..1112.333..2 HVO_1944 :T:::::::::S::DSF:::S:S:::S::::::::::VV:::IE:F:::SS:R:ILS::D Hbo2542 V:::::SVSRQG::::::::::::V:::::EI:::SI::::::A:::::::T::LMT::E rrnAC2685 IE::T:S:REDTFG:T:::I::::Q:::::G:S::::EI::::::::::S:T::TV:::: Hmu3095 L::LT::T::E:::::::::::::::::::::E::Q::::::::::Y:::::T:::D::: consensus GYAATSVAPSPDERRERTVAWRG-QQDFGSGEPRVVLTRGAG----------T--AGDDT #oth 1.322213.221232232.3.2.1232.222..22112322211222222221222.232 HVO_1944 D:GV:T:E:AG::T::NA:I:::T:TE:V::::N:::E::::GSEPSATPTP:PTP::SE Hbo2542 ::::QDAT::::DE:S:::V:N::PL:::P:::SII:SPQT:::TETGDSSN:GGV::G: rrnAC2685 ::Q:D::::QV:::KNDS:T::::::T::ES:::::V:S:DS::::::::::-::::G:S Hmu3095 ::ER:::D:::TRSD:Q::::D::RI::E:D:::L:V:ES:A::::::::::-::::ET: consensus TAAGDADNDATLLVVAGLLAVVGVVAGAWALRRRGALGG-----GASDAGRDDA------ #oth 1321332333232222211121222112222111.32..111111322312221111111 HVO_1944 :P:ASD:SFP:TTA:IA:AL::L:G:::VY::S::::::::::::DGG::AV:::::::: Hbo2542 ::S::S::SS:WF:G::::L::VA:G:G:VFY:::--::TAIKT:P::D:::G:GAAASS rrnAC2685 GSN:--------:L:G::::L::IA:::Y::::Y:V:::::::::--ELAEPP::::::: Hmu3095 :G::E:AG::W:::A:TV::AG::::LL::N::Y:IA:::::::A:::S::::G:::::: consensus -------------AD--------TSDEDADTGGTDATAASDADAGGAPA---PP--PELL #oth 1111222222222112222222212223222222222222.22122311111..112... HVO_1944 ::::TGGTDADAP::STAATSRA:A:AG:::AAA:D:DQ:::SDD:E:S::::::::::: Hbo2542 PQSSDARSESAEM::TSESDETK:T:::GS:::::G:::D:TE:TP:::DDT::WED::: rrnAC2685 :::::::::::::--::::::::-:MVES:DSN:E:P:GT:::::---::::::::A::: Hmu3095 :::::::::::::--::::::::-:E:P:ES::ES:GE:::E::::D:S::::::::::: consensus SNEERVLQLIDSRGGRLKQQEVAGALDWTDAKTSQVIRGLRDEDDLETFRIGRENVLTLP #oth ....1..2.1123...1...21.13....1....1.1121.1.13212..1.....12.. HVO_1944 :::::::R::E:::::I:::::::::::::::::K:V::M:::GTI:G::L::::::R:: Hbo2542 :::::::A::EHE:::::::::::T:::::::::::V:KM:::G::DA::L::::::V:: rrnAC2685 ::::Q::::L::N:::::::Q:::E::::::::::::G::::::KV::::::::::V::: Hmu3095 :::::::::L:DS:::::::AI:ER::::A:::::::GD::E::E:::::::::::V::: consensus DDD--------------------------------------------------------- #oth 231221111111111111111111111111111111111111111111111111111111 HVO_1944 E::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hbo2542 :EN::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: rrnAC2685 :T:VT::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hmu3095 GV:LASDVGEGEGEGEGEGEGEGEGEGEGEGEGEGEGEGEGEGEGEGEGEGEGEGEGEGE consensus ------------G--DGEGDGE-DGEGDEV #oth 111111111111122312222311221232 HVO_1944 ::::::::::::-::::GA:AP:::GSNG: Hbo2542 ::::::::::::-::-------::D:::L: rrnAC2685 :::::::::::::GNG:::::T::SD:ETQ Hmu3095 GEGEGEGEGEGE:EGE:::E::GE:::::P